Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0F4ZDU9

Protein Details
Accession A0A0F4ZDU9    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
105-124GVAPRAKMNQQRSRRFRAAQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
426-435RREANAKRRK
Subcellular Location(s) cyto_nucl 9, nucl 8.5, cyto 8.5, mito 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027073  5_3_exoribonuclease  
IPR041412  Xrn1_helical  
IPR004859  Xrn1_N  
IPR017151  Xrn2/3/4  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0004534  F:5'-3' RNA exonuclease activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006353  P:DNA-templated transcription termination  
GO:0006397  P:mRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF17846  XRN_M  
PF03159  XRN_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
CDD cd18673  PIN_XRN1-2-like  
Amino Acid Sequences MGIPAAFRWLSNKYPKIISSVVEDKPLKMEDGSVIPVNMAAKNPNGEEFDNLYLDMNGIVHPCSHPEDRPAPADEEEMMLEVFKYTDRVLNMVRPRKLLMIAVDGVAPRAKMNQQRSRRFRAAQEAKEKALEKAELLKSVQESGGNIPASNEEVVRKVFDSNSITPGTPFMDILAASLRYWCAYKLNTDEGWANVKVIISDATVPGEGEHKIMNFIRSQRASPNHDPNTRHVIYGLDADLIMLGLATHEPHFRVLREDVFYQDAKARMCRLCGQKGHEARNCRGAEKELEAAKAKVEEDAANGVTEDAIVQKPFIWLHVSVLREYLAVELNVPQLPFKFDIERAIDDWIFLCCFVGNDFLPHLPALEIRENGIDTLTTLWKDNLPVMGGYVTKDGELDLQRAQIIMDGLAKQEDAIFKRRKDQEDRREANAKRRKLDAQARSDRYADQGRQNHVISIPNPNALFSIDDKSIDNMPIPRPAVDASTANKSAASVLKAKLMGQKAQDPSVPAKSAENADPFEAHTVSNTTKRKADALEDDASEKPSTPEEPVDSVRLWEEGYSDRYYEQKFHVDPRNIEFRQGVAGSYMEGLAWVLLYYFQGCPSWEWYYPYHYAPFAQDFTKISKMEINFTKGRIARPFEQLMSVLPAASRHALPEVFHELMLREDSDIIDFYPEDFEIDLNGKKMAWQGVALLPFIDMPRLLAAVQGKYPELSEADHLRNQPGRDALILCDKNEHGIYDDITAAFYAKKKKSEGERDILELDGSRSAGLAGIVEKIPGYTPHGALIYPLERKGMPDIDYDRSISVYYNMPENGHAHKSMLLRGVNPPAPVLTQHDIHMLKNKMNGGSGRNYGGAPLNRNNNYNPRYNQAPIHYGPDSGRSGHRGGYSGHHGGYNNNRSYGNNGGGYNNNNNQHPPAPGQPGFGRGLPPIPPPAAQGFYNSGGRGGYGGGYHNGGYSGGGGGGGGGGYGGHNDNYNQNGGYSGYRDSYRARGGGYHRGSGGGYRGRGGYRGGRGGGNHY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.46
2 0.47
3 0.49
4 0.47
5 0.41
6 0.39
7 0.41
8 0.39
9 0.42
10 0.42
11 0.37
12 0.38
13 0.38
14 0.32
15 0.25
16 0.24
17 0.19
18 0.21
19 0.24
20 0.21
21 0.2
22 0.18
23 0.19
24 0.19
25 0.17
26 0.16
27 0.15
28 0.16
29 0.19
30 0.21
31 0.23
32 0.25
33 0.24
34 0.27
35 0.28
36 0.28
37 0.26
38 0.25
39 0.22
40 0.18
41 0.18
42 0.14
43 0.1
44 0.08
45 0.09
46 0.09
47 0.09
48 0.1
49 0.13
50 0.18
51 0.21
52 0.23
53 0.29
54 0.34
55 0.37
56 0.41
57 0.41
58 0.39
59 0.37
60 0.36
61 0.29
62 0.25
63 0.21
64 0.18
65 0.14
66 0.11
67 0.09
68 0.08
69 0.08
70 0.07
71 0.08
72 0.08
73 0.13
74 0.13
75 0.17
76 0.2
77 0.28
78 0.37
79 0.44
80 0.46
81 0.45
82 0.46
83 0.45
84 0.44
85 0.39
86 0.32
87 0.29
88 0.26
89 0.25
90 0.24
91 0.21
92 0.2
93 0.18
94 0.15
95 0.1
96 0.13
97 0.19
98 0.26
99 0.36
100 0.45
101 0.55
102 0.66
103 0.73
104 0.79
105 0.81
106 0.77
107 0.74
108 0.75
109 0.75
110 0.73
111 0.75
112 0.7
113 0.63
114 0.64
115 0.58
116 0.49
117 0.43
118 0.35
119 0.26
120 0.31
121 0.31
122 0.29
123 0.28
124 0.29
125 0.26
126 0.27
127 0.26
128 0.18
129 0.17
130 0.17
131 0.22
132 0.2
133 0.19
134 0.17
135 0.17
136 0.19
137 0.18
138 0.16
139 0.11
140 0.13
141 0.14
142 0.15
143 0.15
144 0.15
145 0.15
146 0.2
147 0.25
148 0.25
149 0.28
150 0.28
151 0.28
152 0.26
153 0.27
154 0.23
155 0.17
156 0.15
157 0.11
158 0.1
159 0.1
160 0.1
161 0.12
162 0.11
163 0.1
164 0.11
165 0.11
166 0.1
167 0.11
168 0.12
169 0.13
170 0.14
171 0.19
172 0.23
173 0.28
174 0.27
175 0.29
176 0.29
177 0.27
178 0.3
179 0.26
180 0.21
181 0.17
182 0.16
183 0.14
184 0.13
185 0.12
186 0.08
187 0.09
188 0.09
189 0.09
190 0.09
191 0.09
192 0.09
193 0.1
194 0.1
195 0.09
196 0.1
197 0.09
198 0.13
199 0.14
200 0.16
201 0.18
202 0.21
203 0.28
204 0.29
205 0.31
206 0.35
207 0.41
208 0.48
209 0.52
210 0.59
211 0.59
212 0.64
213 0.65
214 0.62
215 0.64
216 0.56
217 0.48
218 0.38
219 0.31
220 0.26
221 0.25
222 0.2
223 0.11
224 0.1
225 0.1
226 0.09
227 0.08
228 0.06
229 0.03
230 0.03
231 0.03
232 0.03
233 0.04
234 0.05
235 0.07
236 0.08
237 0.11
238 0.13
239 0.14
240 0.18
241 0.2
242 0.23
243 0.25
244 0.25
245 0.24
246 0.26
247 0.25
248 0.22
249 0.23
250 0.22
251 0.2
252 0.22
253 0.25
254 0.23
255 0.26
256 0.32
257 0.35
258 0.4
259 0.43
260 0.46
261 0.5
262 0.56
263 0.62
264 0.59
265 0.59
266 0.53
267 0.58
268 0.53
269 0.45
270 0.4
271 0.34
272 0.33
273 0.29
274 0.32
275 0.25
276 0.26
277 0.27
278 0.25
279 0.23
280 0.21
281 0.18
282 0.13
283 0.13
284 0.11
285 0.1
286 0.12
287 0.12
288 0.11
289 0.1
290 0.1
291 0.08
292 0.07
293 0.06
294 0.06
295 0.06
296 0.06
297 0.06
298 0.07
299 0.09
300 0.09
301 0.1
302 0.11
303 0.1
304 0.14
305 0.17
306 0.18
307 0.17
308 0.17
309 0.16
310 0.14
311 0.14
312 0.11
313 0.09
314 0.07
315 0.08
316 0.08
317 0.1
318 0.11
319 0.11
320 0.1
321 0.09
322 0.12
323 0.13
324 0.13
325 0.14
326 0.14
327 0.19
328 0.21
329 0.23
330 0.21
331 0.22
332 0.2
333 0.18
334 0.18
335 0.13
336 0.1
337 0.09
338 0.08
339 0.05
340 0.05
341 0.06
342 0.08
343 0.07
344 0.08
345 0.1
346 0.09
347 0.1
348 0.1
349 0.1
350 0.07
351 0.08
352 0.11
353 0.13
354 0.13
355 0.13
356 0.14
357 0.13
358 0.13
359 0.12
360 0.08
361 0.06
362 0.08
363 0.08
364 0.08
365 0.09
366 0.09
367 0.1
368 0.11
369 0.11
370 0.1
371 0.09
372 0.09
373 0.09
374 0.09
375 0.08
376 0.09
377 0.09
378 0.08
379 0.07
380 0.07
381 0.07
382 0.09
383 0.1
384 0.11
385 0.11
386 0.11
387 0.11
388 0.12
389 0.11
390 0.09
391 0.08
392 0.06
393 0.07
394 0.07
395 0.07
396 0.07
397 0.07
398 0.06
399 0.07
400 0.1
401 0.11
402 0.19
403 0.24
404 0.25
405 0.33
406 0.4
407 0.45
408 0.52
409 0.6
410 0.62
411 0.68
412 0.71
413 0.68
414 0.71
415 0.67
416 0.67
417 0.65
418 0.59
419 0.51
420 0.51
421 0.48
422 0.48
423 0.55
424 0.53
425 0.54
426 0.59
427 0.6
428 0.58
429 0.56
430 0.48
431 0.43
432 0.39
433 0.32
434 0.31
435 0.32
436 0.33
437 0.36
438 0.36
439 0.33
440 0.29
441 0.29
442 0.22
443 0.23
444 0.21
445 0.19
446 0.19
447 0.18
448 0.17
449 0.15
450 0.15
451 0.1
452 0.13
453 0.1
454 0.11
455 0.11
456 0.13
457 0.13
458 0.12
459 0.12
460 0.11
461 0.12
462 0.15
463 0.15
464 0.14
465 0.14
466 0.14
467 0.13
468 0.13
469 0.13
470 0.12
471 0.15
472 0.16
473 0.15
474 0.14
475 0.13
476 0.13
477 0.13
478 0.13
479 0.12
480 0.12
481 0.14
482 0.15
483 0.16
484 0.19
485 0.19
486 0.2
487 0.18
488 0.23
489 0.22
490 0.24
491 0.23
492 0.2
493 0.21
494 0.21
495 0.2
496 0.15
497 0.14
498 0.14
499 0.15
500 0.16
501 0.15
502 0.13
503 0.13
504 0.13
505 0.12
506 0.13
507 0.11
508 0.09
509 0.07
510 0.08
511 0.1
512 0.17
513 0.19
514 0.19
515 0.21
516 0.22
517 0.23
518 0.22
519 0.24
520 0.21
521 0.24
522 0.24
523 0.22
524 0.24
525 0.22
526 0.23
527 0.19
528 0.15
529 0.11
530 0.1
531 0.1
532 0.1
533 0.11
534 0.1
535 0.13
536 0.14
537 0.16
538 0.14
539 0.14
540 0.13
541 0.12
542 0.11
543 0.08
544 0.08
545 0.08
546 0.11
547 0.11
548 0.11
549 0.12
550 0.15
551 0.16
552 0.17
553 0.17
554 0.19
555 0.19
556 0.26
557 0.33
558 0.34
559 0.35
560 0.37
561 0.45
562 0.39
563 0.4
564 0.33
565 0.25
566 0.24
567 0.22
568 0.18
569 0.09
570 0.09
571 0.08
572 0.08
573 0.07
574 0.05
575 0.04
576 0.04
577 0.03
578 0.03
579 0.02
580 0.02
581 0.03
582 0.03
583 0.04
584 0.04
585 0.05
586 0.06
587 0.07
588 0.08
589 0.12
590 0.15
591 0.15
592 0.18
593 0.18
594 0.23
595 0.25
596 0.25
597 0.22
598 0.19
599 0.19
600 0.19
601 0.2
602 0.17
603 0.15
604 0.15
605 0.15
606 0.18
607 0.22
608 0.2
609 0.18
610 0.2
611 0.21
612 0.25
613 0.27
614 0.29
615 0.25
616 0.26
617 0.31
618 0.29
619 0.32
620 0.31
621 0.33
622 0.31
623 0.35
624 0.36
625 0.31
626 0.3
627 0.27
628 0.22
629 0.2
630 0.17
631 0.11
632 0.09
633 0.09
634 0.09
635 0.1
636 0.1
637 0.07
638 0.09
639 0.09
640 0.1
641 0.13
642 0.17
643 0.16
644 0.16
645 0.16
646 0.15
647 0.15
648 0.16
649 0.12
650 0.07
651 0.07
652 0.07
653 0.07
654 0.07
655 0.06
656 0.06
657 0.06
658 0.06
659 0.07
660 0.07
661 0.07
662 0.06
663 0.06
664 0.07
665 0.09
666 0.1
667 0.09
668 0.1
669 0.09
670 0.1
671 0.12
672 0.13
673 0.11
674 0.1
675 0.11
676 0.14
677 0.15
678 0.14
679 0.12
680 0.1
681 0.1
682 0.1
683 0.09
684 0.06
685 0.05
686 0.06
687 0.06
688 0.06
689 0.08
690 0.1
691 0.11
692 0.12
693 0.12
694 0.12
695 0.12
696 0.12
697 0.11
698 0.1
699 0.09
700 0.12
701 0.16
702 0.19
703 0.22
704 0.23
705 0.25
706 0.28
707 0.28
708 0.27
709 0.24
710 0.21
711 0.2
712 0.2
713 0.18
714 0.24
715 0.25
716 0.22
717 0.23
718 0.22
719 0.23
720 0.22
721 0.21
722 0.13
723 0.14
724 0.14
725 0.13
726 0.14
727 0.11
728 0.11
729 0.1
730 0.09
731 0.09
732 0.12
733 0.19
734 0.22
735 0.26
736 0.29
737 0.35
738 0.45
739 0.54
740 0.58
741 0.57
742 0.55
743 0.54
744 0.52
745 0.46
746 0.36
747 0.26
748 0.19
749 0.13
750 0.11
751 0.08
752 0.07
753 0.07
754 0.07
755 0.06
756 0.05
757 0.05
758 0.07
759 0.07
760 0.07
761 0.07
762 0.07
763 0.08
764 0.08
765 0.12
766 0.13
767 0.14
768 0.16
769 0.16
770 0.16
771 0.16
772 0.18
773 0.18
774 0.17
775 0.17
776 0.17
777 0.17
778 0.18
779 0.22
780 0.22
781 0.19
782 0.22
783 0.25
784 0.28
785 0.29
786 0.29
787 0.25
788 0.22
789 0.21
790 0.17
791 0.15
792 0.15
793 0.14
794 0.17
795 0.17
796 0.17
797 0.19
798 0.21
799 0.23
800 0.22
801 0.22
802 0.19
803 0.23
804 0.24
805 0.25
806 0.28
807 0.25
808 0.24
809 0.27
810 0.33
811 0.31
812 0.3
813 0.27
814 0.22
815 0.22
816 0.21
817 0.24
818 0.2
819 0.19
820 0.19
821 0.26
822 0.26
823 0.27
824 0.34
825 0.3
826 0.29
827 0.32
828 0.34
829 0.29
830 0.31
831 0.32
832 0.28
833 0.31
834 0.31
835 0.29
836 0.27
837 0.25
838 0.24
839 0.28
840 0.27
841 0.27
842 0.3
843 0.38
844 0.39
845 0.42
846 0.45
847 0.49
848 0.49
849 0.52
850 0.49
851 0.45
852 0.48
853 0.48
854 0.48
855 0.43
856 0.46
857 0.39
858 0.42
859 0.38
860 0.34
861 0.32
862 0.32
863 0.29
864 0.25
865 0.26
866 0.24
867 0.25
868 0.27
869 0.27
870 0.24
871 0.24
872 0.27
873 0.31
874 0.3
875 0.29
876 0.28
877 0.27
878 0.31
879 0.39
880 0.43
881 0.38
882 0.38
883 0.38
884 0.37
885 0.41
886 0.41
887 0.35
888 0.3
889 0.29
890 0.29
891 0.32
892 0.35
893 0.38
894 0.38
895 0.38
896 0.36
897 0.37
898 0.38
899 0.37
900 0.35
901 0.33
902 0.32
903 0.37
904 0.36
905 0.39
906 0.36
907 0.38
908 0.38
909 0.35
910 0.3
911 0.23
912 0.25
913 0.23
914 0.25
915 0.25
916 0.24
917 0.23
918 0.24
919 0.27
920 0.28
921 0.25
922 0.26
923 0.26
924 0.28
925 0.3
926 0.27
927 0.24
928 0.2
929 0.2
930 0.17
931 0.13
932 0.1
933 0.08
934 0.1
935 0.11
936 0.12
937 0.12
938 0.12
939 0.12
940 0.11
941 0.1
942 0.09
943 0.08
944 0.07
945 0.06
946 0.06
947 0.05
948 0.05
949 0.04
950 0.03
951 0.03
952 0.03
953 0.03
954 0.05
955 0.06
956 0.07
957 0.09
958 0.1
959 0.15
960 0.17
961 0.19
962 0.18
963 0.17
964 0.17
965 0.18
966 0.19
967 0.17
968 0.17
969 0.18
970 0.19
971 0.21
972 0.23
973 0.28
974 0.31
975 0.3
976 0.29
977 0.33
978 0.37
979 0.45
980 0.46
981 0.43
982 0.38
983 0.37
984 0.37
985 0.32
986 0.34
987 0.3
988 0.27
989 0.26
990 0.28
991 0.28
992 0.29
993 0.31
994 0.32
995 0.32
996 0.36
997 0.36
998 0.36