Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

P0CL96

Protein Details
Accession P0CL96    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
48-71SEGSSVMKTKKKKKAQTPGIVFISHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
57-61KKKKK
215-220KRKAKK
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 10, mito 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039119  ABT1/Esf2  
IPR034353  ABT1/ESF2_RRM  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000480  P:endonucleolytic cleavage in 5'-ETS of tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000447  P:endonucleolytic cleavage in ITS1 to separate SSU-rRNA from 5.8S rRNA and LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000472  P:endonucleolytic cleavage to generate mature 5'-end of SSU-rRNA from (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0034462  P:small-subunit processome assembly  
CDD cd12263  RRM_ABT1_like  
Amino Acid Sequences MTTPSKSSNKRFRDNESEVDETGSQIEKQVNATASTSTSRPALSSHESEGSSVMKTKKKKKAQTPGIVFISRVPPGMTPQKIRHLMGRWGDIGKVYAQRRDAPGGYNPNSANQKKQKHASANFTEAWVEFLDKSVAKTVASMLNAQVIGGKKGDRWRDDIWTMRYLSGFKWEMLGEQIAYERQAHQARLRTEITRAKTEQNEYLKNVELARTLEKRKAKKAAAGGPSESAPNQDAHSRSYKQRNVVEKPKTLEGQGMDGVLNNIFG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.76
2 0.73
3 0.69
4 0.64
5 0.54
6 0.51
7 0.42
8 0.32
9 0.28
10 0.22
11 0.15
12 0.15
13 0.16
14 0.14
15 0.16
16 0.2
17 0.2
18 0.19
19 0.2
20 0.18
21 0.18
22 0.2
23 0.18
24 0.15
25 0.15
26 0.14
27 0.14
28 0.14
29 0.18
30 0.21
31 0.23
32 0.25
33 0.27
34 0.27
35 0.27
36 0.27
37 0.23
38 0.18
39 0.2
40 0.23
41 0.25
42 0.34
43 0.44
44 0.53
45 0.61
46 0.7
47 0.76
48 0.82
49 0.86
50 0.89
51 0.86
52 0.83
53 0.78
54 0.68
55 0.58
56 0.49
57 0.42
58 0.31
59 0.25
60 0.18
61 0.13
62 0.18
63 0.26
64 0.27
65 0.29
66 0.32
67 0.41
68 0.44
69 0.44
70 0.45
71 0.41
72 0.44
73 0.42
74 0.41
75 0.34
76 0.31
77 0.3
78 0.24
79 0.21
80 0.16
81 0.19
82 0.18
83 0.2
84 0.21
85 0.24
86 0.26
87 0.28
88 0.26
89 0.22
90 0.26
91 0.31
92 0.31
93 0.32
94 0.3
95 0.31
96 0.38
97 0.36
98 0.39
99 0.4
100 0.44
101 0.45
102 0.51
103 0.52
104 0.54
105 0.58
106 0.58
107 0.53
108 0.52
109 0.46
110 0.41
111 0.35
112 0.26
113 0.22
114 0.14
115 0.11
116 0.06
117 0.07
118 0.08
119 0.07
120 0.08
121 0.09
122 0.09
123 0.08
124 0.08
125 0.09
126 0.1
127 0.11
128 0.11
129 0.09
130 0.1
131 0.1
132 0.1
133 0.11
134 0.09
135 0.09
136 0.09
137 0.09
138 0.1
139 0.16
140 0.22
141 0.21
142 0.26
143 0.27
144 0.32
145 0.35
146 0.38
147 0.36
148 0.34
149 0.33
150 0.29
151 0.27
152 0.23
153 0.2
154 0.21
155 0.18
156 0.15
157 0.16
158 0.15
159 0.15
160 0.15
161 0.15
162 0.09
163 0.08
164 0.09
165 0.07
166 0.08
167 0.09
168 0.08
169 0.14
170 0.17
171 0.19
172 0.23
173 0.29
174 0.3
175 0.34
176 0.36
177 0.31
178 0.34
179 0.39
180 0.38
181 0.38
182 0.38
183 0.39
184 0.41
185 0.44
186 0.45
187 0.45
188 0.45
189 0.42
190 0.42
191 0.38
192 0.35
193 0.32
194 0.25
195 0.21
196 0.19
197 0.23
198 0.26
199 0.28
200 0.34
201 0.41
202 0.46
203 0.52
204 0.59
205 0.56
206 0.57
207 0.62
208 0.63
209 0.62
210 0.6
211 0.53
212 0.46
213 0.43
214 0.38
215 0.29
216 0.23
217 0.17
218 0.15
219 0.15
220 0.19
221 0.19
222 0.22
223 0.29
224 0.32
225 0.39
226 0.48
227 0.52
228 0.55
229 0.62
230 0.67
231 0.7
232 0.75
233 0.75
234 0.71
235 0.71
236 0.69
237 0.63
238 0.54
239 0.5
240 0.41
241 0.37
242 0.31
243 0.27
244 0.2
245 0.19
246 0.19