Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q5KF27

Protein Details
Accession Q5KF27    Localization Confidence High Confidence Score 16.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
298-331DITSDSHKRRRSRSRSRGRSPPRKKSHRARSYSYBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
129-154GRPKPMPVRAPSPPPPPSGPKPRGKR
304-327HKRRRSRSRSRGRSPPRKKSHRAR
449-456KLGRLAKR
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto_nucl 13, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006569  CID_dom  
IPR008942  ENTH_VHS  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR000061  Surp  
IPR035967  SWAP/Surp_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006396  P:RNA processing  
KEGG cne:CNF03310  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04818  CID  
PF00076  RRM_1  
PF01805  Surp  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51391  CID  
PS50102  RRM  
PS50128  SURP  
Amino Acid Sequences MSRRLDLSKFAGSDSEGEEDVPKHQLELTALKSKTFSQGITKKTKRDLEKEAEERKRIEEEKAAALVMAEIEREFEGSAEGSSSGHTGMRGFRGRPIGPGGGFVRAGGAPMGAPTSFAPPRGPAAMGYGRPKPMPVRAPSPPPPPSGPKPRGKRAMDSFLEEIKHNQNAREQKFSQIAKKEGSSVTALAAWETGGSGFDHESTNLFISNLPQEITEEILGLHFAKQGPVATVKIMWPRGDEAFSQASARRGLTGFVSYMERKDAERAVKELDGSEWMGNSIRVGWSKPVAKPLKALFDITSDSHKRRRSRSRSRGRSPPRKKSHRARSYSYSSSSSYSRSPSPERTCKQKWLDSIPEEHGRFIKTVANRVKEHGKGFEDVLMEKERENPKFAFLYDDKLPDYHLYQSTLSSHYRIPSPPPEAFNDDGYASIYSSDSAEDSERERTSKGKLGRLAKRRFEAMLRVMTGKRAEIARGMEFALRRAEAADEIADIICQSVQVDSTPVPRKIARLHLISDILHNSASPLPNVWRYRLAFEHRLPPVLAHLNTVEKSLMVYSGKISADVFRGQVGNVLDIWERWIVFNTDTAELFRAVLVGDKPLSALVKTPQGAWVDKAKLEAEEAERKKRENEQQKAEEEEDRFEQSGFKSSFKRINPQAGPAPAPESVPSAVRSAFEDEDLDGEVMEDLDGEAMEDLDGEAMEDLDGEAM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.22
3 0.16
4 0.16
5 0.18
6 0.17
7 0.18
8 0.2
9 0.17
10 0.15
11 0.16
12 0.18
13 0.2
14 0.25
15 0.29
16 0.34
17 0.34
18 0.34
19 0.35
20 0.34
21 0.37
22 0.33
23 0.3
24 0.31
25 0.38
26 0.45
27 0.55
28 0.59
29 0.59
30 0.66
31 0.72
32 0.71
33 0.71
34 0.73
35 0.71
36 0.75
37 0.78
38 0.8
39 0.79
40 0.75
41 0.69
42 0.63
43 0.61
44 0.53
45 0.48
46 0.45
47 0.41
48 0.41
49 0.4
50 0.36
51 0.28
52 0.25
53 0.21
54 0.15
55 0.11
56 0.07
57 0.06
58 0.07
59 0.07
60 0.08
61 0.08
62 0.07
63 0.08
64 0.08
65 0.08
66 0.08
67 0.08
68 0.07
69 0.08
70 0.08
71 0.08
72 0.08
73 0.09
74 0.09
75 0.12
76 0.2
77 0.24
78 0.24
79 0.29
80 0.35
81 0.36
82 0.37
83 0.39
84 0.36
85 0.31
86 0.35
87 0.31
88 0.26
89 0.26
90 0.22
91 0.19
92 0.15
93 0.15
94 0.11
95 0.09
96 0.06
97 0.07
98 0.08
99 0.06
100 0.07
101 0.08
102 0.14
103 0.15
104 0.16
105 0.17
106 0.18
107 0.21
108 0.21
109 0.21
110 0.15
