Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0E9NQD1

Protein Details
Accession A0A0E9NQD1    Localization Confidence High Confidence Score 17
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
13-34AMAARAPSTRKRKTPVKYEEEQHydrophilic
39-60EARAAPVKRTRRVQVKKEEAEDHydrophilic
64-88VSAPVAKKARGRPRKVKSEIKEEESHydrophilic
101-145EETASTRRTRSRKPKDELHQLLSLPPPPTKKPRTKKPAPPAPDLSHydrophilic
545-570SVDDLKKLNKNKKLVKKLAKKYDAFIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
69-80AKKARGRPRKVK
126-138PPPTKKPRTKKPA
553-563NKNKKLVKKLA
Subcellular Location(s) mito 13.5, cyto_mito 12.333, cyto 10, cyto_nucl 6.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR026850  FANCL_C  
IPR023674  Ribosomal_L1-like  
IPR028364  Ribosomal_L1/biogenesis  
IPR016095  Ribosomal_L1_3-a/b-sand  
IPR023673  Ribosomal_L1_CS  
IPR001841  Znf_RING  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
IPR007527  Znf_SWIM  
IPR039903  Zswim2  
Gene Ontology GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0061630  F:ubiquitin protein ligase activity  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF11793  FANCL_C  
PF00687  Ribosomal_L1  
PF04434  SWIM  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS01199  RIBOSOMAL_L1  
PS50089  ZF_RING_2  
PS50966  ZF_SWIM  
CDD cd00403  Ribosomal_L1  
cd16494  RING-CH-C4HC3_ZSWM2  
Amino Acid Sequences MTAIQASSATGTAMAARAPSTRKRKTPVKYEEEQSSDLEARAAPVKRTRRVQVKKEEAEDTDLVSAPVAKKARGRPRKVKSEIKEEESMETTPALPEVKTEETASTRRTRSRKPKDELHQLLSLPPPPTKKPRTKKPAPPAPDLSAYLSYPPTLLPTFLPPHVRDRPTPFLRHCPPAVESRIARVISQRLFLVHTELPSSSNYAIFHVLGSTGNVYLTTLQQRPHCTCPDYAFSGRRRDGRGVMCKHVLFVLVKVCKVRGALCWQSGFGREEVEGMVEGLRGRAREGDEAGIRVSREVREFYLGRETTPEGGVVKSEVKSEEGRAEEEGVEVHNGAHRKPLTGDCPICYEDLSSSTPSPSSTVWCKAACGNNIHAECFGEWAKSLKRSSKSVTCVYCRTEWVGPENEKKKGSGRGRGGSAVVGNGRVVRNGGWSASAGVYCRFLVQHQHSRSIHQFRQVKMSKVSVSSVRENIQNLLAASEEKKRNFTETIELQIGLKNYDPQRDKRFSGTVRLPNVPRPNMALCILGDAHDIDRAKNGGIDAMSVDDLKKLNKNKKLVKKLAKKYDAFIASEVLIKQIPRLLGPGLSKAGKFPTPVSHADNLGDRVTEVKSTVKFQLKKVLCLGVAVGNVGMTEDELVANIMLSINFLVSLLKKAWQNVGSLVIKSSMGKPFRLY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.08
2 0.08
3 0.09
4 0.13
5 0.18
6 0.28
7 0.37
8 0.45
9 0.53
10 0.61
11 0.7
12 0.75
13 0.81
14 0.82
15 0.8
16 0.79
17 0.77
18 0.76
19 0.72
20 0.64
21 0.55
22 0.49
23 0.42
24 0.34
25 0.29
26 0.21
27 0.18
28 0.23
29 0.24
30 0.24
31 0.31
32 0.4
33 0.47
34 0.54
35 0.61
36 0.65
37 0.73
38 0.79
39 0.81
40 0.83
41 0.82
42 0.8
43 0.75
44 0.66
45 0.62
46 0.52
47 0.43
48 0.34
49 0.27
50 0.22
51 0.17
52 0.18
53 0.13
54 0.19
55 0.19
56 0.2
57 0.26
58 0.36
59 0.47
60 0.55
61 0.64
62 0.68
63 0.77
64 0.85
65 0.87
66 0.88
67 0.84
68 0.84
69 0.81
70 0.77
71 0.72
72 0.63
73 0.57
74 0.5
75 0.43
76 0.33
77 0.26
78 0.2
79 0.15
80 0.15
81 0.12
82 0.09
83 0.1
84 0.14
85 0.16
86 0.17
87 0.18
88 0.19
89 0.22
90 0.26
91 0.3
92 0.33
93 0.35
94 0.42
95 0.48
96 0.56
97 0.63
98 0.71
99 0.77
100 0.77
101 0.82
102 0.84
103 0.88
104 0.84
105 0.78
106 0.7
107 0.6
108 0.56
109 0.49
110 0.43
111 0.34
112 0.3
113 0.3
114 0.32
115 0.41
116 0.48
117 0.56
118 0.62
119 0.71
120 0.78
121 0.84
122 0.89
123 0.9
124 0.91
125 0.86
126 0.84
127 0.79
128 0.73
129 0.66
130 0.57
131 0.49
132 0.41
133 0.34
134 0.28
135 0.22
136 0.18
137 0.14
138 0.13
139 0.13
140 0.11
141 0.12
142 0.11
143 0.16
144 0.19
145 0.22
146 0.27
147 0.25
148 0.33
149 0.4
150 0.42
151 0.42
152 0.47
153 0.54
154 0.54
155 0.6
156 0.56
157 0.58
158 0.6
159 0.6
160 0.54
161 0.47
162 0.44
163 0.43
164 0.43
165 0.39
166 0.34
167 0.32
168 0.37
169 0.33
170 0.32
171 0.28
172 0.3
173 0.26
174 0.27
175 0.24
176 0.19
177 0.2
178 0.2
179 0.22
180 0.17
181 0.16
182 0.15
183 0.15
184 0.16
185 0.15
186 0.17
187 0.12
188 0.13
189 0.13
190 0.13
191 0.14
192 0.12
193 0.12
194 0.1
195 0.1
196 0.08
197 0.08
198 0.07
199 0.06
200 0.06
201 0.06
202 0.06
203 0.06
204 0.08
205 0.13
206 0.14
207 0.17
208 0.21
209 0.27
210 0.31
211 0.35
212 0.37
213 0.34
214 0.34
215 0.35
216 0.35
217 0.35
218 0.35
219 0.37
220 0.38
221 0.43
222 0.45
223 0.45
224 0.45
225 0.42
226 0.44
227 0.46
228 0.51
229 0.47
230 0.47
231 0.47
232 0.43
233 0.4
234 0.34
235 0.28
236 0.19
237 0.16
238 0.19
239 0.17
240 0.18
241 0.18
242 0.18
243 0.17
244 0.17
245 0.17
246 0.14
247 0.2
248 0.23
249 0.25
250 0.25
251 0.24
252 0.24
253 0.26
254 0.24
255 0.17
256 0.14
257 0.11
258 0.11
259 0.1
260 0.1
261 0.07
262 0.06
263 0.06
264 0.05
265 0.05
266 0.05
267 0.06
268 0.06
269 0.07
270 0.09
271 0.1
272 0.11
273 0.12
274 0.14
275 0.13
276 0.14
277 0.14
278 0.13
279 0.11
280 0.1
281 0.11
282 0.09
283 0.1
284 0.11
285 0.12
286 0.15
287 0.15
288 0.16
289 0.23
290 0.22
291 0.21
292 0.21
293 0.21
294 0.18
295 0.18
296 0.17
297 0.09
298 0.09
299 0.09
300 0.08
301 0.09
302 0.08
303 0.09
304 0.09
305 0.1
306 0.11
307 0.12
308 0.14
309 0.13
310 0.13
311 0.13
312 0.14
313 0.11
314 0.11
315 0.1
316 0.07
317 0.06
318 0.05
319 0.05
320 0.06
321 0.07
322 0.07
323 0.11
324 0.11
325 0.12
326 0.14
327 0.16
328 0.17
329 0.23
330 0.24
331 0.2
332 0.23
333 0.23
334 0.21
335 0.18
336 0.16
337 0.1
338 0.12
339 0.12
340 0.11
341 0.1
342 0.1
343 0.11
344 0.1
345 0.11
346 0.09
347 0.11
348 0.13
349 0.16
350 0.19
351 0.18
352 0.19
353 0.22
354 0.26
355 0.25
356 0.25
357 0.24
358 0.27
359 0.27
360 0.27
361 0.23
362 0.19
363 0.16
364 0.16
365 0.14
366 0.08
367 0.08
368 0.1
369 0.12
370 0.16
371 0.19
372 0.23
373 0.26
374 0.3
375 0.35
376 0.38
377 0.42
378 0.43
379 0.46
380 0.43
381 0.43
382 0.42
383 0.39
384 0.33
385 0.31
386 0.27
387 0.23
388 0.23
389 0.26
390 0.26
391 0.33
392 0.36
393 0.37
394 0.36
395 0.36
396 0.36
397 0.4
398 0.42
399 0.43
400 0.45
401 0.45
402 0.46
403 0.46
404 0.42
405 0.34
406 0.28
407 0.2
408 0.14
409 0.1
410 0.08
411 0.1
412 0.09
413 0.09
414 0.09
415 0.08
416 0.1
417 0.1
418 0.1
419 0.08
420 0.09
421 0.09
422 0.09
423 0.1
424 0.08
425 0.08
426 0.09
427 0.09
428 0.09
429 0.08
430 0.08
431 0.16
432 0.23
433 0.32
434 0.33
435 0.41
436 0.41
437 0.46
438 0.53
439 0.54
440 0.49
441 0.48
442 0.51
443 0.44
444 0.54
445 0.53
446 0.5
447 0.44
448 0.46
449 0.39
450 0.35
451 0.36
452 0.31
453 0.31
454 0.31
455 0.3
456 0.28
457 0.29
458 0.28
459 0.27
460 0.23
461 0.2
462 0.16
463 0.14
464 0.12
465 0.11
466 0.11
467 0.18
468 0.22
469 0.22
470 0.26
471 0.26
472 0.3
473 0.31
474 0.31
475 0.31
476 0.28
477 0.32
478 0.29
479 0.29
480 0.25
481 0.25
482 0.24
483 0.17
484 0.15
485 0.16
486 0.17
487 0.25
488 0.29
489 0.34
490 0.43
491 0.48
492 0.49
493 0.49
494 0.54
495 0.48
496 0.52
497 0.54
498 0.52
499 0.52
500 0.56
501 0.52
502 0.53
503 0.59
504 0.52
505 0.44
506 0.41
507 0.38
508 0.35
509 0.34
510 0.28
511 0.2
512 0.2
513 0.19
514 0.15
515 0.13
516 0.11
517 0.11
518 0.13
519 0.13
520 0.11
521 0.13
522 0.14
523 0.13
524 0.14
525 0.13
526 0.12
527 0.11
528 0.11
529 0.09
530 0.1
531 0.1
532 0.09
533 0.09
534 0.09
535 0.11
536 0.13
537 0.19
538 0.27
539 0.36
540 0.43
541 0.53
542 0.61
543 0.71
544 0.79
545 0.83
546 0.85
547 0.86
548 0.89
549 0.91
550 0.89
551 0.8
552 0.72
553 0.7
554 0.63
555 0.53
556 0.44
557 0.35
558 0.26
559 0.27
560 0.24
561 0.17
562 0.15
563 0.13
564 0.14
565 0.15
566 0.15
567 0.13
568 0.15
569 0.15
570 0.18
571 0.19
572 0.22
573 0.23
574 0.24
575 0.24
576 0.24
577 0.27
578 0.25
579 0.25
580 0.24
581 0.28
582 0.31
583 0.35
584 0.38
585 0.37
586 0.36
587 0.36
588 0.37
589 0.32
590 0.28
591 0.24
592 0.18
593 0.17
594 0.17
595 0.16
596 0.13
597 0.16
598 0.18
599 0.22
600 0.3
601 0.37
602 0.4
603 0.42
604 0.52
605 0.49
606 0.52
607 0.52
608 0.49
609 0.39
610 0.36
611 0.34
612 0.27
613 0.25
614 0.2
615 0.16
616 0.11
617 0.1
618 0.1
619 0.08
620 0.05
621 0.05
622 0.05
623 0.05
624 0.05
625 0.06
626 0.06
627 0.06
628 0.06
629 0.06
630 0.05
631 0.06
632 0.06
633 0.05
634 0.05
635 0.06
636 0.07
637 0.08
638 0.11
639 0.12
640 0.17
641 0.19
642 0.22
643 0.29
644 0.3
645 0.31
646 0.29
647 0.37
648 0.35
649 0.33
650 0.31
651 0.25
652 0.24
653 0.24
654 0.27
655 0.27
656 0.27