Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q5KNM1

Protein Details
Accession Q5KNM1    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
174-197GGKEKDKKGREKAPKKKEEKWGDKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
175-197GKEKDKKGREKAPKKKEEKWGDK
269-281KKKKVAPAPVAKP
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 14.5, cyto 10.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006886  RNA_pol_III_Rpc5  
Gene Ontology GO:0005666  C:RNA polymerase III complex  
GO:0006383  P:transcription by RNA polymerase III  
Pfam View protein in Pfam  
PF04801  RPC5  
Amino Acid Sequences MDSPHDNIQTVVDSITSYPEPRESDGPRLSASDAHPSIHDLPGPSTTYIPRQPSPPLPDLRTRSFPVVDASDDEDDEDDEPIATLPIYISPGLGEQGLDLHQYPLQHRDISVPTWARDRGKTISARVKEKAGRVEVEIPVDAGAAYWREDRASELGFVVDVNADDGPVGGYGLGGKEKDKKGREKAPKKKEEKWGDKMRLRSELVPNATGYYSGVVRDGALHLHPISRVLQFRTSLGYLDDVDQKSRSRRLANGTVNGAGDSDEEEAPKKKKVAPAPVAKPRRVLDEEDNDGTGSIKDFRNKMWAMAIKEDEDSWVGYSWKAGEDDAVGDALGSLILDEEKRERLTCQTRPLDYLDRAV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.11
2 0.15
3 0.15
4 0.14
5 0.15
6 0.19
7 0.22
8 0.25
9 0.32
10 0.31
11 0.39
12 0.42
13 0.42
14 0.39
15 0.38
16 0.35
17 0.33
18 0.31
19 0.31
20 0.28
21 0.27
22 0.26
23 0.29
24 0.3
25 0.28
26 0.27
27 0.19
28 0.2
29 0.23
30 0.25
31 0.21
32 0.21
33 0.21
34 0.26
35 0.31
36 0.35
37 0.33
38 0.34
39 0.4
40 0.45
41 0.5
42 0.51
43 0.51
44 0.5
45 0.57
46 0.6
47 0.6
48 0.57
49 0.53
50 0.5
51 0.44
52 0.41
53 0.36
54 0.32
55 0.27
56 0.23
57 0.24
58 0.2
59 0.19
60 0.18
61 0.15
62 0.13
63 0.13
64 0.11
65 0.07
66 0.06
67 0.07
68 0.06
69 0.06
70 0.05
71 0.05
72 0.04
73 0.05
74 0.07
75 0.07
76 0.06
77 0.06
78 0.07
79 0.08
80 0.07
81 0.06
82 0.05
83 0.06
84 0.06
85 0.07
86 0.07
87 0.08
88 0.09
89 0.1
90 0.12
91 0.16
92 0.18
93 0.17
94 0.17
95 0.21
96 0.22
97 0.22
98 0.26
99 0.24
100 0.22
101 0.26
102 0.29
103 0.28
104 0.27
105 0.3
106 0.27
107 0.31
108 0.32
109 0.35
110 0.4
111 0.43
112 0.46
113 0.43
114 0.46
115 0.43
116 0.44
117 0.43
118 0.37
119 0.34
120 0.31
121 0.34
122 0.29
123 0.26
124 0.22
125 0.17
126 0.14
127 0.13
128 0.1
129 0.06
130 0.05
131 0.04
132 0.05
133 0.06
134 0.06
135 0.06
136 0.07
137 0.08
138 0.1
139 0.1
140 0.1
141 0.09
142 0.09
143 0.09
144 0.08
145 0.07
146 0.05
147 0.04
148 0.04
149 0.04
150 0.04
151 0.03
152 0.04
153 0.04
154 0.03
155 0.03
156 0.02
157 0.02
158 0.03
159 0.03
160 0.04
161 0.04
162 0.05
163 0.12
164 0.15
165 0.22
166 0.27
167 0.34
168 0.41
169 0.51
170 0.61
171 0.65
172 0.73
173 0.77
174 0.82
175 0.82
176 0.82
177 0.83
178 0.82
179 0.8
180 0.79
181 0.78
182 0.76
183 0.74
184 0.71
185 0.64
186 0.58
187 0.51
188 0.46
189 0.41
190 0.38
191 0.36
192 0.32
193 0.29
194 0.24
195 0.22
196 0.18
197 0.13
198 0.09
199 0.07
200 0.06
201 0.07
202 0.06
203 0.06
204 0.06
205 0.06
206 0.06
207 0.06
208 0.07
209 0.07
210 0.08
211 0.08
212 0.09
213 0.11
214 0.13
215 0.15
216 0.16
217 0.19
218 0.19
219 0.2
220 0.21
221 0.2
222 0.17
223 0.15
224 0.14
225 0.12
226 0.13
227 0.19
228 0.16
229 0.17
230 0.19
231 0.21
232 0.24
233 0.28
234 0.31
235 0.28
236 0.32
237 0.39
238 0.47
239 0.5
240 0.49
241 0.47
242 0.44
243 0.4
244 0.36
245 0.28
246 0.18
247 0.13
248 0.09
249 0.09
250 0.08
251 0.09
252 0.11
253 0.16
254 0.18
255 0.21
256 0.23
257 0.25
258 0.31
259 0.39
260 0.47
261 0.52
262 0.6
263 0.65
264 0.73
265 0.76
266 0.71
267 0.69
268 0.59
269 0.58
270 0.51
271 0.47
272 0.45
273 0.45
274 0.49
275 0.44
276 0.44
277 0.36
278 0.33
279 0.28
280 0.2
281 0.14
282 0.13
283 0.14
284 0.19
285 0.2
286 0.22
287 0.29
288 0.3
289 0.3
290 0.34
291 0.37
292 0.35
293 0.4
294 0.4
295 0.33
296 0.34
297 0.32
298 0.26
299 0.21
300 0.18
301 0.13
302 0.13
303 0.12
304 0.11
305 0.12
306 0.12
307 0.13
308 0.13
309 0.12
310 0.11
311 0.12
312 0.13
313 0.12
314 0.11
315 0.09
316 0.08
317 0.07
318 0.06
319 0.05
320 0.04
321 0.03
322 0.03
323 0.05
324 0.05
325 0.07
326 0.11
327 0.15
328 0.18
329 0.19
330 0.21
331 0.3
332 0.39
333 0.43
334 0.51
335 0.55
336 0.55
337 0.57
338 0.61
339 0.59