111 0.21
112 0.24
113 0.27
114 0.3
115 0.31
116 0.32
117 0.31
118 0.33
119 0.31
120 0.33
121 0.37
122 0.38
123 0.41
124 0.44
125 0.52
126 0.56
127 0.61
128 0.57
129 0.54
130 0.54
131 0.54
132 0.57
133 0.6
134 0.62
135 0.63
136 0.68
137 0.74
138 0.79
139 0.75
140 0.75
141 0.72
142 0.73
143 0.65
144 0.61
145 0.54
146 0.47
147 0.45
148 0.37
149 0.33
150 0.28
151 0.32
152 0.28
153 0.27
154 0.32
155 0.4
156 0.43
157 0.47
158 0.44
159 0.43
160 0.49
161 0.52
162 0.52
163 0.49
164 0.49
165 0.43
166 0.43
167 0.41
168 0.34
169 0.32
170 0.26
171 0.2
172 0.17
173 0.16
174 0.15
175 0.11
176 0.11
177 0.08
178 0.06
179 0.06
180 0.05
181 0.04
182 0.04
183 0.05
184 0.06
185 0.07
186 0.07
187 0.08
188 0.08
189 0.09
190 0.1
191 0.09
192 0.09
193 0.08
194 0.1
195 0.11
196 0.11
197 0.1
198 0.1
199 0.1
200 0.1
201 0.12
202 0.1
203 0.08
204 0.07
205 0.07
206 0.07
207 0.07
208 0.07
209 0.07
210 0.07
211 0.08
212 0.09
213 0.09
214 0.1
215 0.12
216 0.12
217 0.11
218 0.12
219 0.14
220 0.18
221 0.2
222 0.19
223 0.18
224 0.19
225 0.2
226 0.21
227 0.18
228 0.17
229 0.17
230 0.16
231 0.17
232 0.16
233 0.17
234 0.16
235 0.16
236 0.14
237 0.12
238 0.13
239 0.12
240 0.12
241 0.1
242 0.1
243 0.14
244 0.13
245 0.13
246 0.14
247 0.14
248 0.13
249 0.15
250 0.18
251 0.2
252 0.21
253 0.22
254 0.23
255 0.22
256 0.22
257 0.2
258 0.16
259 0.13
260 0.13
261 0.11
262 0.08
263 0.08
264 0.08
265 0.08
266 0.07
267 0.07
268 0.07
269 0.08
270 0.09
271 0.1
272 0.14
273 0.18
274 0.19
275 0.28
276 0.29
277 0.29
278 0.33
279 0.34
280 0.36
281 0.33
282 0.33
283 0.24
284 0.22
285 0.23
286 0.2
287 0.24
288 0.21
289 0.23
290 0.28
291 0.34
292 0.38
293 0.45
294 0.55
295 0.6
296 0.68
297 0.76
298 0.81
299 0.86
300 0.87
301 0.89
302 0.89
303 0.89
304 0.88
305 0.88
306 0.87
307 0.86
308 0.88
309 0.88
310 0.89
311 0.87
312 0.83
313 0.78
314 0.75
315 0.72
316 0.66
317 0.58
318 0.49
319 0.4
320 0.36
321 0.31
322 0.26
323 0.21
324 0.19
325 0.19
326 0.2
327 0.23
328 0.29
329 0.36
330 0.43
331 0.44
332 0.5
333 0.52
334 0.56
335 0.58
336 0.54
337 0.5
338 0.47
339 0.5
340 0.43
341 0.43
342 0.38
343 0.39
344 0.35
345 0.32
346 0.27
347 0.22
348 0.2
349 0.18
350 0.18
351 0.13
352 0.21
353 0.26
354 0.3
355 0.3
356 0.32
357 0.37
358 0.36
359 0.36
360 0.32
361 0.28
362 0.24
363 0.24
364 0.24
365 0.19
366 0.16
367 0.16
368 0.14
369 0.13
370 0.12
371 0.19
372 0.21
373 0.22
374 0.25
375 0.23
376 0.24
377 0.25
378 0.25
379 0.23
380 0.19
381 0.22
382 0.21
383 0.22
384 0.2
385 0.19
386 0.2
387 0.15
388 0.15
389 0.14
390 0.14
391 0.14
392 0.14
393 0.15
394 0.16
395 0.18
396 0.17
397 0.15
398 0.15
399 0.15
400 0.17
401 0.17
402 0.2
403 0.23
404 0.27
405 0.28
406 0.28
407 0.3
408 0.32
409 0.32
410 0.29
411 0.24
412 0.2
413 0.17
414 0.16
415 0.13
416 0.09
417 0.08
418 0.07
419 0.06
420 0.06
421 0.06
422 0.05
423 0.06
424 0.07
425 0.07
426 0.09
427 0.13
428 0.13
429 0.14
430 0.15
431 0.16
432 0.19
433 0.24
434 0.27
435 0.29
436 0.35
437 0.44
438 0.52
439 0.6
440 0.65
441 0.64
442 0.61
443 0.57
444 0.52
445 0.45
446 0.42
447 0.37
448 0.32
449 0.28
450 0.28
451 0.27
452 0.27
453 0.26
454 0.2
455 0.18
456 0.15
457 0.14
458 0.14
459 0.17
460 0.15
461 0.15
462 0.16
463 0.16
464 0.15
465 0.16
466 0.15
467 0.13
468 0.12
469 0.11
470 0.11
471 0.09
472 0.1
473 0.08
474 0.06
475 0.07
476 0.07
477 0.06
478 0.05
479 0.05
480 0.04
481 0.04
482 0.04
483 0.04
484 0.04
485 0.04
486 0.06
487 0.07
488 0.15
489 0.21
490 0.22
491 0.25
492 0.26
493 0.29
494 0.32
495 0.4
496 0.38
497 0.35
498 0.36
499 0.36
500 0.37
501 0.34
502 0.32
503 0.25
504 0.19
505 0.16
506 0.14
507 0.12
508 0.14
509 0.14
510 0.12
511 0.12
512 0.15
513 0.23
514 0.25
515 0.26
516 0.29
517 0.3
518 0.34
519 0.38
520 0.42
521 0.42
522 0.43
523 0.49
524 0.43
525 0.44
526 0.4
527 0.35
528 0.33
529 0.32
530 0.29
531 0.22
532 0.22
533 0.24
534 0.24
535 0.25
536 0.19
537 0.13
538 0.13
539 0.12
540 0.13
541 0.1
542 0.1
543 0.1
544 0.14
545 0.14
546 0.14
547 0.14
548 0.14
549 0.16
550 0.17
551 0.16
552 0.14
553 0.14
554 0.13
555 0.17
556 0.16
557 0.14
558 0.12
559 0.14
560 0.12
561 0.12
562 0.14
563 0.12
564 0.11
565 0.11
566 0.13
567 0.13
568 0.13
569 0.17
570 0.17
571 0.18
572 0.18
573 0.18
574 0.18
575 0.16
576 0.16
577 0.12
578 0.1
579 0.08
580 0.11
581 0.1
582 0.11
583 0.11
584 0.11
585 0.11
586 0.12
587 0.13
588 0.11
589 0.13
590 0.13
591 0.2
592 0.2
593 0.21
594 0.24
595 0.26
596 0.27
597 0.28
598 0.32
599 0.28
600 0.29
601 0.3
602 0.27
603 0.24
604 0.24
605 0.25
606 0.23
607 0.3
608 0.34
609 0.41
610 0.43
611 0.44
612 0.48
613 0.53
614 0.58
615 0.59
616 0.64
617 0.65
618 0.7
619 0.72
620 0.73
621 0.67
622 0.62
623 0.53
624 0.47
625 0.39
626 0.35
627 0.32
628 0.26
629 0.26
630 0.21
631 0.29
632 0.27
633 0.28
634 0.29
635 0.34
636 0.42
637 0.43
638 0.52
639 0.5
640 0.58
641 0.57
642 0.6
643 0.61
644 0.57
645 0.55
646 0.47
647 0.43
648 0.33
649 0.31
650 0.26
651 0.22
652 0.19
653 0.19
654 0.19
655 0.18
656 0.18
657 0.18
658 0.2
659 0.21
660 0.21
661 0.2
662 0.19
663 0.17
664 0.18
665 0.19
666 0.16
667 0.1
668 0.1
669 0.09
670 0.08
671 0.07
672 0.06
673 0.04
674 0.05
675 0.05
676 0.05
677 0.05
678 0.05
679 0.05
680 0.05
681 0.05
682 0.05
683 0.05
684 0.05
685 0.05
686 0.05
687 0.05
688 0.05