Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q5KF11

Protein Details
Accession Q5KF11    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
69-96SNAAIAREERRNKKRKKGEKDYTSNTSNHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
76-87EERRNKKRKKGE
211-239KGKDKEKKEKTEGEKKKLTAEEKQKMSKR
Subcellular Location(s) nucl 13, cyto_nucl 11.5, cyto 8, pero 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR003954  RRM_dom_euk  
IPR034393  TatSF1-like  
Gene Ontology GO:0005686  C:U2 snRNP  
GO:0005684  C:U2-type spliceosomal complex  
GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG cne:CNF03490  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MPNAPIPGQFEQDTRVSFDKVSGKWQYEDDEGTEHEWNGTAWIPIIDDELVRAQQAAYSVPGVDESTPSNAAIAREERRNKKRKKGEKDYTSNTSNAPAAATEASKPAPAPSAPKKTGVWVTNLPPNTTIQKLADVFSKAGVLHIDDEGNPRIKMYYDDEGNFKGEAWVVYFKEGSVDLAITLLDDTELELGAGYPPMRVKVAEYFKDQEKGKDKEKKEKTEGEKKKLTAEEKQKMSKRMKTLQSKITWRSDDESDDPAAPLGGAPAPTNNRFARVVVLKGMFVPEELEKDPALLLELKEEVREEAETLGQVTSVILYDKEEDGVMTIKFKEPVSAQACVAKMNNRYFDGRVIYAGLYNGKERFKKSGGRTFDEDNDQEEKERLDNFAHWLVEGEDEEAAKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.28
3 0.26
4 0.24
5 0.29
6 0.33
7 0.31
8 0.38
9 0.39
10 0.4
11 0.4
12 0.42
13 0.4
14 0.36
15 0.37
16 0.3
17 0.26
18 0.24
19 0.25
20 0.24
21 0.2
22 0.17
23 0.16
24 0.14
25 0.13
26 0.13
27 0.1
28 0.09
29 0.09
30 0.1
31 0.09
32 0.11
33 0.1
34 0.09
35 0.1
36 0.11
37 0.11
38 0.11
39 0.11
40 0.09
41 0.1
42 0.11
43 0.1
44 0.09
45 0.1
46 0.1
47 0.1
48 0.1
49 0.1
50 0.1
51 0.1
52 0.1
53 0.13
54 0.13
55 0.13
56 0.13
57 0.14
58 0.14
59 0.17
60 0.2
61 0.22
62 0.3
63 0.39
64 0.49
65 0.58
66 0.68
67 0.73
68 0.79
69 0.85
70 0.87
71 0.89
72 0.9
73 0.91
74 0.91
75 0.92
76 0.88
77 0.84
78 0.76
79 0.66
80 0.55
81 0.46
82 0.36
83 0.27
84 0.2
85 0.13
86 0.11
87 0.11
88 0.11
89 0.1
90 0.11
91 0.11
92 0.11
93 0.12
94 0.11
95 0.12
96 0.12
97 0.19
98 0.26
99 0.35
100 0.36
101 0.4
102 0.39
103 0.41
104 0.47
105 0.42
106 0.38
107 0.33
108 0.35
109 0.37
110 0.38
111 0.34
112 0.28
113 0.28
114 0.26
115 0.23
116 0.21
117 0.16
118 0.19
119 0.2
120 0.2
121 0.21
122 0.2
123 0.18
124 0.17
125 0.17
126 0.13
127 0.12
128 0.12
129 0.09
130 0.08
131 0.09
132 0.09
133 0.08
134 0.11
135 0.13
136 0.15
137 0.14
138 0.13
139 0.13
140 0.13
141 0.15
142 0.16
143 0.18
144 0.19
145 0.2
146 0.22
147 0.22
148 0.23
149 0.21
150 0.16
151 0.12
152 0.1
153 0.09
154 0.09
155 0.11
156 0.1
157 0.11
158 0.11
159 0.1
160 0.11
161 0.1
162 0.09
163 0.06
164 0.06
165 0.05
166 0.05
167 0.05
168 0.04
169 0.04
170 0.03
171 0.03
172 0.03
173 0.03
174 0.03
175 0.03
176 0.03
177 0.03
178 0.03
179 0.03
180 0.04
181 0.04
182 0.04
183 0.05
184 0.06
185 0.06
186 0.06
187 0.07
188 0.14
189 0.19
190 0.21
191 0.24
192 0.26
193 0.27
194 0.33
195 0.32
196 0.31
197 0.33
198 0.35
199 0.41
200 0.47
201 0.49
202 0.54
203 0.62
204 0.64
205 0.62
206 0.67
207 0.67
208 0.69
209 0.74
210 0.71
211 0.68
212 0.61
213 0.61
214 0.57
215 0.52
216 0.49
217 0.51
218 0.51
219 0.51
220 0.57
221 0.57
222 0.6
223 0.63
224 0.6
225 0.57
226 0.58
227 0.62
228 0.64
229 0.66
230 0.66
231 0.66
232 0.67
233 0.65
234 0.63
235 0.56
236 0.48
237 0.44
238 0.38
239 0.35
240 0.3
241 0.28
242 0.22
243 0.21
244 0.19
245 0.16
246 0.14
247 0.1
248 0.07
249 0.06
250 0.05
251 0.05
252 0.05
253 0.09
254 0.12
255 0.14
256 0.2
257 0.19
258 0.21
259 0.22
260 0.22
261 0.24
262 0.23
263 0.23
264 0.22
265 0.23
266 0.2
267 0.19
268 0.19
269 0.14
270 0.11
271 0.12
272 0.08
273 0.11
274 0.12
275 0.13
276 0.12
277 0.12
278 0.12
279 0.1
280 0.11
281 0.1
282 0.09
283 0.09
284 0.11
285 0.11
286 0.11
287 0.12
288 0.11
289 0.1
290 0.1
291 0.09
292 0.09
293 0.09
294 0.09
295 0.09
296 0.09
297 0.07
298 0.07
299 0.06
300 0.06
301 0.05
302 0.06
303 0.05
304 0.06
305 0.08
306 0.09
307 0.09
308 0.09
309 0.09
310 0.09
311 0.11
312 0.1
313 0.11
314 0.12
315 0.13
316 0.16
317 0.16
318 0.18
319 0.17
320 0.26
321 0.28
322 0.29
323 0.27
324 0.3
325 0.3
326 0.29
327 0.3
328 0.27
329 0.3
330 0.34
331 0.38
332 0.36
333 0.39
334 0.38
335 0.41
336 0.39
337 0.33
338 0.28
339 0.25
340 0.22
341 0.2
342 0.2
343 0.19
344 0.16
345 0.18
346 0.21
347 0.26
348 0.3
349 0.32
350 0.38
351 0.4
352 0.48
353 0.54
354 0.59
355 0.6
356 0.62
357 0.63
358 0.62
359 0.62
360 0.6
361 0.52
362 0.47
363 0.43
364 0.38
365 0.35
366 0.31
367 0.27
368 0.23
369 0.23
370 0.21
371 0.2
372 0.21
373 0.25
374 0.28
375 0.27
376 0.24
377 0.24
378 0.22
379 0.22
380 0.2
381 0.16
382 0.12