FuNGI

A0A0B1P2D4

Protein Details

Accession

A0A0B1P2D4

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
2-22	LSSTCRKRKAESPKSIYSNKS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 19, mito 4, cyto 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR035426 Gemin2/Brr1
Gene Ontology	GO:0000387 P:spliceosomal snRNP assembly
Pfam	View protein in Pfam PF04938 SIP1

Amino Acid Sequences

MLSSTCRKRKAESPKSIYSNKSRNRPVIEGRVDPLHGQRSALPGLDGEFGLIGSDGELGEENKIDSKNALAYLTAVREEAIGIPTVLFAPKTSSKNDDQSLLDDLGDSTSRYEDGAYLSISSPVLETEREESSLEPSLFIISRYERLHADLHRTPPAGLVSKLKPYQRTHVGPLDKDLSRWWIGHLRNANPNPAQVASMDKITVLRLLGLLTQGSVLKTGLKSSSCLSLWIWSLLARLPDRGDLSSEEIAVVRGLGKKAISLGICIKEDPDWGVCLIEDETSNDSDIEESYSSDFLDFDELHQEKIIDDKTEIDRTKLSSSPSALDTQIELQTENINISQEQGEEHESLKGIIPVQGSIDNAKQDSSKDNSVDRALKNTGSDSASNDFLTAKARVLEHYCNVADQESANLKAGITLNTVSDDKCYSSALRWNAQATVDMILTIVGESYGQLDLLASRSPWTGVV

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.75
2	0.8
3	0.81
4	0.79
5	0.77
6	0.77
7	0.74
8	0.76
9	0.74
10	0.75
11	0.75
12	0.75
13	0.74
14	0.74
15	0.71
16	0.65
17	0.59
18	0.55
19	0.49
20	0.44
21	0.41
22	0.36
23	0.3
24	0.28
25	0.27
26	0.28
27	0.28
28	0.27
29	0.22
30	0.16
31	0.18
32	0.18
33	0.15
34	0.11
35	0.09
36	0.08
37	0.08
38	0.08
39	0.06
40	0.04
41	0.05
42	0.04
43	0.05
44	0.06
45	0.06
46	0.07
47	0.08
48	0.08
49	0.12
50	0.12
51	0.12
52	0.12
53	0.13
54	0.15
55	0.16
56	0.16
57	0.12
58	0.14
59	0.16
60	0.17
61	0.15
62	0.13
63	0.11
64	0.11
65	0.11
66	0.11
67	0.09
68	0.08
69	0.08
70	0.08
71	0.08
72	0.09
73	0.09
74	0.07
75	0.07
76	0.12
77	0.18
78	0.21
79	0.24
80	0.29
81	0.33
82	0.4
83	0.42
84	0.4
85	0.35
86	0.34
87	0.34
88	0.3
89	0.24
90	0.18
91	0.16
92	0.13
93	0.13
94	0.11
95	0.08
96	0.08
97	0.08
98	0.08
99	0.08
100	0.07
101	0.09
102	0.1
103	0.1
104	0.1
105	0.1
106	0.11
107	0.11
108	0.1
109	0.08
110	0.08
111	0.08
112	0.08
113	0.09
114	0.11
115	0.12
116	0.13
117	0.13
118	0.13
119	0.15
120	0.19
121	0.18
122	0.15
123	0.14
124	0.15
125	0.14
126	0.14
127	0.14
128	0.11
129	0.16
130	0.16
131	0.18
132	0.17
133	0.19
134	0.23
135	0.23
136	0.29
137	0.29
138	0.32
139	0.34
140	0.34
141	0.31
142	0.29
143	0.3
144	0.25
145	0.21
146	0.23
147	0.21
148	0.27
149	0.31
150	0.32
151	0.36
152	0.37
153	0.43
154	0.46
155	0.47
156	0.46
157	0.5
158	0.51
159	0.44
160	0.44
161	0.42
162	0.34
163	0.3
164	0.26
165	0.22
166	0.2
167	0.2
168	0.19
169	0.21
170	0.22
171	0.27
172	0.31
173	0.31
174	0.38
175	0.39
176	0.41
177	0.34
178	0.34
179	0.29
180	0.25
181	0.21
182	0.13
183	0.15
184	0.12
185	0.11
186	0.11
187	0.09
188	0.09
189	0.09
190	0.1
191	0.06
192	0.05
193	0.05
194	0.05
195	0.06
196	0.06
197	0.05
198	0.05
199	0.05
200	0.05
201	0.05
202	0.06
203	0.05
204	0.06
205	0.07
206	0.08
207	0.09
208	0.09
209	0.1
210	0.11
211	0.14
212	0.13
213	0.14
214	0.13
215	0.13
216	0.14
217	0.13
218	0.12
219	0.08
220	0.09
221	0.09
222	0.11
223	0.09
224	0.09
225	0.1
226	0.11
227	0.12
228	0.12
229	0.12
230	0.1
231	0.14
232	0.13
233	0.13
234	0.11
235	0.1
236	0.1
237	0.09
238	0.07
239	0.05
240	0.07
241	0.07
242	0.08
243	0.07
244	0.07
245	0.08
246	0.11
247	0.09
248	0.1
249	0.13
250	0.15
251	0.15
252	0.15
253	0.15
254	0.13
255	0.13
256	0.13
257	0.1
258	0.08
259	0.08
260	0.08
261	0.07
262	0.08
263	0.08
264	0.07
265	0.06
266	0.07
267	0.09
268	0.09
269	0.1
270	0.09
271	0.08
272	0.08
273	0.08
274	0.08
275	0.07
276	0.07
277	0.07
278	0.08
279	0.08
280	0.08
281	0.07
282	0.06
283	0.08
284	0.08
285	0.07
286	0.15
287	0.15
288	0.16
289	0.16
290	0.16
291	0.13
292	0.17
293	0.18
294	0.11
295	0.11
296	0.14
297	0.17
298	0.25
299	0.25
300	0.23
301	0.23
302	0.25
303	0.28
304	0.27
305	0.26
306	0.22
307	0.23
308	0.24
309	0.24
310	0.23
311	0.2
312	0.19
313	0.17
314	0.16
315	0.16
316	0.14
317	0.13
318	0.11
319	0.12
320	0.12
321	0.12
322	0.1
323	0.09
324	0.09
325	0.1
326	0.1
327	0.09
328	0.09
329	0.1
330	0.12
331	0.12
332	0.13
333	0.12
334	0.12
335	0.12
336	0.13
337	0.12
338	0.11
339	0.12
340	0.12
341	0.11
342	0.12
343	0.13
344	0.13
345	0.14
346	0.15
347	0.15
348	0.15
349	0.15
350	0.15
351	0.15
352	0.2
353	0.23
354	0.25
355	0.26
356	0.28
357	0.3
358	0.35
359	0.4
360	0.35
361	0.36
362	0.33
363	0.32
364	0.31
365	0.29
366	0.27
367	0.24
368	0.23
369	0.21
370	0.22
371	0.22
372	0.21
373	0.2
374	0.17
375	0.15
376	0.17
377	0.14
378	0.13
379	0.14
380	0.15
381	0.17
382	0.22
383	0.26
384	0.25
385	0.29
386	0.28
387	0.26
388	0.27
389	0.24
390	0.2
391	0.15
392	0.18
393	0.17
394	0.18
395	0.19
396	0.18
397	0.17
398	0.2
399	0.21
400	0.17
401	0.16
402	0.16
403	0.15
404	0.18
405	0.19
406	0.15
407	0.16
408	0.16
409	0.16
410	0.16
411	0.17
412	0.16
413	0.19
414	0.27
415	0.3
416	0.33
417	0.35
418	0.36
419	0.36
420	0.35
421	0.33
422	0.26
423	0.23
424	0.18
425	0.14
426	0.12
427	0.1
428	0.1
429	0.07
430	0.06
431	0.04
432	0.04
433	0.04
434	0.06
435	0.06
436	0.06
437	0.06
438	0.06
439	0.07
440	0.09
441	0.11
442	0.09
443	0.11
444	0.12

A0A0B1P2D4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer