Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0E9NDM9

Protein Details
Accession A0A0E9NDM9    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
361-408AKAAKKEEKRALKRQEKEKKKKALAKQAKKQQKKREKAGKKGKKTGTDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
355-410KKVDAAAKAAKKEEKRALKRQEKEKKKKALAKQAKKQQKKREKAGKKGKKTGTDMK
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 11.5, cyto 7.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR022684  Calpain_cysteine_protease  
IPR001514  DNA-dir_RNA_pol_30-40kDasu_CS  
IPR011262  DNA-dir_RNA_pol_insert  
IPR011263  DNA-dir_RNA_pol_RpoA/D/Rpb3  
IPR038765  Papain-like_cys_pep_sf  
IPR001300  Peptidase_C2_calpain_cat  
IPR036603  RBP11-like  
IPR022842  RNAP_Rpo3/Rpb3/RPAC1  
IPR036643  RNApol_insert_sf  
Gene Ontology GO:0055029  C:nuclear DNA-directed RNA polymerase complex  
GO:0004198  F:calcium-dependent cysteine-type endopeptidase activity  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003899  F:DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity  
GO:0046983  F:protein dimerization activity  
GO:0006351  P:DNA-templated transcription  
GO:0006508  P:proteolysis  
Pfam View protein in Pfam  
PF00648  Peptidase_C2  
PF01000  RNA_pol_A_bac  
PF01193  RNA_pol_L  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50203  CALPAIN_CAT  
PS00446  RNA_POL_D_30KD  
CDD cd07031  RNAP_II_RPB3  
Amino Acid Sequences MLERAVSWSDRSGDREEGYRQHNLKGSKALYFAQCGEENETWLPLLEKAYAKAHGDYEAIDGGLTGEGIEDLTGGVTTTLFTNDILDREVFWQNLLRVNQDHLFGCFTGCLHSGAADSRSGIFEGHAYSVLKVVEVKGERLVLLRNPWGNSEWTGPWGDGTKEWTPEWMQLLGHRFGNDGVFWMSYKDLLRIFDSWDITRLFDSDWKTTQVWTTIEVPWTADYHSTKFEMTVSKAGPHVIVLSQLDDRYFQGLEGQYIFSLQFRLHKKADDDYILRSQSWMFSTRSVNAEVDLEPGTYTVLIKVTATKCASPKPVEEVVRLTYREKPAKLIQIGLSYDLAHAKGQPVPRSPEEQKKVDAAAKAAKKEEKRALKRQEKEKKKKALAKQAKKQQKKREKAGKKGKKTGTDMKSKWESKKEEVAESQDASSTKPADPAPEDDSEYHKVSAPVSPVTATSAHAVKAGDQEPEDPQLEDQKAEVQKPQRPKLARSSGDESSNRVEVSDTSGSNSDSDSDSSDSDTDTEGQTVVNQPEAAQEEVEKDEIEKWPWNAVGVVGLRVYSQSSAVTLEVKVGEEGEKAPLDMDDSAKDAHEKGKDAPEDEAEKSSTDISDLRGQVTTGLTLVSISHLPPAVAECIRLQHAPQHTTLGHTVEQTTSSGSYSPFHSSHHLLSSQQISCNRILPSATVTMSFNPDEPKVTIREVTKDSVEFMMENTDLAVANSLRRVMIAEVPTVAIDLVEIETNTSVLADEFIAHRLGLIPLSSLDVETAIPKYTRDCDCDAYCQNCSVTLTLHAACSGGYGNMDVWSRDLVVEARHGTDIGKPVVGEGGKGVLICKLARGQELRVKCIAKKGIAKEHAKWSPVCAVGFEYDPHNALRHTDYWYEEDIEKEWPASKYAEWDEEGAAKKNEPFDYNAKPKKFFMNVESVGSIPVNMIVERGFDELIRKLYRVQDDWKKLDNPNKTNGVAAGYGGGWGEGDDAAYSPQAGTAWGGSAAADGWGNANAGAGW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.33
2 0.36
3 0.37
4 0.4
5 0.42
6 0.47
7 0.44
8 0.45
9 0.5
10 0.48
11 0.47
12 0.49
13 0.46
14 0.41
15 0.42
16 0.41
17 0.38
18 0.38
19 0.35
20 0.32
21 0.33
22 0.31
23 0.35
24 0.31
25 0.31
26 0.28
27 0.27
28 0.22
29 0.2
30 0.19
31 0.14
32 0.14
33 0.16
34 0.17
35 0.19
36 0.23
37 0.26
38 0.27
39 0.28
40 0.28
41 0.25
42 0.24
43 0.22
