FuNGI

Q5KD60

Protein Details

Accession

Q5KD60

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
6-29	SVNHLVLPRTKRRNYNTHNNQTEY	Hydrophilic
1156-1179	QVERGKFGGKLEKKKKNKKRLGGF	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
1160-1178	GKFGGKLEKKKKNKKRLGG

Subcellular Location(s)

nucl 12, mito 8.5, cyto_mito 7.5, cyto 5.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR019350 RNA_pol_I-sp_TIF_RRN6-like
Pfam	View protein in Pfam PF10214 Rrn6

Amino Acid Sequences

MSFPPSVNHLVLPRTKRRNYNTHNNQTEYSEDNQFQDDVEEERDQVDDAVGVGGPTVEFGRQGGVSLQRKRGSWGWMWSVEDRQDLKWRTGKEAIHFFPATRTPEIESDPEISLREVINSSVQYAEDLCLPYERDGLRDVITDILMEEHAAGPSGTSKQPAGPLRKLEEDAFDETQIYQGSIVAVIQNSRGKSARTFVAFPTGEVGHHLNIAPFLATSTTRVDKRSRFRFTPTVKPIDRFPTSILQICSSPMISPFRIDHDATALLVRTRTTTHLLNLHPSLTPFSPYITSTRIAELSFSDTEDRRHVDVVLDPATWSRALVVDEGGGIWMWWEDKEIRGGRLEKVMNLRKIRDKITDDKDQFFRISFGTQPGTALVLSSREATLIDIDNHDHPATSLITLSGFNRRFTFLEKTALERDSRYTTICTTHEVFWLDETGKGVPALGFRHEYGVTDIEAIIFPGQGKDQMTTLLYSPSHPFITALATPKSDPVRFLTPPYALGLPLHRDMTLKELSYLSLNSNRHPPSLIALDQEGGLWCIPLISSRNTRFGAIDSAEGREGQKQKQEIIPISAQWDDEVSSLAAKREDREELGVGDGWLEKAQVAYKEIDLRWVWLAINEQDIKIFSPEPSVASLSDTEGEGEEEASGELMTRNDWVTDDERESGEQDLDKEGGRENVGNEEEGAADSSLEEPGHEGRYREGRGAIESDEATANAANIAAEEVEKDDDDGDESDWEDEEGEGEEDLKRMQCQGEKTESWFRPEEFAQYLRELEAPMDGLVTGSELALDMCFPSASSLDEEQVRRWDDVEEDAPLQTLTIHPYAIRSTLEGMDELVLSKFVPIIHTLHSGFPSFTESRPLLPLPYQRPFQLYRFFLDSFPPSSLRDNLSAAQLALNLYLSTLIFSPSDYLPLAPAAHDRLIDAAAEEEQQGDEVELFVQATSQLSLNDPAPPLIEFNVVKPTLAPVRPLYKSLNAVESGSEWEDVVEGDEKGKEEKRMERLQTHIARTLIDDWKLGQDLTYWTWTPMGLEDTQWDPERATDPTRGDAPQPMDGVSSMQKESDRRIRPLPGSRSHPSLSLSQPRSRVQPASPPRTSRSHPFSHLIPPSLSTSHSMPSIPSLVQGPRSSPPPTMSQMGIVTSSQPEGENQNQEMGWASTQVERGKFGGKLEKKKKNKKRLGGF

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.55
2	0.62
3	0.69
4	0.74
5	0.79
6	0.8
7	0.83
8	0.85
9	0.85
10	0.85
11	0.8
12	0.73
13	0.65
14	0.59
15	0.52
16	0.44
17	0.4
18	0.34
19	0.31
20	0.31
21	0.28
22	0.25
23	0.22
24	0.19
25	0.15
26	0.18
27	0.18
28	0.16
29	0.17
30	0.17
31	0.16
32	0.15
33	0.12
34	0.08
35	0.08
36	0.08
37	0.07
38	0.07
39	0.06
40	0.06
41	0.05
42	0.06
43	0.06
44	0.06
45	0.06
46	0.07
47	0.09
48	0.09
49	0.1
50	0.13
51	0.22
52	0.3
53	0.37
54	0.45
55	0.46
56	0.47
57	0.51
58	0.52
59	0.49
60	0.47
61	0.48
62	0.46
63	0.46
64	0.49
65	0.47
66	0.47
67	0.43
68	0.43
69	0.38
70	0.34
71	0.4
72	0.4
73	0.43
74	0.44
75	0.44
76	0.45
77	0.5
78	0.5
79	0.49
80	0.55
81	0.51
82	0.52
83	0.5
84	0.44
85	0.42
86	0.44
87	0.41
88	0.33
89	0.32
90	0.28
91	0.31
92	0.34
93	0.32
94	0.28
95	0.27
96	0.26
97	0.25
98	0.23
99	0.2
100	0.19
101	0.17
102	0.16
103	0.14
104	0.14
105	0.16
106	0.16
107	0.16
108	0.15
109	0.15
110	0.14
111	0.14
112	0.13
113	0.13
114	0.13
115	0.13
116	0.14
117	0.16
118	0.16
119	0.21
120	0.2
121	0.19
122	0.2
123	0.21
124	0.2
125	0.2
126	0.19
127	0.15
128	0.15
129	0.13
130	0.11
131	0.1
132	0.09
133	0.08
134	0.08
135	0.07
136	0.07
137	0.07
138	0.07
139	0.06
140	0.09
141	0.12
142	0.12
143	0.14
144	0.14
145	0.16
146	0.24
147	0.31
148	0.37
149	0.39
150	0.44
151	0.47
152	0.5
153	0.51
154	0.45
155	0.41
156	0.38
157	0.37
158	0.33
159	0.28
160	0.25
161	0.22
162	0.23
163	0.19
164	0.15
165	0.09
166	0.08
167	0.08
168	0.08
169	0.08
170	0.07
171	0.08
172	0.08
173	0.12
174	0.15
175	0.15
176	0.19
177	0.2
178	0.21
179	0.23
180	0.26
181	0.28
182	0.29
183	0.3
184	0.28
185	0.36
186	0.34
187	0.31
188	0.31
189	0.25
190	0.21
191	0.22
192	0.23
193	0.14
194	0.15
195	0.15
196	0.12
197	0.12
198	0.12
199	0.09
200	0.07
201	0.07
202	0.08
203	0.08
204	0.09
205	0.14
206	0.19
207	0.21
208	0.25
209	0.31
210	0.38
211	0.48
212	0.56
213	0.6
214	0.58
215	0.63
216	0.69
217	0.69
218	0.71
219	0.69
220	0.68
221	0.63
222	0.61
223	0.59
224	0.57
225	0.53
226	0.44
227	0.4
228	0.37
229	0.37
230	0.4
231	0.36
232	0.3
233	0.28
234	0.27
235	0.25
236	0.18
237	0.16
238	0.15
239	0.18
240	0.16
241	0.18
242	0.19
243	0.23
244	0.26
245	0.26
246	0.23
247	0.21
248	0.21
249	0.19
250	0.19
251	0.15
252	0.12
253	0.12
254	0.12
255	0.1
256	0.11
257	0.13
258	0.16
259	0.17
260	0.2
261	0.26
262	0.27
263	0.31
264	0.3
265	0.29
266	0.26
267	0.24
268	0.24
269	0.18
270	0.19
271	0.15
272	0.15
273	0.16
274	0.16
275	0.18
276	0.17
277	0.18
278	0.17
279	0.18
280	0.18
281	0.16
282	0.16
283	0.14
284	0.16
285	0.15
286	0.15
287	0.16
288	0.16
289	0.18
290	0.21
291	0.22
292	0.19
293	0.2
294	0.19
295	0.17
296	0.19
297	0.21
298	0.2
299	0.17
300	0.16
301	0.15
302	0.16
303	0.14
304	0.11
305	0.08
306	0.08
307	0.09
308	0.09
309	0.09
310	0.08
311	0.08
312	0.08
313	0.07
314	0.05
315	0.04
316	0.04
317	0.04
318	0.04
319	0.04
320	0.06
321	0.07
322	0.08
323	0.15
324	0.17
325	0.18
326	0.23
327	0.25
328	0.25
329	0.31
330	0.3
331	0.27
332	0.34
333	0.4
334	0.43
335	0.44
336	0.47
337	0.48
338	0.51
339	0.52
340	0.49
341	0.47
342	0.49
343	0.52
344	0.58
345	0.53
346	0.55
347	0.53
348	0.48
349	0.43
350	0.35
351	0.29
352	0.2
353	0.19
354	0.15
355	0.16
356	0.16
357	0.15
358	0.15
359	0.14
360	0.13
361	0.12
362	0.1
363	0.07
364	0.07
365	0.07
366	0.08
367	0.08
368	0.07
369	0.07
370	0.07
371	0.09
372	0.09
373	0.1
374	0.1
375	0.11
376	0.12
377	0.14
378	0.13
379	0.11
380	0.1
381	0.11
382	0.11
383	0.09
384	0.08
385	0.07
386	0.08
387	0.09
388	0.09
389	0.16
390	0.17
391	0.18
392	0.19
393	0.21
394	0.21
395	0.25
396	0.3
397	0.24
398	0.29
399	0.29
400	0.31
401	0.32
402	0.33
403	0.3
404	0.24
405	0.25
406	0.22
407	0.23
408	0.2
409	0.19
410	0.18
411	0.21
412	0.21
413	0.21
414	0.2
415	0.2
416	0.22
417	0.22
418	0.21
419	0.17
420	0.18
421	0.15
422	0.13
423	0.13
424	0.1
425	0.09
426	0.09
427	0.09
428	0.07
429	0.09
430	0.09
431	0.1
432	0.12
433	0.11
434	0.14
435	0.14
436	0.14
437	0.14
438	0.14
439	0.12
440	0.11
441	0.1
442	0.08
443	0.08
444	0.08
445	0.06
446	0.05
447	0.05
448	0.05
449	0.05
450	0.06
451	0.07
452	0.08
453	0.08
454	0.09
455	0.09
456	0.09
457	0.1
458	0.11
459	0.1
460	0.11
461	0.12
462	0.14
463	0.13
464	0.13
465	0.12
466	0.1
467	0.13
468	0.14
469	0.16
470	0.14
471	0.15
472	0.15
473	0.18
474	0.21
475	0.18
476	0.17
477	0.18
478	0.22
479	0.22
480	0.25
481	0.24
482	0.21
483	0.22
484	0.22
485	0.19
486	0.14
487	0.13
488	0.13
489	0.12
490	0.13
491	0.13
492	0.12
493	0.12
494	0.12
495	0.16
496	0.16
497	0.13
498	0.13
499	0.12
500	0.13
501	0.13
502	0.14
503	0.11
504	0.16
505	0.16
506	0.16
507	0.23
508	0.24
509	0.23
510	0.24
511	0.22
512	0.18
513	0.21
514	0.2
515	0.14
516	0.13
517	0.13
518	0.12
519	0.12
520	0.09
521	0.06
522	0.05
523	0.04
524	0.04
525	0.03
526	0.03
527	0.05
528	0.07
529	0.1
530	0.16
531	0.18
532	0.23
533	0.24
534	0.25
535	0.23
536	0.23
537	0.22
538	0.17
539	0.17
540	0.13
541	0.13
542	0.12
543	0.12
544	0.12
545	0.14
546	0.16
547	0.16
548	0.19
549	0.19
550	0.21
551	0.23
552	0.26
553	0.22
554	0.23
555	0.22
556	0.18
557	0.19
558	0.17
559	0.15
560	0.11
561	0.11
562	0.08
563	0.07
564	0.07
565	0.05
566	0.05
567	0.06
568	0.07
569	0.08
570	0.08
571	0.09
572	0.1
573	0.11
574	0.11
575	0.12
576	0.12
577	0.11
578	0.11
579	0.11
580	0.08
581	0.08
582	0.07
583	0.06
584	0.05
585	0.05
586	0.04
587	0.04
588	0.05
589	0.06
590	0.07
591	0.08
592	0.09
593	0.12
594	0.12
595	0.16
596	0.14
597	0.15
598	0.14
599	0.14
600	0.13
601	0.1
602	0.12
603	0.09
604	0.12
605	0.11
606	0.11
607	0.1
608	0.11
609	0.1
610	0.1
611	0.1
612	0.07
613	0.08
614	0.09
615	0.09
616	0.1
617	0.1
618	0.09
619	0.1
620	0.1
621	0.08
622	0.09
623	0.08
624	0.07
625	0.06
626	0.06
627	0.05
628	0.05
629	0.04
630	0.04
631	0.04
632	0.04
633	0.03
634	0.03
635	0.04
636	0.04
637	0.04
638	0.05
639	0.05
640	0.05
641	0.06
642	0.08
643	0.09
644	0.11
645	0.13
646	0.13
647	0.13
648	0.13
649	0.14
650	0.12
651	0.11
652	0.1
653	0.09
654	0.09
655	0.09
656	0.09
657	0.08
658	0.08
659	0.09
660	0.09
661	0.09
662	0.09
663	0.11
664	0.12
665	0.11
666	0.11
667	0.1
668	0.09
669	0.09
670	0.09
671	0.05
672	0.04
673	0.04
674	0.05
675	0.05
676	0.05
677	0.05
678	0.05
679	0.06
680	0.09
681	0.1
682	0.1
683	0.12
684	0.18
685	0.19
686	0.2
687	0.2
688	0.18
689	0.18
690	0.19
691	0.18
692	0.13
693	0.12
694	0.12
695	0.1
696	0.1
697	0.09
698	0.07
699	0.06
700	0.05
701	0.05
702	0.03
703	0.03
704	0.03
705	0.03
706	0.03
707	0.03
708	0.04
709	0.05
710	0.05
711	0.05
712	0.05
713	0.05
714	0.06
715	0.07
716	0.06
717	0.06
718	0.07
719	0.07
720	0.07
721	0.06
722	0.06
723	0.05
724	0.05
725	0.05
726	0.05
727	0.05
728	0.05
729	0.06
730	0.06
731	0.07
732	0.07
733	0.06
734	0.07
735	0.1
736	0.12
737	0.15
738	0.2
739	0.25
740	0.25
741	0.3
742	0.39
743	0.38
744	0.39
745	0.38
746	0.34
747	0.31
748	0.31
749	0.29
750	0.22
751	0.23
752	0.21
753	0.2
754	0.19
755	0.17
756	0.17
757	0.13
758	0.11
759	0.09
760	0.08
761	0.07
762	0.06
763	0.05
764	0.05
765	0.04
766	0.04
767	0.04
768	0.03
769	0.03
770	0.03
771	0.03
772	0.03
773	0.03
774	0.03
775	0.03
776	0.03
777	0.04
778	0.04
779	0.05
780	0.06
781	0.09
782	0.1
783	0.11
784	0.15
785	0.16
786	0.17
787	0.22
788	0.22
789	0.2
790	0.2
791	0.19
792	0.16
793	0.18
794	0.18
795	0.15
796	0.14
797	0.13
798	0.13
799	0.12
800	0.11
801	0.07
802	0.07
803	0.08
804	0.08
805	0.08
806	0.08
807	0.1
808	0.11
809	0.12
810	0.12
811	0.1
812	0.11
813	0.12
814	0.13
815	0.11
816	0.11
817	0.1
818	0.09
819	0.09
820	0.07
821	0.06
822	0.05
823	0.05
824	0.06
825	0.06
826	0.07
827	0.08
828	0.1
829	0.12
830	0.16
831	0.17
832	0.17
833	0.18
834	0.18
835	0.17
836	0.15
837	0.19
838	0.17
839	0.16
840	0.2
841	0.19
842	0.2
843	0.23
844	0.23
845	0.19
846	0.22
847	0.29
848	0.3
849	0.34
850	0.34
851	0.33
852	0.37
853	0.38
854	0.39
855	0.4
856	0.35
857	0.33
858	0.36
859	0.36
860	0.32
861	0.32
862	0.3
863	0.24
864	0.25
865	0.23
866	0.2
867	0.22
868	0.24
869	0.24
870	0.23
871	0.23
872	0.22
873	0.22
874	0.21
875	0.18
876	0.16
877	0.14
878	0.12
879	0.09
880	0.09
881	0.06
882	0.06
883	0.06
884	0.06
885	0.06
886	0.06
887	0.07
888	0.06
889	0.07
890	0.09
891	0.09
892	0.11
893	0.1
894	0.1
895	0.1
896	0.11
897	0.11
898	0.09
899	0.11
900	0.13
901	0.13
902	0.13
903	0.13
904	0.12
905	0.12
906	0.12
907	0.1
908	0.08
909	0.07
910	0.08
911	0.08
912	0.07
913	0.06
914	0.07
915	0.07
916	0.06
917	0.05
918	0.05
919	0.05
920	0.05
921	0.05
922	0.05
923	0.05
924	0.05
925	0.05
926	0.06
927	0.06
928	0.07
929	0.08
930	0.11
931	0.11
932	0.14
933	0.14
934	0.13
935	0.13
936	0.13
937	0.13
938	0.12
939	0.17
940	0.14
941	0.15
942	0.22
943	0.21
944	0.21
945	0.19
946	0.22
947	0.24
948	0.25
949	0.26
950	0.24
951	0.31
952	0.33
953	0.35
954	0.36
955	0.34
956	0.38
957	0.36
958	0.36
959	0.3
960	0.29
961	0.26
962	0.23
963	0.21
964	0.17
965	0.16
966	0.12
967	0.1
968	0.1
969	0.1
970	0.1
971	0.09
972	0.08
973	0.09
974	0.1
975	0.11
976	0.15
977	0.19
978	0.22
979	0.25
980	0.33
981	0.4
982	0.48
983	0.53
984	0.53
985	0.55
986	0.6
987	0.62
988	0.58
989	0.55
990	0.47
991	0.41
992	0.39
993	0.4
994	0.34
995	0.29
996	0.25
997	0.21
998	0.24
999	0.24
1000	0.21
1001	0.16
1002	0.13
1003	0.15
1004	0.18
1005	0.21
1006	0.18
1007	0.18
1008	0.19
1009	0.19
1010	0.17
1011	0.16
1012	0.16
1013	0.13
1014	0.13
1015	0.15
1016	0.17
1017	0.21
1018	0.22
1019	0.21
1020	0.17
1021	0.19
1022	0.21
1023	0.22
1024	0.23
1025	0.25
1026	0.25
1027	0.28
1028	0.31
1029	0.3
1030	0.29
1031	0.33
1032	0.33
1033	0.31
1034	0.29
1035	0.26
1036	0.24
1037	0.23
1038	0.23
1039	0.21
1040	0.2
1041	0.16
1042	0.17
1043	0.2
1044	0.22
1045	0.3
1046	0.37
1047	0.4
1048	0.42
1049	0.48
1050	0.54
1051	0.59
1052	0.66
1053	0.67
1054	0.65
1055	0.66
1056	0.65
1057	0.65
1058	0.59
1059	0.54
1060	0.46
1061	0.43
1062	0.43
1063	0.46
1064	0.47
1065	0.47
1066	0.51
1067	0.52
1068	0.55
1069	0.55
1070	0.51
1071	0.44
1072	0.49
1073	0.54
1074	0.58
1075	0.62
1076	0.61
1077	0.6
1078	0.63
1079	0.64
1080	0.63
1081	0.61
1082	0.58
1083	0.57
1084	0.56
1085	0.55
1086	0.57
1087	0.57
1088	0.51
1089	0.44
1090	0.39
1091	0.38
1092	0.35
1093	0.32
1094	0.26
1095	0.23
1096	0.22
1097	0.23
1098	0.21
1099	0.18
1100	0.2
1101	0.22
1102	0.18
1103	0.18
1104	0.2
1105	0.21
1106	0.27
1107	0.27
1108	0.27
1109	0.28
1110	0.32
1111	0.33
1112	0.33
1113	0.33
1114	0.33
1115	0.36
1116	0.36
1117	0.33
1118	0.32
1119	0.31
1120	0.29
1121	0.27
1122	0.21
1123	0.19
1124	0.17
1125	0.17
1126	0.14
1127	0.13
1128	0.14
1129	0.19
1130	0.25
1131	0.29
1132	0.29
1133	0.31
1134	0.3
1135	0.3
1136	0.31
1137	0.26
1138	0.2
1139	0.15
1140	0.16
1141	0.16
1142	0.21
1143	0.26
1144	0.25
1145	0.25
1146	0.27
1147	0.29
1148	0.3
1149	0.31
1150	0.37
1151	0.42
1152	0.51
1153	0.6
1154	0.69
1155	0.75
1156	0.85
1157	0.91
1158	0.92
1159	0.94

Q5KD60

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer