Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0B2UCZ4

Protein Details
Accession A0A0B2UCZ4    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
144-173NSKHKLHEFEPKNKNKKRIGRKYNLDILNEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
155-164KNKNKKRIGR
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 13, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034261  CNOT4_RRM  
IPR039780  Mot2  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR003954  RRM_dom_euk  
IPR000571  Znf_CCCH  
Gene Ontology GO:0030014  C:CCR4-NOT complex  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0004842  F:ubiquitin-protein transferase activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
PS50103  ZF_C3H1  
CDD cd12438  RRM_CNOT4  
Amino Acid Sequences MISKDTQAQAPDTSPSFSSIRVVQKNLVYIICIPQKYAYEDVLCRNEFFGQFGIIKKIVVNKRASSLESTASAYITYSTSEEARICIQEVDESLLDGKVLKCTYGTTKYCTFYLKNSICQNGECMYLHENKPQKDLLTKDEMCNSKHKLHEFEPKNKNKKRIGRKYNLDILNELFKHKTSRVFKAPDKILFEPLDFTN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.23
3 0.21
4 0.19
5 0.21
6 0.23
7 0.31
8 0.33
9 0.35
10 0.36
11 0.37
12 0.39
13 0.39
14 0.32
15 0.25
16 0.21
17 0.25
18 0.27
19 0.24
20 0.22
21 0.23
22 0.25
23 0.27
24 0.28
25 0.24
26 0.22
27 0.24
28 0.29
29 0.32
30 0.3
31 0.27
32 0.26
33 0.26
34 0.22
35 0.22
36 0.17
37 0.13
38 0.14
39 0.15
40 0.18
41 0.15
42 0.15
43 0.15
44 0.22
45 0.25
46 0.29
47 0.32
48 0.29
49 0.34
50 0.35
51 0.36
52 0.3
53 0.27
54 0.23
55 0.21
56 0.21
57 0.16
58 0.15
59 0.13
60 0.1
61 0.09
62 0.08
63 0.07
64 0.06
65 0.07
66 0.07
67 0.08
68 0.08
69 0.09
70 0.09
71 0.09
72 0.09
73 0.08
74 0.08
75 0.08
76 0.08
77 0.09
78 0.08
79 0.07
80 0.07
81 0.07
82 0.06
83 0.07
84 0.07
85 0.07
86 0.07
87 0.07
88 0.07
89 0.08
90 0.12
91 0.19
92 0.2
93 0.22
94 0.25
95 0.27
96 0.28
97 0.29
98 0.26
99 0.22
100 0.3
101 0.28
102 0.31
103 0.32
104 0.34
105 0.32
106 0.32
107 0.31
108 0.22
109 0.22
110 0.17
111 0.15
112 0.15
113 0.19
114 0.2
115 0.24
116 0.29
117 0.28
118 0.3
119 0.3
120 0.29
121 0.29
122 0.3
123 0.29
124 0.33
125 0.33
126 0.33
127 0.38
128 0.39
129 0.36
130 0.39
131 0.39
132 0.36
133 0.39
134 0.41
135 0.4
136 0.43
137 0.52
138 0.53
139 0.59
140 0.64
141 0.69
142 0.76
143 0.77
144 0.8
145 0.79
146 0.82
147 0.83
148 0.84
149 0.85
150 0.85
151 0.87
152 0.86
153 0.86
154 0.8
155 0.71
156 0.62
157 0.53
158 0.51
159 0.42
160 0.36
161 0.28
162 0.25
163 0.28
164 0.28
165 0.36
166 0.34
167 0.42
168 0.49
169 0.56
170 0.61
171 0.66
172 0.7
173 0.67
174 0.68
175 0.61
176 0.58
177 0.52
178 0.47