Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q5KL47

Protein Details
Accession Q5KL47    Localization Confidence High Confidence Score 24.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
138-163SEAAKAKETKKTKKSKLGKYVPAEESHydrophilic
518-543SDADRQARRLAKKKAKMSLEKDKAKGHydrophilic
550-582TKSEREKTSASKKPKAKKGKKRAPSAVAKMKGSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
143-153AKETKKTKKSK
481-584DKTKKAYVRPGVIPKGDPALGDKLKNLSKEERKTIKSSDADRQARRLAKKKAKMSLEKDKAKGAVKLTLTKSEREKTSASKKPKAKKGKKRAPSAVAKMKGSRE
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0019843  F:rRNA binding  
GO:0000463  P:maturation of LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
KEGG cne:CNC00790  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MAKHSAHKGKAPVTDKNNKRKRDAQDSSQGDAPVALFAAVKDTELDDIFAKSNAFSAPAPVASTSKAHLQTTSAPAAKKGKKSPSPEMEEDVRVDDQDESESSEEDEDGEDNEAELSEIDEELPDDDDEDVSDAESDSEAAKAKETKKTKKSKLGKYVPAEESVQDKNRRTAFIGNLPIDAAKSKSTLKQLRAHIMSFVPSAKIESLRFRSVAFATPTAALPTEDPEKDANQRAKREKERAAAWKAKQNADGEDAELDKAKVFIDAKGKRKVAFIKKDFHSEIDSCNAYVVFAYPHPDRAANVAPILDPFEAAAKFIASANSSTFSGRTIRVDSVRLPSSVGLAGASTSLSKRDAWLPSNTDPKKSLFVGGLDYAAKEEDVRVFFEELVKAERGANKEGSGKWVTGVRIVRDKETQLGKGFGYVHFADRESVEEILAMDAKQIKFAKRTLRVQPCKTIPTANTLQNTIKKIAAGSGGASKDKTKKAYVRPGVIPKGDPALGDKLKNLSKEERKTIKSSDADRQARRLAKKKAKMSLEKDKAKGAVKLTLTKSEREKTSASKKPKAKKGKKRAPSAVAKMKGSRE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.68
2 0.72
3 0.76
4 0.79
5 0.77
6 0.79
7 0.79
8 0.79
9 0.8
10 0.78
11 0.76
12 0.78
13 0.76
14 0.72
15 0.67
16 0.58
17 0.46
18 0.38
19 0.3
20 0.2
21 0.14
22 0.11
23 0.07
24 0.06
25 0.1
26 0.09
27 0.09
28 0.1
29 0.1
30 0.12
31 0.12
32 0.14
33 0.11
34 0.13
35 0.14
36 0.14
37 0.13
38 0.11
39 0.13
40 0.12
41 0.13
42 0.11
43 0.14
44 0.15
45 0.15
46 0.16
47 0.16
48 0.17
49 0.16
50 0.17
51 0.16
52 0.22
53 0.24
54 0.24
55 0.23
56 0.25
57 0.29
58 0.33
59 0.38
60 0.34
61 0.31
62 0.35
63 0.44
64 0.48
65 0.51
66 0.54
67 0.57
68 0.62
69 0.69
70 0.75
71 0.75
72 0.76
73 0.71
74 0.68
75 0.62
76 0.56
77 0.49
78 0.42
79 0.33
80 0.25
81 0.22
82 0.17
83 0.14
84 0.13
85 0.13
86 0.12
87 0.12
88 0.13
89 0.12
90 0.12
91 0.11
92 0.1
93 0.1
94 0.08
95 0.08
96 0.09
97 0.08
98 0.08
99 0.08
100 0.08
101 0.07
102 0.06
103 0.06
104 0.05
105 0.05
106 0.05
107 0.05
108 0.05
109 0.06
110 0.07
111 0.07
112 0.07
113 0.07
114 0.07
115 0.07
116 0.08
117 0.07
118 0.06
119 0.06
120 0.06
121 0.06
122 0.06
123 0.06
124 0.05
125 0.06
126 0.08
127 0.08
128 0.1
129 0.16
130 0.2
131 0.28
132 0.37
133 0.46
134 0.54
135 0.65
136 0.72
137 0.77
138 0.83
139 0.85
140 0.87
141 0.87
142 0.86
143 0.81
144 0.8
145 0.71
146 0.64
147 0.54
148 0.44
149 0.39
150 0.34
151 0.35
152 0.33
153 0.34
154 0.37
155 0.39
156 0.39
157 0.38
158 0.39
159 0.36
160 0.37
161 0.42
162 0.36
163 0.34
164 0.32
165 0.3
166 0.24
167 0.2
168 0.14
169 0.09
170 0.1
171 0.12
172 0.16
173 0.25
174 0.31
175 0.36
176 0.42
177 0.46
178 0.52
179 0.53
180 0.49
181 0.42
182 0.36
183 0.32
184 0.25
185 0.21
186 0.14
187 0.11
188 0.12
189 0.11
190 0.13
191 0.13
192 0.18
193 0.22
194 0.24
195 0.24
196 0.23
197 0.25
198 0.23
199 0.27
200 0.22
201 0.18
202 0.17
203 0.18
204 0.18
205 0.15
206 0.15
207 0.1
208 0.08
209 0.1
210 0.13
211 0.12
212 0.13
213 0.14
214 0.16
215 0.19
216 0.26
217 0.31
218 0.32
219 0.4
220 0.46
221 0.54
222 0.6
223 0.63
224 0.63
225 0.6
226 0.61
227 0.62
228 0.62
229 0.61
230 0.56
231 0.54
232 0.52
233 0.49
234 0.46
235 0.39
236 0.33
237 0.29
238 0.26
239 0.21
240 0.18
241 0.16
242 0.12
243 0.11
244 0.1
245 0.06
246 0.06
247 0.06
248 0.07
249 0.07
250 0.1
251 0.19
252 0.25
253 0.32
254 0.38
255 0.4
256 0.39
257 0.42
258 0.47
259 0.47
260 0.51
261 0.5
262 0.51
263 0.51
264 0.56
265 0.53
266 0.46
267 0.4
268 0.3
269 0.27
270 0.23
271 0.21
272 0.15
273 0.15
274 0.13
275 0.09
276 0.09
277 0.07
278 0.05
279 0.05
280 0.09
281 0.09
282 0.1
283 0.11
284 0.11
285 0.11
286 0.14
287 0.16
288 0.13
289 0.13
290 0.12
291 0.11
292 0.11
293 0.12
294 0.09
295 0.06
296 0.06
297 0.07
298 0.07
299 0.07
300 0.07
301 0.05
302 0.06
303 0.06
304 0.07
305 0.06
306 0.06
307 0.07
308 0.08
309 0.09
310 0.09
311 0.08
312 0.09
313 0.1
314 0.11
315 0.12
316 0.13
317 0.15
318 0.16
319 0.18
320 0.18
321 0.21
322 0.22
323 0.2
324 0.18
325 0.16
326 0.16
327 0.14
328 0.12
329 0.07
330 0.05
331 0.05
332 0.05
333 0.05
334 0.04
335 0.04
336 0.05
337 0.07
338 0.07
339 0.08
340 0.13
341 0.17
342 0.19
343 0.23
344 0.27
345 0.31
346 0.41
347 0.4
348 0.38
349 0.36
350 0.35
351 0.34
352 0.3
353 0.27
354 0.18
355 0.18
356 0.18
357 0.17
358 0.16
359 0.13
360 0.12
361 0.1
362 0.09
363 0.08
364 0.06
365 0.06
366 0.08
367 0.09
368 0.1
369 0.12
370 0.12
371 0.12
372 0.14
373 0.14
374 0.12
375 0.14
376 0.13
377 0.12
378 0.14
379 0.17
380 0.18
381 0.21
382 0.21
383 0.2
384 0.23
385 0.23
386 0.26
387 0.24
388 0.21
389 0.19
390 0.22
391 0.2
392 0.22
393 0.24
394 0.22
395 0.28
396 0.29
397 0.31
398 0.3
399 0.31
400 0.31
401 0.32
402 0.33
403 0.27
404 0.28
405 0.25
406 0.25
407 0.26
408 0.19
409 0.21
410 0.18
411 0.18
412 0.17
413 0.18
414 0.16
415 0.15
416 0.17
417 0.14
418 0.13
419 0.11
420 0.1
421 0.1
422 0.1
423 0.1
424 0.07
425 0.07
426 0.12
427 0.12
428 0.18
429 0.2
430 0.23
431 0.26
432 0.3
433 0.38
434 0.42
435 0.49
436 0.54
437 0.63
438 0.69
439 0.71
440 0.75
441 0.7
442 0.66
443 0.61
444 0.56
445 0.45
446 0.44
447 0.44
448 0.41
449 0.38
450 0.37
451 0.41
452 0.4
453 0.43
454 0.37
455 0.32
456 0.27
457 0.26
458 0.24
459 0.21
460 0.16
461 0.14
462 0.17
463 0.18
464 0.18
465 0.19
466 0.22
467 0.27
468 0.32
469 0.35
470 0.37
471 0.44
472 0.52
473 0.63
474 0.66
475 0.66
476 0.69
477 0.73
478 0.72
479 0.66
480 0.57
481 0.48
482 0.44
483 0.38
484 0.3
485 0.25
486 0.27
487 0.28
488 0.28
489 0.28
490 0.3
491 0.33
492 0.36
493 0.37
494 0.38
495 0.45
496 0.52
497 0.6
498 0.63
499 0.64
500 0.66
501 0.66
502 0.65
503 0.62
504 0.6
505 0.59
506 0.61
507 0.64
508 0.63
509 0.64
510 0.63
511 0.64
512 0.67
513 0.67
514 0.68
515 0.7
516 0.76
517 0.79
518 0.8
519 0.82
520 0.83
521 0.82
522 0.83
523 0.83
524 0.81
525 0.75
526 0.71
527 0.66
528 0.6
529 0.56
530 0.48
531 0.45
532 0.41
533 0.47
534 0.45
535 0.5
536 0.48
537 0.49
538 0.53
539 0.53
540 0.53
541 0.49
542 0.5
543 0.49
544 0.58
545 0.62
546 0.64
547 0.66
548 0.71
549 0.77
550 0.84
551 0.86
552 0.87
553 0.89
554 0.91
555 0.92
556 0.93
557 0.93
558 0.93
559 0.91
560 0.9
561 0.89
562 0.88
563 0.84
564 0.79