Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0F4ZDQ0

Protein Details
Accession A0A0F4ZDQ0    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
19-41VKTSDCCVWKQHKWNNSKCHTSSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
166-185KRKTKSKSAPPVGEPKKVAG
Subcellular Location(s) cyto_nucl 13.833, cyto 13.5, nucl 12, cyto_mito 8.166
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR007275  YTH_domain  
IPR045168  YTH_prot  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF04146  YTH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50882  YTH  
CDD cd21134  YTH  
Amino Acid Sequences MGASPPLVAIDYTNIESRVKTSDCCVWKQHKWNNSKCHTSSGTSAQAPTNRLGYAVWIGNLPVKTDLMDLVRHVHAATTNLESLFLISKSNCAFANFRDEASWRAALEAVHDSEFHTMRLVARHRRLSPETGLEGEKDEAESVGDSSADTTTEKASHKTAEVTDSKRKTKSKSAPPVGEPKKVAGPPPASARDAGRDRYFVLKSLTVEDLQQSTRTGVWATQAHNEAILNEAYSNAANVYLIFSANKSGEYFGYARMTSALNPDPAVAIDFAPLSVPTDAVDALTEKVPASGCVPAGRIVHDELRGTIFWEVDGSMSSEGAETATRTDTAPTNADTAPANTHKTPTDPPNKIKDNEKPMGKPFTLRWLSTTRVGFQRTRGLANAWNGNREVKIARDGTEIEPEAGARLVQLFHSESP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.18
3 0.19
4 0.2
5 0.23
6 0.22
7 0.21
8 0.23
9 0.31
10 0.35
11 0.39
12 0.46
13 0.48
14 0.56
15 0.65
16 0.69
17 0.7
18 0.75
19 0.8
20 0.82
21 0.81
22 0.82
23 0.73
24 0.72
25 0.67
26 0.6
27 0.56
28 0.52
29 0.5
30 0.43
31 0.43
32 0.39
33 0.39
34 0.38
35 0.35
36 0.31
37 0.24
38 0.23
39 0.2
40 0.19
41 0.19
42 0.18
43 0.16
44 0.14
45 0.14
46 0.19
47 0.19
48 0.18
49 0.15
50 0.14
51 0.14
52 0.14
53 0.16
54 0.13
55 0.14
56 0.14
57 0.16
58 0.17
59 0.16
60 0.15
61 0.14
62 0.14
63 0.15
64 0.16
65 0.15
66 0.16
67 0.16
68 0.16
69 0.15
70 0.14
71 0.14
72 0.12
73 0.11
74 0.1
75 0.13
76 0.14
77 0.16
78 0.15
79 0.16
80 0.18
81 0.17
82 0.26
83 0.24
84 0.23
85 0.23
86 0.24
87 0.23
88 0.26
89 0.25
90 0.16
91 0.16
92 0.16
93 0.15
94 0.16
95 0.17
96 0.14
97 0.13
98 0.13
99 0.13
100 0.16
101 0.17
102 0.14
103 0.12
104 0.11
105 0.12
106 0.19
107 0.25
108 0.3
109 0.36
110 0.43
111 0.44
112 0.51
113 0.53
114 0.51
115 0.48
116 0.44
117 0.38
118 0.34
119 0.32
120 0.26
121 0.24
122 0.2
123 0.16
124 0.12
125 0.1
126 0.08
127 0.07
128 0.07
129 0.06
130 0.05
131 0.05
132 0.05
133 0.05
134 0.05
135 0.06
136 0.06
137 0.06
138 0.07
139 0.1
140 0.12
141 0.13
142 0.14
143 0.15
144 0.16
145 0.17
146 0.17
147 0.2
148 0.24
149 0.27
150 0.34
151 0.38
152 0.42
153 0.46
154 0.49
155 0.49
156 0.54
157 0.59
158 0.61
159 0.66
160 0.7
161 0.68
162 0.67
163 0.73
164 0.67
165 0.61
166 0.51
167 0.42
168 0.39
169 0.35
170 0.34
171 0.29
172 0.27
173 0.25
174 0.29
175 0.3
176 0.26
177 0.26
178 0.24
179 0.25
180 0.25
181 0.26
182 0.22
183 0.2
184 0.2
185 0.24
186 0.24
187 0.19
188 0.19
189 0.17
190 0.17
191 0.18
192 0.18
193 0.14
194 0.14
195 0.13
196 0.12
197 0.11
198 0.11
199 0.09
200 0.09
201 0.08
202 0.09
203 0.08
204 0.07
205 0.1
206 0.12
207 0.13
208 0.16
209 0.18
210 0.17
211 0.17
212 0.17
213 0.13
214 0.12
215 0.1
216 0.07
217 0.05
218 0.05
219 0.06
220 0.05
221 0.05
222 0.04
223 0.04
224 0.04
225 0.04
226 0.05
227 0.05
228 0.05
229 0.05
230 0.05
231 0.07
232 0.07
233 0.08
234 0.07
235 0.08
236 0.08
237 0.11
238 0.11
239 0.11
240 0.13
241 0.13
242 0.12
243 0.13
244 0.13
245 0.11
246 0.14
247 0.14
248 0.13
249 0.13
250 0.13
251 0.12
252 0.11
253 0.12
254 0.08
255 0.06
256 0.06
257 0.06
258 0.06
259 0.06
260 0.06
261 0.07
262 0.06
263 0.06
264 0.06
265 0.06
266 0.06
267 0.06
268 0.07
269 0.06
270 0.07
271 0.07
272 0.08
273 0.07
274 0.08
275 0.08
276 0.09
277 0.09
278 0.1
279 0.1
280 0.11
281 0.12
282 0.14
283 0.15
284 0.15
285 0.16
286 0.16
287 0.19
288 0.19
289 0.18
290 0.16
291 0.18
292 0.16
293 0.16
294 0.14
295 0.11
296 0.1
297 0.1
298 0.09
299 0.07
300 0.07
301 0.08
302 0.07
303 0.07
304 0.07
305 0.06
306 0.06
307 0.07
308 0.06
309 0.05
310 0.07
311 0.08
312 0.08
313 0.09
314 0.11
315 0.13
316 0.16
317 0.17
318 0.17
319 0.2
320 0.19
321 0.2
322 0.18
323 0.17
324 0.2
325 0.21
326 0.24
327 0.22
328 0.25
329 0.24
330 0.27
331 0.32
332 0.37
333 0.44
334 0.47
335 0.53
336 0.6
337 0.66
338 0.66
339 0.68
340 0.67
341 0.66
342 0.67
343 0.67
344 0.62
345 0.61
346 0.66
347 0.58
348 0.53
349 0.46
350 0.48
351 0.47
352 0.42
353 0.4
354 0.37
355 0.4
356 0.42
357 0.43
358 0.37
359 0.39
360 0.43
361 0.42
362 0.42
363 0.47
364 0.43
365 0.44
366 0.4
367 0.37
368 0.38
369 0.42
370 0.46
371 0.39
372 0.39
373 0.38
374 0.39
375 0.36
376 0.33
377 0.29
378 0.23
379 0.28
380 0.27
381 0.27
382 0.28
383 0.31
384 0.3
385 0.36
386 0.34
387 0.27
388 0.26
389 0.24
390 0.22
391 0.19
392 0.16
393 0.09
394 0.09
395 0.09
396 0.09
397 0.13