FuNGI

P0CS56

Protein Details

Accession

P0CS56

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
37-65	GSSPAPTSNKTKPKPKPAPKKRKAAAVIA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
46-62	KTKPKPKPAPKKRKAAA
71-72	RR

Subcellular Location(s)

nucl 20, cyto 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR015943 WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf IPR001680 WD40_repeat IPR019775 WD40_repeat_CS IPR036322 WD40_repeat_dom_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0006974 P:DNA damage response GO:2000001 P:regulation of DNA damage checkpoint
KEGG	cne:CNI03070 -
PROSITE	View protein in PROSITE PS00678 WD_REPEATS_1

Amino Acid Sequences

MDEETAYELERQKTIAENRALLDSLGLDPAGASSPFGSSPAPTSNKTKPKPKPAPKKRKAAAVIAVDEGPRRRSGRIAGLEADGDAFKAKVEEEEKEREILRVVSRKEREKVMDVGKMVEDTPEDEIKDMEKYLQSIAELSNPRTYPAGTVSAREAYADSDTVPSEVQRLKDAFKDMSLKGNTKVTNERVFSMCVHPEKTKTLVLVGDKYGQLGIWDALGPPMEKPENEDDTSGLLRAEGEDEYQEGRVWRVQAHAKNSISCMKVDPVNGSGLFSTAYDCSLRHLSFSTLQSTELFSFQDEDLLINHFDLLPSAQEAWMVDKNGGISHWDTRESKRESGRRRWVVQEEGRGAKLGGVSVNPLMPHLICTAGNDQHVRIWDTRHLFSISSNLVPSAAAIEEEEEGTSTLSGQSSSLPHDTHPTRESDYSTVTSYLASPRGKGLMRAKWQHGKSCSSAYWDPWGRRILTTSYDDHLRVFNIDPGSSLVDDRAVGSLLQPNGFKPTKVVRHNCQTGRWLTILRAQWSLNMEYMPHFTVGNMKRTLDVVSATGEKIVGLWTDDVTAVPTVTASHPNIVDRVVGGNTSGRIQLWSSGDHI

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.34
2	0.38
3	0.38
4	0.38
5	0.39
6	0.41
7	0.39
8	0.31
9	0.26
10	0.18
11	0.15
12	0.13
13	0.11
14	0.08
15	0.07
16	0.08
17	0.1
18	0.08
19	0.08
20	0.07
21	0.09
22	0.09
23	0.11
24	0.11
25	0.1
26	0.14
27	0.21
28	0.25
29	0.27
30	0.34
31	0.43
32	0.53
33	0.6
34	0.66
35	0.68
36	0.75
37	0.83
38	0.88
39	0.89
40	0.9
41	0.94
42	0.93
43	0.94
44	0.88
45	0.87
46	0.81
47	0.77
48	0.74
49	0.69
50	0.62
51	0.52
52	0.48
53	0.39
54	0.37
55	0.31
56	0.25
57	0.24
58	0.24
59	0.23
60	0.26
61	0.31
62	0.37
63	0.41
64	0.42
65	0.4
66	0.39
67	0.37
68	0.33
69	0.29
70	0.19
71	0.13
72	0.1
73	0.07
74	0.06
75	0.07
76	0.07
77	0.11
78	0.13
79	0.18
80	0.23
81	0.29
82	0.31
83	0.33
84	0.33
85	0.29
86	0.28
87	0.28
88	0.3
89	0.31
90	0.33
91	0.4
92	0.46
93	0.53
94	0.54
95	0.57
96	0.54
97	0.51
98	0.55
99	0.51
100	0.49
101	0.43
102	0.41
103	0.35
104	0.31
105	0.26
106	0.2
107	0.14
108	0.11
109	0.14
110	0.14
111	0.13
112	0.13
113	0.13
114	0.14
115	0.14
116	0.13
117	0.12
118	0.12
119	0.12
120	0.13
121	0.13
122	0.12
123	0.12
124	0.13
125	0.17
126	0.19
127	0.2
128	0.25
129	0.24
130	0.25
131	0.25
132	0.24
133	0.19
134	0.19
135	0.24
136	0.19
137	0.2
138	0.22
139	0.23
140	0.22
141	0.21
142	0.18
143	0.12
144	0.13
145	0.12
146	0.1
147	0.09
148	0.1
149	0.1
150	0.1
151	0.08
152	0.11
153	0.13
154	0.14
155	0.17
156	0.18
157	0.2
158	0.23
159	0.26
160	0.23
161	0.23
162	0.27
163	0.24
164	0.3
165	0.32
166	0.3
167	0.29
168	0.34
169	0.32
170	0.31
171	0.36
172	0.33
173	0.37
174	0.36
175	0.36
176	0.32
177	0.32
178	0.31
179	0.28
180	0.28
181	0.24
182	0.26
183	0.25
184	0.26
185	0.27
186	0.28
187	0.26
188	0.22
189	0.21
190	0.21
191	0.21
192	0.21
193	0.2
194	0.19
195	0.17
196	0.17
197	0.15
198	0.12
199	0.1
200	0.09
201	0.08
202	0.05
203	0.05
204	0.05
205	0.06
206	0.07
207	0.07
208	0.06
209	0.09
210	0.1
211	0.09
212	0.13
213	0.18
214	0.22
215	0.22
216	0.23
217	0.2
218	0.21
219	0.21
220	0.18
221	0.12
222	0.07
223	0.07
224	0.06
225	0.07
226	0.05
227	0.05
228	0.05
229	0.06
230	0.07
231	0.07
232	0.08
233	0.07
234	0.08
235	0.09
236	0.1
237	0.1
238	0.13
239	0.19
240	0.23
241	0.27
242	0.33
243	0.32
244	0.32
245	0.34
246	0.35
247	0.29
248	0.25
249	0.23
250	0.17
251	0.19
252	0.18
253	0.18
254	0.14
255	0.15
256	0.14
257	0.13
258	0.11
259	0.09
260	0.09
261	0.07
262	0.07
263	0.05
264	0.06
265	0.06
266	0.06
267	0.09
268	0.12
269	0.12
270	0.12
271	0.12
272	0.13
273	0.17
274	0.18
275	0.19
276	0.16
277	0.16
278	0.16
279	0.16
280	0.15
281	0.12
282	0.11
283	0.08
284	0.09
285	0.08
286	0.09
287	0.07
288	0.07
289	0.07
290	0.08
291	0.08
292	0.06
293	0.06
294	0.05
295	0.05
296	0.05
297	0.05
298	0.04
299	0.04
300	0.05
301	0.04
302	0.05
303	0.05
304	0.08
305	0.09
306	0.1
307	0.09
308	0.09
309	0.1
310	0.09
311	0.09
312	0.08
313	0.08
314	0.1
315	0.11
316	0.14
317	0.16
318	0.18
319	0.27
320	0.29
321	0.33
322	0.38
323	0.45
324	0.5
325	0.58
326	0.66
327	0.64
328	0.63
329	0.64
330	0.6
331	0.6
332	0.56
333	0.52
334	0.46
335	0.41
336	0.38
337	0.33
338	0.28
339	0.21
340	0.17
341	0.12
342	0.08
343	0.06
344	0.07
345	0.07
346	0.08
347	0.07
348	0.07
349	0.07
350	0.06
351	0.07
352	0.07
353	0.08
354	0.07
355	0.09
356	0.13
357	0.14
358	0.16
359	0.16
360	0.16
361	0.16
362	0.18
363	0.18
364	0.16
365	0.17
366	0.2
367	0.24
368	0.24
369	0.25
370	0.24
371	0.22
372	0.21
373	0.23
374	0.19
375	0.16
376	0.15
377	0.13
378	0.12
379	0.11
380	0.11
381	0.07
382	0.06
383	0.05
384	0.05
385	0.05
386	0.06
387	0.06
388	0.06
389	0.05
390	0.05
391	0.05
392	0.05
393	0.05
394	0.05
395	0.05
396	0.05
397	0.05
398	0.07
399	0.08
400	0.11
401	0.13
402	0.13
403	0.13
404	0.21
405	0.22
406	0.25
407	0.26
408	0.26
409	0.27
410	0.29
411	0.31
412	0.25
413	0.27
414	0.24
415	0.24
416	0.21
417	0.18
418	0.17
419	0.15
420	0.16
421	0.19
422	0.17
423	0.17
424	0.17
425	0.22
426	0.22
427	0.27
428	0.32
429	0.34
430	0.42
431	0.48
432	0.53
433	0.58
434	0.6
435	0.62
436	0.58
437	0.55
438	0.49
439	0.48
440	0.43
441	0.41
442	0.4
443	0.34
444	0.39
445	0.4
446	0.38
447	0.38
448	0.41
449	0.36
450	0.34
451	0.36
452	0.29
453	0.28
454	0.3
455	0.28
456	0.27
457	0.29
458	0.28
459	0.26
460	0.24
461	0.2
462	0.19
463	0.17
464	0.19
465	0.17
466	0.17
467	0.17
468	0.17
469	0.18
470	0.17
471	0.16
472	0.11
473	0.11
474	0.11
475	0.11
476	0.1
477	0.08
478	0.07
479	0.09
480	0.14
481	0.14
482	0.16
483	0.16
484	0.16
485	0.23
486	0.24
487	0.23
488	0.23
489	0.31
490	0.38
491	0.48
492	0.55
493	0.56
494	0.65
495	0.74
496	0.73
497	0.68
498	0.66
499	0.59
500	0.55
501	0.49
502	0.4
503	0.33
504	0.36
505	0.37
506	0.33
507	0.33
508	0.29
509	0.3
510	0.32
511	0.32
512	0.26
513	0.21
514	0.19
515	0.18
516	0.21
517	0.19
518	0.16
519	0.14
520	0.13
521	0.22
522	0.26
523	0.31
524	0.31
525	0.3
526	0.3
527	0.31
528	0.33
529	0.25
530	0.22
531	0.16
532	0.17
533	0.18
534	0.17
535	0.16
536	0.14
537	0.12
538	0.11
539	0.11
540	0.08
541	0.08
542	0.09
543	0.09
544	0.1
545	0.11
546	0.1
547	0.11
548	0.11
549	0.09
550	0.08
551	0.08
552	0.09
553	0.11
554	0.17
555	0.17
556	0.2
557	0.22
558	0.24
559	0.25
560	0.24
561	0.22
562	0.17
563	0.18
564	0.15
565	0.13
566	0.13
567	0.15
568	0.15
569	0.16
570	0.16
571	0.14
572	0.15
573	0.16
574	0.2
575	0.2

P0CS56

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer