FuNGI

Q5KKN8

Protein Details

Accession

Q5KKN8

Localization Confidence

Low

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
175-194	ALSSVRKKRKPAPGYKKVDD	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
180-187	RKKRKPAP

Subcellular Location(s)

cyto 18.5, cyto_mito 12.833, cyto_nucl 11.666, mito 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR013915 Pre-mRNA_splic_Prp19 IPR038959 Prp19 IPR003613 Ubox_domain IPR015943 WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf IPR001680 WD40_repeat IPR036322 WD40_repeat_dom_sf IPR013083 Znf_RING/FYVE/PHD
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0000974 C:Prp19 complex GO:0071006 C:U2-type catalytic step 1 spliceosome GO:0061630 F:ubiquitin protein ligase activity GO:0004842 F:ubiquitin-protein transferase activity GO:0006281 P:DNA repair GO:0000398 P:mRNA splicing, via spliceosome GO:0070534 P:protein K63-linked ubiquitination
KEGG	cne:CNC02380 -
Pfam	View protein in Pfam PF08606 Prp19 PF00400 WD40
PROSITE	View protein in PROSITE PS51698 U_BOX PS50082 WD_REPEATS_2 PS50294 WD_REPEATS_REGION
CDD	cd16656 RING-Ubox_PRP19 cd00200 WD40

Amino Acid Sequences

MFFCAISGSPPTVPVVSKTSGAVYEKALIERYIEENGTDPISGEALTKDDLVDVKAKPSTIPPRPANQTSIPALLTALQSEYDSIMLESLEIKKAFQSSRQELANALYREDAATRVIARLMKERDEARQALSSIQSTIGFQPPAAAEEPAADVEMAQEGALPADVEAKVMETNQALSSVRKKRKPAPGYKKVDDIKSYTQINHVPSLHATKPAGITALDLAQDGNTVVTGGADKAVQVFDLEASKVLGTLKGHTKAVTHVAFREHEGEPRLAISASADKTVRVWGEDDGKWGARATLSGHKGEINGLAVHPSGSYVAAGSADSTWSLYDLSTAKEVTKYTAIPGIDGSFAYTSFAVHPDGVLHGGGTKDGAVRVWDARQSNSLAATLSSHAKDLSTLSFSENGYYLATSSISGPPTVKIFDLRKLDILSSWTLPEENTIREVKFDPSAQFLSVVGTDARVYANKTWQELVTFEENAGDLVGARFGKLGSEIVLAGMDRTLRVLGKKE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.2
2	0.22
3	0.21
4	0.22
5	0.22
6	0.22
7	0.25
8	0.26
9	0.25
10	0.21
11	0.25
12	0.25
13	0.26
14	0.26
15	0.22
16	0.21
17	0.22
18	0.22
19	0.2
20	0.19
21	0.18
22	0.18
23	0.19
24	0.18
25	0.15
26	0.13
27	0.11
28	0.11
29	0.11
30	0.1
31	0.09
32	0.1
33	0.11
34	0.1
35	0.1
36	0.11
37	0.11
38	0.12
39	0.16
40	0.15
41	0.18
42	0.2
43	0.2
44	0.2
45	0.28
46	0.36
47	0.4
48	0.48
49	0.49
50	0.56
51	0.63
52	0.66
53	0.63
54	0.57
55	0.54
56	0.47
57	0.44
58	0.36
59	0.29
60	0.25
61	0.22
62	0.18
63	0.13
64	0.11
65	0.09
66	0.09
67	0.09
68	0.09
69	0.08
70	0.08
71	0.07
72	0.07
73	0.06
74	0.06
75	0.08
76	0.09
77	0.14
78	0.13
79	0.14
80	0.15
81	0.2
82	0.21
83	0.26
84	0.33
85	0.34
86	0.4
87	0.41
88	0.39
89	0.36
90	0.38
91	0.39
92	0.31
93	0.26
94	0.21
95	0.19
96	0.19
97	0.19
98	0.17
99	0.09
100	0.1
101	0.1
102	0.1
103	0.13
104	0.14
105	0.15
106	0.22
107	0.24
108	0.26
109	0.29
110	0.3
111	0.32
112	0.36
113	0.36
114	0.31
115	0.31
116	0.28
117	0.26
118	0.26
119	0.22
120	0.17
121	0.17
122	0.15
123	0.13
124	0.14
125	0.16
126	0.14
127	0.13
128	0.14
129	0.13
130	0.15
131	0.15
132	0.13
133	0.09
134	0.1
135	0.11
136	0.09
137	0.09
138	0.07
139	0.06
140	0.06
141	0.06
142	0.05
143	0.04
144	0.04
145	0.04
146	0.04
147	0.04
148	0.04
149	0.03
150	0.06
151	0.06
152	0.06
153	0.06
154	0.07
155	0.07
156	0.07
157	0.08
158	0.06
159	0.07
160	0.07
161	0.09
162	0.09
163	0.11
164	0.2
165	0.29
166	0.36
167	0.41
168	0.46
169	0.53
170	0.63
171	0.71
172	0.74
173	0.75
174	0.78
175	0.81
176	0.78
177	0.78
178	0.71
179	0.64
180	0.55
181	0.49
182	0.43
183	0.39
184	0.38
185	0.3
186	0.3
187	0.3
188	0.3
189	0.29
190	0.24
191	0.2
192	0.2
193	0.25
194	0.22
195	0.21
196	0.19
197	0.17
198	0.17
199	0.16
200	0.15
201	0.1
202	0.1
203	0.08
204	0.08
205	0.07
206	0.06
207	0.06
208	0.05
209	0.05
210	0.05
211	0.04
212	0.03
213	0.03
214	0.03
215	0.03
216	0.03
217	0.03
218	0.04
219	0.04
220	0.04
221	0.04
222	0.04
223	0.04
224	0.04
225	0.04
226	0.04
227	0.05
228	0.05
229	0.05
230	0.05
231	0.05
232	0.05
233	0.05
234	0.06
235	0.06
236	0.09
237	0.13
238	0.15
239	0.15
240	0.15
241	0.16
242	0.15
243	0.21
244	0.2
245	0.17
246	0.16
247	0.18
248	0.18
249	0.19
250	0.21
251	0.16
252	0.16
253	0.18
254	0.17
255	0.14
256	0.14
257	0.14
258	0.09
259	0.09
260	0.07
261	0.1
262	0.1
263	0.12
264	0.11
265	0.11
266	0.12
267	0.14
268	0.13
269	0.09
270	0.1
271	0.1
272	0.15
273	0.15
274	0.17
275	0.16
276	0.16
277	0.16
278	0.15
279	0.13
280	0.08
281	0.08
282	0.1
283	0.16
284	0.18
285	0.18
286	0.18
287	0.19
288	0.19
289	0.19
290	0.16
291	0.1
292	0.09
293	0.08
294	0.08
295	0.08
296	0.08
297	0.07
298	0.06
299	0.05
300	0.05
301	0.05
302	0.04
303	0.04
304	0.04
305	0.04
306	0.05
307	0.04
308	0.04
309	0.04
310	0.05
311	0.04
312	0.05
313	0.05
314	0.04
315	0.06
316	0.07
317	0.08
318	0.1
319	0.1
320	0.1
321	0.12
322	0.13
323	0.13
324	0.14
325	0.13
326	0.13
327	0.17
328	0.16
329	0.15
330	0.15
331	0.14
332	0.12
333	0.11
334	0.11
335	0.07
336	0.07
337	0.08
338	0.07
339	0.07
340	0.07
341	0.09
342	0.09
343	0.08
344	0.08
345	0.08
346	0.09
347	0.09
348	0.08
349	0.06
350	0.07
351	0.07
352	0.07
353	0.06
354	0.06
355	0.06
356	0.06
357	0.07
358	0.07
359	0.09
360	0.11
361	0.13
362	0.17
363	0.18
364	0.19
365	0.21
366	0.22
367	0.21
368	0.2
369	0.19
370	0.15
371	0.13
372	0.13
373	0.12
374	0.14
375	0.13
376	0.13
377	0.13
378	0.12
379	0.13
380	0.13
381	0.13
382	0.12
383	0.12
384	0.13
385	0.16
386	0.16
387	0.17
388	0.16
389	0.14
390	0.13
391	0.12
392	0.11
393	0.08
394	0.09
395	0.08
396	0.1
397	0.12
398	0.12
399	0.13
400	0.13
401	0.14
402	0.16
403	0.17
404	0.15
405	0.19
406	0.21
407	0.28
408	0.33
409	0.33
410	0.34
411	0.35
412	0.34
413	0.29
414	0.29
415	0.25
416	0.21
417	0.2
418	0.17
419	0.16
420	0.15
421	0.18
422	0.18
423	0.17
424	0.19
425	0.21
426	0.21
427	0.23
428	0.25
429	0.24
430	0.25
431	0.27
432	0.24
433	0.26
434	0.28
435	0.26
436	0.25
437	0.22
438	0.2
439	0.17
440	0.16
441	0.11
442	0.1
443	0.1
444	0.1
445	0.11
446	0.11
447	0.14
448	0.16
449	0.24
450	0.27
451	0.29
452	0.31
453	0.3
454	0.31
455	0.28
456	0.29
457	0.26
458	0.23
459	0.21
460	0.19
461	0.18
462	0.16
463	0.16
464	0.11
465	0.06
466	0.06
467	0.1
468	0.09
469	0.09
470	0.1
471	0.09
472	0.1
473	0.11
474	0.12
475	0.1
476	0.11
477	0.11
478	0.11
479	0.12
480	0.11
481	0.1
482	0.1
483	0.09
484	0.07
485	0.09
486	0.1
487	0.12

Q5KKN8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer