Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0B1PD92

Protein Details
Accession A0A0B1PD92    Localization Confidence High Confidence Score 16.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
42-64ILPGNITKRKGKARRSIGPQYSSHydrophilic
78-98FTNPPKDKSPKIVNNNQNSSIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
49-56KRKGKARR
332-335ARRK
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 12.5, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR025724  GAG-pre-integrase_dom  
IPR001584  Integrase_cat-core  
IPR012337  RNaseH-like_sf  
IPR036397  RNaseH_sf  
IPR013103  RVT_2  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003887  F:DNA-directed DNA polymerase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003964  F:RNA-directed DNA polymerase activity  
GO:0015074  P:DNA integration  
GO:0032196  P:transposition  
Pfam View protein in Pfam  
PF13976  gag_pre-integrs  
PF14223  Retrotran_gag_2  
PF07727  RVT_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50994  INTEGRASE  
CDD cd09272  RNase_HI_RT_Ty1  
Amino Acid Sequences MTMKLYSYFWIPEFPTQIYADDISQETIIEIEAAAEKEPEEILPGNITKRKGKARRSIGPQYSSEWAKSKESPDEFEFTNPPKDKSPKIVNNNQNSSIHDLENIPVHQRSNITRAQKPIESQYMYSFPKDITSLFHGIEKLDDSNWFIWKGNVQDNLDLCDLWDIVIGEEPRPHESEVEELRSWIRREKTARTIIKNAFGTNDYSQRFWSMRCEEGASVRLHVGEVRALHLELAELGITIERYLLAIVLYKSLPPSYDGLISTIFATDLDNVDPGYIARKIFEEEMCRIDRSEDANLATNIKCQNCHEIGHLKADCYSKGGGKEGQGPRQIARRKKEEAAQKHSVSQVAEDDAFHASHMATEKSSITENCNISGTTWSHDVWIADSGASSHIANQREITKFTPSNGILNVAGGLTATIEGTGELLIQGKIDGKHKNFKLLNVLYVPTNKQCLISCSKLDKAGGRLTYGNRPCRFYNRDGIMIAKGTLERNLYKIDVKAIIKNEDMANLVSTNVLSWNETHRRLGHISLTSLKMLFKRDHVDGIKIDEDEPIPKELSSESCIAAKSHKLPFPLLTTKRSKQFGDLTHTDVWGSPHVRQTPGGNQYFILFIDDYTRFITVKLYNRWPKEIKADNAAEYEGIRSWLKKYGIELRTSAPYSPQQNGVSERMNRTLLDLARAIRIEKNLPVCRLLHTLYGLKQSGREWINTLKKFLVEEAKYLQLPKQYGLFYRHESEGYGIIAVWVDDLFIVSTDSTRLNRTEDEIKKKWEATDQGEPKLLLGIHMEKDKETNSIKIHQEQYFARVLSIGSLMFAYIATRPDITYAINFLAQFNGKASQRHWNAIKNIFRYLKGTINECIIFDKSRHTEPQFTLTAYSDADNGKYVDRKSISGFVIVIAGGAIKWAAEKQRLITISTAESEYVAANLTGRNCLFLKDIMEDMNFLHDDPISLFMDSDGAIAITKNPENTRATIHIDKIYHWIRQHVESGTFSPESIPSKQNPADLFTKSLPKPLFEQHKLNIGVM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.3
3 0.28
4 0.29
5 0.27
6 0.26
7 0.21
8 0.2
9 0.19
10 0.17
11 0.16
12 0.15
13 0.12
14 0.1
15 0.1
16 0.07
17 0.06
18 0.06
19 0.08
20 0.09
21 0.09
22 0.1
23 0.1
24 0.1
25 0.11
26 0.1
27 0.11
28 0.11
29 0.12
30 0.16
31 0.18
32 0.23
33 0.28
34 0.32
35 0.35
36 0.42
37 0.52
38 0.57
39 0.65
40 0.69
41 0.74
42 0.8
43 0.83
44 0.86
45 0.84
46 0.8
47 0.72
48 0.65
49 0.62
50 0.55
51 0.49
52 0.44
53 0.39
54 0.39
55 0.41
56 0.42
57 0.45
58 0.46
59 0.48
60 0.46
61 0.46
62 0.42
63 0.41
64 0.42
65 0.36
66 0.43
67 0.4
68 0.39
69 0.44
70 0.49
71 0.5
72 0.54
73 0.61
74 0.61
75 0.68
76 0.76
77 0.77
78 0.81
79 0.82
80 0.77
81 0.68
82 0.61
83 0.58
84 0.5
85 0.41
86 0.33
87 0.27
88 0.24
89 0.27
90 0.25
91 0.22
92 0.21
93 0.22
94 0.22
95 0.25
96 0.27
97 0.29
98 0.34
99 0.38
100 0.41
101 0.46
102 0.49
103 0.49
104 0.49
105 0.5
106 0.51
107 0.47
108 0.44
109 0.42
110 0.43
111 0.41
112 0.39
113 0.33
114 0.25
115 0.25
116 0.24
117 0.2
118 0.18
119 0.21
120 0.23
121 0.23
122 0.25
123 0.23
124 0.23
125 0.23
126 0.21
127 0.16
128 0.14
129 0.15
130 0.16
131 0.17
132 0.2
133 0.2
134 0.18
135 0.18
136 0.21
137 0.24
138 0.27
139 0.32
140 0.31
141 0.34
142 0.34
143 0.37
144 0.34
145 0.28
146 0.22
147 0.17
148 0.15
149 0.11
150 0.12
151 0.08
152 0.08
153 0.12
154 0.13
155 0.12
156 0.15
157 0.17
158 0.18
159 0.2
160 0.2
161 0.17
162 0.17
163 0.23
164 0.26
165 0.29
166 0.27
167 0.25
168 0.28
169 0.32
170 0.33
171 0.33
172 0.32
173 0.34
174 0.39
175 0.46
176 0.53
177 0.58
178 0.64
179 0.64
180 0.69
181 0.65
182 0.67
183 0.61
184 0.52
185 0.44
186 0.37
187 0.35
188 0.3
189 0.33
190 0.27
191 0.26
192 0.26
193 0.28
194 0.28
195 0.24
196 0.29
197 0.26
198 0.27
199 0.27
200 0.3
201 0.27
202 0.29
203 0.32
204 0.25
205 0.22
206 0.2
207 0.19
208 0.16
209 0.16
210 0.14
211 0.11
212 0.11
213 0.12
214 0.12
215 0.12
216 0.12
217 0.11
218 0.1
219 0.07
220 0.07
221 0.05
222 0.04
223 0.04
224 0.05
225 0.05
226 0.04
227 0.04
228 0.04
229 0.04
230 0.04
231 0.04
232 0.04
233 0.07
234 0.07
235 0.09
236 0.09
237 0.1
238 0.11
239 0.11
240 0.12
241 0.11
242 0.12
243 0.12
244 0.15
245 0.14
246 0.15
247 0.15
248 0.15
249 0.13
250 0.11
251 0.09
252 0.07
253 0.07
254 0.07
255 0.07
256 0.07
257 0.07
258 0.07
259 0.07
260 0.07
261 0.07
262 0.09
263 0.1
264 0.09
265 0.1
266 0.11
267 0.12
268 0.15
269 0.18
270 0.19
271 0.19
272 0.24
273 0.25
274 0.25
275 0.23
276 0.22
277 0.22
278 0.21
279 0.21
280 0.19
281 0.18
282 0.21
283 0.21
284 0.23
285 0.2
286 0.21
287 0.22
288 0.21
289 0.21
290 0.19
291 0.26
292 0.25
293 0.26
294 0.27
295 0.29
296 0.3
297 0.36
298 0.35
299 0.28
300 0.3
301 0.3
302 0.26
303 0.23
304 0.22
305 0.17
306 0.18
307 0.21
308 0.19
309 0.19
310 0.28
311 0.31
312 0.36
313 0.37
314 0.37
315 0.36
316 0.43
317 0.48
318 0.46
319 0.48
320 0.49
321 0.5
322 0.52
323 0.57
324 0.58
325 0.6
326 0.61
327 0.62
328 0.56
329 0.54
330 0.51
331 0.47
332 0.37
333 0.29
334 0.21
335 0.15
336 0.14
337 0.12
338 0.11
339 0.1
340 0.1
341 0.09
342 0.08
343 0.06
344 0.07
345 0.09
346 0.09
347 0.07
348 0.09
349 0.09
350 0.1
351 0.12
352 0.12
353 0.14
354 0.19
355 0.2
356 0.2
357 0.2
358 0.19
359 0.18
360 0.21
361 0.18
362 0.14
363 0.15
364 0.14
365 0.14
366 0.15
367 0.14
368 0.11
369 0.12
370 0.1
371 0.08
372 0.08
373 0.07
374 0.07
375 0.08
376 0.07
377 0.09
378 0.14
379 0.15
380 0.16
381 0.17
382 0.21
383 0.22
384 0.24
385 0.22
386 0.24
387 0.23
388 0.24
389 0.29
390 0.24
391 0.24
392 0.23
393 0.23
394 0.16
395 0.16
396 0.15
397 0.08
398 0.07
399 0.05
400 0.05
401 0.03
402 0.03
403 0.03
404 0.02
405 0.02
406 0.03
407 0.03
408 0.03
409 0.03
410 0.03
411 0.04
412 0.04
413 0.04
414 0.04
415 0.07
416 0.08
417 0.13
418 0.18
419 0.2
420 0.29
421 0.29
422 0.38
423 0.37
424 0.37
425 0.42
426 0.37
427 0.37
428 0.3
429 0.3
430 0.22
431 0.23
432 0.23
433 0.15
434 0.16
435 0.14
436 0.14
437 0.14
438 0.17
439 0.2
440 0.22
441 0.24
442 0.25
443 0.26
444 0.26
445 0.27
446 0.25
447 0.23
448 0.24
449 0.21
450 0.2
451 0.21
452 0.21
453 0.28
454 0.32
455 0.37
456 0.34
457 0.37
458 0.37
459 0.43
460 0.46
461 0.41
462 0.44
463 0.38
464 0.39
465 0.35
466 0.35
467 0.28
468 0.23
469 0.2
470 0.12
471 0.1
472 0.08
473 0.09
474 0.1
475 0.1
476 0.11
477 0.12
478 0.12
479 0.13
480 0.13
481 0.13
482 0.16
483 0.16
484 0.18
485 0.19
486 0.2
487 0.19
488 0.2
489 0.18
490 0.14
491 0.14
492 0.11
493 0.1
494 0.08
495 0.08
496 0.06
497 0.06
498 0.05
499 0.05
500 0.05
501 0.05
502 0.05
503 0.11
504 0.16
505 0.17
506 0.19
507 0.19
508 0.21
509 0.22
510 0.23
511 0.21
512 0.18
513 0.18
514 0.19
515 0.19
516 0.17
517 0.16
518 0.16
519 0.13
520 0.15
521 0.15
522 0.15
523 0.17
524 0.18
525 0.23
526 0.23
527 0.23
528 0.21
529 0.23
530 0.22
531 0.18
532 0.18
533 0.13
534 0.13
535 0.12
536 0.12
537 0.11
538 0.1
539 0.09
540 0.1
541 0.09
542 0.11
543 0.12
544 0.12
545 0.11
546 0.12
547 0.13
548 0.13
549 0.14
550 0.14
551 0.16
552 0.2
553 0.22
554 0.22
555 0.23
556 0.24
557 0.28
558 0.34
559 0.33
560 0.33
561 0.38
562 0.4
563 0.45
564 0.47
565 0.42
566 0.38
567 0.41
568 0.4
569 0.41
570 0.39
571 0.37
572 0.35
573 0.34
574 0.3
575 0.24
576 0.21
577 0.17
578 0.16
579 0.14
580 0.18
581 0.2
582 0.2
583 0.2
584 0.22
585 0.26
586 0.32
587 0.31
588 0.27
589 0.25
590 0.25
591 0.24
592 0.21
593 0.16
594 0.08
595 0.07
596 0.11
597 0.11
598 0.11
599 0.11
600 0.12
601 0.1
602 0.1
603 0.14
604 0.15
605 0.22
606 0.26
607 0.35
608 0.41
609 0.43
610 0.49
611 0.48
612 0.46
613 0.47
614 0.49
615 0.42
616 0.42
617 0.42
618 0.37
619 0.36
620 0.33
621 0.25
622 0.18
623 0.16
624 0.09
625 0.1
626 0.09
627 0.09
628 0.1
629 0.16
630 0.17
631 0.17
632 0.2
633 0.28
634 0.31
635 0.32
636 0.32
637 0.29
638 0.32
639 0.32
640 0.28
641 0.21
642 0.23
643 0.24
644 0.24
645 0.27
646 0.24
647 0.25
648 0.29
649 0.29
650 0.29
651 0.29
652 0.3
653 0.28
654 0.28
655 0.25
656 0.24
657 0.25
658 0.21
659 0.2
660 0.19
661 0.17
662 0.18
663 0.19
664 0.18
665 0.15
666 0.17
667 0.16
668 0.18
669 0.26
670 0.27
671 0.28
672 0.29
673 0.28
674 0.29
675 0.31
676 0.28
677 0.21
678 0.2
679 0.22
680 0.22
681 0.26
682 0.24
683 0.21
684 0.21
685 0.2
686 0.24
687 0.23
688 0.22
689 0.2
690 0.27
691 0.37
692 0.36
693 0.38
694 0.32
695 0.32
696 0.31
697 0.31
698 0.31
699 0.22
700 0.23
701 0.24
702 0.26
703 0.26
704 0.26
705 0.25
706 0.21
707 0.21
708 0.2
709 0.21
710 0.2
711 0.23
712 0.28
713 0.29
714 0.29
715 0.31
716 0.31
717 0.27
718 0.27
719 0.24
720 0.2
721 0.16
722 0.13
723 0.09
724 0.08
725 0.07
726 0.07
727 0.06
728 0.04
729 0.03
730 0.03
731 0.03
732 0.03
733 0.04
734 0.04
735 0.04
736 0.05
737 0.06
738 0.08
739 0.09
740 0.12
741 0.13
742 0.15
743 0.16
744 0.2
745 0.29
746 0.34
747 0.42
748 0.44
749 0.48
750 0.49
751 0.5
752 0.47
753 0.44
754 0.42
755 0.4
756 0.46
757 0.46
758 0.44
759 0.45
760 0.43
761 0.36
762 0.33
763 0.26
764 0.16
765 0.15
766 0.15
767 0.16
768 0.19
769 0.19
770 0.17
771 0.19
772 0.19
773 0.22
774 0.21
775 0.23
776 0.24
777 0.31
778 0.34
779 0.39
780 0.45
781 0.41
782 0.43
783 0.39
784 0.4
785 0.37
786 0.33
787 0.26
788 0.21
789 0.19
790 0.15
791 0.15
792 0.11
793 0.07
794 0.07
795 0.06
796 0.06
797 0.06
798 0.05
799 0.06
800 0.07
801 0.08
802 0.09
803 0.09
804 0.1
805 0.11
806 0.12
807 0.11
808 0.12
809 0.12
810 0.14
811 0.14
812 0.13
813 0.15
814 0.14
815 0.14
816 0.13
817 0.18
818 0.18
819 0.2
820 0.22
821 0.29
822 0.32
823 0.39
824 0.42
825 0.44
826 0.49
827 0.55
828 0.6
829 0.53
830 0.57
831 0.53
832 0.49
833 0.45
834 0.41
835 0.4
836 0.35
837 0.36
838 0.3
839 0.32
840 0.31
841 0.28
842 0.28
843 0.23
844 0.22
845 0.19
846 0.25
847 0.24
848 0.29
849 0.35
850 0.37
851 0.42
852 0.43
853 0.49
854 0.43
855 0.4
856 0.37
857 0.32
858 0.29
859 0.22
860 0.21
861 0.17
862 0.15
863 0.15
864 0.15
865 0.14
866 0.16
867 0.2
868 0.2
869 0.25
870 0.26
871 0.28
872 0.3
873 0.35
874 0.33
875 0.3
876 0.29
877 0.22
878 0.21
879 0.18
880 0.14
881 0.08
882 0.07
883 0.05
884 0.05
885 0.04
886 0.03
887 0.04
888 0.07
889 0.12
890 0.16
891 0.19
892 0.21
893 0.28
894 0.29
895 0.31
896 0.29
897 0.27
898 0.25
899 0.25
900 0.24
901 0.17
902 0.16
903 0.15
904 0.13
905 0.11
906 0.09
907 0.07
908 0.07
909 0.1
910 0.1
911 0.14
912 0.14
913 0.17
914 0.17
915 0.19
916 0.2
917 0.2
918 0.21
919 0.2
920 0.21
921 0.2
922 0.2
923 0.19
924 0.17
925 0.19
926 0.16
927 0.14
928 0.14
929 0.11
930 0.12
931 0.12
932 0.16
933 0.13
934 0.13
935 0.13
936 0.12
937 0.12
938 0.12
939 0.11
940 0.07
941 0.06
942 0.06
943 0.06
944 0.08
945 0.12
946 0.14
947 0.19
948 0.2
949 0.25
950 0.29
951 0.3
952 0.34
953 0.34
954 0.4
955 0.4
956 0.42
957 0.43
958 0.4
959 0.4
960 0.43
961 0.42
962 0.4
963 0.37
964 0.4
965 0.38
966 0.41
967 0.44
968 0.39
969 0.39
970 0.36
971 0.37
972 0.35
973 0.32
974 0.28
975 0.25
976 0.25
977 0.26
978 0.27
979 0.3
980 0.28
981 0.37
982 0.39
983 0.43
984 0.4
985 0.41
986 0.42
987 0.39
988 0.42
989 0.37
990 0.43
991 0.39
992 0.45
993 0.41
994 0.39
995 0.41
996 0.45
997 0.52
998 0.49
999 0.56
1000 0.52
1001 0.59