Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q5K7V2

Protein Details
Accession Q5K7V2    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
256-278FSGKSKSTEAKNKPKKEKVYIEVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
100-106KGPRGSR
287-332RPPRRDREGGERSGERSGERSGRGRGQRGGFGGQRGNNRGGARASR
Subcellular Location(s) cyto_nucl 15, nucl 14, cyto 12
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039764  HABP4/SERBP1  
IPR006861  HABP4_PAIRBP1-bd  
IPR019084  Stm1-like_N  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG cne:CNM01180  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04774  HABP4_PAI-RBP1  
PF09598  Stm1_N  
Amino Acid Sequences MSVVSKNLFDLLGDDESPAPAAPKAAPKKSEATPAQRTVPGAAPRGNANRGRGNNNRGAHTVTRDDRVADNEGTETAGGFDGERVPASKKGNHTRDAHTKGPRGSRPAKTSGGHTSAGNGHYRGAKVPAQAGERRQFERRNANGTTDSQKKVEHGWGANSGEAELKDEVEGEKDAKVEENAPQTPAEAVAAETEAPAAEAEAEQEPEEVTKSYEEYLAERAQQNAAIAALGKKQAREVASEVEGKAFVREAIDDFFSGKSKSTEAKNKPKKEKVYIEVDGQFAQPSRPPRRDREGGERSGERSGERSGRGRGQRGGFGGQRGNNRGGARASRPAPINANDTKAFPALGA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.14
3 0.15
4 0.15
5 0.14
6 0.11
7 0.09
8 0.11
9 0.12
10 0.22
11 0.3
12 0.36
13 0.39
14 0.41
15 0.47
16 0.49
17 0.56
18 0.53
19 0.54
20 0.55
21 0.58
22 0.58
23 0.55
24 0.52
25 0.46
26 0.45
27 0.41
28 0.37
29 0.35
30 0.32
31 0.36
32 0.4
33 0.44
34 0.41
35 0.41
36 0.45
37 0.47
38 0.53
39 0.55
40 0.57
41 0.59
42 0.58
43 0.56
44 0.5
45 0.5
46 0.45
47 0.41
48 0.42
49 0.36
50 0.37
51 0.34
52 0.34
53 0.31
54 0.31
55 0.31
56 0.24
57 0.21
58 0.19
59 0.18
60 0.16
61 0.14
62 0.11
63 0.07
64 0.07
65 0.06
66 0.05
67 0.06
68 0.07
69 0.07
70 0.08
71 0.09
72 0.11
73 0.16
74 0.2
75 0.24
76 0.32
77 0.42
78 0.47
79 0.53
80 0.55
81 0.57
82 0.64
83 0.65
84 0.64
85 0.6
86 0.6
87 0.58
88 0.61
89 0.58
90 0.56
91 0.57
92 0.57
93 0.56
94 0.56
95 0.56
96 0.49
97 0.49
98 0.47
99 0.43
100 0.37
101 0.31
102 0.28
103 0.26
104 0.27
105 0.24
106 0.18
107 0.16
108 0.17
109 0.17
110 0.16
111 0.17
112 0.17
113 0.16
114 0.19
115 0.21
116 0.23
117 0.25
118 0.29
119 0.33
120 0.34
121 0.36
122 0.39
123 0.39
124 0.41
125 0.49
126 0.47
127 0.46
128 0.43
129 0.44
130 0.41
131 0.39
132 0.39
133 0.34
134 0.32
135 0.28
136 0.27
137 0.25
138 0.25
139 0.25
140 0.23
141 0.19
142 0.19
143 0.21
144 0.22
145 0.21
146 0.19
147 0.15
148 0.13
149 0.11
150 0.11
151 0.08
152 0.07
153 0.07
154 0.07
155 0.07
156 0.07
157 0.07
158 0.06
159 0.07
160 0.07
161 0.07
162 0.07
163 0.07
164 0.07
165 0.1
166 0.14
167 0.13
168 0.14
169 0.14
170 0.14
171 0.13
172 0.13
173 0.1
174 0.05
175 0.05
176 0.04
177 0.05
178 0.04
179 0.04
180 0.04
181 0.03
182 0.04
183 0.03
184 0.03
185 0.03
186 0.03
187 0.04
188 0.05
189 0.05
190 0.05
191 0.06
192 0.06
193 0.06
194 0.07
195 0.06
196 0.06
197 0.06
198 0.07
199 0.07
200 0.09
201 0.09
202 0.09
203 0.13
204 0.13
205 0.16
206 0.16
207 0.16
208 0.15
209 0.15
210 0.14
211 0.11
212 0.1
213 0.07
214 0.06
215 0.07
216 0.08
217 0.11
218 0.12
219 0.11
220 0.13
221 0.16
222 0.17
223 0.19
224 0.19
225 0.19
226 0.21
227 0.23
228 0.22
229 0.19
230 0.19
231 0.16
232 0.14
233 0.1
234 0.08
235 0.07
236 0.07
237 0.08
238 0.09
239 0.1
240 0.1
241 0.11
242 0.11
243 0.12
244 0.12
245 0.12
246 0.12
247 0.13
248 0.17
249 0.24
250 0.34
251 0.42
252 0.53
253 0.62
254 0.71
255 0.79
256 0.84
257 0.84
258 0.84
259 0.83
260 0.78
261 0.76
262 0.69
263 0.65
264 0.58
265 0.52
266 0.43
267 0.34
268 0.29
269 0.2
270 0.18
271 0.17
272 0.23
273 0.31
274 0.39
275 0.44
276 0.51
277 0.6
278 0.66
279 0.69
280 0.71
281 0.7
282 0.67
283 0.68
284 0.62
285 0.56
286 0.51
287 0.46
288 0.35
289 0.3
290 0.3
291 0.29
292 0.3
293 0.32
294 0.34
295 0.42
296 0.48
297 0.51
298 0.52
299 0.51
300 0.51
301 0.5
302 0.51
303 0.45
304 0.42
305 0.43
306 0.41
307 0.44
308 0.44
309 0.44
310 0.43
311 0.4
312 0.4
313 0.38
314 0.39
315 0.37
316 0.41
317 0.4
318 0.41
319 0.43
320 0.44
321 0.45
322 0.43
323 0.45
324 0.4
325 0.44
326 0.39
327 0.38
328 0.36
329 0.31