Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q5KCA1

Protein Details
Accession Q5KCA1    Localization Confidence High Confidence Score 16.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
280-304VISKINKDIGKKKRTKKDDEDGEINHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
289-295GKKKRTK
Subcellular Location(s) nucl 21, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013260  mRNA_splic_SYF2  
Gene Ontology GO:0071013  C:catalytic step 2 spliceosome  
GO:0071014  C:post-mRNA release spliceosomal complex  
GO:0000974  C:Prp19 complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG cne:CNH00300  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08231  SYF2  
Amino Acid Sequences MPPRKSKSRDVKSTAPSPSPSIGQRRSSRAPRKEPAPAVEVVEEKDEVSSESEEVDAAEGLETRETDAGEAEQDEQVQEVAEKEHVKSNKGKEKMSMAERMAKIKELRMKMNQSAAQNRRDLVEDHQKAQVTAKELARLEKQRKLAQTLRLKAEAEENGEDIERKKNWEWTIEDNERWQAKLEEQKVKQDTHFHNAEDDAYKKYNRNLRATKADLVAYERQKEAALGLAPGTLVPARATSSSLAASSSKPGLTGAEDLYRGADTLVYGDNKPSEDAVDRVISKINKDIGKKKRTKKDDEDGEINYINERNKVFNKKISRYFDKYTKEIRANFERGTAL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.76
2 0.7
3 0.62
4 0.55
5 0.5
6 0.45
7 0.44
8 0.46
9 0.47
10 0.51
11 0.54
12 0.58
13 0.65
14 0.71
15 0.76
16 0.76
17 0.79
18 0.78
19 0.78
20 0.8
21 0.76
22 0.7
23 0.63
24 0.55
25 0.48
26 0.42
27 0.37
28 0.29
29 0.25
30 0.2
31 0.16
32 0.15
33 0.12
34 0.11
35 0.12
36 0.12
37 0.1
38 0.1
39 0.1
40 0.1
41 0.09
42 0.09
43 0.07
44 0.06
45 0.06
46 0.06
47 0.06
48 0.07
49 0.07
50 0.07
51 0.08
52 0.08
53 0.08
54 0.08
55 0.08
56 0.08
57 0.09
58 0.09
59 0.09
60 0.09
61 0.09
62 0.08
63 0.08
64 0.07
65 0.07
66 0.06
67 0.07
68 0.1
69 0.11
70 0.12
71 0.19
72 0.2
73 0.23
74 0.3
75 0.38
76 0.44
77 0.47
78 0.47
79 0.44
80 0.49
81 0.52
82 0.49
83 0.46
84 0.39
85 0.43
86 0.43
87 0.43
88 0.38
89 0.35
90 0.32
91 0.31
92 0.36
93 0.31
94 0.35
95 0.38
96 0.43
97 0.42
98 0.47
99 0.46
100 0.43
101 0.49
102 0.49
103 0.46
104 0.42
105 0.4
106 0.34
107 0.32
108 0.29
109 0.25
110 0.31
111 0.29
112 0.3
113 0.32
114 0.32
115 0.3
116 0.31
117 0.27
118 0.2
119 0.23
120 0.22
121 0.23
122 0.24
123 0.26
124 0.29
125 0.34
126 0.35
127 0.36
128 0.4
129 0.4
130 0.41
131 0.45
132 0.45
133 0.47
134 0.51
135 0.51
136 0.49
137 0.46
138 0.45
139 0.38
140 0.37
141 0.29
142 0.23
143 0.18
144 0.15
145 0.13
146 0.13
147 0.13
148 0.1
149 0.13
150 0.11
151 0.14
152 0.15
153 0.2
154 0.21
155 0.25
156 0.27
157 0.28
158 0.36
159 0.36
160 0.35
161 0.3
162 0.33
163 0.3
164 0.27
165 0.22
166 0.15
167 0.16
168 0.23
169 0.28
170 0.32
171 0.33
172 0.4
173 0.41
174 0.42
175 0.4
176 0.41
177 0.38
178 0.36
179 0.37
180 0.3
181 0.28
182 0.27
183 0.27
184 0.2
185 0.19
186 0.15
187 0.15
188 0.17
189 0.18
190 0.23
191 0.28
192 0.32
193 0.39
194 0.42
195 0.46
196 0.52
197 0.53
198 0.51
199 0.47
200 0.42
201 0.33
202 0.32
203 0.32
204 0.28
205 0.26
206 0.23
207 0.22
208 0.21
209 0.2
210 0.16
211 0.13
212 0.1
213 0.08
214 0.08
215 0.08
216 0.08
217 0.07
218 0.08
219 0.05
220 0.05
221 0.05
222 0.05
223 0.07
224 0.07
225 0.09
226 0.09
227 0.1
228 0.1
229 0.1
230 0.11
231 0.11
232 0.11
233 0.12
234 0.13
235 0.12
236 0.11
237 0.11
238 0.11
239 0.12
240 0.13
241 0.12
242 0.13
243 0.14
244 0.13
245 0.14
246 0.13
247 0.11
248 0.09
249 0.08
250 0.05
251 0.07
252 0.1
253 0.11
254 0.11
255 0.13
256 0.14
257 0.15
258 0.16
259 0.14
260 0.13
261 0.13
262 0.14
263 0.16
264 0.18
265 0.18
266 0.18
267 0.23
268 0.22
269 0.22
270 0.26
271 0.3
272 0.31
273 0.37
274 0.46
275 0.51
276 0.61
277 0.69
278 0.74
279 0.78
280 0.82
281 0.86
282 0.86
283 0.86
284 0.86
285 0.84
286 0.79
287 0.71
288 0.66
289 0.57
290 0.48
291 0.39
292 0.32
293 0.26
294 0.24
295 0.23
296 0.25
297 0.32
298 0.41
299 0.45
300 0.51
301 0.59
302 0.64
303 0.72
304 0.76
305 0.76
306 0.74
307 0.77
308 0.77
309 0.73
310 0.71
311 0.7
312 0.69
313 0.68
314 0.66
315 0.66
316 0.66
317 0.65
318 0.59