Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q5KDI4

Protein Details
Accession Q5KDI4    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
246-267GDASVHKQRTWRQYMNRRGGFNHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 13.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013957  SNRNP27  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
KEGG cne:CNG03870  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08648  SNRNP27  
Amino Acid Sequences MSSRGFDRDARYSRDEPSGGRARSQSPTRDRMRDDRGGGYKKDYRDRDYKERDRDLPYSSRERERGTDDRRRERDYEGHSSRYDKPREKAYDRDREKEKERDNPNSDPNYRPRREDGFERSRGQSAYPPRGGRGGAYSRGGGRDYAERSPAYGWPGGDKGGRERDYQSMDRRTIEEGRRRREEERAMGVVYNEDGRVYDPREEEREREQHSEEPDADDPEAQMAAMMGFGGFNSTKKKGIGQNVEGDASVHKQRTWRQYMNRRGGFNRPLDKVKD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.53
2 0.48
3 0.4
4 0.43
5 0.46
6 0.4
7 0.42
8 0.41
9 0.39
10 0.45
11 0.5
12 0.5
13 0.49
14 0.57
15 0.61
16 0.65
17 0.66
18 0.67
19 0.69
20 0.67
21 0.63
22 0.62
23 0.63
24 0.61
25 0.57
26 0.56
27 0.53
28 0.52
29 0.58
30 0.55
31 0.53
32 0.57
33 0.63
34 0.67
35 0.72
36 0.75
37 0.75
38 0.77
39 0.76
40 0.72
41 0.67
42 0.61
43 0.57
44 0.53
45 0.53
46 0.5
47 0.52
48 0.49
49 0.49
50 0.47
51 0.48
52 0.52
53 0.52
54 0.57
55 0.59
56 0.66
57 0.68
58 0.7
59 0.65
60 0.6
61 0.6
62 0.57
63 0.58
64 0.52
65 0.5
66 0.46
67 0.49
68 0.51
69 0.52
70 0.53
71 0.49
72 0.48
73 0.54
74 0.61
75 0.61
76 0.63
77 0.64
78 0.67
79 0.65
80 0.69
81 0.65
82 0.64
83 0.66
84 0.65
85 0.61
86 0.59
87 0.61
88 0.63
89 0.63
90 0.62
91 0.63
92 0.6
93 0.57
94 0.52
95 0.55
96 0.55
97 0.51
98 0.49
99 0.47
100 0.45
101 0.46
102 0.48
103 0.48
104 0.46
105 0.5
106 0.5
107 0.47
108 0.43
109 0.4
110 0.34
111 0.3
112 0.29
113 0.3
114 0.31
115 0.3
116 0.29
117 0.3
118 0.29
119 0.24
120 0.23
121 0.19
122 0.16
123 0.17
124 0.17
125 0.16
126 0.17
127 0.17
128 0.12
129 0.1
130 0.12
131 0.14
132 0.15
133 0.16
134 0.15
135 0.16
136 0.17
137 0.17
138 0.15
139 0.14
140 0.13
141 0.12
142 0.13
143 0.13
144 0.13
145 0.13
146 0.15
147 0.21
148 0.23
149 0.23
150 0.24
151 0.27
152 0.32
153 0.35
154 0.38
155 0.36
156 0.36
157 0.36
158 0.35
159 0.34
160 0.36
161 0.38
162 0.41
163 0.43
164 0.49
165 0.54
166 0.56
167 0.55
168 0.55
169 0.55
170 0.51
171 0.49
172 0.44
173 0.38
174 0.35
175 0.33
176 0.26
177 0.2
178 0.14
179 0.09
180 0.07
181 0.06
182 0.07
183 0.1
184 0.12
185 0.15
186 0.16
187 0.2
188 0.26
189 0.28
190 0.3
191 0.35
192 0.39
193 0.4
194 0.42
195 0.42
196 0.4
197 0.41
198 0.42
199 0.35
200 0.33
201 0.3
202 0.28
203 0.25
204 0.21
205 0.18
206 0.14
207 0.13
208 0.09
209 0.07
210 0.05
211 0.04
212 0.04
213 0.04
214 0.03
215 0.03
216 0.03
217 0.05
218 0.06
219 0.08
220 0.13
221 0.16
222 0.19
223 0.2
224 0.26
225 0.31
226 0.41
227 0.48
228 0.47
229 0.52
230 0.52
231 0.52
232 0.45
233 0.39
234 0.31
235 0.26
236 0.26
237 0.2
238 0.2
239 0.25
240 0.33
241 0.43
242 0.51
243 0.56
244 0.62
245 0.71
246 0.8
247 0.85
248 0.83
249 0.79
250 0.74
251 0.74
252 0.71
253 0.69
254 0.66
255 0.61