FuNGI

Q5KBF6

Protein Details

Accession

Q5KBF6

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
199-219	QSLTAKAKRRRRDGEFASPQL	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
207-208	RR

Subcellular Location(s)

cyto 13.5, nucl 8, cyto_mito 7.5, pero 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR011545 DEAD/DEAH_box_helicase_dom IPR014001 Helicase_ATP-bd IPR001650 Helicase_C IPR027417 P-loop_NTPase IPR025696 rRNA_proc-arch_dom IPR016438 SKI2-like IPR012961 Ski2/MTR4_C IPR040801 Ski2_N
Gene Ontology	GO:0055087 C:Ski complex GO:0005524 F:ATP binding GO:0016787 F:hydrolase activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0003724 F:RNA helicase activity GO:0030968 P:endoplasmic reticulum unfolded protein response GO:0070478 P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, 3'-5' exonucleolytic nonsense-mediated decay GO:0070481 P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, non-stop decay
Pfam	View protein in Pfam PF00270 DEAD PF08148 DSHCT PF13234 rRNA_proc-arch PF17911 Ski2_N
PROSITE	View protein in PROSITE PS51192 HELICASE_ATP_BIND_1 PS51194 HELICASE_CTER
CDD	cd18795 SF2_C_Ski2

Amino Acid Sequences

MEQTTDIEDSVFLELLNTAANPTSVDAIPSDELATSLGIDGPLSREQALELLENEVLSPVHKFQGHELGQWQVQPPISLPIPPLTLSPLHQTHTVTPSFRGINGEFTHWREALAPKPPAHPTLSSSTTRAPGSMQNFVRGKGSYAPFLPGGLEAAAKVEEDEDEDEDEEVGWKTRAPGMKKGAKLDGADKFLAEMLGQQSLTAKAKRRRRDGEFASPQLTVSRLGDKDEDVDGIDLKPVQSSDKNIDDLLPIGRLPAPPSSKKQFKAVAKKEWAHVVDVNQKLENFNELVPEMAKDYPFELDNFQKEAVYRLEMGDSVFVAAHTSAGKTVVAEYAIALAAKHMTKTIYTSPIKALSNQKFRDFKTTFEPSTVGILTGDVQINAEGSCLIMTTEILRSMLYKGADLIRDVEFVVFDEVHYVNDAERGVVWEEVIIMLPEHVNIILLSATVPNTKEFADWVGRTKKKDIYVISTPMRPVPLEHFLWAGRETHKIVSSQSKFLMEGYSSASDALRRKQDKEREANGLPPVQRTGGRGGAAIRAKDLPTGKSAPFTRIGAGRNHTNRGGGNGPPQAAFGGGRGGRGGGRGGFGGSSRPSHVLDQNIWTHLISYLKKNMLLPVVNFVFSKKRCEEYAQTLSLDLCTAKEKSEVHITWERALTRLKGEDKTLPQILRMRELLSRGIGVHHGGLLPLVKEVVEILFARGLVKVLFATETFAMGVNMPAKSVVFSGIRKHDGTSFRNLLPGEYTQMAGRAGRRGLDTTGTVIILSGDELPSVEELNEMMLGVPNRLSSQFRLTYNMILNLLRVEALKVEEMIKRSFSENATQKMAPEQQRVIAQTEKELAKLPKLECDVCSADIDAFYNLSTEASRLNAQFLKRASWSNQSGKLFVPGRVIVLRNAHFPGNLAVILGNHPNLGPDGQRSDVKAFRVLVLVTPGQKSGKGDLSVEELTPRWPPILPKGSFPSPTAERTVVDTSSISFVINHILKYDFHRLNSRESPSDVQRALDDLTKLHEELSLLPELPEADWSRLRDIDIQSLLKERTNAAGRLSKLGCQLCEDFADHYATVHERKQVEQRIQKLKLQLSDQNLELLPDYESRVEVLKRLSFIDENATVLLKGRVACEINSAPELILTELILENILADYTPEEVVALLSIFVFVEKTESQPIIPTKLQDGLDVIYNIAEQVEREQDYCQVQHDEFATKYKPGLVEVVYEWARGMPFNEITNLTDVPEGTIVRVITRLDETCREVRDAARVIGDADLFKKMEEAQGLIRRDIVFAASLYL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.08
2	0.08
3	0.09
4	0.07
5	0.07
6	0.07
7	0.08
8	0.08
9	0.09
10	0.12
11	0.11
12	0.12
13	0.12
14	0.15
15	0.16
16	0.16
17	0.15
18	0.11
19	0.12
20	0.11
21	0.11
22	0.08
23	0.08
24	0.08
25	0.07
26	0.07
27	0.08
28	0.11
29	0.13
30	0.14
31	0.14
32	0.13
33	0.14
34	0.16
35	0.17
36	0.15
37	0.14
38	0.14
39	0.14
40	0.14
41	0.14
42	0.12
43	0.11
44	0.1
45	0.11
46	0.11
47	0.15
48	0.18
49	0.19
50	0.22
51	0.33
52	0.34
53	0.34
54	0.35
55	0.35
56	0.34
57	0.35
58	0.33
59	0.26
60	0.25
61	0.23
62	0.22
63	0.23
64	0.22
65	0.21
66	0.21
67	0.21
68	0.22
69	0.22
70	0.21
71	0.19
72	0.2
73	0.21
74	0.26
75	0.26
76	0.26
77	0.29
78	0.3
79	0.32
80	0.36
81	0.37
82	0.32
83	0.31
84	0.34
85	0.32
86	0.31
87	0.32
88	0.27
89	0.3
90	0.3
91	0.34
92	0.32
93	0.35
94	0.38
95	0.33
96	0.32
97	0.29
98	0.31
99	0.31
100	0.36
101	0.39
102	0.36
103	0.42
104	0.45
105	0.44
106	0.44
107	0.4
108	0.36
109	0.37
110	0.4
111	0.37
112	0.37
113	0.37
114	0.37
115	0.35
116	0.31
117	0.26
118	0.28
119	0.3
120	0.36
121	0.33
122	0.38
123	0.39
124	0.39
125	0.4
126	0.34
127	0.32
128	0.31
129	0.32
130	0.28
131	0.27
132	0.29
133	0.26
134	0.26
135	0.24
136	0.16
137	0.15
138	0.12
139	0.1
140	0.07
141	0.08
142	0.08
143	0.08
144	0.07
145	0.07
146	0.06
147	0.08
148	0.1
149	0.1
150	0.11
151	0.12
152	0.12
153	0.12
154	0.12
155	0.11
156	0.1
157	0.1
158	0.09
159	0.09
160	0.11
161	0.16
162	0.22
163	0.25
164	0.33
165	0.41
166	0.49
167	0.52
168	0.55
169	0.55
170	0.52
171	0.5
172	0.48
173	0.45
174	0.41
175	0.37
176	0.32
177	0.28
178	0.24
179	0.22
180	0.15
181	0.12
182	0.1
183	0.12
184	0.11
185	0.11
186	0.12
187	0.16
188	0.2
189	0.22
190	0.3
191	0.36
192	0.46
193	0.55
194	0.64
195	0.69
196	0.73
197	0.79
198	0.78
199	0.81
200	0.8
201	0.75
202	0.67
203	0.58
204	0.5
205	0.4
206	0.33
207	0.24
208	0.17
209	0.2
210	0.17
211	0.2
212	0.21
213	0.2
214	0.22
215	0.21
216	0.19
217	0.13
218	0.13
219	0.12
220	0.11
221	0.12
222	0.1
223	0.09
224	0.1
225	0.09
226	0.13
227	0.14
228	0.18
229	0.23
230	0.26
231	0.27
232	0.27
233	0.27
234	0.23
235	0.23
236	0.19
237	0.15
238	0.11
239	0.11
240	0.12
241	0.12
242	0.14
243	0.19
244	0.24
245	0.28
246	0.35
247	0.43
248	0.49
249	0.51
250	0.56
251	0.58
252	0.62
253	0.68
254	0.69
255	0.7
256	0.71
257	0.71
258	0.67
259	0.65
260	0.57
261	0.48
262	0.43
263	0.38
264	0.38
265	0.39
266	0.38
267	0.32
268	0.31
269	0.29
270	0.27
271	0.25
272	0.17
273	0.14
274	0.14
275	0.12
276	0.13
277	0.12
278	0.12
279	0.11
280	0.11
281	0.11
282	0.1
283	0.11
284	0.12
285	0.12
286	0.13
287	0.14
288	0.18
289	0.2
290	0.22
291	0.21
292	0.2
293	0.2
294	0.22
295	0.2
296	0.17
297	0.15
298	0.14
299	0.14
300	0.14
301	0.14
302	0.11
303	0.09
304	0.08
305	0.07
306	0.06
307	0.06
308	0.06
309	0.06
310	0.06
311	0.06
312	0.06
313	0.07
314	0.07
315	0.07
316	0.07
317	0.07
318	0.07
319	0.07
320	0.07
321	0.07
322	0.07
323	0.07
324	0.06
325	0.05
326	0.07
327	0.08
328	0.08
329	0.08
330	0.08
331	0.09
332	0.13
333	0.17
334	0.23
335	0.24
336	0.26
337	0.28
338	0.32
339	0.32
340	0.34
341	0.4
342	0.4
343	0.48
344	0.49
345	0.54
346	0.54
347	0.55
348	0.6
349	0.51
350	0.45
351	0.43
352	0.47
353	0.4
354	0.37
355	0.36
356	0.26
357	0.28
358	0.26
359	0.18
360	0.11
361	0.11
362	0.1
363	0.11
364	0.11
365	0.08
366	0.08
367	0.07
368	0.08
369	0.07
370	0.06
371	0.04
372	0.04
373	0.04
374	0.04
375	0.04
376	0.03
377	0.04
378	0.05
379	0.06
380	0.07
381	0.07
382	0.07
383	0.08
384	0.09
385	0.12
386	0.11
387	0.1
388	0.11
389	0.13
390	0.14
391	0.14
392	0.15
393	0.12
394	0.13
395	0.13
396	0.11
397	0.09
398	0.09
399	0.1
400	0.07
401	0.06
402	0.09
403	0.08
404	0.09
405	0.09
406	0.09
407	0.07
408	0.09
409	0.09
410	0.07
411	0.07
412	0.08
413	0.09
414	0.09
415	0.08
416	0.06
417	0.06
418	0.06
419	0.06
420	0.05
421	0.04
422	0.04
423	0.04
424	0.04
425	0.04
426	0.04
427	0.04
428	0.04
429	0.04
430	0.04
431	0.04
432	0.04
433	0.05
434	0.05
435	0.07
436	0.07
437	0.08
438	0.09
439	0.09
440	0.09
441	0.09
442	0.11
443	0.15
444	0.15
445	0.21
446	0.29
447	0.32
448	0.35
449	0.38
450	0.4
451	0.39
452	0.44
453	0.4
454	0.38
455	0.39
456	0.43
457	0.42
458	0.39
459	0.36
460	0.31
461	0.29
462	0.22
463	0.18
464	0.17
465	0.19
466	0.18
467	0.18
468	0.19
469	0.18
470	0.19
471	0.19
472	0.16
473	0.13
474	0.15
475	0.16
476	0.16
477	0.18
478	0.17
479	0.18
480	0.26
481	0.27
482	0.27
483	0.27
484	0.25
485	0.24
486	0.24
487	0.23
488	0.13
489	0.11
490	0.12
491	0.11
492	0.1
493	0.1
494	0.1
495	0.12
496	0.14
497	0.18
498	0.23
499	0.25
500	0.29
501	0.37
502	0.46
503	0.51
504	0.58
505	0.57
506	0.56
507	0.54
508	0.54
509	0.48
510	0.44
511	0.36
512	0.28
513	0.25
514	0.19
515	0.19
516	0.17
517	0.18
518	0.16
519	0.16
520	0.15
521	0.15
522	0.19
523	0.2
524	0.18
525	0.16
526	0.15
527	0.15
528	0.17
529	0.18
530	0.14
531	0.15
532	0.19
533	0.18
534	0.22
535	0.23
536	0.22
537	0.23
538	0.22
539	0.2
540	0.21
541	0.23
542	0.21
543	0.23
544	0.28
545	0.28
546	0.31
547	0.29
548	0.27
549	0.25
550	0.25
551	0.24
552	0.18
553	0.2
554	0.19
555	0.19
556	0.18
557	0.18
558	0.14
559	0.13
560	0.11
561	0.07
562	0.09
563	0.09
564	0.09
565	0.08
566	0.09
567	0.08
568	0.09
569	0.09
570	0.05
571	0.06
572	0.06
573	0.06
574	0.06
575	0.06
576	0.07
577	0.08
578	0.08
579	0.09
580	0.1
581	0.12
582	0.14
583	0.16
584	0.16
585	0.17
586	0.19
587	0.19
588	0.19
589	0.18
590	0.15
591	0.14
592	0.12
593	0.15
594	0.12
595	0.14
596	0.17
597	0.18
598	0.19
599	0.19
600	0.19
601	0.18
602	0.18
603	0.16
604	0.16
605	0.16
606	0.16
607	0.15
608	0.15
609	0.18
610	0.18
611	0.23
612	0.2
613	0.22
614	0.23
615	0.27
616	0.3
617	0.32
618	0.36
619	0.32
620	0.3
621	0.28
622	0.27
623	0.23
624	0.19
625	0.11
626	0.06
627	0.07
628	0.07
629	0.07
630	0.1
631	0.1
632	0.12
633	0.2
634	0.19
635	0.23
636	0.28
637	0.28
638	0.28
639	0.29
640	0.27
641	0.21
642	0.23
643	0.18
644	0.14
645	0.18
646	0.19
647	0.18
648	0.2
649	0.23
650	0.23
651	0.27
652	0.28
653	0.24
654	0.24
655	0.27
656	0.26
657	0.24
658	0.23
659	0.2
660	0.18
661	0.2
662	0.18
663	0.14
664	0.13
665	0.1
666	0.1
667	0.09
668	0.08
669	0.07
670	0.06
671	0.06
672	0.05
673	0.05
674	0.05
675	0.05
676	0.04
677	0.04
678	0.04
679	0.04
680	0.04
681	0.04
682	0.05
683	0.04
684	0.05
685	0.05
686	0.06
687	0.06
688	0.06
689	0.06
690	0.05
691	0.05
692	0.05
693	0.04
694	0.05
695	0.05
696	0.06
697	0.06
698	0.06
699	0.06
700	0.06
701	0.06
702	0.06
703	0.07
704	0.07
705	0.07
706	0.06
707	0.06
708	0.06
709	0.06
710	0.07
711	0.08
712	0.08
713	0.1
714	0.14
715	0.18
716	0.2
717	0.2
718	0.21
719	0.24
720	0.28
721	0.3
722	0.33
723	0.32
724	0.3
725	0.33
726	0.32
727	0.26
728	0.22
729	0.2
730	0.16
731	0.13
732	0.13
733	0.1
734	0.11
735	0.11
736	0.1
737	0.11
738	0.11
739	0.11
740	0.12
741	0.12
742	0.13
743	0.13
744	0.14
745	0.13
746	0.12
747	0.12
748	0.11
749	0.09
750	0.08
751	0.07
752	0.06
753	0.06
754	0.04
755	0.04
756	0.04
757	0.04
758	0.04
759	0.04
760	0.05
761	0.04
762	0.04
763	0.04
764	0.04
765	0.04
766	0.04
767	0.04
768	0.05
769	0.05
770	0.06
771	0.06
772	0.06
773	0.07
774	0.09
775	0.1
776	0.1
777	0.16
