Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q5KH30

Protein Details
Accession Q5KH30    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
194-215DSVGSNKKKKTQNNSTRRNGSPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
200-228KKKKTQNNSTRRNGSPNKSVAKGKKAKRG
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 11, cyto 7.5, extr 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013246  SAGA_su_Sgf11  
Gene Ontology GO:0071819  C:DUBm complex  
GO:0000124  C:SAGA complex  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0003713  F:transcription coactivator activity  
GO:0016578  P:histone deubiquitination  
GO:0045893  P:positive regulation of DNA-templated transcription  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
KEGG cne:CNE01470  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08209  Sgf11  
Amino Acid Sequences MPDKKEEIRSVTKIILDEMLDDLILTTTISAHREVKRGRVICGTCGTRCRSHLPLLPNNVASCSKSLHTSADASGSSSRAQTPQCISEAGGRSSGYAVGPEKGTGGSTGVGSGSGKIDSSGNAFFDCLVCSRPIASNRYAPHLAKCMGLNGSIRRVAARSAAVKARLGTGHDRSSPSPYLATGSENGDWGSDADSVGSNKKKKTQNNSTRRNGSPNKSVAKGKKAKRGSSAGTPTPQFPRQTLPPSKLGRPPTNRQTTQSSPVSSPEKSVISVASSGTGVTGSKTLPGARNTLPEIVLGDESSEDADDDY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.36
2 0.31
3 0.23
4 0.2
5 0.17
6 0.14
7 0.11
8 0.1
9 0.09
10 0.07
11 0.07
12 0.06
13 0.04
14 0.05
15 0.08
16 0.09
17 0.12
18 0.18
19 0.22
20 0.3
21 0.33
22 0.4
23 0.48
24 0.48
25 0.49
26 0.51
27 0.49
28 0.45
29 0.51
30 0.47
31 0.4
32 0.44
33 0.46
34 0.41
35 0.42
36 0.44
37 0.41
38 0.43
39 0.46
40 0.48
41 0.51
42 0.54
43 0.54
44 0.5
45 0.46
46 0.42
47 0.38
48 0.31
49 0.24
50 0.2
51 0.17
52 0.17
53 0.19
54 0.18
55 0.18
56 0.19
57 0.18
58 0.19
59 0.18
60 0.17
61 0.17
62 0.16
63 0.14
64 0.14
65 0.14
66 0.15
67 0.16
68 0.18
69 0.21
70 0.22
71 0.22
72 0.22
73 0.22
74 0.24
75 0.27
76 0.24
77 0.22
78 0.2
79 0.19
80 0.18
81 0.18
82 0.11
83 0.1
84 0.1
85 0.1
86 0.1
87 0.1
88 0.1
89 0.09
90 0.09
91 0.08
92 0.08
93 0.07
94 0.06
95 0.06
96 0.06
97 0.06
98 0.06
99 0.06
100 0.06
101 0.05
102 0.05
103 0.06
104 0.06
105 0.06
106 0.09
107 0.09
108 0.09
109 0.09
110 0.09
111 0.08
112 0.08
113 0.08
114 0.07
115 0.07
116 0.07
117 0.07
118 0.08
119 0.12
120 0.15
121 0.19
122 0.2
123 0.24
124 0.25
125 0.3
126 0.32
127 0.29
128 0.27
129 0.27
130 0.26
131 0.21
132 0.21
133 0.17
134 0.14
135 0.15
136 0.15
137 0.13
138 0.14
139 0.14
140 0.13
141 0.12
142 0.12
143 0.11
144 0.11
145 0.12
146 0.11
147 0.13
148 0.15
149 0.15
150 0.16
151 0.15
152 0.15
153 0.13
154 0.14
155 0.16
156 0.17
157 0.19
158 0.21
159 0.22
160 0.22
161 0.26
162 0.25
163 0.22
164 0.18
165 0.16
166 0.16
167 0.14
168 0.14
169 0.11
170 0.12
171 0.12
172 0.12
173 0.12
174 0.1
175 0.09
176 0.08
177 0.08
178 0.06
179 0.06
180 0.06
181 0.07
182 0.08
183 0.13
184 0.18
185 0.2
186 0.22
187 0.3
188 0.37
189 0.44
190 0.54
191 0.61
192 0.66
193 0.73
194 0.82
195 0.82
196 0.82
197 0.76
198 0.75
199 0.72
200 0.66
201 0.64
202 0.6
203 0.56
204 0.52
205 0.57
206 0.54
207 0.56
208 0.59
209 0.59
210 0.62
211 0.65
212 0.66
213 0.65
214 0.66
215 0.6
216 0.6
217 0.6
218 0.54
219 0.51
220 0.48
221 0.44
222 0.44
223 0.44
224 0.37
225 0.31
226 0.33
227 0.35
228 0.44
229 0.47
230 0.45
231 0.49
232 0.52
233 0.56
234 0.57
235 0.59
236 0.59
237 0.6
238 0.65
239 0.67
240 0.72
241 0.7
242 0.67
243 0.67
244 0.63
245 0.63
246 0.59
247 0.52
248 0.43
249 0.46
250 0.46
251 0.38
252 0.35
253 0.31
254 0.27
255 0.25
256 0.25
257 0.2
258 0.17
259 0.18
260 0.15
261 0.13
262 0.11
263 0.1
264 0.1
265 0.09
266 0.07
267 0.07
268 0.08
269 0.07
270 0.09
271 0.11
272 0.15
273 0.2
274 0.22
275 0.27
276 0.28
277 0.33
278 0.34
279 0.35
280 0.31
281 0.26
282 0.25
283 0.22
284 0.2
285 0.15
286 0.13
287 0.1
288 0.11
289 0.11
290 0.09