FuNGI

P0CQ80

Protein Details

Accession

P0CQ80

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
431-450	APPAQQQPQQRQRQHPPVPS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
589-606	RGNGRGQGHRGRGRGRGG

Subcellular Location(s)

nucl 20, cyto 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR011545 DEAD/DEAH_box_helicase_dom IPR014001 Helicase_ATP-bd IPR001650 Helicase_C IPR027417 P-loop_NTPase IPR000629 RNA-helicase_DEAD-box_CS IPR014014 RNA_helicase_DEAD_Q_motif
Gene Ontology	GO:0010494 C:cytoplasmic stress granule GO:0000932 C:P-body GO:0005524 F:ATP binding GO:0016887 F:ATP hydrolysis activity GO:0003729 F:mRNA binding GO:0003724 F:RNA helicase activity GO:0006397 P:mRNA processing GO:0051028 P:mRNA transport GO:0017148 P:negative regulation of translation GO:0033962 P:P-body assembly GO:0034063 P:stress granule assembly
KEGG	cne:CNC06460 -
Pfam	View protein in Pfam PF00270 DEAD PF00271 Helicase_C
PROSITE	View protein in PROSITE PS00039 DEAD_ATP_HELICASE PS51192 HELICASE_ATP_BIND_1 PS51194 HELICASE_CTER PS51195 Q_MOTIF
CDD	cd17940 DEADc_DDX6 cd18787 SF2_C_DEAD

Amino Acid Sequences

MASSSTLLNDDWKQGLAAPPKDLRPQTEDVTATQGSRFEDFGLRRELLMGIYTAGFERPSPIQEQAIPMALTGRDILARAKNGTGKTASFIIPTLNRINTSLSHIQALILVPTRELALQTSQVCKTLGAHIPNLQVMITTGGTTLRDDILRLQQPVHILVGTPGRILDLGSKGIASLNKCGVFVMDEADKLLSEDFMPVIEQTLALCPQERQVMLFSATFPWTVKEFKDQHMVQPYEINLMDELTLKGVTQYYAYVEESQKVHCLNTLFSKLQINQSIIFCNSTNRVELLAKKVTELGYSCFYSHAKMQQAHRNRVFHDFRNGMTRNLVCSDLLTRGIDIQAVNVVINFDFPRTAESYLHRIGRSGRFGHLGLAISLLTLEDRHNLYRIESELGTEIAPIPAVIDPVLYVAPAMVEEERESPPPKPAAIAAPPAQQQPQQRQRQHPPVPSHQAAQQSPAAAPVQQQQQQQQQQQQQQQQQQPQYQQAYGQGPPQPQALFQQQPNSSPAPAPLPSYSQQAPTQAQGPAPVQSPPPAPSTQPQAPAQTPIQGQIPPTQPRAQQQGQQQPGQPGQAQGQSQPNRRPNTGGFRGNGRGQGHRGRGRGRGGQPGQPGAGAGAGQSQQAQA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.2
2	0.27
3	0.31
4	0.32
5	0.34
6	0.38
7	0.42
8	0.5
9	0.5
10	0.48
11	0.46
12	0.48
13	0.45
14	0.47
15	0.44
16	0.37
17	0.4
18	0.36
19	0.3
20	0.26
21	0.25
22	0.21
23	0.21
24	0.2
25	0.17
26	0.23
27	0.24
28	0.27
29	0.31
30	0.29
31	0.28
32	0.28
33	0.27
34	0.2
35	0.19
36	0.15
37	0.1
38	0.1
39	0.1
40	0.1
41	0.1
42	0.09
43	0.08
44	0.12
45	0.12
46	0.15
47	0.18
48	0.2
49	0.22
50	0.24
51	0.27
52	0.25
53	0.27
54	0.24
55	0.21
56	0.2
57	0.17
58	0.16
59	0.13
60	0.12
61	0.09
62	0.1
63	0.14
64	0.16
65	0.19
66	0.2
67	0.24
68	0.28
69	0.28
70	0.32
71	0.3
72	0.26
73	0.26
74	0.28
75	0.25
76	0.2
77	0.2
78	0.2
79	0.19
80	0.23
81	0.25
82	0.23
83	0.24
84	0.24
85	0.26
86	0.23
87	0.28
88	0.29
89	0.25
90	0.25
91	0.24
92	0.23
93	0.22
94	0.21
95	0.16
96	0.14
97	0.13
98	0.12
99	0.12
100	0.13
101	0.11
102	0.11
103	0.11
104	0.1
105	0.15
106	0.17
107	0.21
108	0.21
109	0.22
110	0.22
111	0.21
112	0.2
113	0.23
114	0.26
115	0.25
116	0.27
117	0.29
118	0.3
119	0.3
120	0.29
121	0.21
122	0.15
123	0.13
124	0.13
125	0.09
126	0.08
127	0.07
128	0.08
129	0.09
130	0.09
131	0.1
132	0.09
133	0.09
134	0.1
135	0.13
136	0.2
137	0.23
138	0.24
139	0.23
140	0.23
141	0.25
142	0.25
143	0.23
144	0.15
145	0.11
146	0.12
147	0.15
148	0.13
149	0.12
150	0.11
151	0.1
152	0.1
153	0.1
154	0.11
155	0.1
156	0.1
157	0.1
158	0.1
159	0.1
160	0.12
161	0.15
162	0.13
163	0.14
164	0.18
165	0.18
166	0.18
167	0.18
168	0.16
169	0.15
170	0.14
171	0.13
172	0.1
173	0.09
174	0.1
175	0.1
176	0.09
177	0.08
178	0.08
179	0.06
180	0.05
181	0.06
182	0.05
183	0.05
184	0.06
185	0.05
186	0.06
187	0.06
188	0.06
189	0.05
190	0.07
191	0.08
192	0.08
193	0.09
194	0.08
195	0.1
196	0.13
197	0.13
198	0.12
199	0.13
200	0.15
201	0.16
202	0.16
203	0.14
204	0.13
205	0.13
206	0.13
207	0.11
208	0.11
209	0.12
210	0.13
211	0.13
212	0.2
213	0.22
214	0.24
215	0.33
216	0.32
217	0.35
218	0.43
219	0.43
220	0.34
221	0.34
222	0.32
223	0.26
224	0.26
225	0.21
226	0.11
227	0.11
228	0.11
229	0.09
230	0.09
231	0.06
232	0.06
233	0.06
234	0.06
235	0.06
236	0.06
237	0.06
238	0.06
239	0.06
240	0.08
241	0.09
242	0.12
243	0.12
244	0.14
245	0.15
246	0.15
247	0.16
248	0.15
249	0.14
250	0.13
251	0.14
252	0.12
253	0.16
254	0.19
255	0.18
256	0.18
257	0.21
258	0.21
259	0.24
260	0.25
261	0.23
262	0.21
263	0.21
264	0.21
265	0.19
266	0.19
267	0.14
268	0.13
269	0.14
270	0.13
271	0.13
272	0.12
273	0.13
274	0.13
275	0.15
276	0.18
277	0.19
278	0.19
279	0.18
280	0.19
281	0.18
282	0.17
283	0.16
284	0.13
285	0.13
286	0.13
287	0.13
288	0.13
289	0.13
290	0.13
291	0.14
292	0.16
293	0.18
294	0.22
295	0.26
296	0.33
297	0.41
298	0.48
299	0.51
300	0.48
301	0.45
302	0.5
303	0.49
304	0.43
305	0.42
306	0.35
307	0.31
308	0.37
309	0.37
310	0.29
311	0.28
312	0.26
313	0.21
314	0.21
315	0.2
316	0.12
317	0.11
318	0.12
319	0.1
320	0.11
321	0.09
322	0.08
323	0.08
324	0.08
325	0.09
326	0.07
327	0.06
328	0.06
329	0.06
330	0.06
331	0.05
332	0.05
333	0.04
334	0.06
335	0.06
336	0.05
337	0.05
338	0.05
339	0.07
340	0.09
341	0.11
342	0.12
343	0.14
344	0.19
345	0.22
346	0.25
347	0.23
348	0.22
349	0.25
350	0.28
351	0.3
352	0.26
353	0.24
354	0.24
355	0.24
356	0.24
357	0.21
358	0.17
359	0.13
360	0.12
361	0.1
362	0.07
363	0.07
364	0.06
365	0.04
366	0.04
367	0.04
368	0.06
369	0.08
370	0.09
371	0.11
372	0.11
373	0.12
374	0.14
375	0.15
376	0.15
377	0.13
378	0.13
379	0.12
380	0.12
381	0.11
382	0.1
383	0.09
384	0.06
385	0.06
386	0.05
387	0.05
388	0.05
389	0.05
390	0.05
391	0.04
392	0.04
393	0.05
394	0.05
395	0.04
396	0.04
397	0.03
398	0.03
399	0.03
400	0.04
401	0.04
402	0.04
403	0.06
404	0.08
405	0.1
406	0.13
407	0.15
408	0.15
409	0.19
410	0.2
411	0.19
412	0.18
413	0.18
414	0.2
415	0.21
416	0.25
417	0.22
418	0.25
419	0.26
420	0.27
421	0.27
422	0.26
423	0.29
424	0.35
425	0.43
426	0.49
427	0.55
428	0.63
429	0.71
430	0.78
431	0.8
432	0.78
433	0.75
434	0.74
435	0.75
436	0.68
437	0.6
438	0.53
439	0.52
440	0.44
441	0.4
442	0.33
443	0.26
444	0.24
445	0.24
446	0.2
447	0.14
448	0.15
449	0.17
450	0.22
451	0.26
452	0.28
453	0.32
454	0.41
455	0.48
456	0.52
457	0.55
458	0.56
459	0.59
460	0.65
461	0.67
462	0.66
463	0.67
464	0.68
465	0.68
466	0.67
467	0.65
468	0.61
469	0.61
470	0.56
471	0.47
472	0.42
473	0.4
474	0.37
475	0.32
476	0.32
477	0.29
478	0.28
479	0.28
480	0.3
481	0.24
482	0.22
483	0.25
484	0.28
485	0.29
486	0.3
487	0.37
488	0.35
489	0.37
490	0.4
491	0.37
492	0.31
493	0.26
494	0.26
495	0.22
496	0.22
497	0.23
498	0.21
499	0.23
500	0.24
501	0.28
502	0.28
503	0.28
504	0.29
505	0.31
506	0.31
507	0.28
508	0.3
509	0.26
510	0.25
511	0.24
512	0.24
513	0.21
514	0.21
515	0.2
516	0.18
517	0.2
518	0.22
519	0.21
520	0.24
521	0.23
522	0.25
523	0.27
524	0.34
525	0.36
526	0.39
527	0.39
528	0.41
529	0.41
530	0.43
531	0.41
532	0.38
533	0.33
534	0.3
535	0.29
536	0.25
537	0.25
538	0.27
539	0.34
540	0.33
541	0.37
542	0.4
543	0.41
544	0.46
545	0.53
546	0.5
547	0.49
548	0.54
549	0.6
550	0.6
551	0.61
552	0.59
553	0.56
554	0.54
555	0.52
556	0.44
557	0.36
558	0.34
559	0.34
560	0.31
561	0.3
562	0.38
563	0.42
564	0.48
565	0.56
566	0.6
567	0.61
568	0.62
569	0.63
570	0.6
571	0.63
572	0.64
573	0.6
574	0.55
575	0.55
576	0.58
577	0.56
578	0.55
579	0.48
580	0.44
581	0.44
582	0.51
583	0.54
584	0.55
585	0.57
586	0.56
587	0.6
588	0.61
589	0.64
590	0.6
591	0.62
592	0.59
593	0.6
594	0.6
595	0.56
596	0.5
597	0.41
598	0.36
599	0.26
600	0.22
601	0.15
602	0.1
603	0.1
604	0.1
605	0.11

P0CQ80

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer