Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0B1PAX5

Protein Details
Accession A0A0B1PAX5    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
130-159IRYSQKPKGDLPKKKLRGSKAKKAAVKNKDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
135-159KPKGDLPKKKLRGSKAKKAAVKNKD
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 12.5, cyto 5.5, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR029004  L28e/Mak16  
IPR002672  Ribosomal_L28e  
Gene Ontology GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0005840  C:ribosome  
GO:0003735  F:structural constituent of ribosome  
GO:0006412  P:translation  
Pfam View protein in Pfam  
PF01778  Ribosomal_L28e  
Amino Acid Sequences MSHHSSQVSSDLIWEVIRPQNSFLVKRASSGGVQFSRDPLNLTNVHSRKYAGFVNDKAVGILPIEGGKGGITLITKKTKFTQKPSSAIYTTVFGGNKTSRRTYKGVVNTVVKSRYRSDLRAEAVARASAIRYSQKPKGDLPKKKLRGSKAKKAAVKNKD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.13
3 0.17
4 0.2
5 0.2
6 0.2
7 0.26
8 0.3
9 0.32
10 0.32
11 0.34
12 0.32
13 0.32
14 0.33
15 0.29
16 0.26
17 0.26
18 0.29
19 0.23
20 0.25
21 0.24
22 0.24
23 0.25
24 0.23
25 0.24
26 0.18
27 0.21
28 0.2
29 0.23
30 0.31
31 0.3
32 0.32
33 0.3
34 0.3
35 0.25
36 0.27
37 0.26
38 0.2
39 0.24
40 0.23
41 0.26
42 0.27
43 0.26
44 0.23
45 0.21
46 0.17
47 0.12
48 0.11
49 0.07
50 0.05
51 0.05
52 0.04
53 0.04
54 0.04
55 0.04
56 0.03
57 0.04
58 0.04
59 0.05
60 0.09
61 0.14
62 0.15
63 0.16
64 0.21
65 0.3
66 0.34
67 0.4
68 0.48
69 0.48
70 0.51
71 0.53
72 0.52
73 0.44
74 0.41
75 0.34
76 0.24
77 0.2
78 0.18
79 0.15
80 0.11
81 0.13
82 0.15
83 0.18
84 0.21
85 0.26
86 0.26
87 0.31
88 0.34
89 0.34
90 0.39
91 0.43
92 0.44
93 0.44
94 0.45
95 0.42
96 0.43
97 0.45
98 0.38
99 0.33
100 0.31
101 0.34
102 0.34
103 0.34
104 0.37
105 0.39
106 0.4
107 0.43
108 0.41
109 0.35
110 0.32
111 0.29
112 0.24
113 0.17
114 0.15
115 0.11
116 0.13
117 0.16
118 0.2
119 0.27
120 0.33
121 0.38
122 0.41
123 0.47
124 0.56
125 0.61
126 0.66
127 0.68
128 0.73
129 0.76
130 0.81
131 0.81
132 0.8
133 0.81
134 0.81
135 0.83
136 0.82
137 0.82
138 0.82
139 0.85