Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q5KJS1

Protein Details
Accession Q5KJS1    Localization Confidence High Confidence Score 18.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
313-338DDKSVQQRLKKASKKKDDKKGTLYLGHydrophilic
420-473VGANKKFRKVPRARMEKMKHEKERTEEEKSKADKKLLKKERQRKKKLEAAGIDYBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
5-29RSAPTPKSGAAVKKAKPASKGAKPK
83-93KKKGKAAKGKA
202-249KKGKKQAAKKGKEVAEKAEDVKETGKRKAQKVAEDAEPVSKKTRSKTK
321-331LKKASKKKDDK
424-465KKFRKVPRARMEKMKHEKERTEEEKSKADKKLLKKERQRKKK
Subcellular Location(s) nucl 14.5, mito 10, cyto_nucl 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000463  P:maturation of LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
KEGG cne:CNC05560  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12307  RRM_NIFK_like  
Amino Acid Sequences MAPKRSAPTPKSGAAVKKAKPASKGAKPKSTDSPLDTVKNVASSVLNTVSDAVDVAGDLVLDDGEPAAASEALEETVDVPALKKKGKAAKGKAGETAAQVADKVQESTKPIRGKAAKALKDAQEVDAKAVADRATKAAKDTADAVGKAAKDPENRKKAEDFMEQAENAMKKVADKVGEVLEDTLEQFGEASGITEVAENLSKKGKKQAAKKGKEVAEKAEDVKETGKRKAQKVAEDAEPVSKKTRSKTKKIVEPESESEQEQDDGDEDVYIHGFSSSDGEADSSDDESDAEDLAVAEAARTVDMGSLPMVAKDDKSVQQRLKKASKKKDDKKGTLYLGRIPHGFYEDQMKEYFSQFGDVTRVRLARNRKTGASKHYAYIEMSSESVAEIVADTMNNYLLMGHLLRCHVIPSDKVHPQLWVGANKKFRKVPRARMEKMKHEKERTEEEKSKADKKLLKKERQRKKKLEAAGIDYEFDGHA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.55
2 0.6
3 0.54
4 0.58
5 0.61
6 0.62
7 0.6
8 0.62
9 0.62
10 0.64
11 0.71
12 0.7
13 0.72
14 0.72
15 0.73
16 0.73
17 0.71
18 0.66
19 0.6
20 0.59
21 0.55
22 0.55
23 0.5
24 0.43
25 0.36
26 0.32
27 0.27
28 0.21
29 0.16
30 0.14
31 0.16
32 0.17
33 0.16
34 0.14
35 0.15
36 0.14
37 0.13
38 0.12
39 0.09
40 0.06
41 0.06
42 0.06
43 0.05
44 0.04
45 0.04
46 0.04
47 0.04
48 0.04
49 0.04
50 0.03
51 0.03
52 0.03
53 0.03
54 0.04
55 0.05
56 0.05
57 0.05
58 0.06
59 0.06
60 0.06
61 0.06
62 0.06
63 0.06
64 0.07
65 0.06
66 0.07
67 0.12
68 0.16
69 0.18
70 0.2
71 0.27
72 0.36
73 0.44
74 0.54
75 0.57
76 0.63
77 0.68
78 0.68
79 0.65
80 0.58
81 0.51
82 0.42
83 0.37
84 0.27
85 0.2
86 0.17
87 0.14
88 0.14
89 0.13
90 0.13
91 0.11
92 0.13
93 0.18
94 0.23
95 0.3
96 0.32
97 0.32
98 0.4
99 0.43
100 0.43
101 0.48
102 0.53
103 0.5
104 0.51
105 0.56
106 0.49
107 0.51
108 0.49
109 0.41
110 0.37
111 0.32
112 0.29
113 0.26
114 0.23
115 0.18
116 0.18
117 0.16
118 0.12
119 0.13
120 0.14
121 0.15
122 0.15
123 0.17
124 0.19
125 0.18
126 0.17
127 0.19
128 0.2
129 0.2
130 0.2
131 0.19
132 0.18
133 0.18
134 0.17
135 0.18
136 0.18
137 0.22
138 0.31
139 0.4
140 0.46
141 0.48
142 0.5
143 0.5
144 0.5
145 0.49
146 0.45
147 0.38
148 0.33
149 0.35
150 0.31
151 0.29
152 0.29
153 0.23
154 0.18
155 0.16
156 0.12
157 0.1
158 0.12
159 0.14
160 0.12
161 0.12
162 0.14
163 0.14
164 0.14
165 0.14
166 0.12
167 0.1
168 0.09
169 0.08
170 0.07
171 0.05
172 0.04
173 0.04
174 0.04
175 0.04
176 0.03
177 0.04
178 0.04
179 0.04
180 0.04
181 0.04
182 0.04
183 0.05
184 0.07
185 0.07
186 0.08
187 0.14
188 0.15
189 0.16
190 0.25
191 0.3
192 0.35
193 0.44
194 0.54
195 0.59
196 0.64
197 0.68
198 0.68
199 0.67
200 0.66
201 0.58
202 0.51
203 0.44
204 0.39
205 0.36
206 0.3
207 0.24
208 0.19
209 0.2
210 0.21
211 0.21
212 0.23
213 0.27
214 0.3
215 0.33
216 0.4
217 0.41
218 0.41
219 0.42
220 0.42
221 0.39
222 0.35
223 0.33
224 0.3
225 0.27
226 0.23
227 0.21
228 0.21
229 0.2
230 0.24
231 0.34
232 0.36
233 0.44
234 0.53
235 0.58
236 0.63
237 0.68
238 0.71
239 0.66
240 0.64
241 0.59
242 0.54
243 0.47
244 0.39
245 0.33
246 0.25
247 0.21
248 0.15
249 0.11
250 0.07
251 0.07
252 0.06
253 0.06
254 0.05
255 0.05
256 0.05
257 0.05
258 0.04
259 0.04
260 0.04
261 0.04
262 0.06
263 0.06
264 0.05
265 0.05
266 0.06
267 0.06
268 0.06
269 0.07
270 0.05
271 0.05
272 0.05
273 0.05
274 0.05
275 0.06
276 0.05
277 0.04
278 0.04
279 0.04
280 0.04
281 0.04
282 0.04
283 0.03
284 0.04
285 0.04
286 0.04
287 0.04
288 0.04
289 0.04
290 0.04
291 0.05
292 0.04
293 0.06
294 0.06
295 0.06
296 0.07
297 0.07
298 0.07
299 0.09
300 0.12
301 0.16
302 0.21
303 0.28
304 0.33
305 0.39
306 0.45
307 0.52
308 0.59
309 0.62
310 0.67
311 0.71
312 0.76
313 0.8
314 0.84
315 0.87
316 0.87
317 0.86
318 0.83
319 0.8
320 0.75
321 0.69
322 0.62
323 0.57
324 0.5
325 0.44
326 0.38
327 0.31
328 0.25
329 0.23
330 0.21
331 0.16
332 0.21
333 0.2
334 0.21
335 0.21
336 0.22
337 0.2
338 0.21
339 0.22
340 0.14
341 0.15
342 0.13
343 0.14
344 0.18
345 0.18
346 0.18
347 0.2
348 0.22
349 0.21
350 0.27
351 0.34
352 0.38
353 0.47
354 0.49
355 0.5
356 0.57
357 0.61
358 0.64
359 0.63
360 0.56
361 0.49
362 0.48
363 0.45
364 0.37
365 0.33
366 0.27
367 0.2
368 0.18
369 0.15
370 0.12
371 0.1
372 0.09
373 0.07
374 0.05
375 0.04
376 0.04
377 0.05
378 0.05
379 0.05
380 0.06
381 0.06
382 0.06
383 0.06
384 0.05
385 0.05
386 0.07
387 0.07
388 0.08
389 0.1
390 0.11
391 0.12
392 0.12
393 0.13
394 0.14
395 0.16
396 0.19
397 0.23
398 0.3
399 0.34
400 0.37
401 0.37
402 0.35
403 0.33
404 0.37
405 0.37
406 0.37
407 0.36
408 0.4
409 0.48
410 0.51
411 0.57
412 0.57
413 0.58
414 0.61
415 0.67
416 0.71
417 0.73
418 0.79
419 0.79
420 0.83
421 0.84
422 0.84
423 0.85
424 0.85
425 0.84
426 0.81
427 0.81
428 0.77
429 0.79
430 0.74
431 0.73
432 0.7
433 0.65
434 0.66
435 0.66
436 0.67
437 0.62
438 0.64
439 0.62
440 0.64
441 0.71
442 0.73
443 0.77
444 0.81
445 0.86
446 0.88
447 0.92
448 0.93
449 0.92
450 0.91
451 0.89
452 0.87
453 0.87
454 0.83
455 0.79
456 0.76
457 0.67
458 0.58
459 0.49