Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q5KHJ0

Protein Details
Accession Q5KHJ0    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
127-149GTSSSLQQRHKRQRPSVNDPDFDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
170-178KKERARVKK
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto_nucl 11, mito 5, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR024738  Hfi1/Tada1  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0000124  C:SAGA complex  
GO:0003713  F:transcription coactivator activity  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
KEGG cne:CND06310  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF12767  SAGA-Tad1  
Amino Acid Sequences MSSVPSPHHPPSRPVLQPTSTNTLHPHPPVASSSTHMYQNHTLPRRNGIVSSQMRVDIHAIKQELHDVLGEAGLPYWKSLNAYLVGQLGRAELEDMVRGWLKGDHLHLHNKLLSSLLTNASIPTHDGTSSSLQQRHKRQRPSVNDPDFDVDDTLIESKRRVEGWVMNLGKKERARVKKALAGAAEKGVLGAAAAAEKDMWGGVGEKRWSPYTSNSLIPPLALPTRHLPSSHQLALRLSQFAKLHDLSIPSTSSSTAAADDIGEFMAVGMDAHMGDILHGVVHLTGRDRPGETTIRVPLGKKAAGPTFGAGRESMQQLDNDQNQNPSTSTSTSRGNIPPPDLETFLHLLTLHPNLHPNISPAIHRLMTAHTLAELEAANPYPYPNTYANANINVNVNGNAPTAVLMPSSSELGAGAAPSTETGSVSKIPSQPPLPHPKSKSTAAPGPGPVPVSSIPGRQPPRSEIIASQLLANGLLKLDKAGGHAGRDGKDGKDGRDGEDGKKERKHNLHWKYEDPALLLRDVLG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.6
2 0.6
3 0.55
4 0.58
5 0.59
6 0.59
7 0.5
8 0.47
9 0.44
10 0.42
11 0.44
12 0.4
13 0.38
14 0.31
15 0.33
16 0.33
17 0.32
18 0.29
19 0.26
20 0.29
21 0.28
22 0.33
23 0.32
24 0.35
25 0.37
26 0.42
27 0.49
28 0.5
29 0.54
30 0.5
31 0.56
32 0.56
33 0.52
34 0.47
35 0.4
36 0.43
37 0.4
38 0.41
39 0.36
40 0.33
41 0.32
42 0.31
43 0.32
44 0.26
45 0.25
46 0.27
47 0.27
48 0.25
49 0.25
50 0.28
51 0.25
52 0.21
53 0.19
54 0.14
55 0.13
56 0.12
57 0.11
58 0.07
59 0.07
60 0.08
61 0.08
62 0.08
63 0.08
64 0.09
65 0.11
66 0.12
67 0.14
68 0.15
69 0.16
70 0.16
71 0.19
72 0.18
73 0.17
74 0.15
75 0.13
76 0.11
77 0.1
78 0.09
79 0.07
80 0.07
81 0.08
82 0.08
83 0.1
84 0.11
85 0.1
86 0.11
87 0.12
88 0.13
89 0.15
90 0.18
91 0.22
92 0.25
93 0.33
94 0.34
95 0.36
96 0.37
97 0.34
98 0.31
99 0.26
100 0.22
101 0.17
102 0.17
103 0.15
104 0.14
105 0.13
106 0.13
107 0.13
108 0.13
109 0.12
110 0.11
111 0.1
112 0.09
113 0.1
114 0.12
115 0.15
116 0.2
117 0.25
118 0.29
119 0.35
120 0.43
121 0.53
122 0.62
123 0.67
124 0.71
125 0.75
126 0.8
127 0.83
128 0.85
129 0.85
130 0.8
131 0.73
132 0.65
133 0.59
134 0.49
135 0.4
136 0.31
137 0.2
138 0.13
139 0.12
140 0.12
141 0.1
142 0.09
143 0.09
144 0.11
145 0.13
146 0.13
147 0.14
148 0.16
149 0.19
150 0.23
151 0.32
152 0.32
153 0.31
154 0.33
155 0.33
156 0.35
157 0.32
158 0.35
159 0.35
160 0.42
161 0.47
162 0.51
163 0.54
164 0.54
165 0.55
166 0.52
167 0.45
168 0.38
169 0.32
170 0.26
171 0.22
172 0.16
173 0.13
174 0.09
175 0.07
176 0.05
177 0.04
178 0.03
179 0.03
180 0.03
181 0.03
182 0.03
183 0.03
184 0.03
185 0.03
186 0.03
187 0.03
