FuNGI

Q5KMK8

Protein Details

Accession

Q5KMK8

Localization Confidence

High

Confidence Score

19.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
681-707	KGEGSSRTARRARKKIHKSTSPLKTIT	Hydrophilic
856-885	RATSPKKTKVSSPARRRPKYKIISSTKDGE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
561-587	KLKTPKKDVQPLKTNAAGKAKRGRGKK
686-698	SRTARRARKKIHK
861-874	KKTKVSSPARRRPK

Subcellular Location(s)

nucl 18, cyto 4.5, cyto_mito 4.5, mito 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR036279 5-3_exonuclease_C_sf IPR041177 GEN1_C IPR029060 PIN-like_dom_sf IPR006086 XPG-I_dom IPR006084 XPG/Rad2 IPR006085 XPG_DNA_repair_N
Gene Ontology	GO:0017108 F:5'-flap endonuclease activity GO:0006281 P:DNA repair
Pfam	View protein in Pfam PF18380 GEN1_C PF00867 XPG_I PF00752 XPG_N
CDD	cd09870 PIN_YEN1

Amino Acid Sequences

MGVSGLWDLLRPSAASVTLHTLSKEAFLENKNGLRALTVGIDASIWIFHAAVPQHGENPFLRTIFFKITALLQHPVLPVFVFDGPNKPAMKRNQKVGGKFGTHDYRSKQFKALLDTCGLEWWNAPGEAEAELAVMNRQGKIDAILSDDGDALLFGAKCLIRNSSPTLSGSLASSTKNNPSAGSKRDYDVYTLSRICGEWAKEQDTELTSEESCTMAMVWIALLSGGDYTPEGLYSIGHKISYGLAKAGLSDYLKEYCRDKQAFLKSLPGLHARMVEELRTNSSKQQDKRYPDRSNKLSAMSPSQLFPTSTLDAYLSPCTSPLDDPSQGWPGFGQGSCSMARGKARSEGRGDMEGMAAACEKYFEWGTKDLVCKKFAGESVGIFGAEIMNAAREAVRARDSLGLGVGIGPEKTPSRITSFFQQSVPSPISSKSTGASQFPNPATQLRDTVPPHIVQIHSERTSKDGTEKDYRISFHQDVYVERCRNAMLGIRVDPSELPQEEKNRLGLADHADKDNDDKVSATQTASKSEIRVWLPQYLVREAWPELVKAYDDKLAAKTASKLKTPKKDVQPLKTNAAGKAKRGRGKKALEADGEDVNAFTSFFSQRPKESTLDAFEEEEEQIEPTPPQSKATQEVIDLSLSPSPSPPASPTQKSSNNAEKKKLARPALNTSTSSTPSGGEKGEGSSRTARRARKKIHKSTSPLKTITDLSKSSPSPEQSTATPTITPRFSSRTFRKTISSPSAFPPRRVQAQEVIDLCSSSEEDTAPAKPIHRRQAARSPKISSPPSGILSSSTKINTQSSRSSRSTSVSFPACPLNKPSSRSPRESSILSHPLLSGSSQSSSLSPPPPTPPNTQRATSPKKTKVSSPARRRPKYKIISSTKDGEVIDCTMRR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.13
2	0.13
3	0.15
4	0.2
5	0.21
6	0.22
7	0.21
8	0.21
9	0.2
10	0.22
11	0.21
12	0.16
13	0.2
14	0.21
15	0.26
16	0.3
17	0.33
18	0.32
19	0.32
20	0.3
21	0.25
22	0.23
23	0.2
24	0.16
25	0.13
26	0.11
27	0.1
28	0.1
29	0.09
30	0.09
31	0.07
32	0.06
33	0.06
34	0.06
35	0.06
36	0.11
37	0.12
38	0.14
39	0.18
40	0.19
41	0.23
42	0.23
43	0.27
44	0.23
45	0.27
46	0.27
47	0.23
48	0.22
49	0.2
50	0.23
51	0.26
52	0.26
53	0.22
54	0.21
55	0.23
56	0.27
57	0.28
58	0.27
59	0.22
60	0.23
61	0.24
62	0.23
63	0.21
64	0.17
65	0.13
66	0.14
67	0.15
68	0.15
69	0.15
70	0.19
71	0.21
72	0.26
73	0.28
74	0.27
75	0.32
76	0.4
77	0.5
78	0.51
79	0.58
80	0.63
81	0.68
82	0.7
83	0.7
84	0.67
85	0.59
86	0.55
87	0.54
88	0.52
89	0.49
90	0.5
91	0.48
92	0.49
93	0.53
94	0.54
95	0.51
96	0.48
97	0.49
98	0.53
99	0.51
100	0.46
101	0.41
102	0.39
103	0.35
104	0.32
105	0.28
106	0.19
107	0.15
108	0.14
109	0.14
110	0.13
111	0.13
112	0.11
113	0.11
114	0.11
115	0.11
116	0.09
117	0.07
118	0.07
119	0.07
120	0.07
121	0.08
122	0.09
123	0.09
124	0.1
125	0.1
126	0.1
127	0.12
128	0.14
129	0.12
130	0.14
131	0.15
132	0.15
133	0.15
134	0.14
135	0.12
136	0.1
137	0.09
138	0.05
139	0.07
140	0.07
141	0.06
142	0.09
143	0.1
144	0.12
145	0.13
146	0.17
147	0.16
148	0.2
149	0.26
150	0.26
151	0.28
152	0.27
153	0.28
154	0.26
155	0.24
156	0.22
157	0.18
158	0.16
159	0.15
160	0.17
161	0.17
162	0.22
163	0.25
164	0.25
165	0.24
166	0.3
167	0.35
168	0.37
169	0.39
170	0.36
171	0.34
172	0.38
173	0.37
174	0.32
175	0.3
176	0.28
177	0.28
178	0.27
179	0.25
180	0.22
181	0.21
182	0.21
183	0.21
184	0.21
185	0.22
186	0.26
187	0.29
188	0.28
189	0.28
190	0.29
191	0.26
192	0.25
193	0.2
194	0.18
195	0.15
196	0.15
197	0.15
198	0.12
199	0.11
200	0.09
201	0.08
202	0.06
203	0.05
204	0.05
205	0.04
206	0.04
207	0.04
208	0.04
209	0.03
210	0.03
211	0.03
212	0.03
213	0.04
214	0.04
215	0.05
216	0.05
217	0.05
218	0.05
219	0.05
220	0.06
221	0.08
222	0.11
223	0.1
224	0.1
225	0.1
226	0.11
227	0.13
228	0.15
229	0.14
230	0.11
231	0.12
232	0.12
233	0.12
234	0.12
235	0.12
236	0.1
237	0.1
238	0.12
239	0.14
240	0.15
241	0.17
242	0.19
243	0.22
244	0.3
245	0.31
246	0.31
247	0.36
248	0.43
249	0.47
250	0.46
251	0.47
252	0.39
253	0.4
254	0.4
255	0.35
256	0.27
257	0.23
258	0.25
259	0.19
260	0.21
261	0.19
262	0.18
263	0.17
264	0.17
265	0.2
266	0.2
267	0.2
268	0.22
269	0.29
270	0.35
271	0.37
272	0.47
273	0.5
274	0.56
275	0.65
276	0.7
277	0.72
278	0.74
279	0.78
280	0.72
281	0.7
282	0.65
283	0.58
284	0.51
285	0.43
286	0.39
287	0.32
288	0.29
289	0.23
290	0.22
291	0.21
292	0.18
293	0.17
294	0.17
295	0.16
296	0.15
297	0.15
298	0.14
299	0.13
300	0.15
301	0.15
302	0.11
303	0.09
304	0.1
305	0.1
306	0.11
307	0.11
308	0.12
309	0.16
310	0.16
311	0.17
312	0.2
313	0.25
314	0.23
315	0.23
316	0.2
317	0.16
318	0.16
319	0.15
320	0.15
321	0.09
322	0.12
323	0.12
324	0.13
325	0.12
326	0.12
327	0.15
328	0.14
329	0.15
330	0.21
331	0.23
332	0.25
333	0.28
334	0.29
335	0.29
336	0.29
337	0.28
338	0.21
339	0.18
340	0.15
341	0.12
342	0.09
343	0.07
344	0.05
345	0.04
346	0.04
347	0.04
348	0.06
349	0.07
350	0.08
351	0.1
352	0.12
353	0.14
354	0.17
355	0.22
356	0.27
357	0.29
358	0.29
359	0.27
360	0.25
361	0.27
362	0.24
363	0.23
364	0.16
365	0.13
366	0.14
367	0.14
368	0.13
369	0.1
370	0.09
371	0.06
372	0.05
373	0.05
374	0.03
375	0.03
376	0.03
377	0.03
378	0.03
379	0.04
380	0.05
381	0.06
382	0.08
383	0.08
384	0.09
385	0.12
386	0.12
387	0.11
388	0.11
389	0.09
390	0.07
391	0.07
392	0.06
393	0.04
394	0.04
395	0.04
396	0.05
397	0.05
398	0.07
399	0.08
400	0.09
401	0.14
402	0.16
403	0.18
404	0.24
405	0.29
406	0.29
407	0.29
408	0.29
409	0.24
410	0.26
411	0.26
412	0.19
413	0.15
414	0.14
415	0.16
416	0.16
417	0.16
418	0.12
419	0.14
420	0.15
421	0.16
422	0.18
423	0.16
424	0.2
425	0.2
426	0.21
427	0.18
428	0.18
429	0.19
430	0.17
431	0.18
432	0.14
433	0.19
434	0.19
435	0.21
436	0.21
437	0.19
438	0.18
439	0.18
440	0.17
441	0.13
442	0.16
443	0.18
444	0.19
445	0.2
446	0.2
447	0.2
448	0.21
449	0.2
450	0.21
451	0.18
452	0.21
453	0.27
454	0.27
455	0.28
456	0.29
457	0.29
458	0.27
459	0.32
460	0.27
461	0.21
462	0.23
463	0.21
464	0.2
465	0.25
466	0.3
467	0.24
468	0.23
469	0.23
470	0.2
471	0.2
472	0.19
473	0.17
474	0.12
475	0.13
476	0.14
477	0.15
478	0.15
479	0.15
480	0.14
481	0.12
482	0.13
483	0.12
484	0.13
485	0.15
486	0.19
487	0.21
488	0.22
489	0.21
490	0.17
491	0.17
492	0.15
493	0.14
494	0.15
495	0.18
496	0.18
497	0.18
498	0.18
499	0.18
500	0.19
501	0.2
502	0.15
503	0.1
504	0.09
505	0.09
506	0.12
507	0.13
508	0.12
509	0.14
510	0.15
511	0.17
512	0.19
513	0.19
514	0.17
515	0.18
516	0.23
517	0.2
518	0.23
519	0.23
520	0.23
521	0.23
522	0.24
523	0.25
524	0.21
525	0.2
526	0.16
527	0.17
528	0.14
529	0.18
530	0.17
531	0.14
532	0.13
533	0.13
534	0.13
535	0.11
536	0.12
537	0.11
538	0.11
539	0.12
540	0.13
541	0.14
542	0.14
543	0.14
544	0.17
545	0.21
546	0.24
547	0.27
548	0.34
549	0.41
550	0.5
551	0.56
552	0.6
553	0.62
554	0.7
555	0.73
556	0.74
557	0.76
558	0.7
559	0.67
560	0.64
561	0.57
562	0.5
563	0.52
564	0.44
565	0.4
566	0.44
567	0.47
568	0.48
569	0.51
570	0.54
571	0.53
572	0.57
573	0.59
574	0.58
575	0.56
576	0.51
577	0.49
578	0.44
579	0.36
580	0.31
581	0.23
582	0.16
583	0.11
584	0.1
585	0.07
586	0.05
587	0.07
588	0.08
589	0.09
590	0.14
591	0.16
592	0.18
593	0.22
594	0.26
595	0.25
596	0.27
597	0.29
598	0.27
599	0.28
600	0.27
601	0.24
602	0.2
603	0.2
604	0.17
605	0.15
606	0.11
607	0.09
608	0.08
609	0.08
610	0.08
611	0.08
612	0.13
613	0.13
614	0.15
615	0.16
616	0.18
617	0.22
618	0.26
619	0.26
620	0.22
621	0.24
622	0.22
623	0.21
624	0.19
625	0.15
626	0.12
627	0.11
628	0.11
629	0.09
630	0.1
631	0.1
632	0.11
633	0.13
634	0.19
635	0.26
636	0.3
637	0.33
638	0.4
639	0.46
640	0.48
641	0.53
642	0.55
643	0.58
644	0.59
645	0.61
646	0.59
647	0.58
648	0.62
649	0.63
650	0.59
651	0.55
652	0.57
653	0.61
654	0.61
655	0.59
656	0.53
657	0.48
658	0.45
659	0.41
660	0.36
661	0.27
662	0.21
663	0.19
664	0.2
665	0.17
666	0.14
667	0.13
668	0.14
669	0.18
670	0.18
671	0.19
672	0.25
673	0.27
674	0.34
675	0.4
676	0.46
677	0.53
678	0.62
679	0.69
680	0.72
681	0.81
682	0.84
683	0.88
684	0.88
685	0.86
686	0.86
687	0.85
688	0.8
689	0.71
690	0.61
691	0.54
692	0.49
693	0.45
694	0.4
695	0.32
696	0.29
697	0.34
698	0.33
699	0.33
700	0.35
701	0.34
702	0.33
703	0.35
704	0.34
705	0.29
706	0.34
707	0.34
708	0.3
709	0.29
710	0.25
711	0.27
712	0.26
713	0.27
714	0.25
715	0.28
716	0.3
717	0.38
718	0.45
719	0.48
720	0.51
721	0.52
722	0.54
723	0.52
724	0.57
725	0.57
726	0.53
727	0.47
728	0.49
729	0.58
730	0.55
731	0.54
732	0.53
733	0.5
734	0.53
735	0.54
736	0.51
737	0.48
738	0.5
739	0.53
740	0.45
741	0.42
742	0.34
743	0.31
744	0.27
745	0.2
746	0.17
747	0.11
748	0.11
749	0.08
750	0.1
751	0.12
752	0.13
753	0.15
754	0.17
755	0.2
756	0.27
757	0.35
758	0.43
759	0.5
760	0.54
761	0.58
762	0.67
763	0.74
764	0.75
765	0.72
766	0.68
767	0.64
768	0.68
769	0.64
770	0.56
771	0.51
772	0.47
773	0.45
774	0.4
775	0.35
776	0.3
777	0.31
778	0.29
779	0.27
780	0.24
781	0.22
782	0.24
783	0.29
784	0.3
785	0.31
786	0.39
787	0.42
788	0.48
789	0.49
790	0.51
791	0.48
792	0.49
793	0.47
794	0.41
795	0.42
796	0.38
797	0.35
798	0.33
799	0.39
800	0.36
801	0.35
802	0.37
803	0.4
804	0.41
805	0.45
806	0.54
807	0.56
808	0.61
809	0.66
810	0.65
811	0.64
812	0.63
813	0.61
814	0.55
815	0.53
816	0.52
817	0.46
818	0.41
819	0.34
820	0.3
821	0.28
822	0.24
823	0.17
824	0.14
825	0.14
826	0.14
827	0.15
828	0.15
829	0.18
830	0.23
831	0.25
832	0.25
833	0.27
834	0.33
835	0.39
836	0.43
837	0.5
838	0.53
839	0.56
840	0.58
841	0.57
842	0.58
843	0.62
844	0.66
845	0.67
846	0.69
847	0.7
848	0.74
849	0.75
850	0.75
851	0.75
852	0.77
853	0.77
854	0.78
855	0.8
856	0.83
857	0.89
858	0.88
859	0.87
860	0.86
861	0.86
862	0.84
863	0.85
864	0.84
865	0.82
866	0.81
867	0.78
868	0.69
869	0.63
870	0.53
871	0.43
872	0.36
873	0.31

Q5KMK8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer