FuNGI

Q5KCB1

Protein Details

Accession

Q5KCB1

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
412-437	DKPRGADQDKKPSKPRARVRFGGEEE	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
422-427	KPSKPR

Subcellular Location(s)

mito 18, cyto_nucl 4, nucl 3.5, cyto 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008728 Elongator_complex_protein_4 IPR027417 P-loop_NTPase
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0033588 C:elongator holoenzyme complex GO:0008023 C:transcription elongation factor complex GO:0002098 P:tRNA wobble uridine modification
KEGG	cne:CNH00410 -
Pfam	View protein in Pfam PF05625 PAXNEB
CDD	cd19494 Elp4

Amino Acid Sequences

MPSFTRRIPVANPPPPGTTPSPIHSLPLLPTGLPSMDDLLGGGLPLHSILLVLAPDTQSAWGRLLERYWIAQGLASGQAGVLVGEKEEGEAVVKGCMWTEGGVSGDGSESEGEGGVEGGERKIAWRYEKMGKFQTTVKGNGSNLSLMTTIPPEALSLMQESGQMSYVAINSDEPSTSRSCVLDEVLKGVWEKLQHADKGRATRLAVHELGSLDWGHISMSEIHRFIHSLRELLKTKPASALITLPASLILSMGNERESIVRRLSWGVDACVELKGFADDPTLPPLFPTHGLLTLHSYPTTHALLPSTLKHSTLLGVSQSSTSASSSGGGGGAGENNLGFRLKRKRFVVETVHLGVEGGVGERRTGGDVREALDGADATHSHAHSHPTMTIPSSGIEPSQPVLASTPQTGVDDKPRGADQDKKPSKPRARVRFGGEEEVIIVGKGGDGSKHDHAHSHTHDHGPRGKDQPQKIALRHDRPDLYEF

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.56
2	0.54
3	0.55
4	0.49
5	0.45
6	0.42
7	0.39
8	0.42
9	0.38
10	0.38
11	0.34
12	0.31
13	0.27
14	0.27
15	0.24
16	0.18
17	0.19
18	0.19
19	0.17
20	0.16
21	0.15
22	0.13
23	0.12
24	0.12
25	0.11
26	0.1
27	0.09
28	0.08
29	0.08
30	0.05
31	0.05
32	0.05
33	0.05
34	0.04
35	0.04
36	0.04
37	0.05
38	0.05
39	0.05
40	0.07
41	0.07
42	0.08
43	0.08
44	0.1
45	0.11
46	0.12
47	0.13
48	0.14
49	0.16
50	0.17
51	0.17
52	0.19
53	0.19
54	0.2
55	0.2
56	0.18
57	0.17
58	0.16
59	0.15
60	0.13
61	0.13
62	0.11
63	0.1
64	0.08
65	0.08
66	0.07
67	0.07
68	0.06
69	0.05
70	0.05
71	0.06
72	0.06
73	0.06
74	0.06
75	0.06
76	0.06
77	0.07
78	0.08
79	0.08
80	0.08
81	0.08
82	0.08
83	0.09
84	0.08
85	0.07
86	0.07
87	0.07
88	0.08
89	0.08
90	0.08
91	0.08
92	0.07
93	0.07
94	0.07
95	0.06
96	0.05
97	0.05
98	0.05
99	0.05
100	0.05
101	0.05
102	0.04
103	0.05
104	0.05
105	0.05
106	0.06
107	0.06
108	0.07
109	0.11
110	0.14
111	0.17
112	0.21
113	0.26
114	0.36
115	0.4
116	0.45
117	0.48
118	0.47
119	0.46
120	0.46
121	0.48
122	0.42
123	0.4
124	0.38
125	0.34
126	0.33
127	0.32
128	0.29
129	0.23
130	0.19
131	0.17
132	0.14
133	0.1
134	0.1
135	0.09
136	0.08
137	0.08
138	0.08
139	0.06
140	0.07
141	0.07
142	0.07
143	0.07
144	0.07
145	0.07
146	0.08
147	0.08
148	0.08
149	0.09
150	0.08
151	0.07
152	0.07
153	0.07
154	0.07
155	0.07
156	0.07
157	0.07
158	0.08
159	0.08
160	0.07
161	0.1
162	0.11
163	0.11
164	0.12
165	0.12
166	0.12
167	0.12
168	0.14
169	0.14
170	0.13
171	0.14
172	0.13
173	0.13
174	0.13
175	0.12
176	0.12
177	0.1
178	0.11
179	0.14
180	0.18
181	0.2
182	0.23
183	0.28
184	0.3
185	0.34
186	0.34
187	0.32
188	0.28
189	0.3
190	0.3
191	0.29
192	0.26
193	0.22
194	0.21
195	0.19
196	0.19
197	0.15
198	0.12
199	0.07
200	0.07
201	0.06
202	0.04
203	0.04
204	0.05
205	0.07
206	0.1
207	0.12
208	0.12
209	0.12
210	0.13
211	0.13
212	0.13
213	0.16
214	0.15
215	0.14
216	0.16
217	0.22
218	0.24
219	0.24
220	0.3
221	0.24
222	0.24
223	0.24
224	0.23
225	0.18
226	0.17
227	0.17
228	0.12
229	0.12
230	0.11
231	0.09
232	0.08
233	0.07
234	0.06
235	0.05
236	0.03
237	0.03
238	0.04
239	0.04
240	0.04
241	0.05
242	0.05
243	0.07
244	0.1
245	0.11
246	0.12
247	0.12
248	0.13
249	0.14
250	0.14
251	0.15
252	0.13
253	0.12
254	0.11
255	0.12
256	0.11
257	0.11
258	0.1
259	0.07
260	0.07
261	0.07
262	0.07
263	0.06
264	0.07
265	0.07
266	0.08
267	0.12
268	0.12
269	0.11
270	0.11
271	0.12
272	0.12
273	0.12
274	0.14
275	0.1
276	0.13
277	0.14
278	0.14
279	0.18
280	0.18
281	0.18
282	0.15
283	0.15
284	0.12
285	0.15
286	0.16
287	0.12
288	0.11
289	0.11
290	0.13
291	0.14
292	0.15
293	0.16
294	0.15
295	0.15
296	0.15
297	0.15
298	0.15
299	0.13
300	0.13
301	0.09
302	0.09
303	0.09
304	0.09
305	0.09
306	0.08
307	0.08
308	0.08
309	0.07
310	0.07
311	0.07
312	0.07
313	0.07
314	0.06
315	0.05
316	0.05
317	0.05
318	0.05
319	0.04
320	0.04
321	0.04
322	0.04
323	0.05
324	0.05
325	0.05
326	0.12
327	0.22
328	0.28
329	0.35
330	0.39
331	0.45
332	0.49
333	0.56
334	0.58
335	0.52
336	0.52
337	0.47
338	0.44
339	0.36
340	0.32
341	0.25
342	0.17
343	0.12
344	0.07
345	0.06
346	0.06
347	0.06
348	0.07
349	0.07
350	0.09
351	0.1
352	0.1
353	0.14
354	0.15
355	0.17
356	0.18
357	0.18
358	0.15
359	0.15
360	0.14
361	0.09
362	0.1
363	0.08
364	0.09
365	0.11
366	0.12
367	0.13
368	0.14
369	0.18
370	0.18
371	0.2
372	0.2
373	0.19
374	0.21
375	0.2
376	0.2
377	0.17
378	0.16
379	0.15
380	0.15
381	0.13
382	0.12
383	0.11
384	0.11
385	0.12
386	0.11
387	0.1
388	0.12
389	0.14
390	0.15
391	0.15
392	0.16
393	0.15
394	0.17
395	0.18
396	0.18
397	0.24
398	0.27
399	0.26
400	0.28
401	0.28
402	0.31
403	0.33
404	0.4
405	0.41
406	0.47
407	0.56
408	0.6
409	0.67
410	0.74
411	0.79
412	0.8
413	0.82
414	0.82
415	0.82
416	0.82
417	0.81
418	0.8
419	0.74
420	0.71
421	0.6
422	0.49
423	0.41
424	0.35
425	0.27
426	0.17
427	0.13
428	0.06
429	0.06
430	0.07
431	0.06
432	0.07
433	0.09
434	0.15
435	0.21
436	0.25
437	0.25
438	0.29
439	0.32
440	0.4
441	0.43
442	0.45
443	0.44
444	0.49
445	0.52
446	0.54
447	0.58
448	0.53
449	0.55
450	0.55
451	0.58
452	0.58
453	0.6
454	0.63
455	0.65
456	0.69
457	0.66
458	0.7
459	0.72
460	0.72
461	0.71
462	0.7
463	0.65

Q5KCB1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer