FuNGI

A0A0F4ZCP9

Protein Details

Accession

A0A0F4ZCP9

Localization Confidence

High

Confidence Score

25.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
19-51	AKPSPAPGQRRPPPNPLRPMRRQPGNPMVPRKR	Hydrophilic
199-224	IAPGIKEQKQPKQKPKEEKINLNRMP	Hydrophilic
407-438	KESAQMREKRLKRNHARKLKKKFMKRANEDAI	Basic
518-541	SSGNESSRKKKVKKMLQNKSVPLA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
22-53	SPAPGQRRPPPNPLRPMRRQPGNPMVPRKRVT
207-214	KQPKQKPK
413-432	REKRLKRNHARKLKKKFMKR
503-514	KKKNLKRTGSPG
520-532	GNESSRKKKVKKM

Subcellular Location(s)

nucl 24, mito 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MSAPSGPTPSTNGAANGSAKPSPAPGQRRPPPNPLRPMRRQPGNPMVPRKRVTAPKQIGFRKMPETTSLDRFPRDALKELEKKRQMYGGWSEPPPNTQYADYPVVTTKRELREHMRIHAMRLIKSKGGEATNSIDPTNQEQFTRPVTLHRRDPRQPPPGRAPPKEPTPEPVAVDDKETERLAQMKAEKEAQRAIDQAKIAPGIKEQKQPKQKPKEEKINLNRMPTTAKGKKQSDIRYEEALPWHLEDADGKNVWVGSYESALSENNVALLIDGGKFRMIPIEKWYKFTSKPPFVPITAEQAEDMLRKQIPVTRWLMKKEEERAEDQKRMQEWRASNGPAKRRRPEQESRDYDEVDMDPGDEFQDDDETGGFLEFDDEDAKITSERIRKNQLGANLFGDGDEQEVDQKESAQMREKRLKRNHARKLKKKFMKRANEDAIESDESDSDPFLAQASSDDSEEEEEKEGQEEEKKDDADADKTDKDKTEKESDAPSSKKTSILDPLKKKNLKRTGSPGASESSGNESSRKKKVKKMLQNKSVPLASGQRRKVGAAGNLSDGEGTAGEMSDSQPRKKIKLVSKGASSGSRPGSPNPSGPRPILAHEIVEALPSPPDGISVLNLFKFFDDRVGDRPGYTTKSEWLKLVRENSVYGQDKLLRRK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.25
2	0.27
3	0.24
4	0.24
5	0.23
6	0.22
7	0.21
8	0.23
9	0.27
10	0.33
11	0.39
12	0.45
13	0.55
14	0.63
15	0.72
16	0.75
17	0.78
18	0.8
19	0.81
20	0.83
21	0.82
22	0.84
23	0.84
24	0.88
25	0.87
26	0.87
27	0.82
28	0.81
29	0.82
30	0.82
31	0.8
32	0.81
33	0.8
34	0.78
35	0.76
36	0.71
37	0.69
38	0.69
39	0.68
40	0.68
41	0.68
42	0.66
43	0.73
44	0.74
45	0.74
46	0.68
47	0.65
48	0.62
49	0.56
50	0.5
51	0.46
52	0.47
53	0.44
54	0.46
55	0.48
56	0.44
57	0.42
58	0.41
59	0.39
60	0.4
61	0.39
62	0.37
63	0.36
64	0.42
65	0.5
66	0.55
67	0.62
68	0.61
69	0.6
70	0.57
71	0.58
72	0.49
73	0.46
74	0.48
75	0.45
76	0.45
77	0.45
78	0.46
79	0.41
80	0.43
81	0.39
82	0.33
83	0.27
84	0.23
85	0.23
86	0.25
87	0.29
88	0.26
89	0.25
90	0.28
91	0.28
92	0.28
93	0.29
94	0.3
95	0.33
96	0.37
97	0.41
98	0.44
99	0.51
100	0.54
101	0.56
102	0.59
103	0.52
104	0.51
105	0.51
106	0.46
107	0.41
108	0.43
109	0.4
110	0.33
111	0.33
112	0.32
113	0.32
114	0.3
115	0.27
116	0.24
117	0.25
118	0.27
119	0.27
120	0.25
121	0.22
122	0.21
123	0.25
124	0.28
125	0.25
126	0.21
127	0.22
128	0.26
129	0.28
130	0.29
131	0.24
132	0.27
133	0.35
134	0.4
135	0.47
136	0.53
137	0.58
138	0.63
139	0.72
140	0.73
141	0.75
142	0.75
143	0.72
144	0.74
145	0.76
146	0.77
147	0.73
148	0.7
149	0.66
150	0.68
151	0.67
152	0.59
153	0.52
154	0.5
155	0.48
156	0.42
157	0.39
158	0.34
159	0.29
160	0.29
161	0.26
162	0.22
163	0.22
164	0.2
165	0.17
166	0.15
167	0.17
168	0.16
169	0.18
170	0.21
171	0.21
172	0.23
173	0.3
174	0.31
175	0.31
176	0.34
177	0.31
178	0.29
179	0.29
180	0.28
181	0.24
182	0.22
183	0.2
184	0.18
185	0.18
186	0.17
187	0.15
188	0.18
189	0.21
190	0.25
191	0.33
192	0.37
193	0.44
194	0.54
195	0.63
196	0.7
197	0.74
198	0.78
199	0.81
200	0.85
201	0.87
202	0.84
203	0.85
204	0.84
205	0.83
206	0.78
207	0.71
208	0.62
209	0.52
210	0.47
211	0.39
212	0.4
213	0.36
214	0.38
215	0.43
216	0.45
217	0.49
218	0.54
219	0.59
220	0.58
221	0.57
222	0.55
223	0.5
224	0.48
225	0.45
226	0.39
227	0.32
228	0.25
229	0.19
230	0.16
231	0.12
232	0.11
233	0.11
234	0.11
235	0.13
236	0.12
237	0.12
238	0.12
239	0.12
240	0.11
241	0.11
242	0.09
243	0.06
244	0.07
245	0.07
246	0.07
247	0.08
248	0.08
249	0.07
250	0.07
251	0.06
252	0.06
253	0.05
254	0.05
255	0.04
256	0.04
257	0.04
258	0.05
259	0.05
260	0.05
261	0.05
262	0.05
263	0.05
264	0.1
265	0.11
266	0.11
267	0.17
268	0.28
269	0.28
270	0.32
271	0.34
272	0.33
273	0.34
274	0.41
275	0.45
276	0.41
277	0.42
278	0.43
279	0.44
280	0.4
281	0.42
282	0.35
283	0.33
284	0.27
285	0.25
286	0.2
287	0.18
288	0.18
289	0.15
290	0.13
291	0.09
292	0.08
293	0.08
294	0.09
295	0.12
296	0.13
297	0.17
298	0.21
299	0.26
300	0.29
301	0.32
302	0.34
303	0.34
304	0.37
305	0.39
306	0.41
307	0.36
308	0.38
309	0.42
310	0.44
311	0.44
312	0.41
313	0.38
314	0.34
315	0.35
316	0.32
317	0.3
318	0.27
319	0.28
320	0.3
321	0.29
322	0.31
323	0.33
324	0.4
325	0.43
326	0.48
327	0.48
328	0.52
329	0.55
330	0.59
331	0.63
332	0.63
333	0.65
334	0.65
335	0.66
336	0.61
337	0.56
338	0.48
339	0.39
340	0.31
341	0.21
342	0.14
343	0.09
344	0.06
345	0.06
346	0.06
347	0.05
348	0.05
349	0.04
350	0.05
351	0.05
352	0.05
353	0.05
354	0.04
355	0.05
356	0.05
357	0.04
358	0.03
359	0.04
360	0.04
361	0.04
362	0.05
363	0.05
364	0.05
365	0.06
366	0.06
367	0.06
368	0.07
369	0.11
370	0.17
371	0.21
372	0.25
373	0.32
374	0.33
375	0.36
376	0.39
377	0.39
378	0.36
379	0.34
380	0.3
381	0.24
382	0.22
383	0.18
384	0.16
385	0.1
386	0.07
387	0.06
388	0.05
389	0.06
390	0.07
391	0.07
392	0.07
393	0.08
394	0.1
395	0.12
396	0.14
397	0.22
398	0.26
399	0.32
400	0.42
401	0.47
402	0.55
403	0.61
404	0.7
405	0.72
406	0.79
407	0.82
408	0.83
409	0.88
410	0.88
411	0.91
412	0.91
413	0.89
414	0.88
415	0.88
416	0.87
417	0.87
418	0.84
419	0.83
420	0.8
421	0.73
422	0.64
423	0.55
424	0.48
425	0.38
426	0.31
427	0.22
428	0.14
429	0.12
430	0.11
431	0.1
432	0.07
433	0.06
434	0.05
435	0.05
436	0.05
437	0.05
438	0.05
439	0.08
440	0.09
441	0.09
442	0.09
443	0.09
444	0.11
445	0.12
446	0.12
447	0.11
448	0.1
449	0.1
450	0.11
451	0.12
452	0.11
453	0.15
454	0.16
455	0.19
456	0.21
457	0.22
458	0.21
459	0.23
460	0.24
461	0.22
462	0.23
463	0.23
464	0.23
465	0.24
466	0.27
467	0.27
468	0.29
469	0.29
470	0.33
471	0.37
472	0.36
473	0.37
474	0.41
475	0.43
476	0.47
477	0.45
478	0.42
479	0.39
480	0.38
481	0.38
482	0.34
483	0.32
484	0.34
485	0.42
486	0.48
487	0.52
488	0.6
489	0.67
490	0.72
491	0.73
492	0.74
493	0.74
494	0.7
495	0.68
496	0.68
497	0.68
498	0.66
499	0.63
500	0.54
501	0.47
502	0.43
503	0.36
504	0.28
505	0.24
506	0.22
507	0.21
508	0.24
509	0.27
510	0.32
511	0.42
512	0.5
513	0.5
514	0.56
515	0.66
516	0.73
517	0.78
518	0.83
519	0.84
520	0.85
521	0.87
522	0.82
523	0.77
524	0.67
525	0.56
526	0.48
527	0.46
528	0.45
529	0.46
530	0.45
531	0.44
532	0.44
533	0.44
534	0.45
535	0.42
536	0.38
537	0.35
538	0.34
539	0.31
540	0.31
541	0.3
542	0.26
543	0.2
544	0.15
545	0.09
546	0.08
547	0.05
548	0.05
549	0.05
550	0.05
551	0.07
552	0.15
553	0.18
554	0.2
555	0.27
556	0.3
557	0.34
558	0.4
559	0.48
560	0.5
561	0.57
562	0.64
563	0.64
564	0.66
565	0.66
566	0.62
567	0.57
568	0.5
569	0.46
570	0.4
571	0.39
572	0.35
573	0.36
574	0.41
575	0.39
576	0.45
577	0.46
578	0.49
579	0.48
580	0.47
581	0.48
582	0.43
583	0.44
584	0.42
585	0.36
586	0.3
587	0.26
588	0.27
589	0.21
590	0.2
591	0.17
592	0.11
593	0.11
594	0.1
595	0.1
596	0.07
597	0.08
598	0.08
599	0.08
600	0.1
601	0.13
602	0.16
603	0.16
604	0.17
605	0.16
606	0.16
607	0.18
608	0.16
609	0.18
610	0.2
611	0.21
612	0.25
613	0.31
614	0.31
615	0.29
616	0.32
617	0.32
618	0.32
619	0.33
620	0.3
621	0.31
622	0.38
623	0.4
624	0.41
625	0.41
626	0.43
627	0.47
628	0.51
629	0.5
630	0.44
631	0.45
632	0.44
633	0.48
634	0.46
635	0.4
636	0.4
637	0.41

A0A0F4ZCP9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer