Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0B1PDI6

Protein Details
Accession A0A0B1PDI6    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
164-188IEIVQRRVKRARRARLTYMRKPKHDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
170-179RVKRARRARL
214-225RNESKKSSGGKR
Subcellular Location(s) mito 17, nucl 7.5, cyto_nucl 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR038657  L19_sf  
IPR001857  Ribosomal_L19  
IPR008991  Translation_prot_SH3-like_sf  
Gene Ontology GO:0005840  C:ribosome  
GO:0003735  F:structural constituent of ribosome  
GO:0006412  P:translation  
Pfam View protein in Pfam  
PF01245  Ribosomal_L19  
Amino Acid Sequences MPRNTIFQKNIWPFSSCLLDMGCMRISNVGFKCITTYHKSVSFSNVQLPRPNQSVTVSKKITVFPPPPSPAQKCKEPIEYLNASQISILDPTGARTHLFSRTNSEAAKLGDLLLIKLRDGEPFAGVCINIRRRGVDTAILLRNHLTRVGVEMWYKIYSPNVAGIEIVQRRVKRARRARLTYMRKPKHDMGSVQNILLAYYKSKGALRGGPGSMRNESKKSSGGKR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.43
3 0.33
4 0.27
5 0.21
6 0.21
7 0.19
8 0.21
9 0.19
10 0.14
11 0.14
12 0.16
13 0.16
14 0.22
15 0.23
16 0.23
17 0.22
18 0.22
19 0.24
20 0.22
21 0.27
22 0.26
23 0.28
24 0.29
25 0.34
26 0.36
27 0.36
28 0.39
29 0.39
30 0.34
31 0.39
32 0.4
33 0.37
34 0.41
35 0.42
36 0.4
37 0.39
38 0.38
39 0.31
40 0.3
41 0.35
42 0.35
43 0.42
44 0.38
45 0.37
46 0.38
47 0.38
48 0.38
49 0.37
50 0.35
51 0.31
52 0.38
53 0.39
54 0.41
55 0.46
56 0.49
57 0.49
58 0.5
59 0.52
60 0.49
61 0.51
62 0.52
63 0.48
64 0.45
65 0.43
66 0.41
67 0.35
68 0.35
69 0.3
70 0.25
71 0.22
72 0.2
73 0.13
74 0.11
75 0.1
76 0.06
77 0.05
78 0.07
79 0.08
80 0.08
81 0.08
82 0.09
83 0.11
84 0.16
85 0.19
86 0.18
87 0.23
88 0.25
89 0.27
90 0.26
91 0.25
92 0.2
93 0.19
94 0.18
95 0.12
96 0.1
97 0.09
98 0.09
99 0.08
100 0.08
101 0.08
102 0.07
103 0.08
104 0.08
105 0.07
106 0.08
107 0.09
108 0.07
109 0.07
110 0.08
111 0.07
112 0.07
113 0.07
114 0.12
115 0.14
116 0.17
117 0.17
118 0.18
119 0.2
120 0.22
121 0.22
122 0.2
123 0.18
124 0.21
125 0.25
126 0.24
127 0.22
128 0.21
129 0.21
130 0.18
131 0.17
132 0.12
133 0.08
134 0.11
135 0.12
136 0.13
137 0.12
138 0.13
139 0.14
140 0.14
141 0.14
142 0.12
143 0.11
144 0.11
145 0.11
146 0.14
147 0.13
148 0.12
149 0.12
150 0.12
151 0.18
152 0.18
153 0.21
154 0.2
155 0.2
156 0.25
157 0.33
158 0.41
159 0.44
160 0.54
161 0.61
162 0.68
163 0.75
164 0.81
165 0.83
166 0.85
167 0.85
168 0.86
169 0.83
170 0.78
171 0.77
172 0.74
173 0.72
174 0.68
175 0.62
176 0.58
177 0.61
178 0.57
179 0.5
180 0.44
181 0.36
182 0.3
183 0.27
184 0.2
185 0.11
186 0.12
187 0.12
188 0.13
189 0.15
190 0.18
191 0.21
192 0.25
193 0.29
194 0.33
195 0.34
196 0.36
197 0.38
198 0.4
199 0.41
200 0.42
201 0.43
202 0.41
203 0.43
204 0.42
205 0.45