FuNGI

A0A0B2UJZ8

Protein Details

Accession

A0A0B2UJZ8

Localization Confidence

Low

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
113-137	VLLSDKKKVYFKKKIRESNERSSLV	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 12, cyto_nucl 10.333, cyto 6.5, cyto_mito 6.166, mito 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR045867 DNA-dir_RpoC_beta_prime IPR000722 RNA_pol_asu IPR006592 RNA_pol_N IPR007080 RNA_pol_Rpb1_1 IPR007066 RNA_pol_Rpb1_3 IPR042102 RNA_pol_Rpb1_3_sf IPR007083 RNA_pol_Rpb1_4 IPR007081 RNA_pol_Rpb1_5 IPR044893 RNA_pol_Rpb1_clamp_domain IPR035698 RNAP_III_Rpc1_C IPR035697 RNAP_III_RPC1_N IPR038120 Rpb1_funnel_sf
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0003899 F:DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity GO:0006351 P:DNA-templated transcription
Pfam	View protein in Pfam PF04997 RNA_pol_Rpb1_1 PF00623 RNA_pol_Rpb1_2 PF04983 RNA_pol_Rpb1_3 PF05000 RNA_pol_Rpb1_4 PF04998 RNA_pol_Rpb1_5
CDD	cd02736 RNAP_III_Rpc1_C cd02583 RNAP_III_RPC1_N

Amino Acid Sequences

MLRKAEEENLDARIRRISFGILSPEEIERLSVHSISSKDLYDIHTRRPLADGPLDLRLGVGNKKDKCNTCGEGLAACIGHFGEVKLTLPVFNIGLIKQTISMLNCICKSCGEVLLSDKKKVYFKKKIRESNERSSLVLVLRRVIAECKKCNTCPICLARNGQVKKTFGFKIVHEVDETGRRKKKEGVPECNTEEINPLTALNLFGMLKPDDYEFFGLSESPERFIVQSVIVPPCCIRPSVSMEDEGTNEDDITIKISEIVHTNKILSDGIQKGNSLNLINDDWDQLQLQCALLVNSELPQIGIPGQPIRGLVQRLKGKNGRFRCNLSGKRVDFSGRTVISPDPNLGIEEVGIPVRMAKIMTIPEKVTEFNKKRLQELVMNGPENYPGANYVVGEKFKRFLLYGKRDTTLKNGEIVERHLMDDDIVLFNRQPSLHRMSIMSHRVKVHKDRTLRFNECVCTPYNADFDGDEMNVHVPQTEKARAEASVLMSICNNIVTPRHGEPIIAATQDFITGMYLITGKDTFFDRERFGQVVSYFCEARVCVRPAIKKPVELFTGKQLIEVLIRDSLLMNEKWNKKGRVVDAVSIIGKNRGFKSFEDPNDGSVVILDNTYYFGRLDKSIVGGENKKDSLIYAMMKISNESAVRMMNGMTRLCSRYLGEVGFSIGLDDVQPGPNLRSKKNMVVNKGYEEYESKIQEYQRKAGSNNEVLEMEVSSILSHIREECGSICIKELSVRNAPNIMQACGSKGSKINVSQMVACVGQQIVSGTRIPNGMDGRCLPHFKKGVNTPESKGFVLNSFFDGLTSPEFFFHAVSGREGLVDTAVKTAETGYMQRRLMKALEDLSVQYDGTVRTSGMEVVQFVYGEDQIDPVMAESDEVINFERMFLHVKSQFRKFLESGGVPRMLNAFLSEEEIFSRLKQCIPREYAHNNFLNKKFLDGMYKCVIAKAHETFIFGTESLHILLCVEFMEILVLEVSKKIVHMIVEPGTTVGAIAGQSIGEPGTQMTLKTFHFAGVASMNITLGVPRLKEIINAVCNICTPIINAELSSPQDLFRAEVIKGSIGRIFLRDICSSVTEVIGKDEMALDVCIDIDSISRLKLNLDINKIERCLGIQESTKIIDGNVIRIGIKKITDQSYFGMQKIKKRILNTKVCGVSQASRVVINNNRGMYSLVIEGGGLQEIMNTDGVKGENTTCNSVSEVEAVLGIEAARAQIIHEIEYTIGNHGIKIDPRHIMLLADTMTYRGEVFGITRFGISKMSGSTLMLASFEQTSDYLFEAAIHSRSDMVSGVSESIILGIPISIGTGSMDLYWKEKKY

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.3
2	0.28
3	0.27
4	0.26
5	0.24
6	0.27
7	0.33
8	0.28
9	0.29
10	0.29
11	0.29
12	0.26
13	0.23
14	0.2
15	0.14
16	0.16
17	0.16
18	0.15
19	0.15
20	0.18
21	0.19
22	0.22
23	0.24
24	0.22
25	0.2
26	0.22
27	0.26
28	0.32
29	0.34
30	0.37
31	0.43
32	0.43
33	0.43
34	0.44
35	0.43
36	0.39
37	0.4
38	0.37
39	0.32
40	0.36
41	0.35
42	0.3
43	0.27
44	0.23
45	0.22
46	0.22
47	0.26
48	0.31
49	0.36
50	0.44
51	0.52
52	0.56
53	0.57
54	0.6
55	0.57
56	0.52
57	0.5
58	0.44
59	0.36
60	0.31
61	0.29
62	0.21
63	0.17
64	0.14
65	0.1
66	0.1
67	0.1
68	0.09
69	0.09
70	0.1
71	0.11
72	0.13
73	0.14
74	0.13
75	0.14
76	0.15
77	0.13
78	0.14
79	0.14
80	0.12
81	0.15
82	0.15
83	0.15
84	0.14
85	0.15
86	0.17
87	0.16
88	0.2
89	0.19
90	0.24
91	0.26
92	0.27
93	0.26
94	0.24
95	0.25
96	0.24
97	0.26
98	0.21
99	0.2
100	0.26
101	0.35
102	0.38
103	0.39
104	0.39
105	0.39
106	0.45
107	0.53
108	0.57
109	0.57
110	0.65
111	0.72
112	0.8
113	0.86
114	0.88
115	0.89
116	0.87
117	0.87
118	0.87
119	0.77
120	0.68
121	0.59
122	0.52
123	0.45
124	0.4
125	0.3
126	0.23
127	0.22
128	0.22
129	0.22
130	0.25
131	0.3
132	0.34
133	0.39
134	0.44
135	0.5
136	0.5
137	0.59
138	0.56
139	0.52
140	0.53
141	0.55
142	0.53
143	0.52
144	0.55
145	0.54
146	0.6
147	0.58
148	0.56
149	0.55
150	0.51
151	0.48
152	0.5
153	0.44
154	0.4
155	0.4
156	0.34
157	0.37
158	0.38
159	0.38
160	0.32
161	0.31
162	0.29
163	0.35
164	0.38
165	0.38
166	0.41
167	0.41
168	0.44
169	0.52
170	0.57
171	0.59
172	0.65
173	0.67
174	0.67
175	0.72
176	0.73
177	0.67
178	0.59
179	0.48
180	0.41
181	0.32
182	0.27
183	0.19
184	0.16
185	0.13
186	0.13
187	0.13
188	0.09
189	0.1
190	0.09
191	0.09
192	0.12
193	0.12
194	0.12
195	0.13
196	0.14
197	0.13
198	0.15
199	0.16
200	0.14
201	0.13
202	0.13
203	0.13
204	0.13
205	0.17
206	0.15
207	0.15
208	0.15
209	0.16
210	0.16
211	0.17
212	0.17
213	0.12
214	0.14
215	0.17
216	0.21
217	0.2
218	0.21
219	0.2
220	0.22
221	0.22
222	0.21
223	0.19
224	0.18
225	0.26
226	0.31
227	0.33
228	0.31
229	0.32
230	0.32
231	0.31
232	0.28
233	0.22
234	0.16
235	0.14
236	0.11
237	0.11
238	0.09
239	0.11
240	0.09
241	0.08
242	0.09
243	0.1
244	0.11
245	0.15
246	0.18
247	0.19
248	0.19
249	0.2
250	0.18
251	0.2
252	0.19
253	0.15
254	0.18
255	0.2
256	0.23
257	0.24
258	0.23
259	0.22
260	0.23
261	0.24
262	0.18
263	0.14
264	0.13
265	0.13
266	0.14
267	0.15
268	0.15
269	0.13
270	0.13
271	0.13
272	0.11
273	0.11
274	0.1
275	0.1
276	0.09
277	0.09
278	0.08
279	0.08
280	0.08
281	0.07
282	0.07
283	0.08
284	0.07
285	0.07
286	0.07
287	0.07
288	0.08
289	0.08
290	0.09
291	0.1
292	0.11
293	0.11
294	0.12
295	0.13
296	0.16
297	0.19
298	0.2
299	0.27
300	0.35
301	0.36
302	0.44
303	0.48
304	0.51
305	0.57
306	0.62
307	0.63
308	0.6
309	0.63
310	0.64
311	0.68
312	0.67
313	0.66
314	0.67
315	0.59
316	0.56
317	0.52
318	0.46
319	0.37
320	0.34
321	0.33
322	0.25
323	0.23
324	0.24
325	0.24
326	0.24
327	0.24
328	0.22
329	0.15
330	0.15
331	0.15
332	0.13
333	0.11
334	0.08
335	0.08
336	0.08
337	0.07
338	0.06
339	0.05
340	0.06
341	0.06
342	0.06
343	0.06
344	0.05
345	0.08
346	0.12
347	0.15
348	0.17
349	0.17
350	0.18
351	0.2
352	0.21
353	0.22
354	0.29
355	0.3
356	0.37
357	0.44
358	0.43
359	0.44
360	0.47
361	0.47
362	0.42
363	0.42
364	0.43
365	0.41
366	0.4
367	0.38
368	0.34
369	0.31
370	0.25
371	0.2
372	0.11
373	0.07
374	0.07
375	0.07
376	0.07
377	0.1
378	0.13
379	0.15
380	0.16
381	0.16
382	0.17
383	0.17
384	0.18
385	0.16
386	0.19
387	0.28
388	0.36
389	0.42
390	0.44
391	0.45
392	0.45
393	0.46
394	0.46
395	0.42
396	0.33
397	0.3
398	0.28
399	0.28
400	0.28
401	0.29
402	0.26
403	0.2
404	0.2
405	0.16
406	0.15
407	0.13
408	0.12
409	0.11
410	0.08
411	0.08
412	0.08
413	0.08
414	0.08
415	0.1
416	0.1
417	0.11
418	0.14
419	0.21
420	0.22
421	0.23
422	0.23
423	0.24
424	0.31
425	0.38
426	0.36
427	0.33
428	0.35
429	0.38
430	0.43
431	0.48
432	0.48
433	0.47
434	0.52
435	0.54
436	0.59
437	0.64
438	0.63
439	0.58
440	0.54
441	0.49
442	0.42
443	0.39
444	0.32
445	0.25
446	0.23
447	0.22
448	0.19
449	0.18
450	0.17
451	0.15
452	0.14
453	0.13
454	0.11
455	0.08
456	0.07
457	0.08
458	0.07
459	0.07
460	0.07
461	0.06
462	0.08
463	0.13
464	0.16
465	0.16
466	0.17
467	0.18
468	0.18
469	0.19
470	0.19
471	0.16
472	0.15
473	0.14
474	0.14
475	0.13
476	0.13
477	0.11
478	0.09
479	0.08
480	0.05
481	0.06
482	0.08
483	0.12
484	0.13
485	0.16
486	0.15
487	0.15
488	0.15
489	0.17
490	0.17
491	0.13
492	0.11
493	0.09
494	0.09
495	0.09
496	0.09
497	0.05
498	0.04
499	0.04
500	0.04
501	0.04
502	0.05
503	0.05
504	0.06
505	0.06
506	0.05
507	0.06
508	0.08
509	0.1
510	0.12
511	0.15
512	0.16
513	0.18
514	0.21
515	0.2
516	0.19
517	0.19
518	0.17
519	0.17
520	0.17
521	0.16
522	0.14
523	0.13
524	0.14
525	0.11
526	0.14
527	0.18
528	0.18
529	0.19
530	0.23
531	0.28
532	0.32
533	0.42
534	0.4
535	0.38
536	0.38
537	0.39
