Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q5KIF8

Protein Details
Accession Q5KIF8    Localization Confidence High Confidence Score 19.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-27MSMLRTIKPKNARVKRALEKREPQIVEHydrophilic
289-313KMQGRKMKGLKVRDGKKRKTSGADGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
247-266LKRPKIAKSDVEKGLGKKRK
288-307AKMQGRKMKGLKVRDGKKRK
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto 4, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007109  Brix  
IPR039770  Rpf2  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0008097  F:5S rRNA binding  
GO:0008312  F:7S RNA binding  
GO:0019843  F:rRNA binding  
GO:1902626  P:assembly of large subunit precursor of preribosome  
GO:0000466  P:maturation of 5.8S rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000463  P:maturation of LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000027  P:ribosomal large subunit assembly  
KEGG cne:CND03120  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04427  Brix  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50833  BRIX  
Amino Acid Sequences MSMLRTIKPKNARVKRALEKREPQIVENDKTAIFVRGQNSSDKVRNVMKDLYSLKRPHAINFSRKNDIHPFDDASSLEFFAGKNDASLFVTGLHSKKRPHNLVFSRMFDGRVLDQIELGVEGFKAMSEFPTLKSSLGVKPMMVFHSDLFDTHPTYQQLKSQLLDLYNGHPITEAPLLTTLEHVISITAGPVSDTTPLPQVHFRVYTVKLIPSGTRVPRIQLTEMGPSIDFVVRRLQEPDEEMMKAALKRPKIAKSDVEKGLGKKRKNIETDEMGDKVGRIHIGKQDLAKMQGRKMKGLKVRDGKKRKTSGADGMDED
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.81
2 0.83
3 0.84
4 0.85
5 0.84
6 0.83
7 0.81
8 0.82
9 0.74
10 0.65
11 0.65
12 0.63
13 0.56
14 0.49
15 0.44
16 0.34
17 0.34
18 0.33
19 0.25
20 0.19
21 0.2
22 0.21
23 0.24
24 0.25
25 0.27
26 0.3
27 0.34
28 0.38
29 0.35
30 0.37
31 0.38
32 0.4
33 0.4
34 0.41
35 0.36
36 0.37
37 0.41
38 0.41
39 0.43
40 0.42
41 0.4
42 0.43
43 0.43
44 0.41
45 0.46
46 0.48
47 0.5
48 0.58
49 0.61
50 0.62
51 0.62
52 0.63
53 0.61
54 0.58
55 0.51
56 0.44
57 0.41
58 0.34
59 0.35
60 0.3
61 0.23
62 0.2
63 0.17
64 0.14
65 0.11
66 0.1
67 0.09
68 0.11
69 0.08
70 0.08
71 0.08
72 0.09
73 0.1
74 0.1
75 0.09
76 0.09
77 0.1
78 0.13
79 0.14
80 0.17
81 0.2
82 0.25
83 0.32
84 0.41
85 0.47
86 0.48
87 0.56
88 0.58
89 0.63
90 0.63
91 0.59
92 0.53
93 0.46
94 0.43
95 0.32
96 0.28
97 0.2
98 0.18
99 0.17
100 0.13
101 0.12
102 0.11
103 0.11
104 0.09
105 0.08
106 0.05
107 0.03
108 0.03
109 0.03
110 0.03
111 0.03
112 0.03
113 0.04
114 0.06
115 0.07
116 0.08
117 0.11
118 0.12
119 0.12
120 0.13
121 0.15
122 0.15
123 0.18
124 0.17
125 0.14
126 0.15
127 0.16
128 0.15
129 0.14
130 0.13
131 0.09
132 0.11
133 0.11
134 0.1
135 0.1
136 0.11
137 0.11
138 0.12
139 0.14
140 0.14
141 0.16
142 0.17
143 0.18
144 0.21
145 0.2
146 0.2
147 0.19
148 0.19
149 0.17
150 0.18
151 0.15
152 0.13
153 0.16
154 0.15
155 0.13
156 0.12
157 0.11
158 0.12
159 0.12
160 0.1
161 0.07
162 0.09
163 0.09
164 0.09
165 0.1
166 0.07
167 0.06
168 0.06
169 0.06
170 0.04
171 0.04
172 0.04
173 0.04
174 0.03
175 0.03
176 0.03
177 0.04
178 0.05
179 0.06
180 0.07
181 0.07
182 0.12
183 0.12
184 0.14
185 0.16
186 0.17
187 0.18
188 0.19
189 0.19
190 0.19
191 0.21
192 0.23
193 0.23
194 0.22
195 0.21
196 0.21
197 0.2
198 0.19
199 0.24
200 0.22
201 0.26
202 0.26
203 0.27
204 0.3
205 0.33
206 0.3
207 0.28
208 0.28
209 0.26
210 0.26
211 0.24
212 0.2
213 0.17
214 0.17
215 0.15
216 0.13
217 0.1
218 0.16
219 0.16
220 0.18
221 0.2
222 0.19
223 0.19
224 0.22
225 0.24
226 0.2
227 0.2
228 0.19
229 0.17
230 0.19
231 0.18
232 0.21
233 0.22
234 0.21
235 0.27
236 0.33
237 0.39
238 0.42
239 0.46
240 0.49
241 0.52
242 0.59
243 0.57
244 0.56
245 0.52
246 0.51
247 0.57
248 0.56
249 0.51
250 0.51
251 0.56
252 0.59
253 0.6
254 0.63
255 0.6
256 0.59
257 0.62
258 0.58
259 0.5
260 0.42
261 0.37
262 0.31
263 0.24
264 0.19
265 0.17
266 0.14
267 0.17
268 0.22
269 0.26
270 0.29
271 0.3
272 0.34
273 0.34
274 0.38
275 0.41
276 0.39
277 0.42
278 0.45
279 0.45
280 0.47
281 0.49
282 0.53
283 0.54
284 0.58
285 0.62
286 0.66
287 0.73
288 0.76
289 0.82
290 0.83
291 0.85
292 0.86
293 0.83
294 0.81
295 0.79
296 0.77
297 0.74