Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A0F4ZDN5

Protein Details
Accession A0A0F4ZDN5    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
576-595ESIKAKKRSKSKGRLPLDNKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
568-589KTSRKSEAESIKAKKRSKSKGR
Subcellular Location(s) mito 11, nucl 8, cyto 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000547  Clathrin_H-chain/VPS_repeat  
IPR001180  CNH_dom  
IPR032914  Vam6/VPS39/TRAP1  
IPR019452  VPS39/TGF_beta_rcpt-assoc_1  
IPR019453  VPS39/TGF_beta_rcpt-assoc_2  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0043231  C:intracellular membrane-bounded organelle  
GO:0006886  P:intracellular protein transport  
GO:0016192  P:vesicle-mediated transport  
Pfam View protein in Pfam  
PF00780  CNH  
PF10366  Vps39_1  
PF10367  Vps39_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50236  CHCR  
PS50219  CNH  
Amino Acid Sequences MLSAFTARPIIELRQRDKSKIESVLAYGDRVLVGLNTGVLRVYRVNELPPESKQALASGNAASDNTTANLSASTPPSQQAASTPFKQKPTDLLREVEKFSTRAIEQLAIIKEANILVSLSNYHVSLHDLQSYELIETLQRSKNAACFATTSNIVKDAATGIPEIRSRLAVAVKRRLLLWNWHESELSPEVSEIVLPETIRTITWANATSLVVGMNSNYSLVDVISHQIDDIANPSGANGTNGSQGRFGAMGTASMGYMGLGSYMPKPLSAKLGEGEMLLAKDINTLFINDKGQAQRKRQIPWQSAPESIGYSYPYLLALQPPAKGTLEIRNPDTLSLLQTIALPGAAQLHFPPPTVSLAHAGKGFHISSERSVWTMDATNYDFQVTELVEAKHYDEAISILNMLEDALLKDKDGSLREAKMRKAEVLFREKKYRDALDLFNEDAVHAPPERVLRLFPPSIVGAYSEWPELQSDESDTEESQTDDADEGDTEPANGTTSHNDAPTIPASAVPTTTDSRPSTPQNTGAGAGAGAGGFVRMFMGQNKSSDAASTAPSQASEASETGSIRGKTSRKSEAESIKAKKRSKSKGRLPLDNKDLTNAVLELNGYLAGTRARLQRVIDPATGKLKPREKGTAAEQTMKRLLTSIKGDSDAELEKQLRETFALVDTTLFRAYMFSRPSLAGSLFRIPNFCDPDVVNEKLLEHNRYNELVDFFYGKKLHAQALALLHKFGSCAEPDAAAPALHGPQRTIRYLAGLSPAHLDLILEYAEWTLQADAAESMEIFVGDTENAEAMPRDRIVEYLGRIEPVLEIQYLEHIITELNDLTPDFHNRLAELFVNYLKEKPRSDEWDRMMERFVRFLRESRQYSLSRAFSMIPRDEPAFYEAQAAVLSLMGNHKQALEIYAFKMEDYAKAEEYCNQVHKMQSTPASRPSSSDGSAEESKLTIYHTLLQLYVNPPPPYKRKLPPALDLLARHGARLPAESTLSLIPDSLAVSDLEAYFRGRMRASTSLVNEARVVAGLRAAEYIGSQHRLLLGDDLPGAVGLAGRNRRVVVTEDKLCGVCHKRLGGSVVSVLANSTMVHYGCLGRAQGGPVVEKKAEVAGVSGWGRKAVSRG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.49
2 0.53
3 0.56
4 0.58
5 0.58
6 0.57
7 0.55
8 0.53
9 0.44
10 0.42
11 0.46
12 0.41
13 0.36
14 0.28
15 0.22
16 0.19
17 0.16
18 0.15
19 0.07
20 0.07
21 0.07
22 0.08
23 0.07
24 0.08
25 0.08
26 0.08
27 0.1
28 0.12
29 0.14
30 0.18
31 0.19
32 0.23
33 0.27
34 0.33
35 0.35
36 0.35
37 0.4
38 0.36
39 0.36
40 0.33
41 0.31
42 0.28
43 0.26
44 0.25
45 0.19
46 0.18
47 0.17
48 0.17
49 0.15
50 0.13
51 0.12
52 0.11
53 0.11
54 0.1
55 0.1
56 0.1
57 0.11
58 0.14
59 0.16
60 0.18
61 0.19
62 0.2
63 0.22
64 0.21
65 0.2
66 0.22
67 0.25
68 0.29
69 0.34
70 0.4
71 0.44
72 0.49
73 0.51
74 0.48
75 0.5
76 0.53
77 0.56
78 0.52
79 0.51
80 0.52
81 0.54
82 0.55
83 0.5
84 0.44
85 0.35
86 0.32
87 0.33
88 0.27
89 0.25
90 0.24
91 0.22
92 0.2
93 0.26
94 0.26
95 0.23
96 0.22
97 0.2
98 0.18
99 0.17
100 0.16
101 0.1
102 0.09
103 0.07
104 0.08
105 0.08
106 0.09
107 0.1
108 0.1
109 0.1
110 0.11
111 0.15
112 0.18
113 0.19
114 0.21
115 0.2
116 0.2
117 0.22
118 0.22
119 0.18
120 0.15
121 0.13
122 0.1
123 0.12
124 0.18
125 0.21
126 0.21
127 0.23
128 0.24
129 0.29
130 0.32
131 0.3
132 0.25
133 0.24
134 0.25
135 0.27
136 0.28
137 0.26
138 0.23
139 0.24
140 0.23
141 0.19
142 0.18
143 0.16
144 0.13
145 0.12
146 0.12
147 0.11
148 0.14
149 0.15
150 0.17
151 0.15
152 0.15
153 0.15
154 0.17
155 0.23
156 0.25
157 0.31
158 0.39
159 0.41
160 0.41
161 0.41
162 0.42
163 0.39
164 0.43
165 0.42
166 0.43
167 0.43
168 0.44
169 0.43
170 0.39
171 0.41
172 0.34
173 0.29
174 0.19
175 0.15
176 0.15
177 0.14
178 0.14
179 0.09
180 0.08
181 0.08
182 0.08
183 0.08
184 0.09
185 0.1
186 0.1
187 0.12
188 0.11
189 0.11
190 0.14
191 0.16
192 0.15
193 0.17
194 0.17
195 0.15
196 0.14
197 0.13
198 0.1
199 0.08
200 0.07
201 0.06
202 0.06
203 0.06
204 0.06
205 0.06
206 0.06
207 0.06
208 0.06
209 0.06
210 0.08
211 0.08
212 0.08
213 0.08
214 0.09
215 0.09
216 0.08
217 0.1
218 0.1
219 0.09
220 0.09
221 0.09
222 0.1
223 0.1
224 0.11
225 0.1
226 0.09
227 0.15
228 0.17
229 0.18
230 0.17
231 0.16
232 0.16
233 0.15
234 0.14
235 0.1
236 0.09
237 0.08
238 0.08
239 0.08
240 0.07
241 0.07
242 0.07
243 0.05
244 0.04
245 0.04
246 0.04
247 0.03
248 0.05
249 0.06
250 0.09
251 0.09
252 0.1
253 0.12
254 0.13
255 0.18
256 0.18
257 0.19
258 0.17
259 0.18
260 0.17
261 0.16
262 0.15
263 0.11
264 0.1
265 0.08
266 0.08
267 0.06
268 0.08
269 0.08
270 0.09
271 0.08
272 0.1
273 0.11
274 0.14
275 0.15
276 0.14
277 0.19
278 0.23
279 0.31
280 0.37
281 0.42
282 0.47
283 0.51
284 0.55
285 0.58
286 0.62
287 0.6
288 0.59
289 0.62
290 0.57
291 0.53
292 0.49
293 0.43
294 0.34
295 0.27
296 0.21
297 0.15
298 0.12
299 0.11
300 0.1
301 0.09
302 0.09
303 0.09
304 0.09
305 0.12
306 0.13
307 0.14
308 0.15
309 0.16
310 0.16
311 0.16
312 0.17
313 0.21
314 0.26
315 0.28
316 0.29
317 0.3
318 0.3
319 0.29
320 0.29
321 0.22
322 0.17
323 0.15
324 0.13
325 0.11
326 0.11
327 0.11
328 0.09
329 0.08
330 0.06
331 0.04
332 0.07
333 0.07
334 0.07
335 0.08
336 0.11
337 0.11
338 0.12
339 0.13
340 0.11
341 0.13
342 0.13
343 0.13
344 0.15
345 0.16
346 0.17
347 0.18
348 0.17
349 0.15
350 0.18
351 0.16
352 0.12
353 0.13
354 0.13
355 0.13
356 0.16
357 0.16
358 0.14
359 0.14
360 0.14
361 0.13
362 0.14
363 0.13
364 0.12
365 0.14
366 0.14
367 0.14
368 0.14
369 0.13
370 0.11
371 0.12
372 0.09
373 0.08
374 0.1
375 0.1
376 0.11
377 0.11
378 0.12
379 0.12
380 0.11
381 0.1
382 0.07
383 0.08
384 0.08
385 0.07
386 0.07
387 0.06
388 0.05
389 0.05
390 0.05
391 0.04
392 0.04
393 0.04
394 0.06
395 0.06
396 0.07
397 0.07
398 0.08
399 0.11
400 0.12
401 0.16
402 0.16
403 0.19
404 0.26
405 0.29
406 0.31
407 0.33
408 0.33
409 0.31
410 0.31
411 0.33
412 0.33
413 0.4
414 0.44
415 0.43
416 0.51
417 0.49
418 0.5
419 0.5
420 0.45
421 0.39
422 0.36
423 0.35
424 0.31
425 0.33
426 0.29
427 0.24
428 0.22
429 0.18
430 0.15
431 0.13
432 0.09
433 0.07
434 0.07
435 0.08
436 0.1
437 0.11
438 0.1
439 0.11
440 0.11
441 0.16
442 0.16
443 0.14
444 0.15
445 0.14
446 0.14
447 0.13
448 0.12
449 0.08
450 0.09
451 0.1
452 0.08
453 0.08
454 0.08
455 0.08
456 0.08
457 0.08
458 0.07
459 0.07
460 0.07
461 0.09
462 0.09
463 0.09
464 0.09
465 0.09
466 0.09
467 0.08
468 0.07
469 0.06
470 0.06
471 0.06
472 0.05
473 0.05
474 0.05
475 0.05
476 0.05
477 0.05
478 0.05
479 0.05
480 0.06
481 0.06
482 0.06
483 0.07
484 0.1
485 0.11
486 0.11
487 0.11
488 0.11
489 0.12
490 0.12
491 0.11
492 0.09
493 0.09
494 0.1
495 0.09
496 0.09
497 0.08
498 0.1
499 0.11
500 0.11
501 0.15
502 0.15
503 0.17
504 0.21
505 0.23
506 0.24
507 0.24
508 0.27
509 0.24
510 0.24
511 0.22
512 0.19
513 0.15
514 0.11
515 0.1
516 0.06
517 0.04
518 0.03
519 0.02
520 0.02
521 0.02
522 0.02
523 0.02
524 0.02
525 0.03
526 0.05
527 0.09
528 0.11
529 0.11
530 0.13
531 0.13
532 0.13
533 0.13
534 0.12
535 0.09
536 0.1
537 0.11
538 0.1
539 0.09
540 0.1
541 0.1
542 0.09
543 0.08
544 0.08
545 0.07
546 0.06
547 0.07
548 0.07
549 0.08
550 0.11
551 0.11
552 0.11
553 0.15
554 0.16
555 0.2
556 0.24
557 0.31
558 0.29
559 0.32
560 0.38
561 0.39
562 0.43
563 0.47
564 0.48
565 0.48
566 0.54
567 0.54
568 0.53
569 0.57
570 0.61
571 0.64
572 0.69
573 0.71
574 0.74
575 0.76
576 0.8
577 0.77
578 0.73
579 0.69
580 0.62
581 0.52
582 0.43
583 0.38
584 0.29
585 0.24
586 0.16
587 0.1
588 0.07
589 0.06
590 0.05
591 0.05
592 0.04
593 0.04
594 0.03
595 0.04
596 0.04
597 0.04
598 0.07
599 0.1
600 0.11
601 0.13
602 0.14
603 0.18
604 0.23
605 0.25
606 0.24
607 0.22
608 0.23
609 0.26
610 0.27
611 0.25
612 0.27
613 0.3
614 0.31
615 0.34
616 0.38
617 0.35
618 0.37
619 0.4
620 0.42
621 0.38
622 0.43
623 0.39
624 0.36
625 0.37
626 0.33
627 0.28
628 0.2
629 0.19
630 0.15
631 0.18
632 0.17
633 0.16
634 0.17
635 0.17
636 0.16
637 0.18
638 0.15
639 0.12
640 0.13
641 0.12
642 0.11
643 0.13
644 0.13
645 0.11
646 0.1
647 0.1
648 0.09
649 0.09
650 0.1
651 0.08
652 0.08
653 0.09
654 0.09
655 0.09
656 0.08
657 0.07
658 0.07
659 0.09
660 0.13
661 0.14
662 0.13
663 0.15
664 0.15
665 0.16
666 0.17
667 0.16
668 0.12
669 0.13
670 0.17
671 0.17
672 0.17
673 0.18
674 0.18
675 0.23
676 0.25
677 0.23
678 0.2
679 0.19
680 0.25
681 0.29
682 0.29
683 0.23
684 0.19
685 0.2
686 0.23
687 0.26
688 0.24
689 0.2
690 0.22
691 0.23
692 0.24
693 0.24
694 0.21
695 0.2
696 0.16
697 0.15
698 0.15
699 0.13
700 0.16
701 0.15
702 0.14
703 0.16
704 0.17
705 0.18
706 0.17
707 0.17
708 0.16
709 0.21
710 0.26
711 0.22
712 0.21
713 0.19
714 0.17
715 0.17
716 0.15
717 0.11
718 0.07
719 0.09
720 0.1
721 0.1
722 0.1
723 0.11
724 0.12
725 0.1
726 0.09
727 0.08
728 0.09
729 0.1
730 0.11
731 0.1
732 0.15
733 0.18
734 0.2
735 0.21
736 0.19
737 0.2
738 0.2
739 0.2
740 0.21
741 0.18
742 0.17
743 0.17
744 0.16
745 0.14
746 0.13
747 0.12
748 0.06
749 0.07
750 0.06
751 0.04
752 0.05
753 0.05
754 0.05
755 0.05
756 0.05
757 0.04
758 0.05
759 0.05
760 0.05
761 0.05
762 0.05
763 0.06
764 0.05
765 0.05
766 0.04
767 0.04
768 0.04
769 0.04
770 0.04
771 0.04
772 0.04
773 0.04
774 0.04
775 0.04
776 0.05
777 0.05
778 0.06
779 0.08
780 0.08
781 0.09
782 0.09
783 0.1
784 0.12
785 0.15
786 0.15
787 0.18
788 0.18
789 0.17
790 0.17
791 0.17
792 0.14
793 0.12
794 0.12
795 0.07
796 0.07
797 0.07
798 0.08
799 0.09
800 0.08
801 0.07
802 0.06
803 0.06
804 0.06
805 0.08
806 0.07
807 0.06
808 0.07
809 0.07
810 0.09
811 0.11
812 0.14
813 0.14
814 0.15
815 0.16
816 0.15
817 0.16
818 0.16
819 0.16
820 0.14
821 0.14
822 0.14
823 0.16
824 0.16
825 0.19
826 0.21
827 0.25
828 0.25
829 0.28
830 0.34
831 0.39
832 0.45
833 0.51
834 0.5
835 0.55
836 0.55
837 0.52
838 0.48
839 0.44
840 0.39
841 0.35
842 0.33
843 0.29
844 0.29
845 0.31
846 0.35
847 0.4
848 0.43
849 0.42
850 0.48
851 0.43
852 0.46
853 0.49
854 0.44
855 0.36
856 0.34
857 0.31
858 0.28
859 0.32
860 0.3
861 0.25
862 0.25
863 0.26
864 0.25
865 0.25
866 0.25
867 0.19
868 0.17
869 0.18
870 0.16
871 0.14
872 0.14
873 0.12
874 0.09
875 0.08
876 0.07
877 0.05
878 0.08
879 0.09
880 0.1
881 0.1
882 0.1
883 0.1
884 0.11
885 0.12
886 0.12
887 0.13
888 0.13
889 0.17
890 0.17
891 0.16
892 0.18
893 0.16
894 0.17
895 0.19
896 0.2
897 0.18
898 0.2
899 0.21
900 0.23
901 0.26
902 0.27
903 0.27
904 0.27
905 0.27
906 0.29
907 0.31
908 0.29
909 0.3
910 0.35
911 0.36
912 0.37
913 0.43
914 0.46
915 0.44
916 0.43
917 0.44
918 0.41
919 0.37
920 0.35
921 0.27
922 0.28
923 0.3
924 0.28
925 0.23
926 0.18
927 0.17
928 0.16
929 0.16
930 0.11
931 0.11
932 0.15
933 0.16
934 0.17
935 0.17
936 0.17
937 0.2
938 0.2
939 0.25
940 0.27
941 0.27
942 0.28
943 0.35
944 0.41
945 0.44
946 0.5
947 0.53
948 0.57
949 0.65
950 0.69
951 0.69
952 0.68
953 0.66
954 0.62
955 0.54
956 0.49
957 0.47
958 0.41
959 0.34
960 0.3
961 0.28
962 0.24
963 0.26
964 0.22
965 0.16
966 0.18
967 0.18
968 0.18
969 0.16
970 0.16
971 0.14
972 0.13
973 0.1
974 0.09
975 0.1
976 0.08
977 0.08
978 0.07
979 0.07
980 0.08
981 0.09
982 0.09
983 0.09
984 0.1
985 0.12
986 0.14
987 0.16
988 0.15
989 0.17
990 0.21
991 0.26
992 0.28
993 0.32
994 0.33
995 0.4
996 0.4
997 0.39
998 0.34
999 0.29
1000 0.26
1001 0.21
1002 0.19
1003 0.1
1004 0.11
1005 0.1
1006 0.1
1007 0.1
1008 0.09
1009 0.08
1010 0.08
1011 0.11
1012 0.14
1013 0.17
1014 0.16
1015 0.16
1016 0.18
1017 0.2
1018 0.2
1019 0.2
1020 0.16
1021 0.15
1022 0.15
1023 0.14
1024 0.12
1025 0.11
1026 0.1
1027 0.06
1028 0.07
1029 0.06
1030 0.13
1031 0.18
1032 0.19
1033 0.21
1034 0.22
1035 0.23
1036 0.24
1037 0.28
1038 0.3
1039 0.33
1040 0.37
1041 0.38
1042 0.39
1043 0.39
1044 0.37
1045 0.4
1046 0.38
1047 0.34
1048 0.34
1049 0.36
1050 0.35
1051 0.38
1052 0.41
1053 0.36
1054 0.32
1055 0.29
1056 0.26
1057 0.23
1058 0.21
1059 0.18
1060 0.14
1061 0.12
1062 0.1
1063 0.1
1064 0.11
1065 0.11
1066 0.11
1067 0.13
1068 0.14
1069 0.14
1070 0.17
1071 0.16
1072 0.15
1073 0.16
1074 0.18
1075 0.19
1076 0.19
1077 0.22
1078 0.23
1079 0.27
1080 0.25
1081 0.24
1082 0.23
1083 0.22
1084 0.22
1085 0.18
1086 0.16
1087 0.12
1088 0.17
1089 0.19
1090 0.2
1091 0.19
1092 0.19
1093 0.2