FuNGI

A0A0E9NQC0

Protein Details

Accession

A0A0E9NQC0

Localization Confidence

High

Confidence Score

16.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
18-46	ITKKDGPADQKLKPRPKPRDPVGPKLKVV	Basic
188-222	IEYLRAQKEKKKVAKEKSREKEKKRKEKEGGVGAA	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
27-44	QKLKPRPKPRDPVGPKLK
194-244	QKEKKKVAKEKSREKEKKRKEKEGGVGAATAEKGSRRKKSGAPAAGDGAAK
262-271	PKSRRSKQRA
448-462	PGGRGGRGGGRGGGR

Subcellular Location(s)

cyto_nucl 9.5, cyto 8.5, nucl 7.5, mito 6, extr 2, pero 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR039722 Upf3 IPR005120 UPF3_dom
Gene Ontology	GO:0016020 C:membrane GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0000184 P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay
Pfam	View protein in Pfam PF03467 Smg4_UPF3
CDD	cd12455 RRM_like_Smg4_UPF3

Amino Acid Sequences

MPDPKAATDAATAPPIAITKKDGPADQKLKPRPKPRDPVGPKLKVVVRRLPPNLPEEIFITATDEWVNEKTTSWFHYIPGKLTENPNKQSRSSRAYIKFLTPAHITTFHTAFHRHLFIDSRGRESRALVELAPNQKTARTRSGRAKDNRSNTLEEDPEFKAFVESLSEKGSGVPAVEKEEESKVTPLIEYLRAQKEKKKVAKEKSREKEKKRKEKEGGVGAATAEKGSRRKKSGAPAAGDGAAKTNGAKAGQQPATGDATAPKSRRSKQRAAKAAASATAGDTATTTPQPCAPSTNARKPAQKQPKIVQPPQNGVGPPNALMQAARRPPNALAAQAGGGGQGGQGQAQGGGRGRRGGGGGGAAQGNRQPPTQPQASTQQQHVQQPPTGPAAQVAQRGGRAPARGGMNPRGGLAIGGGRGPPVPILVAQAQLQALQSGRGGFARAGFGPGGRGGRGGGRGGGRGGAVVGGATGSRWSEIPTNSPPDLHQIIHQSAMGVSPDDIIKSTLKHGLDKLSPEEKRVLEESASTMSICTKVGAAVGVIALGFATRRLKNTTRLRIFGASLFGMFAGGQVGLMVGIYQTSNIIRALPDKQHLLSVLNETQAEIASGIKAPRSSAVGGSPSGRIPPLEVRGGNGNGNEFEQVPDADDGRILSDEEMNRQAMLLEQQRLASANGADGVDPTPGQPQSAWARAQQQPEPPTRTPKWDEIRQAQTGQSQSAWGRVRREAATSSPSSSSSKSGSEPFGQGAYSYSAKLEEEDLAREKGMEDFEKVLESERAASARTGEDKYAGTGFGGRKKVNQYGDES

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.16
2	0.17
3	0.16
4	0.15
5	0.19
6	0.23
7	0.29
8	0.33
9	0.36
10	0.4
11	0.49
12	0.54
13	0.55
14	0.6
15	0.64
16	0.71
17	0.77
18	0.82
19	0.82
20	0.85
21	0.89
22	0.86
23	0.88
24	0.85
25	0.86
26	0.86
27	0.83
28	0.74
29	0.7
30	0.68
31	0.65
32	0.63
33	0.62
34	0.59
35	0.62
36	0.65
37	0.65
38	0.63
39	0.59
40	0.58
41	0.5
42	0.43
43	0.35
44	0.33
45	0.27
46	0.23
47	0.23
48	0.17
49	0.17
50	0.15
51	0.14
52	0.13
53	0.14
54	0.16
55	0.13
56	0.15
57	0.17
58	0.19
59	0.23
60	0.26
61	0.25
62	0.25
63	0.33
64	0.34
65	0.35
66	0.38
67	0.39
68	0.37
69	0.46
70	0.54
71	0.54
72	0.58
73	0.62
74	0.6
75	0.59
76	0.64
77	0.63
78	0.6
79	0.57
80	0.6
81	0.59
82	0.62
83	0.61
84	0.56
85	0.55
86	0.48
87	0.48
88	0.4
89	0.35
90	0.32
91	0.32
92	0.31
93	0.28
94	0.28
95	0.25
96	0.26
97	0.26
98	0.25
99	0.27
100	0.27
101	0.23
102	0.25
103	0.27
104	0.3
105	0.37
106	0.36
107	0.39
108	0.39
109	0.41
110	0.39
111	0.37
112	0.36
113	0.3
114	0.3
115	0.23
116	0.25
117	0.29
118	0.34
119	0.33
120	0.3
121	0.27
122	0.3
123	0.33
124	0.34
125	0.38
126	0.38
127	0.44
128	0.53
129	0.61
130	0.67
131	0.72
132	0.77
133	0.75
134	0.77
135	0.79
136	0.72
137	0.67
138	0.6
139	0.57
140	0.49
141	0.41
142	0.37
143	0.31
144	0.28
145	0.25
146	0.22
147	0.17
148	0.14
149	0.13
150	0.14
151	0.13
152	0.14
153	0.16
154	0.16
155	0.15
156	0.15
157	0.16
158	0.11
159	0.11
160	0.12
161	0.1
162	0.14
163	0.15
164	0.15
165	0.16
166	0.18
167	0.19
168	0.19
169	0.19
170	0.16
171	0.15
172	0.15
173	0.14
174	0.15
175	0.16
176	0.16
177	0.22
178	0.3
179	0.35
180	0.37
181	0.43
182	0.49
183	0.56
184	0.62
185	0.65
186	0.67
187	0.72
188	0.81
189	0.84
190	0.86
191	0.87
192	0.9
193	0.9
194	0.9
195	0.91
196	0.91
197	0.92
198	0.9
199	0.91
200	0.87
201	0.86
202	0.85
203	0.82
204	0.74
205	0.63
206	0.54
207	0.43
208	0.36
209	0.27
210	0.18
211	0.1
212	0.1
213	0.16
214	0.23
215	0.29
216	0.33
217	0.38
218	0.44
219	0.53
220	0.6
221	0.6
222	0.56
223	0.52
224	0.49
225	0.46
226	0.4
227	0.31
228	0.23
229	0.16
230	0.12
231	0.1
232	0.1
233	0.09
234	0.09
235	0.11
236	0.12
237	0.2
238	0.21
239	0.22
240	0.21
241	0.22
242	0.23
243	0.22
244	0.19
245	0.13
246	0.17
247	0.22
248	0.22
249	0.26
250	0.31
251	0.38
252	0.48
253	0.54
254	0.59
255	0.63
256	0.72
257	0.76
258	0.74
259	0.72
260	0.65
261	0.57
262	0.48
263	0.4
264	0.3
265	0.2
266	0.16
267	0.11
268	0.08
269	0.08
270	0.07
271	0.08
272	0.09
273	0.09
274	0.09
275	0.12
276	0.13
277	0.13
278	0.16
279	0.18
280	0.27
281	0.34
282	0.43
283	0.49
284	0.51
285	0.57
286	0.59
287	0.67
288	0.68
289	0.67
290	0.64
291	0.61
292	0.68
293	0.7
294	0.72
295	0.7
296	0.63
297	0.6
298	0.56
299	0.53
300	0.43
301	0.35
302	0.3
303	0.22
304	0.18
305	0.15
306	0.13
307	0.1
308	0.1
309	0.1
310	0.15
311	0.2
312	0.22
313	0.21
314	0.22
315	0.22
316	0.28
317	0.27
318	0.22
319	0.17
320	0.15
321	0.15
322	0.13
323	0.13
324	0.06
325	0.05
326	0.04
327	0.04
328	0.04
329	0.04
330	0.04
331	0.04
332	0.04
333	0.05
334	0.05
335	0.06
336	0.08
337	0.09
338	0.1
339	0.11
340	0.11
341	0.11
342	0.11
343	0.1
344	0.08
345	0.07
346	0.07
347	0.07
348	0.08
349	0.07
350	0.07
351	0.08
352	0.1
353	0.1
354	0.1
355	0.1
356	0.12
357	0.17
358	0.2
359	0.19
360	0.2
361	0.27
362	0.32
363	0.33
364	0.33
365	0.34
366	0.34
367	0.38
368	0.39
369	0.33
370	0.3
371	0.29
372	0.29
373	0.26
374	0.23
375	0.17
376	0.14
377	0.14
378	0.15
379	0.15
380	0.14
381	0.12
382	0.12
383	0.13
384	0.14
385	0.13
386	0.12
387	0.1
388	0.14
389	0.15
390	0.16
391	0.19
392	0.22
393	0.22
394	0.21
395	0.21
396	0.17
397	0.15
398	0.13
399	0.1
400	0.07
401	0.05
402	0.05
403	0.05
404	0.05
405	0.05
406	0.05
407	0.05
408	0.04
409	0.04
410	0.04
411	0.06
412	0.07
413	0.08
414	0.08
415	0.09
416	0.08
417	0.09
418	0.08
419	0.07
420	0.06
421	0.06
422	0.06
423	0.05
424	0.06
425	0.06
426	0.07
427	0.06
428	0.07
429	0.08
430	0.07
431	0.08
432	0.08
433	0.08
434	0.08
435	0.09
436	0.09
437	0.07
438	0.08
439	0.07
440	0.08
441	0.09
442	0.09
443	0.1
444	0.1
445	0.1
446	0.1
447	0.1
448	0.09
449	0.07
450	0.07
451	0.05
452	0.04
453	0.03
454	0.03
455	0.02
456	0.02
457	0.02
458	0.03
459	0.03
460	0.03
461	0.04
462	0.05
463	0.09
464	0.1
465	0.15
466	0.18
467	0.23
468	0.23
469	0.23
470	0.22
471	0.24
472	0.26
473	0.21
474	0.21
475	0.2
476	0.2
477	0.21
478	0.2
479	0.15
480	0.13
481	0.13
482	0.11
483	0.07
484	0.06
485	0.06
486	0.06
487	0.06
488	0.06
489	0.07
490	0.08
491	0.08
492	0.1
493	0.14
494	0.15
495	0.17
496	0.18
497	0.21
498	0.22
499	0.24
500	0.27
501	0.3
502	0.3
503	0.3
504	0.33
505	0.29
506	0.29
507	0.29
508	0.25
509	0.17
510	0.17
511	0.17
512	0.14
513	0.14
514	0.11
515	0.1
516	0.09
517	0.09
518	0.09
519	0.08
520	0.06
521	0.06
522	0.06
523	0.06
524	0.05
525	0.05
526	0.04
527	0.04
528	0.04
529	0.03
530	0.03
531	0.03
532	0.03
533	0.04
534	0.09
535	0.1
536	0.13
537	0.19
538	0.23
539	0.33
540	0.43
541	0.52
542	0.52
543	0.53
544	0.54
545	0.51
546	0.49
547	0.4
548	0.32
549	0.22
550	0.17
551	0.15
552	0.11
553	0.09
554	0.08
555	0.06
556	0.04
557	0.04
558	0.04
559	0.03
560	0.03
561	0.03
562	0.03
563	0.03
564	0.02
565	0.03
566	0.03
567	0.03
568	0.04
569	0.04
570	0.06
571	0.06
572	0.07
573	0.07
574	0.1
575	0.14
576	0.17
577	0.2
578	0.21
579	0.22
580	0.22
581	0.23
582	0.22
583	0.19
584	0.21
585	0.2
586	0.18
587	0.18
588	0.17
589	0.16
590	0.14
591	0.13
592	0.08
593	0.07
594	0.06
595	0.08
596	0.08
597	0.09
598	0.1
599	0.1
600	0.11
601	0.13
602	0.14
603	0.13
604	0.16
605	0.16
606	0.17
607	0.18
608	0.18
609	0.16
610	0.16
611	0.15
612	0.12
613	0.13
614	0.17
615	0.2
616	0.23
617	0.23
618	0.24
619	0.28
620	0.3
621	0.29
622	0.25
623	0.22
624	0.18
625	0.19
626	0.18
627	0.13
628	0.12
629	0.12
630	0.11
631	0.11
632	0.12
633	0.12
634	0.11
635	0.11
636	0.1
637	0.1
638	0.11
639	0.09
640	0.09
641	0.12
642	0.13
643	0.16
644	0.19
645	0.18
646	0.17
647	0.17
648	0.16
649	0.13
650	0.18
651	0.2
652	0.2
653	0.21
654	0.21
655	0.22
656	0.23
657	0.22
658	0.18
659	0.13
660	0.11
661	0.12
662	0.12
663	0.11
664	0.11
665	0.11
666	0.09
667	0.09
668	0.09
669	0.12
670	0.12
671	0.13
672	0.12
673	0.17
674	0.23
675	0.28
676	0.29
677	0.28
678	0.35
679	0.39
680	0.45
681	0.44
682	0.45
683	0.47
684	0.54
685	0.58
686	0.54
687	0.58
688	0.56
689	0.6
690	0.58
691	0.61
692	0.61
693	0.62
694	0.67
695	0.67
696	0.7
697	0.66
698	0.62
699	0.55
700	0.52
701	0.46
702	0.38
703	0.3
704	0.27
705	0.23
706	0.29
707	0.32
708	0.31
709	0.33
710	0.35
711	0.4
712	0.38
713	0.41
714	0.37
715	0.35
716	0.38
717	0.36
718	0.36
719	0.32
720	0.33
721	0.32
722	0.3
723	0.29
724	0.25
725	0.25
726	0.25
727	0.28
728	0.3
729	0.31
730	0.31
731	0.3
732	0.28
733	0.25
734	0.22
735	0.2
736	0.19
737	0.17
738	0.15
739	0.14
740	0.15
741	0.15
742	0.16
743	0.15
744	0.15
745	0.16
746	0.2
747	0.23
748	0.23
749	0.23
750	0.22
751	0.21
752	0.2
753	0.22
754	0.2
755	0.19
756	0.2
757	0.21
758	0.22
759	0.22
760	0.22
761	0.19
762	0.18
763	0.18
764	0.18
765	0.19
766	0.18
767	0.19
768	0.18
769	0.21
770	0.24
771	0.24
772	0.23
773	0.24
774	0.24
775	0.26
776	0.25
777	0.21
778	0.16
779	0.2
780	0.24
781	0.29
782	0.35
783	0.33
784	0.38
785	0.45
786	0.52
787	0.53

A0A0E9NQC0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer