Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0B1PDC3

Protein Details
Accession A0A0B1PDC3    Localization Confidence High Confidence Score 18.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
3-24KEQKISRKQKAGEILKRKRNLDBasic
716-740DAEIKKDKSTIRPPRRPESNGKSAIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
9-20RKQKAGEILKRK
728-731PPRR
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011989  ARM-like  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR040000  NOP9  
IPR001313  Pumilio_RNA-bd_rpt  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Amino Acid Sequences MPKEQKISRKQKAGEILKRKRNLDSADVDENPRKRRASNENDWDNDYIKIDEEKDFNTLPFYGLLGDEEQEYFRRSDELLELNDFPDEETRSFFLANVFREAENKELKIACSQSCSRLMERLILLCSTDQKKTLFQKFSGNFVHLIRHRFASHCCEMLFIQSAPIVTEELTSKSSTGKSSKSDFPTMENLFLQTLDEIEGCMSSLLTDVFASHTLRVLLMILDGRTLGQHTSKTLVQSKRKEKIEIMALETKQNENLLEKRQVPPSFTFAVEKIISDIASSLDPPFIRLLATHPTGNPTLQLLLELELTSPNLKEMSKLGQNSIISSILPDAIDVENSNSVSLINGLLYDSIGSRLLETICMFASGKLFKKIYQIVFKDRIAAILRNEISSYTAIRVLSRIGKQDLEEALQLIIPQIPKLVERNRSLAIRTLIERCHARCIDTSALTSSISEAYGGHRETLILKMTCLDTTTLLSMTSLQHEGETEIEKDNKQKPSHSQLQGSLLAQSMLMLQGPSSELIQDALISLPPQILLSLSLYTTTSHLIQSALSPTLPVLFRRKLINLLLFSLHCPSSDRQIPILRLCLSSVGSHVLDALLTCTIHPSTLSPHSDSKNSTNSATPLFSYAERISSVLVAHEHEIRNSFYGRIIWRNWSIDLFKRMRSDWVRKVKNFYLTTIPIPSRSQSMNSSTKTTMIMNNNETEVSCKTSNHPSIKIDAEIKKDKSTIRPPRRPESNGKSAIELARERFASKKLMSSSVKKIIT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.79
2 0.79
3 0.8
4 0.8
5 0.84
6 0.79
7 0.75
8 0.72
9 0.67
10 0.63
11 0.6
12 0.56
13 0.56
14 0.55
15 0.54
16 0.54
17 0.54
18 0.52
19 0.52
20 0.47
21 0.43
22 0.5
23 0.55
24 0.58
25 0.63
26 0.68
27 0.7
28 0.71
29 0.72
30 0.65
31 0.56
32 0.47
33 0.38
34 0.28
35 0.22
36 0.21
37 0.2
38 0.21
39 0.22
40 0.22
41 0.24
42 0.24
43 0.22
44 0.22
45 0.21
46 0.18
47 0.16
48 0.15
49 0.12
50 0.11
51 0.12
52 0.11
53 0.11
54 0.11
55 0.11
56 0.12
57 0.13
58 0.15
59 0.14
60 0.13
61 0.14
62 0.14
63 0.16
64 0.19
65 0.22
66 0.22
67 0.26
68 0.26
69 0.24
70 0.24
71 0.21
72 0.18
73 0.17
74 0.17
75 0.14
76 0.16
77 0.17
78 0.18
79 0.18
80 0.18
81 0.2
82 0.22
83 0.24
84 0.25
85 0.25
86 0.24
87 0.27
88 0.28
89 0.29
90 0.29
91 0.27
92 0.27
93 0.27
94 0.28
95 0.31
96 0.32
97 0.28
98 0.29
99 0.31
100 0.32
101 0.36
102 0.39
103 0.35
104 0.37
105 0.36
106 0.35
107 0.34
108 0.32
109 0.27
110 0.24
111 0.23
112 0.19
113 0.25
114 0.23
115 0.23
116 0.24
117 0.24
118 0.31
119 0.4
120 0.48
121 0.46
122 0.45
123 0.53
124 0.51
125 0.57
126 0.52
127 0.45
128 0.38
129 0.34
130 0.4
131 0.34
132 0.36
133 0.31
134 0.32
135 0.31
136 0.31
137 0.34
138 0.34
139 0.33
140 0.32
141 0.3
142 0.28
143 0.27
144 0.27
145 0.26
146 0.18
147 0.15
148 0.14
149 0.14
150 0.12
151 0.13
152 0.1
153 0.08
154 0.09
155 0.09
156 0.1
157 0.12
158 0.12
159 0.12
160 0.14
161 0.15
162 0.19
163 0.21
164 0.23
165 0.27
166 0.32
167 0.39
168 0.42
169 0.45
170 0.42
171 0.41
172 0.45
173 0.42
174 0.39
175 0.32
176 0.27
177 0.22
178 0.22
179 0.18
180 0.1
181 0.09
182 0.07
183 0.07
184 0.06
185 0.06
186 0.06
187 0.05
188 0.05
189 0.05
190 0.04
191 0.04
192 0.04
193 0.05
194 0.05
195 0.05
196 0.06
197 0.08
198 0.09
199 0.09
200 0.1
201 0.1
202 0.09
203 0.09
204 0.09
205 0.07
206 0.07
207 0.08
208 0.06
209 0.06
210 0.06
211 0.06
212 0.06
213 0.07
214 0.07
215 0.08
216 0.09
217 0.1
218 0.13
219 0.15
220 0.19
221 0.26
222 0.34
223 0.4
224 0.49
225 0.57
226 0.63
227 0.65
228 0.64
229 0.57
230 0.55
231 0.54
232 0.47
233 0.43
234 0.41
235 0.38
236 0.37
237 0.37
238 0.31
239 0.24
240 0.22
241 0.17
242 0.15
243 0.18
244 0.2
245 0.24
246 0.26
247 0.29
248 0.35
249 0.36
250 0.35
251 0.34
252 0.34
253 0.3
254 0.29
255 0.27
256 0.2
257 0.24
258 0.2
259 0.18
260 0.15
261 0.13
262 0.12
263 0.1
264 0.1
265 0.07
266 0.07
267 0.07
268 0.06
269 0.08
270 0.08
271 0.09
272 0.09
273 0.08
274 0.08
275 0.08
276 0.1
277 0.13
278 0.15
279 0.15
280 0.15
281 0.18
282 0.19
283 0.18
284 0.16
285 0.12
286 0.11
287 0.09
288 0.1
289 0.07
290 0.07
291 0.07
292 0.07
293 0.06
294 0.06
295 0.06
296 0.06
297 0.06
298 0.06
299 0.06
300 0.06
301 0.07
302 0.08
303 0.13
304 0.17
305 0.17
306 0.18
307 0.2
308 0.21
309 0.2
310 0.2
311 0.16
312 0.11
313 0.11
314 0.1
315 0.07
316 0.07
317 0.06
318 0.06
319 0.06
320 0.06
321 0.06
322 0.07
323 0.07
324 0.07
325 0.07
326 0.06
327 0.06
328 0.05
329 0.06
330 0.05
331 0.04
332 0.04
333 0.04
334 0.04
335 0.04
336 0.04
337 0.04
338 0.04
339 0.05
340 0.05
341 0.05
342 0.06
343 0.06
344 0.07
345 0.07
346 0.07
347 0.06
348 0.07
349 0.07
350 0.06
351 0.09
352 0.11
353 0.12
354 0.15
355 0.16
356 0.16
357 0.2
358 0.24
359 0.26
360 0.31
361 0.32
362 0.35
363 0.39
364 0.38
365 0.36
366 0.31
367 0.3
368 0.24
369 0.23
370 0.18
371 0.19
372 0.19
373 0.16
374 0.16
375 0.14
376 0.13
377 0.12
378 0.12
379 0.07
380 0.09
381 0.09
382 0.09
383 0.09
384 0.1
385 0.13
386 0.14
387 0.16
388 0.16
389 0.16
390 0.16
391 0.19
392 0.18
393 0.15
394 0.13
395 0.11
396 0.1
397 0.09
398 0.09
399 0.06
400 0.07
401 0.06
402 0.06
403 0.06
404 0.06
405 0.07
406 0.12
407 0.17
408 0.22
409 0.24
410 0.28
411 0.3
412 0.3
413 0.3
414 0.3
415 0.26
416 0.21
417 0.21
418 0.21
419 0.19
420 0.21
421 0.23
422 0.2
423 0.25
424 0.24
425 0.23
426 0.21
427 0.25
428 0.25
429 0.23
430 0.23
431 0.17
432 0.17
433 0.16
434 0.15
435 0.11
436 0.08
437 0.07
438 0.07
439 0.06
440 0.07
441 0.1
442 0.11
443 0.1
444 0.1
445 0.1
446 0.11
447 0.13
448 0.15
449 0.12
450 0.12
451 0.13
452 0.13
453 0.13
454 0.13
455 0.12
456 0.08
457 0.09
458 0.09
459 0.08
460 0.08
461 0.08
462 0.08
463 0.08
464 0.09
465 0.09
466 0.09
467 0.08
468 0.09
469 0.09
470 0.09
471 0.11
472 0.1
473 0.11
474 0.13
475 0.14
476 0.2
477 0.26
478 0.32
479 0.31
480 0.34
481 0.39
482 0.46
483 0.55
484 0.53
485 0.5
486 0.46
487 0.49
488 0.47
489 0.4
490 0.32
491 0.23
492 0.18
493 0.14
494 0.11
495 0.07
496 0.05
497 0.05
498 0.04
499 0.04
500 0.04
501 0.05
502 0.05
503 0.05
504 0.05
505 0.05
506 0.06
507 0.06
508 0.05
509 0.05
510 0.05
511 0.05
512 0.05
513 0.05
514 0.05
515 0.05
516 0.05
517 0.05
518 0.05
519 0.05
520 0.07
521 0.07
522 0.07
523 0.07
524 0.08
525 0.08
526 0.09
527 0.1
528 0.09
529 0.09
530 0.09
531 0.09
532 0.09
533 0.1
534 0.11
535 0.11
536 0.1
537 0.1
538 0.09
539 0.12
540 0.13
541 0.14
542 0.19
543 0.2
544 0.23
545 0.26
546 0.28
547 0.29
548 0.32
549 0.35
550 0.29
551 0.29
552 0.29
553 0.26
554 0.25
555 0.24
556 0.2
557 0.14
558 0.16
559 0.15
560 0.21
561 0.27
562 0.28
563 0.29
564 0.34
565 0.38
566 0.37
567 0.41
568 0.35
569 0.29
570 0.28
571 0.25
572 0.21
573 0.18
574 0.16
575 0.15
576 0.13
577 0.12
578 0.12
579 0.1
580 0.09
581 0.08
582 0.08
583 0.06
584 0.06
585 0.06
586 0.08
587 0.08
588 0.08
589 0.09
590 0.09
591 0.13
592 0.2
593 0.24
594 0.25
595 0.31
596 0.33
597 0.37
598 0.4
599 0.4
600 0.39
601 0.38
602 0.37
603 0.34
604 0.33
605 0.32
606 0.3
607 0.25
608 0.2
609 0.2
610 0.19
611 0.21
612 0.19
613 0.18
614 0.18
615 0.17
616 0.15
617 0.14
618 0.14
619 0.11
620 0.11
621 0.11
622 0.12
623 0.17
624 0.17
625 0.18
626 0.2
627 0.2
628 0.21
629 0.21
630 0.2
631 0.16
632 0.21
633 0.23
634 0.27
635 0.28
636 0.31
637 0.35
638 0.37
639 0.37
640 0.36
641 0.36
642 0.37
643 0.44
644 0.41
645 0.4
646 0.42
647 0.41
648 0.47
649 0.51
650 0.54
651 0.55
652 0.63
653 0.68
654 0.68
655 0.76
656 0.72
657 0.73
658 0.65
659 0.59
660 0.56
661 0.49
662 0.48
663 0.47
664 0.42
665 0.36
666 0.36
667 0.34
668 0.3
669 0.29
670 0.3
671 0.28
672 0.34
673 0.39
674 0.39
675 0.43
676 0.39
677 0.39
678 0.37
679 0.35
680 0.35
681 0.34
682 0.38
683 0.36
684 0.37
685 0.37
686 0.35
687 0.33
688 0.29
689 0.24
690 0.23
691 0.21
692 0.21
693 0.24
694 0.34
695 0.42
696 0.45
697 0.48
698 0.45
699 0.48
700 0.5
701 0.5
702 0.48
703 0.45
704 0.47
705 0.51
706 0.51
707 0.5
708 0.51
709 0.51
710 0.52
711 0.58
712 0.61
713 0.64
714 0.71
715 0.75
716 0.81
717 0.86
718 0.83
719 0.83
720 0.81
721 0.8
722 0.79
723 0.72
724 0.65
725 0.6
726 0.56
727 0.51
728 0.45
729 0.38
730 0.36
731 0.35
732 0.34
733 0.33
734 0.33
735 0.35
736 0.33
737 0.37
738 0.35
739 0.43
740 0.48
741 0.52
742 0.58