188 0.05
189 0.06
190 0.1
191 0.11
192 0.12
193 0.14
194 0.16
195 0.17
196 0.18
197 0.21
198 0.24
199 0.25
200 0.26
201 0.25
202 0.25
203 0.24
204 0.22
205 0.18
206 0.13
207 0.12
208 0.11
209 0.12
210 0.14
211 0.16
212 0.17
213 0.17
214 0.17
215 0.2
216 0.26
217 0.28
218 0.26
219 0.24
220 0.24
221 0.26
222 0.25
223 0.22
224 0.17
225 0.17
226 0.16
227 0.16
228 0.19
229 0.17
230 0.17
231 0.16
232 0.17
233 0.14
234 0.14
235 0.14
236 0.1
237 0.1
238 0.1
239 0.09
240 0.08
241 0.07
242 0.06
243 0.06
244 0.06
245 0.05
246 0.05
247 0.05
248 0.04
249 0.03
250 0.03
251 0.03
252 0.03
253 0.02
254 0.02
255 0.02
256 0.02
257 0.02
258 0.02
259 0.03
260 0.03
261 0.03
262 0.03
263 0.03
264 0.03
265 0.03
266 0.03
267 0.03
268 0.03
269 0.04
270 0.05
271 0.06
272 0.08
273 0.09
274 0.1
275 0.1
276 0.14
277 0.17
278 0.17
279 0.18
280 0.19
281 0.2
282 0.2
283 0.2
284 0.2
285 0.2
286 0.2
287 0.18
288 0.2
289 0.19
290 0.2
291 0.2
292 0.17
293 0.17
294 0.16
295 0.16
296 0.12
297 0.12
298 0.12
299 0.13
300 0.13
301 0.11
302 0.11
303 0.12
304 0.17
305 0.2
306 0.21
307 0.21
308 0.22
309 0.21
310 0.22
311 0.21
312 0.17
313 0.15
314 0.15
315 0.17
316 0.17
317 0.2
318 0.2
319 0.25
320 0.25
321 0.28
322 0.28
323 0.27
324 0.26
325 0.26
326 0.27
327 0.24
328 0.21
329 0.19
330 0.19
331 0.16
332 0.16
333 0.13
334 0.11
335 0.12
336 0.15
337 0.13
338 0.12
339 0.15
340 0.15
341 0.17
342 0.17
343 0.16
344 0.17
345 0.17
346 0.17
347 0.16
348 0.19
349 0.18
350 0.17
351 0.17
352 0.15
353 0.17
354 0.16
355 0.14
356 0.11
357 0.11
358 0.1
359 0.11
360 0.08
361 0.06
362 0.07
363 0.07
364 0.07
365 0.07
366 0.08
367 0.08
368 0.08
369 0.12
370 0.13
371 0.14
372 0.16
373 0.2
374 0.23
375 0.26
376 0.26
377 0.23
378 0.23
379 0.23
380 0.22
381 0.18
382 0.16
383 0.13
384 0.13
385 0.11
386 0.09
387 0.09
388 0.09
389 0.08
390 0.08
391 0.06
392 0.07
393 0.08
394 0.09
395 0.08
396 0.07
397 0.07
398 0.07
399 0.07
400 0.06
401 0.05
402 0.04
403 0.04
404 0.05
405 0.05
406 0.05
407 0.06
408 0.07
409 0.09
410 0.11
411 0.13
412 0.18
413 0.22
414 0.23
415 0.28
416 0.32
417 0.36
418 0.42
419 0.52
420 0.54
421 0.58
422 0.6
423 0.63
424 0.64
425 0.62
426 0.61
427 0.57
428 0.57
429 0.52
430 0.52
431 0.46
432 0.42
433 0.39
434 0.34
435 0.27
436 0.23
437 0.2
438 0.21
439 0.2
440 0.22
441 0.24
442 0.31
443 0.36
444 0.37
445 0.41
446 0.4
447 0.44
448 0.44
449 0.43
450 0.36
451 0.37
452 0.38
453 0.34
454 0.3
455 0.25
456 0.22
457 0.2
458 0.19
459 0.12
460 0.08
461 0.09
462 0.08
463 0.07
464 0.09
465 0.09
466 0.11
467 0.17
468 0.18
469 0.2
470 0.24
471 0.28
472 0.28
473 0.32
474 0.32
475 0.26
476 0.33
477 0.34
478 0.33
479 0.37
480 0.37
481 0.37
482 0.44
483 0.46
484 0.42
485 0.49
486 0.52
487 0.5
488 0.57
489 0.58
490 0.59
491 0.65
492 0.71
493 0.72
494 0.76
495 0.79
496 0.78
497 0.78
498 0.73
499 0.69
500 0.61
501 0.53
502 0.48
503 0.39
504 0.33