Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P0CS06

Protein Details
Accession P0CS06    Localization Confidence High Confidence Score 20.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
144-167STEETQSKKGNKKNKNKGKDTAAVHydrophilic
242-267GLKTDFSKEKWRRRKEKKFYQTVQPLHydrophilic
507-536VHPSQFQPESHQRFKRRKTGKAPGKEQLSSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
151-162KKGNKKNKNKGK
249-259KEKWRRRKEKK
521-528KRRKTGKA
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto_nucl 12.333, mito_nucl 9.333, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017423  TRM6  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0031515  C:tRNA (m1A) methyltransferase complex  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0030488  P:tRNA methylation  
KEGG cne:CNC01870  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04189  Gcd10p  
Amino Acid Sequences MTEKQQNSQQPSQLDSTASISALPPQLQQPAAGITGAPGNAEATTSEPPSTKRPRKAIESSEPLTEVILRRLTTIKEGDTVLLRLPSDLVKSVVVQGDNLVQLGKYGAFPASQLIGLHYDITYEIVSSSGSGASTPQPQSLDFSTEETQSKKGNKKNKNKGKDTAAVSKNNPGWNNILRPLKRQLVVDAVIDDIVETNEFIEDLSETEKTTLSHDEIAELRAQGCTPEEIIQAQIARHEKFGLKTDFSKEKWRRRKEKKFYQTVQPLAPSIPNVLYHYNLRSPQSILHLRDDTLSQLLTMANVRPGGRYLVVDDTGGLITAAVLERMGSEGSILLFNESDSPPAWGILQTMNFSDRELEPIKWLNWLEAEEEYQKPAPPVQAEPPTNPIKAAAKQRKYAAQVAELNNTRNELHLGGWDGLILATTLNPISVVARLTPYLLGSAPIVVYSPYYQVLAELLSWSKKDPNYLNDTLTESWERTYQVLPGRTHPMMTTSATGGYLWNATRVHPSQFQPESHQRFKRRKTGKAPGKEQLSSVAKDEEAVNESLEIDPEELANEGE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.39
2 0.33
3 0.29
4 0.25
5 0.22
6 0.18
7 0.15
8 0.18
9 0.2
10 0.19
11 0.18
12 0.2
13 0.24
14 0.24
15 0.24
16 0.21
17 0.19
18 0.19
19 0.17
20 0.14
21 0.11
22 0.13
23 0.12
24 0.11
25 0.08
26 0.08
27 0.08
28 0.09
29 0.09
30 0.09
31 0.12
32 0.14
33 0.15
34 0.16
35 0.19
36 0.29
37 0.39
38 0.46
39 0.52
40 0.6
41 0.66
42 0.73
43 0.79
44 0.79
45 0.78
46 0.77
47 0.7
48 0.63
49 0.57
50 0.48
51 0.39
52 0.33
53 0.25
54 0.21
55 0.22
56 0.2
57 0.21
58 0.24
59 0.24
60 0.26
61 0.27
62 0.24
63 0.23
64 0.24
65 0.24
66 0.23
67 0.22
68 0.19
69 0.18
70 0.16
71 0.14
72 0.15
73 0.14
74 0.14
75 0.15
76 0.14
77 0.13
78 0.14
79 0.17
80 0.18
81 0.17
82 0.15
83 0.15
84 0.16
85 0.15
86 0.14
87 0.11
88 0.08
89 0.08
90 0.09
91 0.09
92 0.06
93 0.07
94 0.08
95 0.08
96 0.08
97 0.09
98 0.1
99 0.1
100 0.1
101 0.1
102 0.11
103 0.12
104 0.12
105 0.1
106 0.1
107 0.09
108 0.1
109 0.09
110 0.07
111 0.06
112 0.06
113 0.06
114 0.06
115 0.06
116 0.05
117 0.05
118 0.05
119 0.07
120 0.09
121 0.15
122 0.16
123 0.17
124 0.18
125 0.18
126 0.22
127 0.22
128 0.23
129 0.18
130 0.21
131 0.2
132 0.22
133 0.24
134 0.22
135 0.23
136 0.25
137 0.32
138 0.36
139 0.41
140 0.49
141 0.57
142 0.67
143 0.76
144 0.81
145 0.84
146 0.83
147 0.84
148 0.81
149 0.79
150 0.73
151 0.72
152 0.67
153 0.61
154 0.55
155 0.54
156 0.51
157 0.47
158 0.42
159 0.34
160 0.34
161 0.33
162 0.35
163 0.35
164 0.39
165 0.36
166 0.39
167 0.43
168 0.44
169 0.42
170 0.39
171 0.34
172 0.31
173 0.31
174 0.27
175 0.22
176 0.16
177 0.14
178 0.13
179 0.11
180 0.06
181 0.05
182 0.04
183 0.04
184 0.03
185 0.03
186 0.04
187 0.04
188 0.04
189 0.04
190 0.04
191 0.06
192 0.06
193 0.06
194 0.07
195 0.08
196 0.08
197 0.1
198 0.11
199 0.11
200 0.13
201 0.13
202 0.14
203 0.14
204 0.15
205 0.14
206 0.12
207 0.11
208 0.09
209 0.09
210 0.07
211 0.07
212 0.07
213 0.07
214 0.08
215 0.08
216 0.09
217 0.09
218 0.1
219 0.1
220 0.09
221 0.12
222 0.14
223 0.14
224 0.14
225 0.16
226 0.16
227 0.17
228 0.23
229 0.22
230 0.21
231 0.23
232 0.28
233 0.32
234 0.32
235 0.41
236 0.44
237 0.51
238 0.6
239 0.68
240 0.74
241 0.8
242 0.89
243 0.89
244 0.92
245 0.91
246 0.91
247 0.85
248 0.84
249 0.8
250 0.72
251 0.62
252 0.52
253 0.42
254 0.32
255 0.28
256 0.19
257 0.12
258 0.1
259 0.09
260 0.1
261 0.1
262 0.11
263 0.12
264 0.13
265 0.15
266 0.16
267 0.17
268 0.16
269 0.16
270 0.16
271 0.21
272 0.25
273 0.24
274 0.26
275 0.25
276 0.24
277 0.24
278 0.23
279 0.18
280 0.13
281 0.1
282 0.07
283 0.06
284 0.06
285 0.06
286 0.06
287 0.06
288 0.07
289 0.08
290 0.08
291 0.08
292 0.09
293 0.1
294 0.09
295 0.09
296 0.1
297 0.1
298 0.11
299 0.1
300 0.09
301 0.09
302 0.08
303 0.08
304 0.06
305 0.04
306 0.03
307 0.04
308 0.04
309 0.03
310 0.03
311 0.03
312 0.03
313 0.04
314 0.04
315 0.03
316 0.03
317 0.04
318 0.04
319 0.05
320 0.05
321 0.05
322 0.05
323 0.05
324 0.08
325 0.07
326 0.08
327 0.08
328 0.09
329 0.09
330 0.09
331 0.09
332 0.07
333 0.08
334 0.09
335 0.1
336 0.1
337 0.1
338 0.11
339 0.11
340 0.11
341 0.12
342 0.1
343 0.14
344 0.15
345 0.15
346 0.17
347 0.2
348 0.2
349 0.21
350 0.21
351 0.17
352 0.16
353 0.16
354 0.15
355 0.13
356 0.15
357 0.14
358 0.14
359 0.16
360 0.16
361 0.16
362 0.15
363 0.16
364 0.16
365 0.15
366 0.18
367 0.22
368 0.29
369 0.3
370 0.31
371 0.36
372 0.37
373 0.35
374 0.32
375 0.28
376 0.24
377 0.28
378 0.37
379 0.41
380 0.43
381 0.47
382 0.5
383 0.54
384 0.54
385 0.54
386 0.45
387 0.42
388 0.43
389 0.42
390 0.45
391 0.41
392 0.39
393 0.33
394 0.33
395 0.26
396 0.2
397 0.19
398 0.13
399 0.12
400 0.12
401 0.14
402 0.13
403 0.13
404 0.12
405 0.1
406 0.09
407 0.08
408 0.07
409 0.04
410 0.03
411 0.04
412 0.04
413 0.04
414 0.04
415 0.04
416 0.05
417 0.06
418 0.07
419 0.07
420 0.09
421 0.09
422 0.1
423 0.1
424 0.1
425 0.1
426 0.09
427 0.09
428 0.08
429 0.08
430 0.07
431 0.07
432 0.07
433 0.06
434 0.07
435 0.07
436 0.09
437 0.09
438 0.09
439 0.09
440 0.09
441 0.1
442 0.09
443 0.08
444 0.08
445 0.09
446 0.11
447 0.11
448 0.13
449 0.18
450 0.19
451 0.25
452 0.29
453 0.34
454 0.41
455 0.44
456 0.44
457 0.4
458 0.43
459 0.37
460 0.36
461 0.31
462 0.23
463 0.21
464 0.22
465 0.21
466 0.19
467 0.19
468 0.2
469 0.25
470 0.32
471 0.32
472 0.35
473 0.4
474 0.39
475 0.39
476 0.34
477 0.3
478 0.26
479 0.26
480 0.23
481 0.17
482 0.18
483 0.17
484 0.17
485 0.14
486 0.13
487 0.14
488 0.12
489 0.15
490 0.14
491 0.15
492 0.23
493 0.25
494 0.29
495 0.32
496 0.35
497 0.41
498 0.45
499 0.46
500 0.48
501 0.56
502 0.6
503 0.63
504 0.69
505 0.69
506 0.75
507 0.82
508 0.83
509 0.82
510 0.83
511 0.84
512 0.87
513 0.87
514 0.87
515 0.87
516 0.85
517 0.83
518 0.74
519 0.64
520 0.62
521 0.57
522 0.47
523 0.42
524 0.36
525 0.28
526 0.28
527 0.29
528 0.22
529 0.21
530 0.2
531 0.17
532 0.15
533 0.16
534 0.15
535 0.15
536 0.13
537 0.1
538 0.09
539 0.09
540 0.09