Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q5KMS1

Protein Details
Accession Q5KMS1    Localization Confidence Low Confidence Score 8.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
328-350SLIPGTTGKRKKIRRNESPIYSLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
337-339RKK
Subcellular Location(s) cyto 21, pero 3, nucl 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011047  Quinoprotein_ADH-like_supfam  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR019775  WD40_repeat_CS  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0006367  P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter  
KEGG cne:CNB00690  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00678  WD_REPEATS_1  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
Amino Acid Sequences MSGSKQVENISYVDIQHDAIDVFDDVEQAVIMKEDIWISGYHHGETSVHGKAMVEFEDGGSINITARDGVKVERVTKTDFVVDIPALGISKRPVHFPKHVLHPPYEKASDVDPPLQINALSVNPKTPHIIVGGPDGYCMILPTGVMASPKKDGVKLKGHVGDIRAVRWFPSGEVVLTASADLTIRVFGMNGVNPRTFKGHSRAITSLAILGVGKTVLSAAKDGTIRLWDVGSGQQVKQWTTGGEKGTLVIEDFILVEESTAIEALGLQGQERVMLVQDQLAVWVQPWDGEGWLVETDKQIASLAYERETGTIAIGYSSGVVEIRDLASLIPGTTGKRKKIRRNESPIYSLAFGLDVEDGKIDLYLGTAAGLPCRLGVKCVADGYQVVVKDELAGWDAVSIECMEAVRDGMWCGGGEGGLRKYTV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.17
3 0.15
4 0.15
5 0.11
6 0.09
7 0.1
8 0.09
9 0.09
10 0.08
11 0.08
12 0.07
13 0.07
14 0.07
15 0.06
16 0.06
17 0.05
18 0.05
19 0.05
20 0.06
21 0.07
22 0.07
23 0.08
24 0.09
25 0.11
26 0.18
27 0.19
28 0.19
29 0.19
30 0.19
31 0.18
32 0.21
33 0.23
34 0.18
35 0.17
36 0.17
37 0.17
38 0.18
39 0.2
40 0.18
41 0.15
42 0.12
43 0.12
44 0.14
45 0.14
46 0.12
47 0.11
48 0.09
49 0.09
50 0.09
51 0.09
52 0.08
53 0.08
54 0.09
55 0.1
56 0.11
57 0.17
58 0.2
59 0.24
60 0.27
61 0.29
62 0.33
63 0.33
64 0.33
65 0.3
66 0.26
67 0.23
68 0.22
69 0.19
70 0.15
71 0.13
72 0.11
73 0.09
74 0.09
75 0.09
76 0.09
77 0.16
78 0.16
79 0.23
80 0.28
81 0.34
82 0.41
83 0.45
84 0.48
85 0.52
86 0.58
87 0.55
88 0.55
89 0.54
90 0.51
91 0.51
92 0.46
93 0.37
94 0.31
95 0.3
96 0.3
97 0.27
98 0.26
99 0.21
100 0.2
101 0.2
102 0.19
103 0.17
104 0.12
105 0.11
106 0.11
107 0.12
108 0.12
109 0.15
110 0.16
111 0.17
112 0.19
113 0.18
114 0.17
115 0.16
116 0.17
117 0.14
118 0.17
119 0.18
120 0.16
121 0.15
122 0.14
123 0.12
124 0.1
125 0.1
126 0.05
127 0.04
128 0.04
129 0.04
130 0.05
131 0.05
132 0.07
133 0.07
134 0.09
135 0.1
136 0.13
137 0.13
138 0.17
139 0.2
140 0.25
141 0.33
142 0.34
143 0.38
144 0.4
145 0.41
146 0.38
147 0.36
148 0.35
149 0.27
150 0.26
151 0.21
152 0.17
153 0.17
154 0.16
155 0.15
156 0.1
157 0.12
158 0.11
159 0.1
160 0.1
161 0.1
162 0.08
163 0.08
164 0.08
165 0.05
166 0.04
167 0.04
168 0.04
169 0.03
170 0.03
171 0.04
172 0.04
173 0.04
174 0.04
175 0.06
176 0.08
177 0.1
178 0.12
179 0.13
180 0.13
181 0.15
182 0.17
183 0.17
184 0.18
185 0.22
186 0.26
187 0.27
188 0.31
189 0.31
190 0.3
191 0.3
192 0.26
193 0.21
194 0.14
195 0.12
196 0.08
197 0.07
198 0.04
199 0.04
200 0.03
201 0.03
202 0.03
203 0.03
204 0.04
205 0.04
206 0.04
207 0.07
208 0.07
209 0.08
210 0.08
211 0.08
212 0.08
213 0.08
214 0.08
215 0.06
216 0.06
217 0.08
218 0.1
219 0.11
220 0.11
221 0.12
222 0.14
223 0.14
224 0.14
225 0.14
226 0.11
227 0.12
228 0.16
229 0.15
230 0.15
231 0.14
232 0.14
233 0.14
234 0.13
235 0.1
236 0.07
237 0.06
238 0.05
239 0.05
240 0.04
241 0.05
242 0.04
243 0.04
244 0.04
245 0.04
246 0.04
247 0.04
248 0.03
249 0.03
250 0.03
251 0.03
252 0.05
253 0.04
254 0.04
255 0.05
256 0.05
257 0.06
258 0.06
259 0.05
260 0.05
261 0.05
262 0.05
263 0.06
264 0.06
265 0.06
266 0.07
267 0.07
268 0.06
269 0.06
270 0.07
271 0.06
272 0.05
273 0.06
274 0.06
275 0.06
276 0.06
277 0.06
278 0.06
279 0.07
280 0.07
281 0.08
282 0.07
283 0.09
284 0.09
285 0.09
286 0.08
287 0.07
288 0.09
289 0.12
290 0.12
291 0.12
292 0.14
293 0.14
294 0.14
295 0.15
296 0.13
297 0.1
298 0.09
299 0.08
300 0.07
301 0.06
302 0.06
303 0.05
304 0.05
305 0.05
306 0.04
307 0.04
308 0.05
309 0.06
310 0.06
311 0.06
312 0.06
313 0.06
314 0.07
315 0.07
316 0.07
317 0.07
318 0.08
319 0.1
320 0.19
321 0.25
322 0.32
323 0.41
324 0.51
325 0.6
326 0.7
327 0.79
328 0.81
329 0.85
330 0.87
331 0.84
332 0.8
333 0.71
334 0.63
335 0.53
336 0.42
337 0.32
338 0.23
339 0.16
340 0.12
341 0.11
342 0.08
343 0.07
344 0.07
345 0.07
346 0.07
347 0.07
348 0.06
349 0.05
350 0.05
351 0.05
352 0.05
353 0.05
354 0.07
355 0.07
356 0.08
357 0.09
358 0.08
359 0.09
360 0.12
361 0.12
362 0.11
363 0.15
364 0.18
365 0.21
366 0.22
367 0.22
368 0.21
369 0.21
370 0.23
371 0.22
372 0.19
373 0.17
374 0.16
375 0.15
376 0.15
377 0.15
378 0.13
379 0.11
380 0.1
381 0.09
382 0.09
383 0.1
384 0.09
385 0.09
386 0.08
387 0.07
388 0.07
389 0.07
390 0.07
391 0.07
392 0.08
393 0.08
394 0.08
395 0.09
396 0.09
397 0.1
398 0.09
399 0.09
400 0.09
401 0.09
402 0.1
403 0.13
404 0.16