FuNGI

A0A0B1P075

Protein Details

Accession

A0A0B1P075

Localization Confidence

High

Confidence Score

23.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-22	MASDKKKAKQVARDLLKRRAAG	Hydrophilic
185-205	SSDTPAPKRKKNKTMAKVSVV	Hydrophilic
347-375	KTDRKITSSTPKKNLKKESKEKVKTQTPL	Hydrophilic
397-416	DSGKSEKKTKEPFSRIPKDI	Hydrophilic
440-468	LIVTKGKGFTKEKNKKKRGSYRGGHIDVN	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
6-20	KKAKQVARDLLKRRA
193-194	RK
362-363	KK
446-459	KGFTKEKNKKKRGS

Subcellular Location(s)

nucl 23, cyto_nucl 13.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007718 Srp40_C
Gene Ontology	GO:0005730 C:nucleolus
Pfam	View protein in Pfam PF05022 SRP40_C

Amino Acid Sequences

MASDKKKAKQVARDLLKRRAAGEKSKIELSPELLDLVEKFFDEIGYTKSSFAFKAERKKYGDGTKEKLTTCPLLGSIFHEYQISNSLKISKVEEENKTTETTKDAKNSPKKNKLDLNSTSSSNSSSSRTCRESNNDLSNEPQNRNSSSGSSKITSSSKISKVSKNVNPKKRKASTSSSSSDSDSSSDTPAPKRKKNKTMAKVSVVSKTSAGSSSSSDETANSKSSNSSDSSSDSESSSGKNSDSQKTGEDSESSSSDSSSSPSHSDSVALSTKKKAQLNKSKSSCDTESTNSTSSSDSSSSNDSSSSSESSGSRNSKGSSGSGSSSDSSSSSDSSSSSDSESSEPEKTDRKITSSTPKKNLKKESKEKVKTQTPLSSSAKSKENEVKTENFTPSVVDSGKSEKKTKEPFSRIPKDIKVDKKLASNAYVPYDYAQKAHEDLIVTKGKGFTKEKNKKKRGSYRGGHIDVNGKNGIKFDD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.81
2	0.82
3	0.81
4	0.72
5	0.65
6	0.63
7	0.59
8	0.59
9	0.61
10	0.58
11	0.56
12	0.58
13	0.56
14	0.5
15	0.46
16	0.41
17	0.34
18	0.28
19	0.24
20	0.2
21	0.2
22	0.17
23	0.16
24	0.13
25	0.1
26	0.1
27	0.09
28	0.09
29	0.1
30	0.11
31	0.12
32	0.16
33	0.16
34	0.17
35	0.19
36	0.2
37	0.19
38	0.22
39	0.27
40	0.3
41	0.4
42	0.47
43	0.52
44	0.56
45	0.6
46	0.64
47	0.65
48	0.68
49	0.65
50	0.64
51	0.64
52	0.64
53	0.6
54	0.55
55	0.5
56	0.43
57	0.36
58	0.32
59	0.24
60	0.21
61	0.2
62	0.22
63	0.24
64	0.21
65	0.21
66	0.2
67	0.19
68	0.18
69	0.25
70	0.23
71	0.17
72	0.18
73	0.21
74	0.22
75	0.24
76	0.26
77	0.23
78	0.29
79	0.35
80	0.39
81	0.41
82	0.42
83	0.42
84	0.41
85	0.37
86	0.31
87	0.29
88	0.29
89	0.28
90	0.32
91	0.36
92	0.44
93	0.52
94	0.62
95	0.68
96	0.73
97	0.74
98	0.75
99	0.78
100	0.73
101	0.73
102	0.68
103	0.64
104	0.57
105	0.53
106	0.47
107	0.39
108	0.35
109	0.27
110	0.23
111	0.19
112	0.19
113	0.22
114	0.27
115	0.31
116	0.32
117	0.36
118	0.41
119	0.46
120	0.5
121	0.54
122	0.49
123	0.46
124	0.46
125	0.48
126	0.46
127	0.41
128	0.37
129	0.33
130	0.32
131	0.35
132	0.33
133	0.29
134	0.27
135	0.29
136	0.27
137	0.25
138	0.24
139	0.25
140	0.25
141	0.24
142	0.25
143	0.28
144	0.29
145	0.35
146	0.39
147	0.4
148	0.45
149	0.52
150	0.54
151	0.59
152	0.65
153	0.68
154	0.73
155	0.75
156	0.79
157	0.77
158	0.76
159	0.71
160	0.7
161	0.66
162	0.64
163	0.6
164	0.53
165	0.48
166	0.43
167	0.38
168	0.29
169	0.23
170	0.18
171	0.15
172	0.14
173	0.14
174	0.15
175	0.2
176	0.28
177	0.34
178	0.4
179	0.49
180	0.57
181	0.65
182	0.73
183	0.78
184	0.79
185	0.83
186	0.81
187	0.77
188	0.73
189	0.64
190	0.6
191	0.5
192	0.41
193	0.31
194	0.25
195	0.2
196	0.16
197	0.14
198	0.1
199	0.1
200	0.12
201	0.12
202	0.12
203	0.12
204	0.11
205	0.13
206	0.13
207	0.13
208	0.11
209	0.11
210	0.11
211	0.12
212	0.13
213	0.13
214	0.13
215	0.13
216	0.14
217	0.16
218	0.17
219	0.17
220	0.15
221	0.14
222	0.13
223	0.12
224	0.12
225	0.11
226	0.09
227	0.14
228	0.17
229	0.2
230	0.21
231	0.22
232	0.21
233	0.23
234	0.24
235	0.2
236	0.17
237	0.14
238	0.14
239	0.14
240	0.13
241	0.11
242	0.1
243	0.1
244	0.09
245	0.09
246	0.09
247	0.09
248	0.1
249	0.11
250	0.12
251	0.11
252	0.11
253	0.1
254	0.13
255	0.16
256	0.16
257	0.16
258	0.18
259	0.22
260	0.28
261	0.31
262	0.33
263	0.39
264	0.49
265	0.56
266	0.64
267	0.63
268	0.62
269	0.61
270	0.61
271	0.52
272	0.44
273	0.39
274	0.32
275	0.32
276	0.31
277	0.29
278	0.24
279	0.23
280	0.21
281	0.18
282	0.17
283	0.14
284	0.12
285	0.13
286	0.15
287	0.15
288	0.15
289	0.14
290	0.13
291	0.13
292	0.14
293	0.14
294	0.12
295	0.13
296	0.13
297	0.15
298	0.21
299	0.22
300	0.22
301	0.23
302	0.23
303	0.23
304	0.24
305	0.23
306	0.19
307	0.19
308	0.18
309	0.17
310	0.18
311	0.16
312	0.15
313	0.15
314	0.12
315	0.12
316	0.12
317	0.11
318	0.1
319	0.1
320	0.1
321	0.11
322	0.12
323	0.11
324	0.12
325	0.11
326	0.12
327	0.13
328	0.15
329	0.16
330	0.16
331	0.16
332	0.18
333	0.23
334	0.24
335	0.3
336	0.29
337	0.3
338	0.31
339	0.36
340	0.44
341	0.49
342	0.56
343	0.59
344	0.68
345	0.72
346	0.78
347	0.83
348	0.83
349	0.84
350	0.85
351	0.87
352	0.88
353	0.88
354	0.86
355	0.85
356	0.82
357	0.77
358	0.72
359	0.69
360	0.6
361	0.6
362	0.57
363	0.53
364	0.48
365	0.47
366	0.48
367	0.41
368	0.45
369	0.45
370	0.46
371	0.46
372	0.47
373	0.47
374	0.47
375	0.52
376	0.47
377	0.39
378	0.34
379	0.3
380	0.26
381	0.26
382	0.2
383	0.15
384	0.15
385	0.22
386	0.29
387	0.32
388	0.36
389	0.36
390	0.45
391	0.54
392	0.62
393	0.65
394	0.67
395	0.72
396	0.78
397	0.83
398	0.79
399	0.77
400	0.73
401	0.71
402	0.71
403	0.71
404	0.68
405	0.64
406	0.63
407	0.62
408	0.62
409	0.57
410	0.52
411	0.47
412	0.42
413	0.41
414	0.38
415	0.31
416	0.27
417	0.29
418	0.26
419	0.23
420	0.21
421	0.19
422	0.2
423	0.21
424	0.22
425	0.18
426	0.19
427	0.25
428	0.29
429	0.27
430	0.27
431	0.3
432	0.31
433	0.36
434	0.4
435	0.43
436	0.49
437	0.59
438	0.68
439	0.75
440	0.82
441	0.84
442	0.9
443	0.91
444	0.9
445	0.9
446	0.88
447	0.88
448	0.88
449	0.83
450	0.74
451	0.66
452	0.63
453	0.54
454	0.5
455	0.43
456	0.34
457	0.31

A0A0B1P075

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer