Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0B1P839

Protein Details
Accession A0A0B1P839    Localization Confidence Medium Confidence Score 10
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
25-49APPQIRLDTVTRKKKNPKEIVAAHHHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 13, mito 10, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012337  RNaseH-like_sf  
IPR002156  RNaseH_domain  
IPR036397  RNaseH_sf  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0004523  F:RNA-DNA hybrid ribonuclease activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF00075  RNase_H  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50879  RNASE_H_1  
CDD cd09276  Rnase_HI_RT_non_LTR  
Amino Acid Sequences MALRKILGVFKTAPILPMEVEAALAPPQIRLDTVTRKKKNPKEIVAAHHQEEFYNTNWETTTFIYTDASYMEDSKGVGVSVVATDQRGTIMEKLAINTGDGNLVYNGELEGITQGIEYGSLQARPGHSFRIFSDNQAALHRLAKLSDLPGQDCQIRAIAAAKKIKEKDAKISISWIPGHSQIRGNVKADGLAKKASKLEPLNNETSFASIKFHIANMRNEQWIKYLRKNDDNPRLSRSVYRRKFDWKIISKPLVPRGTRRDIASAFFQLKLGHGYNKKYLYQLGHSNTNQCRCGSIETPEHLIDSCSANKDARHRLKEKLNGNSLTFQLLLHTVRGIEKTVEFLEETNISTRKWHLNRLQGNRDVIE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.22
3 0.18
4 0.18
5 0.17
6 0.12
7 0.12
8 0.1
9 0.1
10 0.09
11 0.1
12 0.09
13 0.09
14 0.1
15 0.1
16 0.1
17 0.13
18 0.19
19 0.28
20 0.38
21 0.49
22 0.55
23 0.64
24 0.74
25 0.8
26 0.85
27 0.84
28 0.82
29 0.82
30 0.81
31 0.79
32 0.79
33 0.75
34 0.65
35 0.58
36 0.5
37 0.4
38 0.36
39 0.31
40 0.23
41 0.24
42 0.22
43 0.2
44 0.2
45 0.2
46 0.19
47 0.18
48 0.19
49 0.13
50 0.14
51 0.14
52 0.14
53 0.13
54 0.12
55 0.12
56 0.09
57 0.1
58 0.1
59 0.1
60 0.1
61 0.1
62 0.09
63 0.08
64 0.07
65 0.06
66 0.05
67 0.05
68 0.06
69 0.06
70 0.06
71 0.07
72 0.07
73 0.07
74 0.08
75 0.09
76 0.1
77 0.11
78 0.14
79 0.14
80 0.15
81 0.17
82 0.16
83 0.14
84 0.13
85 0.12
86 0.1
87 0.09
88 0.09
89 0.07
90 0.08
91 0.07
92 0.07
93 0.06
94 0.06
95 0.06
96 0.05
97 0.05
98 0.04
99 0.04
100 0.04
101 0.04
102 0.03
103 0.04
104 0.04
105 0.06
106 0.07
107 0.07
108 0.08
109 0.1
110 0.11
111 0.14
112 0.16
113 0.19
114 0.19
115 0.2
116 0.21
117 0.27
118 0.26
119 0.24
120 0.29
121 0.25
122 0.25
123 0.24
124 0.25
125 0.18
126 0.19
127 0.18
128 0.13
129 0.12
130 0.12
131 0.11
132 0.12
133 0.16
134 0.15
135 0.16
136 0.16
137 0.18
138 0.18
139 0.17
140 0.16
141 0.11
142 0.1
143 0.09
144 0.12
145 0.13
146 0.18
147 0.21
148 0.22
149 0.27
150 0.28
151 0.34
152 0.36
153 0.35
154 0.37
155 0.41
156 0.42
157 0.37
158 0.39
159 0.35
160 0.31
161 0.3
162 0.23
163 0.16
164 0.19
165 0.2
166 0.18
167 0.19
168 0.2
169 0.25
170 0.26
171 0.26
172 0.22
173 0.21
174 0.22
175 0.23
176 0.21
177 0.16
178 0.18
179 0.17
180 0.17
181 0.2
182 0.18
183 0.21
184 0.22
185 0.26
186 0.29
187 0.34
188 0.36
189 0.34
190 0.35
191 0.29
192 0.27
193 0.22
194 0.16
195 0.13
196 0.09
197 0.11
198 0.09
199 0.1
200 0.15
201 0.18
202 0.22
203 0.26
204 0.28
205 0.3
206 0.3
207 0.3
208 0.28
209 0.32
210 0.33
211 0.35
212 0.4
213 0.41
214 0.49
215 0.56
216 0.62
217 0.64
218 0.66
219 0.62
220 0.59
221 0.56
222 0.49
223 0.49
224 0.49
225 0.49
226 0.51
227 0.52
228 0.5
229 0.56
230 0.6
231 0.61
232 0.62
233 0.59
234 0.59
235 0.63
236 0.64
237 0.59
238 0.59
239 0.6
240 0.57
241 0.51
242 0.5
243 0.5
244 0.53
245 0.52
246 0.49
247 0.46
248 0.4
249 0.41
250 0.37
251 0.33
252 0.28
253 0.25
254 0.24
255 0.19
256 0.18
257 0.2
258 0.18
259 0.21
260 0.24
261 0.28
262 0.33
263 0.37
264 0.37
265 0.35
266 0.37
267 0.34
268 0.34
269 0.38
270 0.36
271 0.41
272 0.41
273 0.47
274 0.49
275 0.51
276 0.48
277 0.4
278 0.37
279 0.31
280 0.35
281 0.3
282 0.31
283 0.31
284 0.31
285 0.35
286 0.33
287 0.32
288 0.26
289 0.25
290 0.2
291 0.18
292 0.18
293 0.17
294 0.19
295 0.2
296 0.23
297 0.3
298 0.4
299 0.46
300 0.52
301 0.53
302 0.59
303 0.67
304 0.72
305 0.72
306 0.71
307 0.69
308 0.64
309 0.64
310 0.59
311 0.5
312 0.44
313 0.35
314 0.26
315 0.19
316 0.18
317 0.17
318 0.14
319 0.14
320 0.13
321 0.15
322 0.16
323 0.17
324 0.16
325 0.15
326 0.18
327 0.18
328 0.19
329 0.17
330 0.16
331 0.18
332 0.17
333 0.18
334 0.2
335 0.21
336 0.2
337 0.22
338 0.26
339 0.33
340 0.36
341 0.44
342 0.47
343 0.56
344 0.66
345 0.73
346 0.78
347 0.74