Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q5KA73

Protein Details
Accession Q5KA73    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
70-90TRESRRRDPYEQPRPRPSRRGBasic
236-267RDYDRREDRYPPRDRSPRRDYPTRDDDRRRDDBasic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 13, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0016607  C:nuclear speck  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG cne:CNJ02730  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MTSKVYLGRLPPGLQKADVEEHFKGFRIQDVRLMGTFGFVEFDSPRDAEDAVHEFNGKPLLGESIVVEPTRESRRRDPYEQPRPRPSRRGVRINVSGFSSETSWQDLKDYGRLGGNTIIYADVDKRNPGHGVIEYRNMEEAQEAIRRLAGVDINGAPVTLEIAPADPEFDREFDRRPPPRDYDDRRAPRDYYDRPPPRDYHDRPPRRYDDRRGPRDYDDRRAPRDRDYYEDRRAPRDYDRREDRYPPRDRSPRRDYPTRDDDRRRDDVPPPVGP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.33
3 0.32
4 0.35
5 0.35
6 0.35
7 0.31
8 0.32
9 0.32
10 0.31
11 0.3
12 0.24
13 0.28
14 0.25
15 0.25
16 0.27
17 0.3
18 0.31
19 0.29
20 0.29
21 0.22
22 0.2
23 0.19
24 0.13
25 0.11
26 0.08
27 0.1
28 0.09
29 0.11
30 0.12
31 0.12
32 0.12
33 0.12
34 0.12
35 0.1
36 0.14
37 0.17
38 0.15
39 0.16
40 0.17
41 0.15
42 0.17
43 0.19
44 0.15
45 0.11
46 0.1
47 0.11
48 0.11
49 0.11
50 0.11
51 0.11
52 0.12
53 0.12
54 0.12
55 0.1
56 0.15
57 0.23
58 0.26
59 0.3
60 0.37
61 0.47
62 0.55
63 0.6
64 0.66
65 0.69
66 0.75
67 0.8
68 0.79
69 0.79
70 0.81
71 0.81
72 0.79
73 0.76
74 0.76
75 0.74
76 0.76
77 0.7
78 0.7
79 0.71
80 0.65
81 0.58
82 0.48
83 0.4
84 0.3
85 0.26
86 0.2
87 0.13
88 0.11
89 0.14
90 0.13
91 0.12
92 0.13
93 0.14
94 0.14
95 0.16
96 0.16
97 0.13
98 0.15
99 0.15
100 0.15
101 0.15
102 0.14
103 0.11
104 0.1
105 0.09
106 0.07
107 0.08
108 0.08
109 0.08
110 0.09
111 0.1
112 0.1
113 0.12
114 0.12
115 0.12
116 0.12
117 0.12
118 0.16
119 0.16
120 0.21
121 0.2
122 0.2
123 0.2
124 0.18
125 0.16
126 0.12
127 0.11
128 0.07
129 0.09
130 0.09
131 0.08
132 0.08
133 0.08
134 0.08
135 0.09
136 0.08
137 0.05
138 0.07
139 0.07
140 0.07
141 0.07
142 0.07
143 0.06
144 0.05
145 0.06
146 0.05
147 0.04
148 0.04
149 0.04
150 0.05
151 0.05
152 0.07
153 0.05
154 0.08
155 0.08
156 0.09
157 0.12
158 0.13
159 0.16
160 0.21
161 0.31
162 0.36
163 0.39
164 0.44
165 0.46
166 0.52
167 0.59
168 0.61
169 0.62
170 0.66
171 0.7
172 0.69
173 0.68
174 0.61
175 0.57
176 0.57
177 0.53
178 0.5
179 0.52
180 0.56
181 0.58
182 0.61
183 0.58
184 0.57
185 0.62
186 0.61
187 0.61
188 0.63
189 0.68
190 0.69
191 0.75
192 0.75
193 0.74
194 0.77
195 0.75
196 0.75
197 0.76
198 0.8
199 0.77
200 0.73
201 0.71
202 0.73
203 0.69
204 0.67
205 0.66
206 0.65
207 0.66
208 0.7
209 0.66
210 0.64
211 0.66
212 0.6
213 0.57
214 0.58
215 0.59
216 0.6
217 0.65
218 0.6
219 0.57
220 0.57
221 0.53
222 0.55
223 0.57
224 0.56
225 0.59
226 0.65
227 0.66
228 0.69
229 0.75
230 0.74
231 0.74
232 0.76
233 0.73
234 0.74
235 0.78
236 0.81
237 0.82
238 0.82
239 0.82
240 0.81
241 0.84
242 0.81
243 0.8
244 0.82
245 0.81
246 0.82
247 0.81
248 0.82
249 0.8
250 0.79
251 0.72
252 0.66
253 0.63
254 0.63