778	0.2
779	0.2
780	0.25
781	0.25
782	0.27
783	0.27
784	0.27
785	0.22
786	0.18
787	0.17
788	0.13
789	0.12
790	0.09
791	0.07
792	0.06
793	0.05
794	0.06
795	0.06
796	0.07
797	0.09
798	0.11
799	0.13
800	0.14
801	0.14
802	0.14
803	0.16
804	0.18
805	0.17
806	0.23
807	0.26
808	0.29
809	0.32
810	0.3
811	0.29
812	0.31
813	0.36
814	0.33
815	0.31
816	0.28
817	0.27
818	0.3
819	0.31
820	0.3
821	0.26
822	0.21
823	0.19
824	0.23
825	0.21
826	0.19
827	0.22
828	0.2
829	0.2
830	0.26
831	0.24
832	0.25
833	0.28
834	0.28
835	0.24
836	0.28
837	0.27
838	0.23
839	0.23
840	0.18
841	0.15
842	0.14
843	0.14
844	0.09
845	0.07
846	0.06
847	0.06
848	0.05
849	0.06
850	0.06
851	0.05
852	0.06
853	0.07
854	0.1
855	0.1
856	0.13
857	0.16
858	0.16
859	0.2
860	0.21
861	0.22
862	0.22
863	0.25
864	0.25
865	0.29
866	0.35
867	0.37
868	0.43
869	0.41
870	0.4
871	0.37
872	0.41
873	0.35
874	0.3
875	0.28
876	0.21
877	0.22
878	0.23
879	0.24
880	0.19
881	0.22
882	0.22
883	0.21
884	0.23
885	0.21
886	0.19
887	0.19
888	0.18
889	0.14
890	0.12
891	0.1
892	0.08
893	0.08
894	0.1
895	0.1
896	0.09
897	0.07
898	0.07
899	0.08
900	0.08
901	0.09
902	0.08
903	0.09
904	0.12
905	0.14
906	0.16
907	0.17
908	0.21
909	0.23
910	0.24
911	0.25
912	0.23
913	0.22
914	0.22
915	0.2
916	0.17
917	0.17
918	0.17
919	0.15
920	0.15
921	0.16
922	0.15
923	0.16
924	0.17
925	0.18
926	0.21
927	0.2
928	0.2
929	0.19
930	0.24
931	0.23
932	0.22
933	0.19
934	0.15
935	0.15
936	0.16
937	0.15
938	0.11
939	0.12
940	0.14
941	0.22
942	0.31
943	0.3
944	0.34
945	0.39
946	0.42
947	0.43
948	0.42
949	0.39
950	0.33
951	0.35
952	0.34
953	0.29
954	0.25
955	0.28
956	0.29
957	0.23
958	0.2
959	0.18
960	0.15
961	0.16
962	0.15
963	0.11
964	0.09
965	0.09
966	0.14
967	0.16
968	0.15
969	0.14
970	0.15
971	0.16
972	0.22
973	0.31
974	0.27
975	0.28
976	0.37
977	0.37
978	0.44
979	0.49
980	0.49
981	0.42
982	0.43
983	0.45
984	0.42
985	0.47
986	0.39
987	0.33
988	0.29
989	0.28
990	0.26
991	0.24
992	0.2
993	0.13
994	0.16
995	0.17
996	0.17
997	0.15
998	0.15
999	0.12
1000	0.14
1001	0.16
1002	0.14
1003	0.13
1004	0.13
1005	0.13
1006	0.12
1007	0.12
1008	0.14
1009	0.13
1010	0.15
1011	0.19
1012	0.2
1013	0.23
1014	0.23
1015	0.25
1016	0.26
1017	0.26
1018	0.29
1019	0.29
1020	0.29
1021	0.27
1022	0.31
1023	0.3
1024	0.26
1025	0.25
1026	0.2
1027	0.23
1028	0.27
1029	0.27
1030	0.27
1031	0.31
1032	0.31
1033	0.37
1034	0.37
1035	0.33
1036	0.34
1037	0.36
1038	0.32
1039	0.3
1040	0.3
1041	0.25
1042	0.26
1043	0.24
1044	0.19
1045	0.18
1046	0.2
1047	0.16
1048	0.15
1049	0.15
1050	0.16
1051	0.18
1052	0.19
1053	0.23
1054	0.22
1055	0.26
1056	0.35
1057	0.41
1058	0.48
1059	0.53
1060	0.59
1061	0.64
1062	0.67
1063	0.67
1064	0.65
1065	0.62
1066	0.57
1067	0.54
1068	0.51
1069	0.47
1070	0.46
1071	0.42
1072	0.38
1073	0.33
1074	0.29
1075	0.24
1076	0.19
1077	0.14
1078	0.12
1079	0.14
1080	0.11
1081	0.12
1082	0.12
1083	0.15
1084	0.15
1085	0.16
1086	0.2
1087	0.21
1088	0.22
1089	0.23
1090	0.26
1091	0.23
1092	0.23
1093	0.26
1094	0.22
1095	0.21
1096	0.2
1097	0.19
1098	0.15
1099	0.16
1100	0.16
1101	0.12
1102	0.12
1103	0.12
1104	0.16
1105	0.17
1106	0.17
1107	0.22
1108	0.22
1109	0.23
1110	0.23
1111	0.22
1112	0.18
1113	0.17
1114	0.17
1115	0.12
1116	0.1
1117	0.08
1118	0.08
1119	0.08
1120	0.08
1121	0.07
1122	0.06
1123	0.06
1124	0.05
1125	0.06
1126	0.04
1127	0.04
1128	0.05
1129	0.06
1130	0.07
1131	0.06
1132	0.06
1133	0.06
1134	0.06
1135	0.07
1136	0.06
1137	0.05
1138	0.04
1139	0.05
1140	0.05
1141	0.05
1142	0.05
1143	0.04
1144	0.09
1145	0.09
1146	0.12
1147	0.16
1148	0.17
1149	0.17
1150	0.23
1151	0.26
1152	0.28
1153	0.29
1154	0.29
1155	0.27
1156	0.33
1157	0.33
1158	0.28
1159	0.26
1160	0.21
1161	0.23
1162	0.22
1163	0.19
1164	0.13
1165	0.13
1166	0.12
1167	0.1
1168	0.09
1169	0.06
1170	0.09
1171	0.14
1172	0.15
1173	0.16
1174	0.17
1175	0.21
1176	0.25
1177	0.25
1178	0.26
1179	0.25
1180	0.24
1181	0.27
1182	0.28
1183	0.28
1184	0.25
1185	0.3
1186	0.28
1187	0.25
1188	0.26
1189	0.26
1190	0.25
1191	0.23
1192	0.25
1193	0.21
1194	0.22
1195	0.22
1196	0.28
1197	0.24
1198	0.23
1199	0.22
1200	0.19
1201	0.18
1202	0.16
1203	0.16
1204	0.14
1205	0.16
1206	0.18
1207	0.21
1208	0.21
1209	0.22
1210	0.25
1211	0.24
1212	0.2
1213	0.19
1214	0.17
1215	0.16
1216	0.17
1217	0.15
1218	0.13
1219	0.16
1220	0.14
1221	0.14
1222	0.16
1223	0.15
1224	0.15
1225	0.19
1226	0.2
1227	0.22
1228	0.26
1229	0.31
1230	0.34
1231	0.36
1232	0.37
1233	0.35
1234	0.34
1235	0.38
1236	0.37
1237	0.33
1238	0.3
1239	0.28
1240	0.26
1241	0.25
1242	0.24
1243	0.18
1244	0.16
1245	0.18
1246	0.16
1247	0.15
1248	0.16
1249	0.15
1250	0.18
1251	0.18
1252	0.19
1253	0.24
1254	0.32
1255	0.35
1256	0.34
1257	0.36
1258	0.33
1259	0.31
1260	0.29
1261	0.22
1262	0.16

Q5KBF6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer