Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q5KB28

Protein Details
Accession Q5KB28    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
283-304TTSNNKKEAKGIKRKAPPASRGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
288-329KKEAKGIKRKAPPASRGVESLKKVNTNKMAKLTSFFKPKEKK
Subcellular Location(s) cyto_nucl 9.5, cyto 9, nucl 8, mito 6, plas 1, pero 1, E.R. 1, cysk 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR040456  RNase_H2_suB  
IPR019024  RNase_H2_suB_wHTH  
IPR041195  Rnh202_N  
Gene Ontology GO:0005654  C:nucleoplasm  
GO:0032299  C:ribonuclease H2 complex  
GO:0006401  P:RNA catabolic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF09468  RNase_H2-Ydr279  
PF17745  Ydr279_N  
Amino Acid Sequences MDYVSVLPQDIDLSSSHQYLRIPHPRTGEAQLYLPYTTAAGQDVVLEAAKLNGSQRRTWFIGDSGIDAGAMLVHYPIDPLFIVIPLILALVPNGPPPPFQPLHDLLSAASTSTSFALPLPFTSGTKGKSPNRSEGVNEDIERLLTLKNVKRAFKACCEKKVISTAPPSPDPSSSPQPPTQSFYRPSQDLIIQHLKRKAGFFAGPEEFEKFDHLVRGLGRDGLLEKDIDEELLSSARLRAACDHLAQWLPGPVLSKLVKSYDFAALEEHLASRSAAAFAASQITTSNNKKEAKGIKRKAPPASRGVESLKKVNTNKMAKLTSFFKPKEKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.16
3 0.16
4 0.18
5 0.19
6 0.24
7 0.33
8 0.39
9 0.41
10 0.44
11 0.49
12 0.5
13 0.52
14 0.53
15 0.48
16 0.4
17 0.38
18 0.36
19 0.32
20 0.29
21 0.25
22 0.19
23 0.15
24 0.13
25 0.11
26 0.1
27 0.08
28 0.08
29 0.08
30 0.08
31 0.09
32 0.08
33 0.07
34 0.06
35 0.06
36 0.06
37 0.07
38 0.1
39 0.14
40 0.17
41 0.22
42 0.25
43 0.31
44 0.33
45 0.34
46 0.32
47 0.29
48 0.31
49 0.27
50 0.25
51 0.2
52 0.18
53 0.15
54 0.13
55 0.11
56 0.06
57 0.06
58 0.04
59 0.03
60 0.03
61 0.04
62 0.04
63 0.04
64 0.05
65 0.05
66 0.06
67 0.06
68 0.06
69 0.06
70 0.06
71 0.06
72 0.05
73 0.05
74 0.04
75 0.03
76 0.04
77 0.04
78 0.05
79 0.06
80 0.07
81 0.07
82 0.08
83 0.1
84 0.17
85 0.17
86 0.18
87 0.23
88 0.26
89 0.29
90 0.28
91 0.27
92 0.2
93 0.2
94 0.19
95 0.13
96 0.09
97 0.06
98 0.06
99 0.07
100 0.07
101 0.05
102 0.06
103 0.07
104 0.07
105 0.08
106 0.11
107 0.11
108 0.11
109 0.14
110 0.16
111 0.17
112 0.21
113 0.28
114 0.31
115 0.39
116 0.42
117 0.47
118 0.47
119 0.46
120 0.43
121 0.39
122 0.37
123 0.3
124 0.27
125 0.21
126 0.18
127 0.17
128 0.16
129 0.13
130 0.09
131 0.08
132 0.13
133 0.14
134 0.21
135 0.26
136 0.27
137 0.3
138 0.34
139 0.36
140 0.39
141 0.47
142 0.45
143 0.46
144 0.51
145 0.48
146 0.46
147 0.49
148 0.41
149 0.34
150 0.34
151 0.32
152 0.29
153 0.3
154 0.31
155 0.25
156 0.25
157 0.23
158 0.24
159 0.26
160 0.26
161 0.29
162 0.29
163 0.32
164 0.32
165 0.34
166 0.32
167 0.31
168 0.32
169 0.33
170 0.34
171 0.31
172 0.3
173 0.28
174 0.28
175 0.24
176 0.27
177 0.31
178 0.29
179 0.32
180 0.34
181 0.34
182 0.32
183 0.32
184 0.27
185 0.21
186 0.21
187 0.18
188 0.21
189 0.21
190 0.21
191 0.21
192 0.21
193 0.18
194 0.17
195 0.18
196 0.12
197 0.12
198 0.12
199 0.12
200 0.12
201 0.12
202 0.14
203 0.13
204 0.12
205 0.12
206 0.11
207 0.11
208 0.1
209 0.11
210 0.08
211 0.08
212 0.09
213 0.09
214 0.08
215 0.07
216 0.07
217 0.06
218 0.07
219 0.07
220 0.06
221 0.06
222 0.09
223 0.09
224 0.1
225 0.12
226 0.16
227 0.18
228 0.19
229 0.19
230 0.19
231 0.2
232 0.19
233 0.17
234 0.15
235 0.13
236 0.13
237 0.14
238 0.11
239 0.16
240 0.17
241 0.17
242 0.17
243 0.19
244 0.19
245 0.19
246 0.21
247 0.22
248 0.22
249 0.21
250 0.2
251 0.18
252 0.18
253 0.17
254 0.15
255 0.1
256 0.1
257 0.09
258 0.08
259 0.08
260 0.08
261 0.07
262 0.08
263 0.07
264 0.07
265 0.11
266 0.1
267 0.09
268 0.1
269 0.13
270 0.18
271 0.23
272 0.28
273 0.32
274 0.35
275 0.36
276 0.44
277 0.51
278 0.55
279 0.62
280 0.65
281 0.68
282 0.75
283 0.81
284 0.83
285 0.82
286 0.77
287 0.74
288 0.71
289 0.63
290 0.59
291 0.58
292 0.55
293 0.5
294 0.51
295 0.48
296 0.5
297 0.5
298 0.54
299 0.57
300 0.57
301 0.59
302 0.6
303 0.6
304 0.53
305 0.55
306 0.51
307 0.5
308 0.53
309 0.5