Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P0CO10

Protein Details
Accession P0CO10    Localization Confidence Low Confidence Score 7.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-20MAGRDPRDRAPRVRNRAPAAHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 9cyto_mito 9, mito 8.5, cyto 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003107  HAT  
IPR045075  Syf1-like  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR019734  TPR_repeat  
Gene Ontology GO:0071014  C:post-mRNA release spliceosomal complex  
GO:0000974  C:Prp19 complex  
GO:0071007  C:U2-type catalytic step 2 spliceosome  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
GO:0000245  P:spliceosomal complex assembly  
KEGG cne:CNA06730  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02184  HAT  
Amino Acid Sequences MAGRDPRDRAPRVRNRAPAAVQITAEQLLREAQERQEPAIQAPKQRVQDLEELSEFQARKRTEFESRIRYSRDSILAWTKYAQWEASQNEYERSRSVFERALDVDPRSVDLWIKYTDMELKARNINHARNLFDRAITLLPRVDALWYKYVYLEELLLNVSGARQIFERWMQWEPNDKAWQSYIKLEERYNELDRASAIYERWIACRPIPKNWVTWAKFEEDRGQPDKAREVFQTALEFFGDEEEQVEKAQSVFAAFARMETRLKEFERARVIYKFALARLPRSKSASLYAQYTKFEKQHGDRAGVELTVLGKRRIQYEEELAYDPTNYDAWFSLARLEEDAYRADREDGEDVEPMRVREVYERAVANVPPALEKRYWRRYIYLWLQYAAFEEIDTKDYDRARDVYKAAVKLVPHKTFTFAKLWLAYAYFEIRRLDVSAARKVLGAGIGMCPKPKLFTGYIELEMRLREFDRVRTLYEKFLTYDPSLSSAWIQWTQVESAVEDFERVRAIFELAVQQSLDMPEIVWKAYIDFEAGEGERERARNLYERLLERTSHVKVWISYALMEIATLGGGEDEDGNEIEGEAGDADLARQVFERGYKDLRAKGEKEDRAVLLESWKSFEQEHGDEETLAKVEDMLPTTRKRWRKAEDGSGELEEYWDLVFPDDEREANPTSFKFFQAAQAWAQQRAGQGEEGGLSYDLPSDSEDENEDGDEDGDGREEEGMDQD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.8
2 0.77
3 0.79
4 0.73
5 0.7
6 0.64
7 0.57
8 0.48
9 0.4
10 0.36
11 0.3
12 0.27
13 0.18
14 0.14
15 0.13
16 0.14
17 0.15
18 0.16
19 0.18
20 0.25
21 0.27
22 0.29
23 0.33
24 0.33
25 0.35
26 0.41
27 0.41
28 0.4
29 0.46
30 0.49
31 0.48
32 0.5
33 0.49
34 0.44
35 0.48
36 0.46
37 0.43
38 0.37
39 0.35
40 0.33
41 0.36
42 0.32
43 0.26
44 0.3
45 0.26
46 0.27
47 0.29
48 0.34
49 0.38
50 0.46
51 0.53
52 0.55
53 0.6
54 0.64
55 0.64
56 0.62
57 0.56
58 0.54
59 0.5
60 0.41
61 0.4
62 0.43
63 0.4
64 0.38
65 0.36
66 0.33
67 0.31
68 0.32
69 0.27
70 0.21
71 0.26
72 0.28
73 0.33
74 0.34
75 0.32
76 0.36
77 0.37
78 0.37
79 0.32
80 0.31
81 0.28
82 0.25
83 0.28
84 0.28
85 0.27
86 0.3
87 0.31
88 0.33
89 0.33
90 0.32
91 0.3
92 0.25
93 0.26
94 0.22
95 0.2
96 0.18
97 0.16
98 0.18
99 0.17
100 0.18
101 0.16
102 0.17
103 0.21
104 0.22
105 0.25
106 0.24
107 0.27
108 0.32
109 0.33
110 0.4
111 0.41
112 0.42
113 0.47
114 0.48
115 0.48
116 0.45
117 0.5
118 0.42
119 0.36
120 0.32
121 0.26
122 0.24
123 0.21
124 0.2
125 0.15
126 0.14
127 0.14
128 0.14
129 0.14
130 0.14
131 0.16
132 0.19
133 0.19
134 0.19
135 0.2
136 0.2
137 0.19
138 0.16
139 0.14
140 0.1
141 0.1
142 0.1
143 0.09
144 0.08
145 0.07
146 0.07
147 0.07
148 0.07
149 0.07
150 0.07
151 0.08
152 0.12
153 0.14
154 0.16
155 0.17
156 0.21
157 0.23
158 0.25
159 0.34
160 0.34
161 0.39
162 0.42
163 0.39
164 0.37
165 0.37
166 0.38
167 0.3
168 0.32
169 0.31
170 0.3
171 0.33
172 0.33
173 0.33
174 0.34
175 0.37
176 0.35
177 0.31
178 0.26
179 0.24
180 0.23
181 0.22
182 0.18
183 0.14
184 0.11
185 0.12
186 0.15
187 0.16
188 0.18
189 0.19
190 0.19
191 0.21
192 0.29
193 0.3
194 0.34
195 0.39
196 0.39
197 0.39
198 0.45
199 0.52
200 0.46
201 0.47
202 0.42
203 0.4
204 0.4
205 0.38
206 0.38
207 0.32
208 0.36
209 0.35
210 0.36
211 0.33
212 0.34
213 0.39
214 0.34
215 0.33
216 0.27
217 0.28
218 0.27
219 0.26
220 0.27
221 0.2
222 0.18
223 0.16
224 0.15
225 0.1
226 0.1
227 0.09
228 0.06
229 0.07
230 0.07
231 0.07
232 0.07
233 0.07
234 0.06
235 0.06
236 0.07
237 0.06
238 0.05
239 0.06
240 0.06
241 0.08
242 0.07
243 0.09
244 0.09
245 0.11
246 0.11
247 0.12
248 0.15
249 0.17
250 0.19
251 0.25
252 0.25
253 0.29
254 0.35
255 0.36
256 0.36
257 0.33
258 0.34
259 0.28
260 0.29
261 0.25
262 0.19
263 0.23
264 0.2
265 0.25
266 0.29
267 0.33
268 0.33
269 0.36
270 0.36
271 0.31
272 0.35
273 0.33
274 0.28
275 0.29
276 0.29
277 0.27
278 0.27
279 0.28
280 0.28
281 0.25
282 0.25
283 0.26
284 0.26
285 0.32
286 0.33
287 0.34
288 0.31
289 0.31
290 0.29
291 0.24
292 0.2
293 0.12
294 0.11
295 0.1
296 0.11
297 0.1
298 0.11
299 0.12
300 0.15
301 0.17
302 0.18
303 0.18
304 0.21
305 0.23
306 0.23
307 0.23
308 0.21
309 0.19
310 0.16
311 0.14
312 0.1
313 0.09
314 0.06
315 0.06
316 0.06
317 0.07
318 0.07
319 0.07
320 0.09
321 0.09
322 0.1
323 0.09
324 0.1
325 0.09
326 0.1
327 0.11
328 0.09
329 0.09
330 0.09
331 0.09
332 0.09
333 0.1
334 0.1
335 0.1
336 0.1
337 0.11
338 0.11
339 0.11
340 0.12
341 0.11
342 0.1
343 0.09
344 0.09
345 0.1
346 0.12
347 0.12
348 0.14
349 0.14
350 0.15
351 0.16
352 0.16
353 0.14
354 0.13
355 0.11
356 0.09
357 0.1
358 0.11
359 0.11
360 0.15
361 0.22
362 0.3
363 0.35
364 0.35
365 0.37
366 0.37
367 0.43
368 0.47
369 0.46
370 0.38
371 0.34
372 0.33
373 0.3
374 0.29
375 0.21
376 0.14
377 0.07
378 0.07
379 0.07
380 0.08
381 0.09
382 0.08
383 0.11
384 0.12
385 0.13
386 0.13
387 0.15
388 0.16
389 0.18
390 0.18
391 0.2
392 0.23
393 0.23
394 0.22
395 0.22
396 0.2
397 0.26
398 0.33
399 0.3
400 0.29
401 0.28
402 0.31
403 0.31
404 0.33
405 0.28
406 0.21
407 0.21
408 0.19
409 0.19
410 0.16
411 0.14
412 0.12
413 0.1
414 0.12
415 0.1
416 0.12
417 0.12
418 0.11
419 0.11
420 0.12
421 0.13
422 0.14
423 0.18
424 0.2
425 0.2
426 0.2
427 0.2
428 0.18
429 0.18
430 0.14
431 0.1
432 0.07
433 0.08
434 0.11
435 0.11
436 0.11
437 0.11
438 0.11
439 0.12
440 0.12
441 0.15
442 0.13
443 0.16
444 0.21
445 0.23
446 0.26
447 0.25
448 0.25
449 0.21
450 0.2
451 0.17
452 0.13
453 0.11
454 0.12
455 0.13
456 0.16
457 0.22
458 0.23
459 0.25
460 0.28
461 0.29
462 0.3
463 0.3
464 0.28
465 0.23
466 0.23
467 0.24
468 0.21
469 0.21
470 0.17
471 0.18
472 0.17
473 0.15
474 0.15
475 0.13
476 0.15
477 0.14
478 0.14
479 0.12
480 0.13
481 0.13
482 0.14
483 0.13
484 0.11
485 0.1
486 0.11
487 0.1
488 0.09
489 0.09
490 0.07
491 0.09
492 0.08
493 0.08
494 0.08
495 0.09
496 0.08
497 0.09
498 0.14
499 0.13
500 0.13
501 0.12
502 0.12
503 0.12
504 0.12
505 0.12
506 0.06
507 0.06
508 0.08
509 0.09
510 0.09
511 0.09
512 0.09
513 0.09
514 0.1
515 0.1
516 0.07
517 0.07
518 0.07
519 0.09
520 0.09
521 0.1
522 0.1
523 0.11
524 0.13
525 0.14
526 0.14
527 0.14
528 0.16
529 0.22
530 0.24
531 0.28
532 0.32
533 0.34
534 0.38
535 0.39
536 0.37
537 0.32
538 0.36
539 0.32
540 0.28
541 0.27
542 0.24
543 0.23
544 0.26
545 0.25
546 0.2
547 0.18
548 0.17
549 0.15
550 0.13
551 0.12
552 0.08
553 0.06
554 0.05
555 0.04
556 0.03
557 0.03
558 0.03
559 0.03
560 0.03
561 0.04
562 0.05
563 0.05
564 0.06
565 0.05
566 0.06
567 0.05
568 0.05
569 0.05
570 0.04
571 0.04
572 0.03
573 0.03
574 0.04
575 0.06
576 0.06
577 0.06
578 0.06
579 0.08
580 0.09
581 0.13
582 0.16
583 0.18
584 0.22
585 0.26
586 0.31
587 0.36
588 0.42
589 0.45
590 0.44
591 0.49
592 0.56
593 0.54
594 0.53
595 0.52
596 0.46
597 0.42
598 0.41
599 0.32
600 0.28
601 0.27
602 0.24
603 0.23
604 0.23
605 0.22
606 0.2
607 0.23
608 0.24
609 0.22
610 0.25
611 0.25
612 0.25
613 0.24
614 0.25
615 0.22
616 0.17
617 0.15
618 0.12
619 0.08
620 0.08
621 0.11
622 0.12
623 0.15
624 0.19
625 0.22
626 0.28
627 0.36
628 0.43
629 0.48
630 0.55
631 0.59
632 0.65
633 0.7
634 0.75
635 0.74
636 0.7
637 0.66
638 0.57
639 0.51
640 0.4
641 0.32
642 0.21
643 0.14
644 0.11
645 0.08
646 0.07
647 0.07
648 0.08
649 0.08
650 0.12
651 0.13
652 0.14
653 0.14
654 0.18
655 0.2
656 0.21
657 0.24
658 0.2
659 0.25
660 0.26
661 0.27
662 0.25
663 0.22
664 0.29
665 0.31
666 0.32
667 0.29
668 0.35
669 0.37
670 0.37
671 0.37
672 0.31
673 0.29
674 0.29
675 0.29
676 0.21
677 0.19
678 0.18
679 0.17
680 0.15
681 0.14
682 0.11
683 0.09
684 0.09
685 0.1
686 0.09
687 0.09
688 0.1
689 0.12
690 0.12
691 0.14
692 0.16
693 0.15
694 0.16
695 0.16
696 0.15
697 0.12
698 0.12
699 0.11
700 0.09
701 0.08
702 0.09
703 0.08
704 0.08
705 0.08
706 0.08