Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q5KHS1

Protein Details
Accession Q5KHS1    Localization Confidence High Confidence Score 23.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
15-40ADSTEVQDKNKRHRKDKPWDTDDIDHHydrophilic
305-333APTTSSTETKEKKKKKVYTPFPPPQQPSKHydrophilic
344-372FLKPKEKEAIDKRKKMEKQKEVAQERRAVBasic
379-402APPEKRDETVEERRKKRRKAEEFMBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
317-319KKK
347-371PKEKEAIDKRKKMEKQKEVAQERRA
389-398EERRKKRRKA
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR041174  KH_8  
IPR004087  KH_dom  
IPR036612  KH_dom_type_1_sf  
IPR024166  rRNA_assembly_KRR1  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0030688  C:preribosome, small subunit precursor  
GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000447  P:endonucleolytic cleavage in ITS1 to separate SSU-rRNA from 5.8S rRNA and LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
KEGG cne:CND05510  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF17903  KH_8  
CDD cd22393  KH-I_KRR1_rpt1  
cd22394  KH-I_KRR1_rpt2  
Amino Acid Sequences MSAKNQKRKATDIPADSTEVQDKNKRHRKDKPWDTDDIDHWAMEEFKAPNPETHKPFLEESSFALLFPKYREPYLRSVWSSITSALEAYGLACELDLVQGKMTVKTTRKTWDPYIIFKGRDLLKLLARGVNAPQAIKILEDGIACDIIKIGGIVRNKERFVKRRQRIVGPNGSTLKAIELLTECYVLVQGNTVSVMGSYKGLKEVRRIILDCMNNIHPIYRIKELMIRRELAKDPKLANENWDRFLPKFQKKHLKTSEKTAKKNAALEREAASASSANANHIPLGTSSASIPAPAPVPVPASIPAPTTSSTETKEKKKKKVYTPFPPPQQPSKLDLQLASGEYFLKPKEKEAIDKRKKMEKQKEVAQERRAVREEAFVAPPEKRDETVEERRKKRRKAEEFM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.61
2 0.61
3 0.54
4 0.47
5 0.43
6 0.37
7 0.36
8 0.38
9 0.41
10 0.48
11 0.57
12 0.63
13 0.67
14 0.75
15 0.8
16 0.85
17 0.89
18 0.89
19 0.85
20 0.83
21 0.8
22 0.75
23 0.66
24 0.62
25 0.52
26 0.41
27 0.35
28 0.29
29 0.23
30 0.18
31 0.21
32 0.14
33 0.17
34 0.23
35 0.24
36 0.27
37 0.34
38 0.42
39 0.42
40 0.46
41 0.46
42 0.43
43 0.45
44 0.44
45 0.4
46 0.33
47 0.3
48 0.31
49 0.28
50 0.24
51 0.23
52 0.2
53 0.19
54 0.21
55 0.26
56 0.22
57 0.25
58 0.31
59 0.33
60 0.4
61 0.45
62 0.49
63 0.44
64 0.44
65 0.42
66 0.39
67 0.36
68 0.3
69 0.24
70 0.17
71 0.15
72 0.13
73 0.11
74 0.08
75 0.07
76 0.06
77 0.05
78 0.04
79 0.04
80 0.04
81 0.04
82 0.06
83 0.07
84 0.07
85 0.07
86 0.1
87 0.11
88 0.13
89 0.15
90 0.2
91 0.23
92 0.26
93 0.3
94 0.33
95 0.37
96 0.42
97 0.44
98 0.48
99 0.47
100 0.49
101 0.54
102 0.53
103 0.48
104 0.43
105 0.44
106 0.36
107 0.35
108 0.33
109 0.27
110 0.25
111 0.28
112 0.29
113 0.25
114 0.22
115 0.21
116 0.19
117 0.2
118 0.18
119 0.15
120 0.14
121 0.13
122 0.13
123 0.12
124 0.11
125 0.07
126 0.08
127 0.08
128 0.08
129 0.07
130 0.08
131 0.08
132 0.07
133 0.06
134 0.05
135 0.05
136 0.04
137 0.04
138 0.08
139 0.1
140 0.13
141 0.19
142 0.22
143 0.24
144 0.31
145 0.38
146 0.41
147 0.5
148 0.58
149 0.6
150 0.66
151 0.69
152 0.71
153 0.71
154 0.72
155 0.7
156 0.62
157 0.6
158 0.52
159 0.48
160 0.39
161 0.31
162 0.24
163 0.17
164 0.14
165 0.1
166 0.08
167 0.09
168 0.1
169 0.1
170 0.09
171 0.07
172 0.07
173 0.06
174 0.06
175 0.05
176 0.04
177 0.04
178 0.04
179 0.04
180 0.04
181 0.04
182 0.04
183 0.04
184 0.05
185 0.05
186 0.05
187 0.09
188 0.12
189 0.13
190 0.16
191 0.22
192 0.24
193 0.27
194 0.28
195 0.26
196 0.31
197 0.3
198 0.27
199 0.24
200 0.21
201 0.19
202 0.19
203 0.17
204 0.13
205 0.14
206 0.17
207 0.16
208 0.16
209 0.15
210 0.21
211 0.23
212 0.27
213 0.28
214 0.26
215 0.25
216 0.29
217 0.32
218 0.32
219 0.32
220 0.3
221 0.28
222 0.32
223 0.34
224 0.3
225 0.32
226 0.36
227 0.35
228 0.32
229 0.33
230 0.3
231 0.28
232 0.35
233 0.39
234 0.38
235 0.41
236 0.48
237 0.57
238 0.59
239 0.69
240 0.71
241 0.72
242 0.66
243 0.71
244 0.74
245 0.71
246 0.72
247 0.69
248 0.65
249 0.58
250 0.63
251 0.57
252 0.54
253 0.47
254 0.44
255 0.39
256 0.33
257 0.3
258 0.23
259 0.19
260 0.12
261 0.11
262 0.12
263 0.1
264 0.11
265 0.12
266 0.12
267 0.12
268 0.11
269 0.12
270 0.08
271 0.12
272 0.1
273 0.1
274 0.1
275 0.12
276 0.12
277 0.11
278 0.11
279 0.09
280 0.09
281 0.09
282 0.1
283 0.09
284 0.11
285 0.11
286 0.12
287 0.12
288 0.13
289 0.13
290 0.14
291 0.15
292 0.14
293 0.15
294 0.16
295 0.18
296 0.19
297 0.22
298 0.29
299 0.34
300 0.43
301 0.53
302 0.59
303 0.66
304 0.74
305 0.8
306 0.83
307 0.88
308 0.88
309 0.88
310 0.9
311 0.89
312 0.88
313 0.87
314 0.81
315 0.79
316 0.75
317 0.68
318 0.62
319 0.6
320 0.55
321 0.48
322 0.43
323 0.37
324 0.33
325 0.31
326 0.26
327 0.19
328 0.16
329 0.14
330 0.16
331 0.15
332 0.19
333 0.18
334 0.21
335 0.28
336 0.31
337 0.4
338 0.49
339 0.59
340 0.63
341 0.71
342 0.74
343 0.76
344 0.81
345 0.82
346 0.82
347 0.81
348 0.79
349 0.8
350 0.85
351 0.84
352 0.85
353 0.8
354 0.78
355 0.71
356 0.7
357 0.64
358 0.56
359 0.47
360 0.45
361 0.41
362 0.36
363 0.35
364 0.3
365 0.29
366 0.29
367 0.31
368 0.31
369 0.31
370 0.28
371 0.28
372 0.33
373 0.39
374 0.49
375 0.56
376 0.6
377 0.67
378 0.77
379 0.83
380 0.86
381 0.87
382 0.88