44 0.21
45 0.18
46 0.15
47 0.12
48 0.11
49 0.09
50 0.09
51 0.08
52 0.05
53 0.04
54 0.04
55 0.04
56 0.04
57 0.04
58 0.04
59 0.04
60 0.04
61 0.04
62 0.04
63 0.04
64 0.05
65 0.06
66 0.07
67 0.07
68 0.07
69 0.1
70 0.12
71 0.13
72 0.15
73 0.14
74 0.15
75 0.18
76 0.21
77 0.19
78 0.18
79 0.22
80 0.21
81 0.28
82 0.28
83 0.28
84 0.26
85 0.31
86 0.32
87 0.3
88 0.29
89 0.24
90 0.25
91 0.21
92 0.2
93 0.16
94 0.14
95 0.14
96 0.14
97 0.14
98 0.12
99 0.12
100 0.13
101 0.15
102 0.16
103 0.14
104 0.13
105 0.13
106 0.14
107 0.14
108 0.13
109 0.11
110 0.11
111 0.12
112 0.12
113 0.13
114 0.13
115 0.13
116 0.15
117 0.15
118 0.14
119 0.13
120 0.12
121 0.17
122 0.18
123 0.19
124 0.19
125 0.19
126 0.19
127 0.2
128 0.22
129 0.19
130 0.21
131 0.26
132 0.27
133 0.28
134 0.29
135 0.3
136 0.29
137 0.28
138 0.28
139 0.23
140 0.22
141 0.22
142 0.2
143 0.19
144 0.19
145 0.18
146 0.15
147 0.2
148 0.21
149 0.23
150 0.23
151 0.25
152 0.24
153 0.26
154 0.27
155 0.23
156 0.2
157 0.22
158 0.27
159 0.26
160 0.26
161 0.23
162 0.21
163 0.2
164 0.21
165 0.17
166 0.14
167 0.12
168 0.11
169 0.11
170 0.12
171 0.11
172 0.13
173 0.13
174 0.14
175 0.15
176 0.16
177 0.19
178 0.18
179 0.21
180 0.23
181 0.25
182 0.23
183 0.24
184 0.23
185 0.21
186 0.21
187 0.18
188 0.15
189 0.17
190 0.2
191 0.21
192 0.22
193 0.25
194 0.25
195 0.26
196 0.27
197 0.26
198 0.23
199 0.22
200 0.23
201 0.22
202 0.23
203 0.22
204 0.21
205 0.18
206 0.18
207 0.15
208 0.17
209 0.16
210 0.17
211 0.19
212 0.2
213 0.19
214 0.18
215 0.2
216 0.19
217 0.2
218 0.23
219 0.22
220 0.23
221 0.23
222 0.23
223 0.21
224 0.17
225 0.15
226 0.1
227 0.11
228 0.1
229 0.11
230 0.12
231 0.12
232 0.12
233 0.12
234 0.12
235 0.12
236 0.12
237 0.1
238 0.13
239 0.13
240 0.14
241 0.14
242 0.14
243 0.12
244 0.13
245 0.13
246 0.09
247 0.09
248 0.08
249 0.14
250 0.18
251 0.25
252 0.26
253 0.29
254 0.31
255 0.35
256 0.39
257 0.37
258 0.34
259 0.33
260 0.37
261 0.34
262 0.31
263 0.27
264 0.24
265 0.2
266 0.21
267 0.2
268 0.15
269 0.18
270 0.21
271 0.23
272 0.25
273 0.25
274 0.23
275 0.2
276 0.2
277 0.17
278 0.16
279 0.13
280 0.11
281 0.09
282 0.09
283 0.08
284 0.07
285 0.07
286 0.06
287 0.06
288 0.06
289 0.06
290 0.12
291 0.13
292 0.19
293 0.2
294 0.22
295 0.23
296 0.28
297 0.33
298 0.29
299 0.3
300 0.31
301 0.36
302 0.35
303 0.35
304 0.33
305 0.32
306 0.33
307 0.32
308 0.28
309 0.27
310 0.33
311 0.37
312 0.35
313 0.36
314 0.38
315 0.44
316 0.43
317 0.4
318 0.34
319 0.32
320 0.32
321 0.28
322 0.24
323 0.16
324 0.16
325 0.14
326 0.12
327 0.09
328 0.09
329 0.09
330 0.12
331 0.16
332 0.19
333 0.23
334 0.27
335 0.29
336 0.36
337 0.4
338 0.47
339 0.48
340 0.47
341 0.45
342 0.41
343 0.42
344 0.38
345 0.34
346 0.26
347 0.28
348 0.28
349 0.28
350 0.3
351 0.32
352 0.31
353 0.37
354 0.43
355 0.46
356 0.51
357 0.59
358 0.67
359 0.71
360 0.77
361 0.81
362 0.83
363 0.84
364 0.86
365 0.86
366 0.86
367 0.85
368 0.86
369 0.84
370 0.84
371 0.84
372 0.84
373 0.83
374 0.83
375 0.85
376 0.86
377 0.86
378 0.86
379 0.85
380 0.84
381 0.86
382 0.87
383 0.86
384 0.87
385 0.89
386 0.88
387 0.86
388 0.87
389 0.82
390 0.78
391 0.76
392 0.75
393 0.7
394 0.7
395 0.61
396 0.59
397 0.61
398 0.59
399 0.58
400 0.55
401 0.53
402 0.48
403 0.55
404 0.5
405 0.45
406 0.42
407 0.41
408 0.35
409 0.31
410 0.27
411 0.21
412 0.19
413 0.16
414 0.16
415 0.13
416 0.11
417 0.14
418 0.14
419 0.14
420 0.15
421 0.18
422 0.19
423 0.19
424 0.2
425 0.18
426 0.22
427 0.23
428 0.23
429 0.2
430 0.18
431 0.17
432 0.17
433 0.18
434 0.16
435 0.13
436 0.12
437 0.11
438 0.1
439 0.11
440 0.11
441 0.1
442 0.09
443 0.1
444 0.1
445 0.11
446 0.11
447 0.1
448 0.13
449 0.13
450 0.13
451 0.12
452 0.13
453 0.12
454 0.15
455 0.15
456 0.11
457 0.1
458 0.14
459 0.14
460 0.13
461 0.12
462 0.16
463 0.17
464 0.17
465 0.21
466 0.22
467 0.26
468 0.34
469 0.39
470 0.4
471 0.41
472 0.44
473 0.5
474 0.54
475 0.52
476 0.49
477 0.49
478 0.44
479 0.47
480 0.44
481 0.36
482 0.29
483 0.27
484 0.21
485 0.16
486 0.15
487 0.09
488 0.14
489 0.14
490 0.12
491 0.12
492 0.13
493 0.13
494 0.13
495 0.13
496 0.09
497 0.07
498 0.08
499 0.08
500 0.09
501 0.09
502 0.09
503 0.09
504 0.08
505 0.08
506 0.08
507 0.07
508 0.06
509 0.06
510 0.06
511 0.06
512 0.06
513 0.08
514 0.08
515 0.08
516 0.07
517 0.07
518 0.09
519 0.11
520 0.1
521 0.08
522 0.08
523 0.09
524 0.09
525 0.1
526 0.08
527 0.07
528 0.08
529 0.09
530 0.11
531 0.12
532 0.12
533 0.13
534 0.13
535 0.13
536 0.11
537 0.1
538 0.11
539 0.09
540 0.09
541 0.07
542 0.08
543 0.07
544 0.07
545 0.08
546 0.05
547 0.05
548 0.05
549 0.05
550 0.06
551 0.06
552 0.07
553 0.07
554 0.07
555 0.07
556 0.07
557 0.07
558 0.06
559 0.06
560 0.06
561 0.07
562 0.07
563 0.07
564 0.07
565 0.07
566 0.06
567 0.07
568 0.07
569 0.08
570 0.06
571 0.08
572 0.08
573 0.08
574 0.09
575 0.08
576 0.12
577 0.13
578 0.14
579 0.15
580 0.22
581 0.22
582 0.23
583 0.23
584 0.22
585 0.24
586 0.23
587 0.22
588 0.16
589 0.15
590 0.15
591 0.14
592 0.11
593 0.09
594 0.09
595 0.1
596 0.15
597 0.15
598 0.15
599 0.15
600 0.15
601 0.15
602 0.15
603 0.12
604 0.07
605 0.06
606 0.05
607 0.05
608 0.05
609 0.05
610 0.05
611 0.05
612 0.06
613 0.06
614 0.06
615 0.06
616 0.08
617 0.09
618 0.09
619 0.1
620 0.09
621 0.11
622 0.12
623 0.13
624 0.12
625 0.15
626 0.2
627 0.21
628 0.21
629 0.23
630 0.21
631 0.24
632 0.25
633 0.22
634 0.18
635 0.16
636 0.16
637 0.13
638 0.13
639 0.11
640 0.11
641 0.09
642 0.08
643 0.09
644 0.09
645 0.09
646 0.11
647 0.15
648 0.15
649 0.16
650 0.19
651 0.21
652 0.22
653 0.24
654 0.22
655 0.19
656 0.21
657 0.25
658 0.23
659 0.24
660 0.25
661 0.24
662 0.24
663 0.28
664 0.25
665 0.21
666 0.2
667 0.17
668 0.17
669 0.17
670 0.16
671 0.13
672 0.14
673 0.14
674 0.16
675 0.16
676 0.14
677 0.14
678 0.14
679 0.15
680 0.16
681 0.17
682 0.16
683 0.18
684 0.2
685 0.2
686 0.24
687 0.25
688 0.26
689 0.25
690 0.23
691 0.23
692 0.2
693 0.19
694 0.14
695 0.11
696 0.12
697 0.1
698 0.09
699 0.08
700 0.08
701 0.07
702 0.07
703 0.09
704 0.06
705 0.07
706 0.08
707 0.08
708 0.08
709 0.08
710 0.09
711 0.09
712 0.13
713 0.14
714 0.13
715 0.13
716 0.14
717 0.13
718 0.12
719 0.11
720 0.06
721 0.04
722 0.04
723 0.04
724 0.04
725 0.04
726 0.05
727 0.05
728 0.05
729 0.05
730 0.05
731 0.04
732 0.04
733 0.05
734 0.04
735 0.05
736 0.06
737 0.07
738 0.08
739 0.07
740 0.07
741 0.08
742 0.08
743 0.08
744 0.07
745 0.07
746 0.06
747 0.08
748 0.08
749 0.07
750 0.07
751 0.07
752 0.07
753 0.08
754 0.09
755 0.09
756 0.09
757 0.09
758 0.12
759 0.18
760 0.21
761 0.24
762 0.26
763 0.31
764 0.32
765 0.39
766 0.42
767 0.39
768 0.37
769 0.35
770 0.31
771 0.27
772 0.26
773 0.2
774 0.15
775 0.15
776 0.17
777 0.16
778 0.16
779 0.14
780 0.13
781 0.12
782 0.12
783 0.1
784 0.06
785 0.06
786 0.06
787 0.07
788 0.09
789 0.1
790 0.09
791 0.1
792 0.1
793 0.1
794 0.1
795 0.11
796 0.09
797 0.1
798 0.14
799 0.14
800 0.15
801 0.15
802 0.15
803 0.14
804 0.17
805 0.2
806 0.17
807 0.17
808 0.15
809 0.15
810 0.19
811 0.18
812 0.14
813 0.1
814 0.1
815 0.1
816 0.1
817 0.1
818 0.08
819 0.1
820 0.1
821 0.11
822 0.14
823 0.15
824 0.2
825 0.22
826 0.26
827 0.32
828 0.35
829 0.37
830 0.39
831 0.4
832 0.37
833 0.43
834 0.42
835 0.42
836 0.46
837 0.49
838 0.54
839 0.6
840 0.64
841 0.61
842 0.66
843 0.64
844 0.59
845 0.53
846 0.46
847 0.44
848 0.42
849 0.36
850 0.27
851 0.25
852 0.23
853 0.24
854 0.21
855 0.18
856 0.16
857 0.17
858 0.17
859 0.16
860 0.15
861 0.16
862 0.19
863 0.19
864 0.22
865 0.24
866 0.26
867 0.27
868 0.3
869 0.3
870 0.27
871 0.26
872 0.23
873 0.23
874 0.21
875 0.18
876 0.2
877 0.18
878 0.19
879 0.2
880 0.19
881 0.23
882 0.27
883 0.29
884 0.26
885 0.27
886 0.26
887 0.29
888 0.31
889 0.29
890 0.26
891 0.24
892 0.26
893 0.3
894 0.31
895 0.28
896 0.31
897 0.33
898 0.42
899 0.51
900 0.57
901 0.57
902 0.57
903 0.57
904 0.61
905 0.61
906 0.55
907 0.5
908 0.51
909 0.49
910 0.49
911 0.47
912 0.38
913 0.33
914 0.29
915 0.23
916 0.13
917 0.12
918 0.1
919 0.09
920 0.09
921 0.08
922 0.09
923 0.11
924 0.12
925 0.11
926 0.1
927 0.14
928 0.16
929 0.22
930 0.23
931 0.23
932 0.25
933 0.32
934 0.38
935 0.39
936 0.46
937 0.5
938 0.57
939 0.62
940 0.65
941 0.64
942 0.65
943 0.68
944 0.69
945 0.64
946 0.63
947 0.64
948 0.58
949 0.53
950 0.47
951 0.42
952 0.32
953 0.26
954 0.2
955 0.13
956 0.13
957 0.11
958 0.09
959 0.06
960 0.06
961 0.06
962 0.05
963 0.05
964 0.05
965 0.06
966 0.07
967 0.07
968 0.08
969 0.07
970 0.08
971 0.07
972 0.08
973 0.08
974 0.08
975 0.09
976 0.09
977 0.09
978 0.08
979 0.08
980 0.08
981 0.08
982 0.07
983 0.06
984 0.07
985 0.08
986 0.08
987 0.08