Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0E9NGX3

Protein Details
Accession A0A0E9NGX3    Localization Confidence High Confidence Score 17
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
100-121RTEVRGKKKRASCKVTFDKRLEBasic
200-219APPSSQKKGKGKPKQPESATHydrophilic
423-445PAPAPAPKKRGRPKKATVPTTTPHydrophilic
471-496DTPPPAPMPKKRGRPKKVAPTPTTVAHydrophilic
516-542QESAEPAKPAPKKRAGRKKSPAAPITIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
206-225KKGKGKPKQPESATTKKRGK
427-437PAPKKRGRPKK
478-487MPKKRGRPKK
522-536AKPAPKKRAGRKKSP
Subcellular Location(s) mito 19.5, cyto_mito 13, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017956  AT_hook_DNA-bd_motif  
IPR000305  GIY-YIG_endonuc  
IPR035901  GIY-YIG_endonuc_sf  
IPR027520  Slx1  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0033557  C:Slx1-Slx4 complex  
GO:0017108  F:5'-flap endonuclease activity  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006281  P:DNA repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF01541  GIY-YIG  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50164  GIY_YIG  
PS51257  PROKAR_LIPOPROTEIN  
CDD cd10455  GIY-YIG_SLX1  
Amino Acid Sequences MPTGKNSVSPQAFYACYLLRSIPWKGKHYVGSTPFPLRRLRQHNGEATQGAARTKHGRPWEMTCIVYGFPTSLAALQFEWAWQNPHLTRQLPSSFKETLRTEVRGKKKRASCKVTFDKRLECAHAMLATGWTRWPLKVKVFNEATWRTWNKIMEKAHDRLPAWVTCELDLRREPSEGPPDVANAMETDSALEEIGFGDDAPPSSQKKGKGKPKQPESATTKKRGKPGLYTPDNNGGVRGLDITNSLFSTPQITKAEQLLTTSAPMACGICKVYMSEPGVPSFADPNVAVCPGDGCTHIAHLHCLSSHFFAQTPAEERDELLPTHGTCPSCKQDIRWGDVIRGVNARRRADEVRQKKGLKVGDAEYAEWMMNEVAEEEDLSEMSSSSEGESEEGVVDLAIFENVCESVTGTGQGLAPENPEVAPAPAPAPKKRGRPKKATVPTTTPATEPAAQESIINGEEAICDITHMDEDTPPPAPMPKKRGRPKKVAPTPTTVAASGPTSAPSEEAGPSEVVVQESAEPAKPAPKKRAGRKKSPAAPITIDDSEDERNGHSAGDVIVL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.31
2 0.23
3 0.21
4 0.21
5 0.2
6 0.19
7 0.24
8 0.29
9 0.33
10 0.39
11 0.43
12 0.45
13 0.5
14 0.54
15 0.53
16 0.56
17 0.54
18 0.54
19 0.53
20 0.59
21 0.55
22 0.52
23 0.55
24 0.51
25 0.55
26 0.58
27 0.6
28 0.6
29 0.66
30 0.71
31 0.67
32 0.66
33 0.56
34 0.49
35 0.44
36 0.37
37 0.3
38 0.22
39 0.23
40 0.25
41 0.28
42 0.32
43 0.37
44 0.41
45 0.43
46 0.5
47 0.54
48 0.51
49 0.49
50 0.43
51 0.37
52 0.32
53 0.28
54 0.21
55 0.13
56 0.1
57 0.1
58 0.09
59 0.09
60 0.1
61 0.1
62 0.1
63 0.1
64 0.1
65 0.1
66 0.12
67 0.11
68 0.14
69 0.14
70 0.21
71 0.21
72 0.27
73 0.31
74 0.31
75 0.32
76 0.36
77 0.42
78 0.39
79 0.41
80 0.4
81 0.39
82 0.39
83 0.44
84 0.39
85 0.39
86 0.4
87 0.42
88 0.44
89 0.49
90 0.59
91 0.61
92 0.64
93 0.67
94 0.7
95 0.76
96 0.79
97 0.79
98 0.76
99 0.77
100 0.82
101 0.83
102 0.83
103 0.77
104 0.72
105 0.68
106 0.64
107 0.58
108 0.48
109 0.39
110 0.33
111 0.28
112 0.23
113 0.19
114 0.18
115 0.14
116 0.13
117 0.12
118 0.13
119 0.14
120 0.15
121 0.2
122 0.22
123 0.29
124 0.38
125 0.39
126 0.45
127 0.47
128 0.48
129 0.5
130 0.49
131 0.44
132 0.43
133 0.44
134 0.38
135 0.39
136 0.41
137 0.37
138 0.41
139 0.41
140 0.41
141 0.45
142 0.45
143 0.47
144 0.48
145 0.45
146 0.41
147 0.41
148 0.35
149 0.31
150 0.31
151 0.26
152 0.21
153 0.26
154 0.23
155 0.23
156 0.24
157 0.23
158 0.22
159 0.22
160 0.23
161 0.22
162 0.29
163 0.26
164 0.25
165 0.23
166 0.22
167 0.22
168 0.2
169 0.15
170 0.08
171 0.08
172 0.07
173 0.06
174 0.06
175 0.06
176 0.06
177 0.05
178 0.05
179 0.04
180 0.04
181 0.04
182 0.04
183 0.04
184 0.04
185 0.04
186 0.05
187 0.06
188 0.08
189 0.1
190 0.14
191 0.17
192 0.24
193 0.33
194 0.42
195 0.52
196 0.6
197 0.67
198 0.74
199 0.79
200 0.81
201 0.74
202 0.74
203 0.72
204 0.72
205 0.69
206 0.68
207 0.68
208 0.63
209 0.67
210 0.64
211 0.59
212 0.55
213 0.58
214 0.59
215 0.57
216 0.55
217 0.51
218 0.53
219 0.52
220 0.45
221 0.35
222 0.25
223 0.19
224 0.17
225 0.15
226 0.07
227 0.06
228 0.06
229 0.07
230 0.07
231 0.07
232 0.07
233 0.06
234 0.06
235 0.1
236 0.09
237 0.14
238 0.16
239 0.16
240 0.17
241 0.19
242 0.2
243 0.16
244 0.17
245 0.13
246 0.11
247 0.11
248 0.1
249 0.08
250 0.07
251 0.07
252 0.06
253 0.05
254 0.06
255 0.06
256 0.06
257 0.06
258 0.06
259 0.07
260 0.11
261 0.13
262 0.15
263 0.15
264 0.15
265 0.16
266 0.15
267 0.14
268 0.11
269 0.09
270 0.07
271 0.07
272 0.07
273 0.07
274 0.08
275 0.07
276 0.06
277 0.06
278 0.06
279 0.07
280 0.07
281 0.07
282 0.07
283 0.08
284 0.1
285 0.1
286 0.1
287 0.1
288 0.1
289 0.09
290 0.1
291 0.1
292 0.11
293 0.12
294 0.11
295 0.11
296 0.11
297 0.12
298 0.12
299 0.14
300 0.14
301 0.15
302 0.14
303 0.15
304 0.16
305 0.16
306 0.15
307 0.12
308 0.12
309 0.11
310 0.13
311 0.15
312 0.14
313 0.13
314 0.18
315 0.2
316 0.24
317 0.24
318 0.24
319 0.3
320 0.34
321 0.38
322 0.39
323 0.36
324 0.32
325 0.36
326 0.35
327 0.28
328 0.28
329 0.24
330 0.23
331 0.29
332 0.29
333 0.26
334 0.3
335 0.32
336 0.37
337 0.46
338 0.49
339 0.5
340 0.57
341 0.57
342 0.54
343 0.57
344 0.5
345 0.42
346 0.38
347 0.32
348 0.3
349 0.29
350 0.28
351 0.22
352 0.2
353 0.17
354 0.14
355 0.12
356 0.06
357 0.05
358 0.05
359 0.05
360 0.04
361 0.04
362 0.04
363 0.04
364 0.04
365 0.04
366 0.05
367 0.04
368 0.04
369 0.05
370 0.05
371 0.05
372 0.05
373 0.06
374 0.06
375 0.06
376 0.06
377 0.06
378 0.06
379 0.06
380 0.05
381 0.04
382 0.04
383 0.04
384 0.04
385 0.03
386 0.03
387 0.03
388 0.04
389 0.04
390 0.04
391 0.04
392 0.05
393 0.05
394 0.06
395 0.07
396 0.07
397 0.08
398 0.08
399 0.09
400 0.1
401 0.09
402 0.1
403 0.1
404 0.1
405 0.09
406 0.09
407 0.09
408 0.09
409 0.09
410 0.09
411 0.1
412 0.14
413 0.19
414 0.21
415 0.28
416 0.34
417 0.43
418 0.53
419 0.63
420 0.67
421 0.73
422 0.79
423 0.83
424 0.87
425 0.84
426 0.81
427 0.76
428 0.71
429 0.66
430 0.58
431 0.47
432 0.39
433 0.36
434 0.32
435 0.26
436 0.26
437 0.22
438 0.2
439 0.2
440 0.18
441 0.16
442 0.13
443 0.12
444 0.08
445 0.07
446 0.07
447 0.08
448 0.08
449 0.06
450 0.05
451 0.06
452 0.06
453 0.07
454 0.08
455 0.08
456 0.09
457 0.1
458 0.12
459 0.14
460 0.13
461 0.13
462 0.19
463 0.24
464 0.31
465 0.4
466 0.47
467 0.56
468 0.67
469 0.77
470 0.8
471 0.84
472 0.87
473 0.88
474 0.9
475 0.89
476 0.83
477 0.8
478 0.75
479 0.69
480 0.6
481 0.49
482 0.39
483 0.3
484 0.27
485 0.2
486 0.17
487 0.14
488 0.13
489 0.13
490 0.13
491 0.12
492 0.13
493 0.13
494 0.13
495 0.14
496 0.12
497 0.12
498 0.13
499 0.13
500 0.12
501 0.11
502 0.1
503 0.09
504 0.11
505 0.13
506 0.13
507 0.13
508 0.13
509 0.21
510 0.28
511 0.35
512 0.42
513 0.5
514 0.59
515 0.7
516 0.8
517 0.81
518 0.85
519 0.88
520 0.9
521 0.89
522 0.89
523 0.82
524 0.77
525 0.72
526 0.63
527 0.6
528 0.5
529 0.41
530 0.32
531 0.3
532 0.27
533 0.24
534 0.22
535 0.17
536 0.18
537 0.17
538 0.16
539 0.13
540 0.12