Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q5KCS1

Protein Details
Accession Q5KCS1    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
238-261GVRGNKSINKLKKRAKALGQDAKKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
4-22KGKKPAAAPFGTKKAGKKV
237-254GGVRGNKSINKLKKRAKA
Subcellular Location(s) cyto 10, nucl 9.5, mito_nucl 9, mito 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR029064  L30e-like  
IPR001921  Ribosomal_L7A/L8  
IPR004038  Ribosomal_L7Ae/L30e/S12e/Gad45  
IPR018492  Ribosomal_L7Ae/L8/Nhp2  
IPR004037  Ribosomal_L7Ae_CS  
Gene Ontology GO:0022625  C:cytosolic large ribosomal subunit  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006364  P:rRNA processing  
KEGG cne:CNH02040  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01248  Ribosomal_L7Ae  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS01082  RIBOSOMAL_L7AE  
Amino Acid Sequences MAPKGKKPAAAPFGTKKAGKKVQNPLFEKRSKTFGIGGDLPPKRDLTRFVKWPEYVRLQRQKVILNQRLKVPPAIAQFSNTLDKNTATQLFQLLNKYKPESTQEKKARLLAEAEKREKEGDKATTADTKKPIFAKYGLNHVVALVEAKKAQLVVIADDVDPIELVVFLPALCRKMGVPYVIVKGKARLGLVTGKKTAATVAITEVRSEDQQALATLVSAAKANFLEKYEDHRRHWGGGVRGNKSINKLKKRAKALGQDAKKIDLSL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.59
2 0.59
3 0.53
4 0.55
5 0.59
6 0.61
7 0.62
8 0.66
9 0.7
10 0.76
11 0.77
12 0.75
13 0.75
14 0.73
15 0.7
16 0.62
17 0.59
18 0.51
19 0.49
20 0.44
21 0.38
22 0.39
23 0.37
24 0.37
25 0.4
26 0.4
27 0.39
28 0.36
29 0.35
30 0.3
31 0.29
32 0.33
33 0.31
34 0.38
35 0.44
36 0.47
37 0.52
38 0.53
39 0.55
40 0.55
41 0.57
42 0.55
43 0.58
44 0.63
45 0.59
46 0.61
47 0.6
48 0.59
49 0.57
50 0.61
51 0.59
52 0.56
53 0.55
54 0.57
55 0.57
56 0.53
57 0.47
58 0.37
59 0.34
60 0.31
61 0.33
62 0.26
63 0.24
64 0.24
65 0.25
66 0.29
67 0.24
68 0.2
69 0.18
70 0.18
71 0.17
72 0.19
73 0.18
74 0.14
75 0.14
76 0.15
77 0.15
78 0.17
79 0.21
80 0.21
81 0.22
82 0.24
83 0.26
84 0.25
85 0.25
86 0.3
87 0.33
88 0.35
89 0.42
90 0.47
91 0.49
92 0.51
93 0.53
94 0.48
95 0.4
96 0.39
97 0.35
98 0.37
99 0.39
100 0.4
101 0.37
102 0.36
103 0.37
104 0.34
105 0.29
106 0.24
107 0.2
108 0.18
109 0.19
110 0.2
111 0.25
112 0.25
113 0.26
114 0.25
115 0.23
116 0.24
117 0.25
118 0.25
119 0.2
120 0.21
121 0.25
122 0.23
123 0.29
124 0.29
125 0.27
126 0.26
127 0.24
128 0.21
129 0.15
130 0.14
131 0.07
132 0.05
133 0.05
134 0.05
135 0.05
136 0.05
137 0.05
138 0.06
139 0.06
140 0.07
141 0.07
142 0.08
143 0.08
144 0.08
145 0.08
146 0.06
147 0.06
148 0.04
149 0.03
150 0.03
151 0.03
152 0.03
153 0.03
154 0.03
155 0.05
156 0.06
157 0.07
158 0.07
159 0.07
160 0.07
161 0.11
162 0.13
163 0.13
164 0.14
165 0.15
166 0.2
167 0.22
168 0.23
169 0.21
170 0.21
171 0.22
172 0.22
173 0.2
174 0.15
175 0.15
176 0.22
177 0.26
178 0.27
179 0.26
180 0.25
181 0.24
182 0.24
183 0.22
184 0.16
185 0.12
186 0.09
187 0.12
188 0.16
189 0.16
190 0.16
191 0.17
192 0.16
193 0.16
194 0.17
195 0.14
196 0.1
197 0.11
198 0.11
199 0.11
200 0.09
201 0.09
202 0.08
203 0.07
204 0.07
205 0.07
206 0.07
207 0.08
208 0.08
209 0.09
210 0.1
211 0.12
212 0.15
213 0.15
214 0.24
215 0.33
216 0.39
217 0.42
218 0.49
219 0.5
220 0.49
221 0.54
222 0.52
223 0.48
224 0.49
225 0.53
226 0.48
227 0.5
228 0.51
229 0.48
230 0.48
231 0.51
232 0.54
233 0.56
234 0.62
235 0.68
236 0.73
237 0.79
238 0.81
239 0.8
240 0.81
241 0.82
242 0.82
243 0.79
244 0.78
245 0.72
246 0.66