Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0F4ZDT4

Protein Details
Accession A0A0F4ZDT4    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
193-213FTPTSGKSIRQRERKTKQTIDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
24-91PAKKEAPKAAAPARRSGNEAAFRDKNAGRENNRGKTTEDGSAPRRSRGGARGGRGSRFPREKDDRHSK
223-271RPRAEGRPRGGAGARGGFRGEGRGRGGPRGSGPRGGARGGAAPAAPRGA
Subcellular Location(s) nucl 9.5, mito 9, cyto_nucl 9, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039764  HABP4/SERBP1  
IPR006861  HABP4_PAIRBP1-bd  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Amino Acid Sequences MSVVSKNPFDLLGDGESPAPAAAPAKKEAPKAAAPARRSGNEAAFRDKNAGRENNRGKTTEDGSAPRRSRGGARGGRGSRFPREKDDRHSKSVGGPGEKQADKAWGANEGNAELKDEIAGEEIAAADKNEDEAVEAAEPEEKVKSFDEFLAEKAEKKLALGDNLSLRQANEGSKGNKKWETAKQLEKEETDYFTPTSGKSIRQRERKTKQTIDIEPRFVEAERPRAEGRPRGGAGARGGFRGEGRGRGGPRGSGPRGGARGGAAPAAPRGAKQSAPINTSDESAFPSLGA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.16
3 0.15
4 0.14
5 0.12
6 0.09
7 0.07
8 0.09
9 0.12
10 0.15
11 0.18
12 0.25
13 0.29
14 0.32
15 0.35
16 0.37
17 0.37
18 0.41
19 0.47
20 0.47
21 0.45
22 0.49
23 0.51
24 0.47
25 0.48
26 0.44
27 0.43
28 0.44
29 0.45
30 0.46
31 0.42
32 0.41
33 0.43
34 0.42
35 0.4
36 0.39
37 0.45
38 0.42
39 0.5
40 0.58
41 0.61
42 0.62
43 0.58
44 0.52
45 0.49
46 0.47
47 0.42
48 0.37
49 0.34
50 0.35
51 0.43
52 0.42
53 0.39
54 0.37
55 0.34
56 0.35
57 0.34
58 0.4
59 0.37
60 0.39
61 0.46
62 0.48
63 0.49
64 0.5
65 0.48
66 0.47
67 0.48
68 0.47
69 0.47
70 0.53
71 0.56
72 0.6
73 0.67
74 0.64
75 0.63
76 0.62
77 0.53
78 0.49
79 0.5
80 0.44
81 0.36
82 0.32
83 0.3
84 0.35
85 0.34
86 0.31
87 0.26
88 0.25
89 0.22
90 0.22
91 0.18
92 0.17
93 0.17
94 0.17
95 0.17
96 0.15
97 0.15
98 0.14
99 0.15
100 0.09
101 0.08
102 0.07
103 0.07
104 0.06
105 0.06
106 0.06
107 0.04
108 0.04
109 0.04
110 0.04
111 0.04
112 0.04
113 0.03
114 0.03
115 0.04
116 0.04
117 0.04
118 0.04
119 0.04
120 0.05
121 0.05
122 0.05
123 0.04
124 0.05
125 0.05
126 0.05
127 0.06
128 0.05
129 0.07
130 0.08
131 0.08
132 0.08
133 0.09
134 0.11
135 0.11
136 0.12
137 0.15
138 0.15
139 0.15
140 0.15
141 0.16
142 0.13
143 0.13
144 0.16
145 0.12
146 0.14
147 0.13
148 0.14
149 0.16
150 0.16
151 0.17
152 0.13
153 0.12
154 0.11
155 0.12
156 0.11
157 0.11
158 0.15
159 0.18
160 0.24
161 0.26
162 0.3
163 0.32
164 0.33
165 0.36
166 0.4
167 0.45
168 0.45
169 0.52
170 0.52
171 0.53
172 0.54
173 0.48
174 0.45
175 0.38
176 0.33
177 0.26
178 0.23
179 0.18
180 0.17
181 0.17
182 0.13
183 0.16
184 0.15
185 0.2
186 0.27
187 0.37
188 0.45
189 0.55
190 0.63
191 0.7
192 0.77
193 0.81
194 0.82
195 0.79
196 0.78
197 0.77
198 0.76
199 0.75
200 0.71
201 0.65
202 0.56
203 0.5
204 0.42
205 0.34
206 0.32
207 0.26
208 0.29
209 0.28
210 0.31
211 0.32
212 0.36
213 0.41
214 0.41
215 0.41
216 0.41
217 0.39
218 0.38
219 0.38
220 0.36
221 0.35
222 0.34
223 0.31
224 0.24
225 0.24
226 0.21
227 0.2
228 0.24
229 0.22
230 0.19
231 0.22
232 0.27
233 0.29
234 0.33
235 0.34
236 0.3
237 0.34
238 0.39
239 0.38
240 0.37
241 0.38
242 0.39
243 0.4
244 0.38
245 0.33
246 0.26
247 0.26
248 0.22
249 0.2
250 0.15
251 0.13
252 0.14
253 0.16
254 0.15
255 0.13
256 0.17
257 0.19
258 0.2
259 0.23
260 0.31
261 0.34
262 0.36
263 0.37
264 0.36
265 0.34
266 0.35
267 0.31
268 0.23
269 0.21
270 0.2