538	0.38
539	0.34
540	0.31
541	0.26
542	0.31
543	0.26
544	0.25
545	0.21
546	0.18
547	0.17
548	0.17
549	0.12
550	0.07
551	0.07
552	0.07
553	0.07
554	0.07
555	0.09
556	0.09
557	0.11
558	0.18
559	0.21
560	0.27
561	0.33
562	0.34
563	0.34
564	0.39
565	0.39
566	0.41
567	0.4
568	0.36
569	0.31
570	0.3
571	0.28
572	0.23
573	0.2
574	0.14
575	0.13
576	0.14
577	0.14
578	0.15
579	0.17
580	0.17
581	0.24
582	0.28
583	0.29
584	0.35
585	0.33
586	0.31
587	0.31
588	0.3
589	0.22
590	0.15
591	0.14
592	0.06
593	0.06
594	0.05
595	0.04
596	0.05
597	0.05
598	0.06
599	0.05
600	0.06
601	0.07
602	0.08
603	0.09
604	0.08
605	0.09
606	0.09
607	0.11
608	0.13
609	0.14
610	0.15
611	0.16
612	0.16
613	0.15
614	0.14
615	0.13
616	0.12
617	0.11
618	0.11
619	0.09
620	0.1
621	0.11
622	0.11
623	0.11
624	0.1
625	0.1
626	0.09
627	0.08
628	0.08
629	0.07
630	0.07
631	0.07
632	0.07
633	0.07
634	0.09
635	0.08
636	0.09
637	0.1
638	0.11
639	0.11
640	0.12
641	0.11
642	0.11
643	0.12
644	0.11
645	0.1
646	0.09
647	0.09
648	0.08
649	0.07
650	0.06
651	0.04
652	0.04
653	0.04
654	0.04
655	0.04
656	0.05
657	0.05
658	0.05
659	0.07
660	0.11
661	0.14
662	0.14
663	0.19
664	0.21
665	0.28
666	0.35
667	0.39
668	0.39
669	0.43
670	0.44
671	0.41
672	0.4
673	0.34
674	0.26
675	0.23
676	0.21
677	0.19
678	0.18
679	0.16
680	0.16
681	0.19
682	0.24
683	0.25
684	0.27
685	0.27
686	0.29
687	0.29
688	0.31
689	0.34
690	0.32
691	0.3
692	0.27
693	0.23
694	0.21
695	0.2
696	0.15
697	0.1
698	0.06
699	0.05
700	0.04
701	0.04
702	0.04
703	0.04
704	0.04
705	0.04
706	0.05
707	0.05
708	0.06
709	0.07
710	0.09
711	0.09
712	0.09
713	0.09
714	0.09
715	0.09
716	0.12
717	0.13
718	0.15
719	0.2
720	0.21
721	0.21
722	0.22
723	0.22
724	0.23
725	0.23
726	0.19
727	0.15
728	0.14
729	0.15
730	0.16
731	0.16
732	0.13
733	0.14
734	0.15
735	0.17
736	0.18
737	0.21
738	0.2
739	0.21
740	0.2
741	0.18
742	0.18
743	0.15
744	0.14
745	0.1
746	0.07
747	0.06
748	0.06
749	0.06
750	0.06
751	0.07
752	0.08
753	0.07
754	0.09
755	0.09
756	0.09
757	0.12
758	0.14
759	0.13
760	0.13
761	0.14
762	0.16
763	0.18
764	0.22
765	0.19
766	0.23
767	0.26
768	0.25
769	0.3
770	0.34
771	0.41
772	0.43
773	0.45
774	0.41
775	0.44
776	0.45
777	0.39
778	0.33
779	0.25
780	0.21
781	0.2
782	0.18
783	0.13
784	0.12
785	0.12
786	0.11
787	0.11
788	0.1
789	0.1
790	0.1
791	0.09
792	0.08
793	0.09
794	0.09
795	0.09
796	0.08
797	0.1
798	0.09
799	0.09
800	0.1
801	0.1
802	0.09
803	0.09
804	0.09
805	0.07
806	0.07
807	0.06
808	0.06
809	0.06
810	0.06
811	0.06
812	0.06
813	0.07
814	0.07
815	0.1
816	0.13
817	0.18
818	0.2
819	0.23
820	0.23
821	0.24
822	0.24
823	0.22
824	0.21
825	0.17
826	0.17
827	0.15
828	0.15
829	0.14
830	0.14
831	0.12
832	0.1
833	0.09
834	0.08
835	0.08
836	0.09
837	0.07
838	0.07
839	0.08
840	0.08
841	0.08
842	0.08
843	0.07
844	0.08
845	0.08
846	0.07
847	0.07
848	0.07
849	0.07
850	0.07
851	0.07
852	0.06
853	0.05
854	0.06
855	0.05
856	0.05
857	0.05
858	0.04
859	0.04
860	0.05
861	0.06
862	0.06
863	0.06
864	0.07
865	0.08
866	0.08
867	0.08
868	0.08
869	0.08
870	0.11
871	0.11
872	0.16
873	0.2
874	0.25
875	0.3
876	0.34
877	0.4
878	0.37
879	0.42
880	0.36
881	0.35
882	0.35
883	0.32
884	0.31
885	0.28
886	0.29
887	0.24
888	0.24
889	0.22
890	0.17
891	0.15
892	0.12
893	0.1
894	0.08
895	0.11
896	0.11
897	0.1
898	0.1
899	0.11
900	0.11
901	0.1
902	0.13
903	0.11
904	0.14
905	0.2
906	0.23
907	0.3
908	0.34
909	0.36
910	0.41
911	0.47
912	0.49
913	0.5
914	0.51
915	0.47
916	0.5
917	0.5
918	0.48
919	0.41
920	0.37
921	0.32
922	0.28
923	0.33
924	0.27
925	0.31
926	0.28
927	0.3
928	0.28
929	0.27
930	0.27
931	0.19
932	0.24
933	0.2
934	0.21
935	0.2
936	0.22
937	0.21
938	0.21
939	0.21
940	0.16
941	0.14
942	0.1
943	0.11
944	0.1
945	0.09
946	0.08
947	0.07
948	0.07
949	0.06
950	0.06
951	0.05
952	0.04
953	0.04
954	0.05
955	0.04
956	0.04
957	0.04
958	0.04
959	0.04
960	0.04
961	0.05
962	0.05
963	0.05
964	0.06
965	0.07
966	0.08
967	0.09
968	0.13
969	0.15
970	0.15
971	0.15
972	0.14
973	0.12
974	0.11
975	0.1
976	0.06
977	0.04
978	0.04
979	0.04
980	0.04
981	0.04
982	0.04
983	0.04
984	0.05
985	0.04
986	0.04
987	0.04
988	0.06
989	0.07
990	0.07
991	0.08
992	0.11
993	0.12
994	0.14
995	0.14
996	0.12
997	0.12
998	0.12
999	0.12
1000	0.11
1001	0.11
1002	0.09
1003	0.09
1004	0.08
1005	0.08
1006	0.08
1007	0.06
1008	0.07
1009	0.08
1010	0.08
1011	0.08
1012	0.11
1013	0.11
1014	0.12
1015	0.15
1016	0.2
1017	0.21
1018	0.23
1019	0.23
1020	0.21
1021	0.21
1022	0.21
1023	0.18
1024	0.12
1025	0.1
1026	0.1
1027	0.12
1028	0.12
1029	0.11
1030	0.11
1031	0.13
1032	0.15
1033	0.15
1034	0.14
1035	0.12
1036	0.13
1037	0.13
1038	0.14
1039	0.13
1040	0.14
1041	0.13
1042	0.14
1043	0.15
1044	0.16
1045	0.16
1046	0.16
1047	0.16
1048	0.15
1049	0.15
1050	0.15
1051	0.16
1052	0.16
1053	0.2
1054	0.19
1055	0.19
1056	0.19
1057	0.2
1058	0.2
1059	0.18
1060	0.16
1061	0.14
1062	0.13
1063	0.14
1064	0.13
1065	0.11
1066	0.1
1067	0.1
1068	0.09
1069	0.09
1070	0.09
1071	0.07
1072	0.06
1073	0.06
1074	0.06
1075	0.05
1076	0.05
1077	0.05
1078	0.07
1079	0.07
1080	0.08
1081	0.09
1082	0.09
1083	0.1
1084	0.15
1085	0.22
1086	0.26
1087	0.3
1088	0.34
1089	0.37
1090	0.4
1091	0.4
1092	0.36
1093	0.29
1094	0.24
1095	0.23
1096	0.21
1097	0.21
1098	0.21
1099	0.22
1100	0.23
1101	0.24
1102	0.24
1103	0.21
1104	0.18
1105	0.2
1106	0.17
1107	0.18
1108	0.17
1109	0.17
1110	0.16
1111	0.18
1112	0.21
1113	0.18
1114	0.19
1115	0.19
1116	0.24
1117	0.28
1118	0.3
1119	0.29
1120	0.3
1121	0.37
1122	0.37
1123	0.35
1124	0.37
1125	0.35
1126	0.41
1127	0.48
1128	0.54
1129	0.49
1130	0.54
1131	0.63
1132	0.65
1133	0.72
1134	0.69
1135	0.69
1136	0.64
1137	0.6
1138	0.55
1139	0.49
1140	0.43
1141	0.36
1142	0.35
1143	0.28
1144	0.26
1145	0.27
1146	0.31
1147	0.34
1148	0.36
1149	0.37
1150	0.34
1151	0.33
1152	0.32
1153	0.33
1154	0.27
1155	0.22
1156	0.17
1157	0.12
1158	0.11
1159	0.1
1160	0.1
1161	0.09
1162	0.08
1163	0.06
1164	0.05
1165	0.05
1166	0.06
1167	0.07
1168	0.08
1169	0.08
1170	0.07
1171	0.1
1172	0.1
1173	0.1
1174	0.11
1175	0.14
1176	0.19
1177	0.22
1178	0.26
1179	0.24
1180	0.25
1181	0.26
1182	0.25
1183	0.23
1184	0.19
1185	0.16
1186	0.12
1187	0.12
1188	0.11
1189	0.09
1190	0.08
1191	0.07
1192	0.05
1193	0.05
1194	0.05
1195	0.04
1196	0.04
1197	0.05
1198	0.09
1199	0.1
1200	0.11
1201	0.12
1202	0.12
1203	0.13
1204	0.15
1205	0.15
1206	0.13
1207	0.15
1208	0.14
1209	0.14
1210	0.15
1211	0.18
1212	0.21
1213	0.24
1214	0.27
1215	0.27
1216	0.29
1217	0.3
1218	0.29
1219	0.26
1220	0.22
1221	0.21
1222	0.17
1223	0.15
1224	0.14
1225	0.13
1226	0.12
1227	0.12
1228	0.12
1229	0.08
1230	0.08
1231	0.07
1232	0.09
1233	0.11
1234	0.13
1235	0.13
1236	0.14
1237	0.15
1238	0.16
1239	0.17
1240	0.16
1241	0.15
1242	0.15
1243	0.17
1244	0.17
1245	0.16
1246	0.18
1247	0.17
1248	0.16
1249	0.14
1250	0.13
1251	0.12
1252	0.11
1253	0.11
1254	0.1
1255	0.09
1256	0.1
1257	0.11
1258	0.12
1259	0.1
1260	0.1
1261	0.11
1262	0.12
1263	0.15
1264	0.15
1265	0.14
1266	0.14
1267	0.14
1268	0.14
1269	0.15
1270	0.13
1271	0.12
1272	0.12
1273	0.12
1274	0.13
1275	0.11
1276	0.11
1277	0.1
1278	0.1
1279	0.09
1280	0.07
1281	0.06
1282	0.05
1283	0.05
1284	0.05
1285	0.06
1286	0.04
1287	0.04
1288	0.05
1289	0.06
1290	0.06
1291	0.07
1292	0.1
1293	0.1
1294	0.15

A0A0B2UJZ8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer