Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A0B1P8W1

Protein Details
Accession A0A0B1P8W1    Localization Confidence High Confidence Score 16.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
283-306AMTRTTNGIRRKKRKGALTNPSSYHydrophilic
373-395NYSMSGKKHLKRGKHQNGIEQLDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
292-297RRKKRK
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007307  Ltv1  
Gene Ontology GO:0042274  P:ribosomal small subunit biogenesis  
Pfam View protein in Pfam  
PF04180  LTV  
Amino Acid Sequences MARKKWIDKKSAAHFTLVHRPQNDPLIHDSSASSLVLNPTPILNSNKSKKLNDLEVELGPEIKNIRYNEGEAANHGIFYDDSEYDYMQHLRDLGNGTGESYFVEASSSRARNKGKEKQSLDEALKNVNLKDQTNELLEQDILPSKNLRHMTYQAQQDVPDALAGLQPDMDPRLREVLIALEDDEYIDEQDDIFCELAKDNQEVDEEEFIRSQWEDEEADWDSDTTAKPKKEYDETSSQHTSMCEVNNELEDHGDGAWMANFHNLKKEHKLRSIPVESSLASSAMTRTTNGIRRKKRKGALTNPSSYSMTSSSIFRTEGLTTLDARFEKIEEQYNEDMDEMASVSQLSVRSVASSNQQYVREDLESIMDEFLGNYSMSGKKHLKRGKHQNGIEQLDEIRKELGPAIIKS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.61
2 0.58
3 0.61
4 0.58
5 0.54
6 0.46
7 0.47
8 0.48
9 0.53
10 0.48
11 0.41
12 0.4
13 0.39
14 0.38
15 0.35
16 0.31
17 0.25
18 0.25
19 0.21
20 0.16
21 0.12
22 0.15
23 0.15
24 0.16
25 0.14
26 0.13
27 0.14
28 0.18
29 0.22
30 0.26
31 0.34
32 0.4
33 0.49
34 0.54
35 0.55
36 0.58
37 0.6
38 0.62
39 0.55
40 0.53
41 0.47
42 0.42
43 0.42
44 0.35
45 0.29
46 0.21
47 0.2
48 0.16
49 0.14
50 0.19
51 0.18
52 0.23
53 0.23
54 0.25
55 0.27
56 0.3
57 0.29
58 0.24
59 0.28
60 0.23
61 0.21
62 0.19
63 0.16
64 0.12
65 0.13
66 0.15
67 0.09
68 0.11
69 0.12
70 0.12
71 0.12
72 0.15
73 0.15
74 0.12
75 0.12
76 0.12
77 0.12
78 0.15
79 0.17
80 0.15
81 0.16
82 0.15
83 0.16
84 0.15
85 0.14
86 0.12
87 0.09
88 0.08
89 0.06
90 0.07
91 0.06
92 0.09
93 0.16
94 0.19
95 0.21
96 0.28
97 0.31
98 0.38
99 0.48
100 0.55
101 0.57
102 0.63
103 0.65
104 0.63
105 0.66
106 0.65
107 0.59
108 0.53
109 0.45
110 0.37
111 0.35
112 0.32
113 0.26
114 0.24
115 0.23
116 0.19
117 0.19
118 0.19
119 0.19
120 0.2
121 0.2
122 0.16
123 0.15
124 0.14
125 0.12
126 0.11
127 0.13
128 0.11
129 0.11
130 0.12
131 0.12
132 0.18
133 0.21
134 0.21
135 0.22
136 0.25
137 0.3
138 0.35
139 0.39
140 0.35
141 0.33
142 0.32
143 0.29
144 0.26
145 0.2
146 0.13
147 0.09
148 0.06
149 0.07
150 0.06
151 0.06
152 0.05
153 0.05
154 0.05
155 0.07
156 0.08
157 0.07
158 0.08
159 0.11
160 0.11
161 0.11
162 0.11
163 0.11
164 0.11
165 0.1
166 0.1
167 0.07
168 0.07
169 0.07
170 0.07
171 0.05
172 0.04
173 0.04
174 0.04
175 0.04
176 0.04
177 0.04
178 0.05
179 0.04
180 0.04
181 0.04
182 0.05
183 0.07
184 0.08
185 0.09
186 0.08
187 0.09
188 0.09
189 0.1
190 0.11
191 0.11
192 0.11
193 0.1
194 0.1
195 0.1
196 0.1
197 0.09
198 0.08
199 0.06
200 0.07
201 0.07
202 0.07
203 0.1
204 0.1
205 0.1
206 0.1
207 0.09
208 0.08
209 0.08
210 0.09
211 0.1
212 0.14
213 0.15
214 0.16
215 0.18
216 0.22
217 0.28
218 0.31
219 0.34
220 0.38
221 0.39
222 0.44
223 0.44
224 0.4
225 0.35
226 0.31
227 0.26
228 0.19
229 0.18
230 0.13
231 0.12
232 0.12
233 0.13
234 0.13
235 0.12
236 0.09
237 0.08
238 0.08
239 0.07
240 0.06
241 0.05
242 0.04
243 0.05
244 0.05
245 0.05
246 0.08
247 0.1
248 0.1
249 0.17
250 0.19
251 0.22
252 0.31
253 0.4
254 0.43
255 0.49
256 0.54
257 0.52
258 0.59
259 0.6
260 0.52
261 0.46
262 0.41
263 0.34
264 0.3
265 0.27
266 0.17
267 0.13
268 0.12
269 0.1
270 0.1
271 0.1
272 0.09
273 0.11
274 0.16
275 0.24
276 0.33
277 0.42
278 0.51
279 0.6
280 0.7
281 0.77
282 0.78
283 0.81
284 0.83
285 0.83
286 0.84
287 0.82
288 0.78
289 0.71
290 0.67
291 0.57
292 0.47
293 0.39
294 0.29
295 0.23
296 0.19
297 0.18
298 0.16
299 0.17
300 0.17
301 0.15
302 0.16
303 0.14
304 0.15
305 0.16
306 0.16
307 0.16
308 0.16
309 0.2
310 0.18
311 0.18
312 0.17
313 0.15
314 0.16
315 0.17
316 0.25
317 0.23
318 0.29
319 0.29
320 0.3
321 0.29
322 0.27
323 0.24
324 0.15
325 0.14
326 0.09
327 0.07
328 0.06
329 0.05
330 0.05
331 0.07
332 0.08
333 0.08
334 0.09
335 0.09
336 0.11
337 0.12
338 0.14
339 0.2
340 0.24
341 0.28
342 0.31
343 0.34
344 0.34
345 0.34
346 0.36
347 0.3
348 0.26
349 0.22
350 0.2
351 0.19
352 0.18
353 0.16
354 0.13
355 0.11
356 0.1
357 0.1
358 0.09
359 0.07
360 0.06
361 0.1
362 0.13
363 0.14
364 0.22
365 0.3
366 0.34
367 0.44
368 0.51
369 0.58
370 0.65
371 0.76
372 0.8
373 0.82
374 0.81
375 0.81
376 0.83
377 0.78
378 0.68
379 0.59
380 0.51
381 0.46
382 0.42
383 0.34
384 0.26
385 0.21
386 0.21
387 0.21
388 0.23