Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P0CM90

Protein Details
Accession P0CM90    Localization Confidence Low Confidence Score 9.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
417-443QQGLGQQRRGGKRREEKKEKEDKEEQEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
424-436RRGGKRREEKKEK
Subcellular Location(s) cyto 15, cyto_nucl 11.166, cyto_mito 10.166, nucl 6, mito_nucl 5.666, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045237  COPS7/eIF3m  
IPR027528  eIF3m  
IPR040750  eIF3m_C_helix  
IPR000717  PCI_dom  
Gene Ontology GO:0016282  C:eukaryotic 43S preinitiation complex  
GO:0033290  C:eukaryotic 48S preinitiation complex  
GO:0005852  C:eukaryotic translation initiation factor 3 complex  
GO:0071541  C:eukaryotic translation initiation factor 3 complex, eIF3m  
GO:0003743  F:translation initiation factor activity  
GO:0002183  P:cytoplasmic translational initiation  
GO:0001732  P:formation of cytoplasmic translation initiation complex  
KEGG cne:CNA04920  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF18005  eIF3m_C_helix  
PF01399  PCI  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50250  PCI  
Amino Acid Sequences MADCITIAPELSFKDQITELAAHLSRSLPNADNQVAVKEFVQGYEAQVDTEEGRGDVEDAKKKQVVKSIVDKFVELKGGLEAAKESEVESSHFLLQHVLSTTFDQASEEYAQAVKDVNEAVKKGAQETTKITRAEAASRVLKNTYNFLPSNSPIRPSTLLSLMSLLASTLDLSALPLPTSTLLPALSSWSIPSSEKVSFLTTASGLYQSTGNLAKALELLTLALKESVEPTVVERAVLLALAVPNKFELDDVLAVQGVKEQLGKVQGVVELFEGDEVEAIEKGKKWTAENVSLIEGAGIPGFTSETVLRKLRLIALVALCTKSETRQLEYAPIAKALAIEESEVETWVIDAVRSKLIVARISQPQSLIRIHSISSITASSRRFGPSEWQLLEKRLEQWKKSVNEARQVVEEAETVAQQGLGQQRRGGKRREEKKEKEDKEEQE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.2
3 0.21
4 0.23
5 0.21
6 0.17
7 0.21
8 0.22
9 0.19
10 0.2
11 0.21
12 0.18
13 0.2
14 0.23
15 0.19
16 0.22
17 0.27
18 0.27
19 0.28
20 0.27
21 0.28
22 0.25
23 0.24
24 0.21
25 0.2
26 0.19
27 0.16
28 0.17
29 0.14
30 0.15
31 0.18
32 0.18
33 0.13
34 0.14
35 0.15
36 0.14
37 0.14
38 0.13
39 0.08
40 0.09
41 0.09
42 0.1
43 0.13
44 0.19
45 0.26
46 0.27
47 0.33
48 0.36
49 0.39
50 0.41
51 0.44
52 0.44
53 0.43
54 0.51
55 0.54
56 0.58
57 0.55
58 0.52
59 0.46
60 0.42
61 0.38
62 0.28
63 0.2
64 0.14
65 0.15
66 0.14
67 0.13
68 0.11
69 0.09
70 0.1
71 0.09
72 0.09
73 0.09
74 0.1
75 0.11
76 0.13
77 0.14
78 0.15
79 0.16
80 0.16
81 0.16
82 0.15
83 0.16
84 0.16
85 0.14
86 0.14
87 0.14
88 0.16
89 0.14
90 0.14
91 0.12
92 0.1
93 0.13
94 0.13
95 0.12
96 0.11
97 0.11
98 0.11
99 0.11
100 0.12
101 0.09
102 0.08
103 0.09
104 0.11
105 0.13
106 0.13
107 0.15
108 0.16
109 0.16
110 0.17
111 0.2
112 0.19
113 0.2
114 0.25
115 0.29
116 0.33
117 0.33
118 0.31
119 0.31
120 0.31
121 0.32
122 0.28
123 0.27
124 0.27
125 0.28
126 0.29
127 0.27
128 0.28
129 0.26
130 0.27
131 0.25
132 0.24
133 0.23
134 0.24
135 0.26
136 0.25
137 0.3
138 0.27
139 0.28
140 0.23
141 0.26
142 0.26
143 0.23
144 0.24
145 0.21
146 0.2
147 0.17
148 0.18
149 0.14
150 0.12
151 0.11
152 0.08
153 0.05
154 0.04
155 0.04
156 0.03
157 0.03
158 0.03
159 0.04
160 0.05
161 0.05
162 0.05
163 0.05
164 0.05
165 0.06
166 0.06
167 0.06
168 0.06
169 0.06
170 0.06
171 0.06
172 0.08
173 0.07
174 0.07
175 0.07
176 0.07
177 0.08
178 0.09
179 0.1
180 0.11
181 0.11
182 0.12
183 0.13
184 0.14
185 0.13
186 0.13
187 0.13
188 0.09
189 0.09
190 0.09
191 0.08
192 0.07
193 0.07
194 0.07
195 0.06
196 0.07
197 0.08
198 0.07
199 0.07
200 0.07
201 0.07
202 0.07
203 0.07
204 0.05
205 0.04
206 0.05
207 0.04
208 0.04
209 0.04
210 0.04
211 0.04
212 0.04
213 0.05
214 0.05
215 0.05
216 0.05
217 0.06
218 0.09
219 0.09
220 0.09
221 0.08
222 0.08
223 0.07
224 0.07
225 0.06
226 0.03
227 0.04
228 0.06
229 0.06
230 0.06
231 0.06
232 0.06
233 0.06
234 0.06
235 0.05
236 0.06
237 0.06
238 0.06
239 0.06
240 0.07
241 0.06
242 0.06
243 0.07
244 0.06
245 0.05
246 0.06
247 0.06
248 0.07
249 0.09
250 0.09
251 0.08
252 0.09
253 0.1
254 0.09
255 0.1
256 0.08
257 0.06
258 0.06
259 0.06
260 0.05
261 0.04
262 0.04
263 0.04
264 0.04
265 0.04
266 0.05
267 0.06
268 0.08
269 0.09
270 0.11
271 0.13
272 0.14
273 0.21
274 0.26
275 0.3
276 0.3
277 0.3
278 0.29
279 0.27
280 0.26
281 0.19
282 0.13
283 0.08
284 0.06
285 0.05
286 0.03
287 0.03
288 0.04
289 0.03
290 0.05
291 0.06
292 0.09
293 0.13
294 0.15
295 0.16
296 0.17
297 0.18
298 0.19
299 0.2
300 0.18
301 0.18
302 0.17
303 0.19
304 0.19
305 0.18
306 0.16
307 0.15
308 0.15
309 0.13
310 0.19
311 0.19
312 0.22
313 0.25
314 0.26
315 0.29
316 0.31
317 0.33
318 0.26
319 0.24
320 0.2
321 0.17
322 0.16
323 0.12
324 0.11
325 0.07
326 0.07
327 0.07
328 0.08
329 0.09
330 0.09
331 0.08
332 0.07
333 0.07
334 0.07
335 0.07
336 0.06
337 0.08
338 0.09
339 0.11
340 0.11
341 0.11
342 0.13
343 0.17
344 0.19
345 0.19
346 0.23
347 0.29
348 0.32
349 0.33
350 0.32
351 0.3
352 0.32
353 0.32
354 0.29
355 0.24
356 0.22
357 0.22
358 0.23
359 0.22
360 0.19
361 0.19
362 0.17
363 0.16
364 0.2
365 0.21
366 0.19
367 0.21
368 0.23
369 0.23
370 0.23
371 0.3
372 0.32
373 0.39
374 0.39
375 0.42
376 0.41
377 0.44
378 0.46
379 0.4
380 0.39
381 0.41
382 0.47
383 0.44
384 0.5
385 0.55
386 0.55
387 0.62
388 0.64
389 0.6
390 0.62
391 0.63
392 0.58
393 0.52
394 0.5
395 0.42
396 0.34
397 0.28
398 0.2
399 0.17
400 0.14
401 0.12
402 0.1
403 0.09
404 0.08
405 0.12
406 0.19
407 0.23
408 0.25
409 0.28
410 0.36
411 0.46
412 0.54
413 0.57
414 0.6
415 0.65
416 0.75
417 0.82
418 0.85
419 0.85
420 0.88
421 0.92
422 0.87
423 0.86