Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0E9NNJ3

Protein Details
Accession A0A0E9NNJ3    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
482-509RERPVSMQKKKITRRKRQVQVAEKNAKKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
487-509SMQKKKITRRKRQVQVAEKNAKK
Subcellular Location(s) mito 17, nucl 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR039355  Transcription_factor_GATA  
IPR000679  Znf_GATA  
IPR013088  Znf_NHR/GATA  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003700  F:DNA-binding transcription factor activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0043565  F:sequence-specific DNA binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF00320  GATA  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00344  GATA_ZN_FINGER_1  
PS50114  GATA_ZN_FINGER_2  
PS50102  RRM  
CDD cd21608  RRM2_NsCP33_like  
cd00202  ZnF_GATA  
Amino Acid Sequences MSAGRPTPTFRHHHHRQTTFSISSKTFRIQYPDGFLNKRPEQIDITLTMAFFYGTGATHRPSGLATTLIDQENRKANDLTLHSTIIATDRETVQNTQHSNNTSAMDTYAYDLYPAGFELGGGLPLGLDASSPMLPQGYAISLFPSAPAAKNETMTAAYNLTPSGNENDNSNSAGWVADGGFFGEELGLAAQTPDLSFSGSPYSLSDDYPIVSPTGSSFMPTGLESFFPTLPCNDDDSNSAFIASADVNVNINVTEQRTFFPQQNAPQAFISDAQFASLAPTDMLPQLTPPVSLFETIEEPQFGDYDMNFGMNLNQLPLAQTGPFAAPAQMNFEMPYSTGVGAEPQIKIEGGRNNSITSADSSCHGHGSSPRRTTARATKQPRELVCFNCHVTKTPLWRRTPDRKHSLCNACGLYLKQYNYMRPLGPRARTHPSPSTAAASTPVDKGNRCVNCACTETSLWRKNERGEAVCNACGLYAKLHGRERPVSMQKKKITRRKRQVQVAEKNAKKVKVEGGEMAKEESGSPAPSASGSESGEGSGAMFEFGSISQLSSQLSSQLSSHLVSMSTKLFIGGLAWATDDVSLRQRFQEFGQIDDAVVIKDRETGRSRGFGFVTFSTADEADAAAKSMDGQELDGRSIRVEADTEEEAVTAVRVEVEDTVVVTPTVVVVDTAVETVRATAVVTVVEATVARRVAATAAAVGQAKSKCPVVMPCHVHVSIIFDFFLSFEFFTPTTLDINVCVLQSV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.74
2 0.75
3 0.75
4 0.75
5 0.75
6 0.7
7 0.64
8 0.59
9 0.52
10 0.48
11 0.46
12 0.43
13 0.4
14 0.38
15 0.42
16 0.41
17 0.43
18 0.46
19 0.5
20 0.51
21 0.5
22 0.52
23 0.54
24 0.53
25 0.54
26 0.48
27 0.44
28 0.42
29 0.41
30 0.39
31 0.32
32 0.31
33 0.26
34 0.25
35 0.21
36 0.17
37 0.14
38 0.1
39 0.09
40 0.07
41 0.06
42 0.09
43 0.12
44 0.13
45 0.15
46 0.15
47 0.15
48 0.15
49 0.17
50 0.16
51 0.15
52 0.14
53 0.15
54 0.19
55 0.21
56 0.23
57 0.22
58 0.25
59 0.32
60 0.33
61 0.33
62 0.3
63 0.29
64 0.34
65 0.37
66 0.37
67 0.31
68 0.3
69 0.27
70 0.26
71 0.25
72 0.21
73 0.18
74 0.13
75 0.13
76 0.15
77 0.18
78 0.2
79 0.22
80 0.23
81 0.29
82 0.31
83 0.32
84 0.35
85 0.35
86 0.35
87 0.36
88 0.33
89 0.27
90 0.25
91 0.22
92 0.18
93 0.15
94 0.15
95 0.13
96 0.11
97 0.11
98 0.1
99 0.1
100 0.09
101 0.09
102 0.07
103 0.06
104 0.06
105 0.07
106 0.07
107 0.07
108 0.07
109 0.06
110 0.05
111 0.05
112 0.06
113 0.03
114 0.03
115 0.03
116 0.06
117 0.06
118 0.06
119 0.07
120 0.07
121 0.07
122 0.07
123 0.08
124 0.07
125 0.08
126 0.08
127 0.09
128 0.1
129 0.1
130 0.1
131 0.11
132 0.11
133 0.12
134 0.14
135 0.18
136 0.18
137 0.2
138 0.2
139 0.19
140 0.19
141 0.19
142 0.18
143 0.14
144 0.14
145 0.13
146 0.13
147 0.12
148 0.1
149 0.11
150 0.13
151 0.15
152 0.15
153 0.16
154 0.19
155 0.2
156 0.21
157 0.19
158 0.16
159 0.13
160 0.12
161 0.1
162 0.08
163 0.07
164 0.06
165 0.06
166 0.06
167 0.06
168 0.06
169 0.06
170 0.05
171 0.04
172 0.04
173 0.04
174 0.03
175 0.03
176 0.04
177 0.04
178 0.04
179 0.04
180 0.05
181 0.05
182 0.06
183 0.06
184 0.07
185 0.1
186 0.1
187 0.11
188 0.1
189 0.15
190 0.15
191 0.15
192 0.16
193 0.13
194 0.14
195 0.14
196 0.14
197 0.09
198 0.08
199 0.08
200 0.07
201 0.1
202 0.09
203 0.09
204 0.09
205 0.09
206 0.1
207 0.1
208 0.1
209 0.08
210 0.09
211 0.09
212 0.11
213 0.11
214 0.11
215 0.12
216 0.11
217 0.13
218 0.14
219 0.17
220 0.16
221 0.16
222 0.18
223 0.2
224 0.21
225 0.19
226 0.17
227 0.13
228 0.12
229 0.13
230 0.1
231 0.09
232 0.07
233 0.07
234 0.08
235 0.08
236 0.08
237 0.06
238 0.07
239 0.07
240 0.08
241 0.09
242 0.09
243 0.1
244 0.15
245 0.17
246 0.19
247 0.24
248 0.27
249 0.3
250 0.39
251 0.39
252 0.37
253 0.35
254 0.32
255 0.27
256 0.24
257 0.21
258 0.13
259 0.12
260 0.1
261 0.09
262 0.09
263 0.1
264 0.08
265 0.07
266 0.06
267 0.06
268 0.07
269 0.08
270 0.08
271 0.06
272 0.06
273 0.08
274 0.08
275 0.08
276 0.08
277 0.09
278 0.1
279 0.1
280 0.1
281 0.1
282 0.12
283 0.12
284 0.13
285 0.1
286 0.1
287 0.09
288 0.09
289 0.08
290 0.06
291 0.05
292 0.07
293 0.07
294 0.06
295 0.06
296 0.06
297 0.06
298 0.07
299 0.07
300 0.06
301 0.06
302 0.06
303 0.07
304 0.08
305 0.08
306 0.06
307 0.06
308 0.07
309 0.07
310 0.07
311 0.07
312 0.07
313 0.07
314 0.07
315 0.11
316 0.11
317 0.11
318 0.11
319 0.11
320 0.1
321 0.1
322 0.11
323 0.07
324 0.07
325 0.07
326 0.06
327 0.06
328 0.08
329 0.09
330 0.08
331 0.07
332 0.08
333 0.07
334 0.08
335 0.11
336 0.14
337 0.15
338 0.17
339 0.18
340 0.18
341 0.18
342 0.18
343 0.15
344 0.13
345 0.11
346 0.09
347 0.1
348 0.11
349 0.11
350 0.11
351 0.1
352 0.09
353 0.14
354 0.21
355 0.27
356 0.27
357 0.3
358 0.3
359 0.32
360 0.35
361 0.4
362 0.44
363 0.46
364 0.52
365 0.55
366 0.6
367 0.64
368 0.61
369 0.57
370 0.49
371 0.44
372 0.4
373 0.36
374 0.31
375 0.29
376 0.28
377 0.24
378 0.24
379 0.24
380 0.3
381 0.36
382 0.42
383 0.42
384 0.47
385 0.54
386 0.61
387 0.67
388 0.67
389 0.68
390 0.64
391 0.66
392 0.69
393 0.68
394 0.58
395 0.53
396 0.44
397 0.35
398 0.33
399 0.29
400 0.24
401 0.21
402 0.21
403 0.22
404 0.23
405 0.25
406 0.27
407 0.29
408 0.25
409 0.23
410 0.3
411 0.3
412 0.33
413 0.35
414 0.36
415 0.41
416 0.42
417 0.46
418 0.43
419 0.41
420 0.38
421 0.36
422 0.34
423 0.27
424 0.25
425 0.22
426 0.18
427 0.16
428 0.15
429 0.16
430 0.15
431 0.15
432 0.18
433 0.23
434 0.23
435 0.24
436 0.24
437 0.24
438 0.25
439 0.28
440 0.26
441 0.2
442 0.2
443 0.22
444 0.3
445 0.34
446 0.34
447 0.36
448 0.37
449 0.38
450 0.43
451 0.43
452 0.37
453 0.33
454 0.36
455 0.35
456 0.33
457 0.3
458 0.23
459 0.19
460 0.16
461 0.13
462 0.1
463 0.12
464 0.14
465 0.18
466 0.22
467 0.24
468 0.28
469 0.3
470 0.33
471 0.36
472 0.43
473 0.48
474 0.51
475 0.58
476 0.6
477 0.67
478 0.73
479 0.75
480 0.77
481 0.78
482 0.83
483 0.85
484 0.88
485 0.88
486 0.89
487 0.89
488 0.88
489 0.87
490 0.86
491 0.77
492 0.75
493 0.69
494 0.61
495 0.51
496 0.44
497 0.4
498 0.34
499 0.34
500 0.32
501 0.32
502 0.31
503 0.31
504 0.29
505 0.23
506 0.18
507 0.16
508 0.13
509 0.1
510 0.09
511 0.09
512 0.08
513 0.08
514 0.08
515 0.09
516 0.09
517 0.1
518 0.1
519 0.1
520 0.1
521 0.1
522 0.1
523 0.09
524 0.08
525 0.05
526 0.05
527 0.04
528 0.04
529 0.04
530 0.04
531 0.04
532 0.05
533 0.05
534 0.06
535 0.06
536 0.07
537 0.08
538 0.08
539 0.08
540 0.1
541 0.1
542 0.11
543 0.11
544 0.12
545 0.13
546 0.12
547 0.13
548 0.1
549 0.11
550 0.1
551 0.12
552 0.12
553 0.11
554 0.1
555 0.1
556 0.09
557 0.08
558 0.08
559 0.07
560 0.07
561 0.06
562 0.07
563 0.06
564 0.07
565 0.07
566 0.07
567 0.08
568 0.14
569 0.16
570 0.17
571 0.2
572 0.21
573 0.21
574 0.22
575 0.3
576 0.23
577 0.24
578 0.27
579 0.24
580 0.23
581 0.22
582 0.21
583 0.12
584 0.13
585 0.11
586 0.08
587 0.13
588 0.14
589 0.19
590 0.23
591 0.28
592 0.3
593 0.36
594 0.37
595 0.36
596 0.36
597 0.31
598 0.31
599 0.27
600 0.26
601 0.21
602 0.2
603 0.17
604 0.16
605 0.15
606 0.11
607 0.11
608 0.09
609 0.08
610 0.08
611 0.06
612 0.06
613 0.07
614 0.07
615 0.08
616 0.07
617 0.09
618 0.12
619 0.13
620 0.15
621 0.16
622 0.15
623 0.14
624 0.15
625 0.14
626 0.11
627 0.11
628 0.1
629 0.13
630 0.14
631 0.15
632 0.14
633 0.13
634 0.13
635 0.12
636 0.11
637 0.06
638 0.06
639 0.05
640 0.05
641 0.06
642 0.06
643 0.07
644 0.07
645 0.08
646 0.08
647 0.08
648 0.08
649 0.07
650 0.07
651 0.06
652 0.06
653 0.05
654 0.04
655 0.04
656 0.05
657 0.05
658 0.06
659 0.06
660 0.06
661 0.06
662 0.06
663 0.07
664 0.06
665 0.06
666 0.06
667 0.07
668 0.06
669 0.07
670 0.07
671 0.06
672 0.07
673 0.07
674 0.07
675 0.1
676 0.1
677 0.1
678 0.1
679 0.1
680 0.11
681 0.11
682 0.11
683 0.09
684 0.09
685 0.12
686 0.12
687 0.12
688 0.17
689 0.17
690 0.19
691 0.2
692 0.22
693 0.2
694 0.22
695 0.3
696 0.31
697 0.4
698 0.44
699 0.45
700 0.5
701 0.49
702 0.46
703 0.38
704 0.38
705 0.3
706 0.26
707 0.22
708 0.16
709 0.16
710 0.15
711 0.16
712 0.12
713 0.1
714 0.1
715 0.13
716 0.13
717 0.14
718 0.16
719 0.16
720 0.15
721 0.16
722 0.15
723 0.13
724 0.16
725 0.17