Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q5KMU2

Protein Details
Accession Q5KMU2    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1019-1054EDGEGEGRKREKKPRKKKTKEGKKGRKVRSKSEVGTBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
1000-1049RAAIVEKRKRRKEGIADSGEDGEGEGRKREKKPRKKKTKEGKKGRKVRSK
1076-1093RKAKSTLAMLKAKRKARR
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 10, mito 6, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR031101  Ctr9  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR019734  TPR_repeat  
Gene Ontology GO:0016593  C:Cdc73/Paf1 complex  
GO:0000993  F:RNA polymerase II complex binding  
GO:0003746  F:translation elongation factor activity  
GO:0016570  P:histone modification  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
GO:0051569  P:regulation of histone H3-K4 methylation  
GO:0006368  P:transcription elongation by RNA polymerase II  
KEGG cne:CNB00490  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF13424  TPR_12  
PF13432  TPR_16  
PF13174  TPR_6  
PF13181  TPR_8  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50005  TPR  
CDD cd22249  UDM1_RNF168_RNF169-like  
Amino Acid Sequences MSNPARVILLVGKGGVQTDVDLDSLAQDEVADIIPVMLADYESECRDWTLIASEHWREGRWNRVMDLLERAVSFFNGERGRRRDSASLINIHSMLAHLHLHLARSAPKVILQNAKYDKLDPSIRTKDYHHREAAASLNAATEALRASGGSQEDEPVSLTMGKVIHYLATGQPGLAHPLVERLLQRQPNNLMALTAQARLQFARRSHLQALQTYQKLLTLAPEMSPDPRIGLGLCFWQLGDRAKARTAWERALEREPGSWVCLLLLGLASLNDARQPSIPRTERLKLETEGVGFVQKAFKLNNKSSASALALASVSGQGGQSQLPLASKLAERAVQYADNKRHAVLANSERGRLGFMAGDLADAGTYIAAVKKEDPNAVNIIAELTLGQMAIKSGNLREALNYIEQTAKRLNGQGPLEYTVLHACLLAYPHPGMSHDEVVRNRTLARNMLTEVHNLVASAETEADWAKLRGVGSDADVFVDLAKLWQGENVEKAIGAYQTALSIITDNDLDSAQEPGLDPPSFTALRLSDNLGALYHLEGNVETAERMYQEALQKIATQEGKEAETLKTVLAYNLGRAYEEGGDHAKAAQWYRDVLRQHPEHVESKVRLALIATSAGRHFDAHTLLKECLQSDENNLILRSVYTNFLITIGSYREAFAFTTQTLKVDKSDAWTFCALGWLHFTLGREAKSPQELAERPKQYLRSAEAYERALIIDPKCAMAAQGLAIALVEDSLALRGTNYGAEEGKVRARLAGQTLGIFGRIKDSLAEGAVNVNLGHCYFIRGEEEKAIESYMTASNAFDEKDVNVLLYLARAWYALANRESNFSAMNKALDYCQKAMHIHPADRAILYNIAMIQQKAAEMLFSLDCSKRTLEELTIALKQAQQAVDTFRSLADDRSGSLPYDAELADQRARYGEGLLRRAAGEMTKQEAYQGEALARVEEARRLRAEEQARIQAAEEARQAELRIKAEEIAEQRRKAREEAQAWQEELAARQAEEEARRAAIVEKRKRRKEGIADSGEDGEGEGRKREKKPRKKKTKEGKKGRKVRSKSEVGTTDEEEEARETGDDEDEETSRARKAKSTLAMLKAKRKARRADPDDDEEEDEDEVNQGQAKRGKQFKSKAYISDSDDENDEAPVSASRPGSEEPLHQKDDEREQSEAHTPAKSQNDEDSGMDVDQNGNDEDEDE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.13
3 0.1
4 0.08
5 0.09
6 0.1
7 0.09
8 0.09
9 0.08
10 0.08
11 0.09
12 0.09
13 0.07
14 0.06
15 0.06
16 0.07
17 0.07
18 0.07
19 0.05
20 0.05
21 0.05
22 0.05
23 0.06
24 0.05
25 0.04
26 0.05
27 0.08
28 0.1
29 0.12
30 0.13
31 0.13
32 0.14
33 0.14
34 0.14
35 0.13
36 0.16
37 0.16
38 0.19
39 0.25
40 0.26
41 0.31
42 0.32
43 0.32
44 0.33
45 0.37
46 0.43
47 0.44
48 0.45
49 0.41
50 0.45
51 0.46
52 0.42
53 0.43
54 0.36
55 0.31
56 0.28
57 0.27
58 0.22
59 0.2
60 0.2
61 0.14
62 0.19
63 0.23
64 0.27
65 0.35
66 0.39
67 0.46
68 0.47
69 0.51
70 0.5
71 0.49
72 0.55
73 0.52
74 0.53
75 0.48
76 0.48
77 0.43
78 0.37
79 0.31
80 0.22
81 0.16
82 0.12
83 0.11
84 0.09
85 0.13
86 0.14
87 0.15
88 0.16
89 0.18
90 0.21
91 0.23
92 0.25
93 0.21
94 0.24
95 0.28
96 0.33
97 0.39
98 0.35
99 0.42
100 0.45
101 0.49
102 0.46
103 0.43
104 0.4
105 0.38
106 0.43
107 0.37
108 0.41
109 0.45
110 0.46
111 0.47
112 0.5
113 0.54
114 0.56
115 0.61
116 0.55
117 0.5
118 0.49
119 0.49
120 0.49
121 0.41
122 0.33
123 0.24
124 0.21
125 0.18
126 0.17
127 0.13
128 0.09
129 0.06
130 0.06
131 0.06
132 0.05
133 0.06
134 0.1
135 0.11
136 0.12
137 0.12
138 0.14
139 0.14
140 0.15
141 0.15
142 0.12
143 0.12
144 0.11
145 0.1
146 0.11
147 0.11
148 0.11
149 0.11
150 0.11
151 0.1
152 0.1
153 0.12
154 0.11
155 0.14
156 0.14
157 0.13
158 0.14
159 0.14
160 0.18
161 0.17
162 0.16
163 0.11
164 0.15
165 0.16
166 0.17
167 0.18
168 0.17
169 0.25
170 0.32
171 0.33
172 0.36
173 0.39
174 0.41
175 0.42
176 0.38
177 0.31
178 0.24
179 0.26
180 0.21
181 0.18
182 0.15
183 0.14
184 0.15
185 0.16
186 0.19
187 0.22
188 0.21
189 0.27
190 0.3
191 0.35
192 0.38
193 0.43
194 0.43
195 0.41
196 0.45
197 0.46
198 0.44
199 0.39
200 0.35
201 0.3
202 0.27
203 0.23
204 0.19
205 0.14
206 0.14
207 0.13
208 0.15
209 0.15
210 0.16
211 0.17
212 0.15
213 0.13
214 0.12
215 0.13
216 0.11
217 0.11
218 0.1
219 0.12
220 0.12
221 0.11
222 0.11
223 0.11
224 0.14
225 0.16
226 0.21
227 0.22
228 0.24
229 0.25
230 0.28
231 0.31
232 0.37
233 0.37
234 0.36
235 0.39
236 0.4
237 0.42
238 0.44
239 0.43
240 0.36
241 0.32
242 0.31
243 0.25
244 0.24
245 0.2
246 0.16
247 0.13
248 0.12
249 0.11
250 0.08
251 0.07
252 0.05
253 0.05
254 0.05
255 0.05
256 0.05
257 0.05
258 0.07
259 0.07
260 0.08
261 0.11
262 0.15
263 0.18
264 0.28
265 0.31
266 0.34
267 0.4
268 0.45
269 0.46
270 0.47
271 0.48
272 0.39
273 0.39
274 0.36
275 0.3
276 0.25
277 0.21
278 0.19
279 0.14
280 0.14
281 0.13
282 0.12
283 0.13
284 0.14
285 0.2
286 0.27
287 0.3
288 0.39
289 0.39
290 0.4
291 0.39
292 0.39
293 0.34
294 0.28
295 0.25
296 0.16
297 0.13
298 0.11
299 0.11
300 0.08
301 0.07
302 0.05
303 0.05
304 0.04
305 0.05
306 0.05
307 0.05
308 0.06
309 0.07
310 0.07
311 0.08
312 0.08
313 0.09
314 0.1
315 0.11
316 0.12
317 0.14
318 0.14
319 0.15
320 0.17
321 0.19
322 0.22
323 0.29
324 0.33
325 0.35
326 0.35
327 0.33
328 0.35
329 0.32
330 0.3
331 0.3
332 0.3
333 0.34
334 0.35
335 0.35
336 0.31
337 0.3
338 0.29
339 0.22
340 0.17
341 0.08
342 0.07
343 0.08
344 0.08
345 0.08
346 0.06
347 0.06
348 0.05
349 0.04
350 0.04
351 0.02
352 0.03
353 0.03
354 0.05
355 0.05
356 0.06
357 0.09
358 0.12
359 0.15
360 0.19
361 0.19
362 0.2
363 0.22
364 0.21
365 0.19
366 0.15
367 0.14
368 0.1
369 0.09
370 0.06
371 0.04
372 0.04
373 0.04
374 0.04
375 0.03
376 0.04
377 0.04
378 0.05
379 0.05
380 0.06
381 0.09
382 0.11
383 0.11
384 0.11
385 0.12
386 0.13
387 0.14
388 0.14
389 0.11
390 0.15
391 0.15
392 0.17
393 0.18
394 0.17
395 0.17
396 0.2
397 0.21
398 0.22
399 0.23
400 0.23
401 0.22
402 0.24
403 0.23
404 0.2
405 0.18
406 0.13
407 0.12
408 0.1
409 0.08
410 0.06
411 0.06
412 0.07
413 0.07
414 0.08
415 0.08
416 0.08
417 0.09
418 0.1
419 0.12
420 0.14
421 0.17
422 0.17
423 0.22
424 0.22
425 0.25
426 0.24
427 0.22
428 0.2
429 0.19
430 0.2
431 0.18
432 0.19
433 0.18
434 0.19
435 0.22
436 0.22
437 0.2
438 0.18
439 0.15
440 0.13
441 0.11
442 0.1
443 0.07
444 0.07
445 0.06
446 0.05
447 0.05
448 0.05
449 0.06
450 0.06
451 0.06
452 0.06
453 0.06
454 0.08
455 0.08
456 0.08
457 0.09
458 0.09
459 0.1
460 0.11
461 0.1
462 0.09
463 0.09
464 0.08
465 0.07
466 0.07
467 0.05
468 0.04
469 0.04
470 0.04
471 0.04
472 0.06
473 0.07
474 0.08
475 0.09
476 0.1
477 0.09
478 0.09
479 0.09
480 0.08
481 0.07
482 0.06
483 0.06
484 0.05
485 0.05
486 0.05
487 0.05
488 0.04
489 0.05
490 0.04
491 0.05
492 0.05
493 0.05
494 0.05
495 0.05
496 0.05
497 0.05
498 0.06
499 0.05
500 0.05
501 0.06
502 0.06
503 0.09
504 0.09
505 0.08
506 0.08
507 0.12
508 0.12
509 0.11
510 0.13
511 0.1
512 0.12
513 0.13
514 0.14
515 0.12
516 0.12
517 0.12
518 0.1
519 0.1
520 0.08
521 0.08
522 0.06
523 0.05
524 0.05
525 0.04
526 0.05
527 0.05
528 0.05
529 0.04
530 0.04
531 0.04
532 0.04
533 0.05
534 0.05
535 0.08
536 0.1
537 0.11
538 0.11
539 0.12
540 0.12
541 0.12
542 0.16
543 0.14
544 0.12
545 0.12
546 0.13
547 0.13
548 0.13
549 0.14
550 0.11
551 0.11
552 0.11
553 0.09
554 0.09
555 0.09
556 0.08
557 0.09
558 0.09
559 0.09
560 0.1
561 0.1
562 0.09
563 0.09
564 0.1
565 0.08
566 0.08
567 0.08
568 0.08
569 0.08
570 0.08
571 0.08
572 0.08
573 0.08
574 0.09
575 0.09
576 0.08
577 0.1
578 0.11
579 0.16
580 0.16
581 0.17
582 0.23
583 0.23
584 0.25
585 0.26
586 0.27
587 0.25
588 0.26
589 0.28
590 0.21
591 0.22
592 0.21
593 0.18
594 0.15
595 0.13
596 0.12
597 0.08
598 0.09
599 0.08
600 0.07
601 0.07
602 0.08
603 0.08
604 0.08
605 0.08
606 0.07
607 0.1
608 0.11
609 0.13
610 0.14
611 0.14
612 0.16
613 0.16
614 0.15
615 0.14
616 0.14
617 0.13
618 0.13
619 0.14
620 0.14
621 0.14
622 0.13
623 0.11
624 0.1
625 0.1
626 0.09
627 0.08
628 0.08
629 0.08
630 0.08
631 0.08
632 0.08
633 0.08
634 0.07
635 0.07
636 0.07
637 0.07
638 0.07
639 0.07
640 0.07
641 0.08
642 0.08
643 0.08
644 0.08
645 0.07
646 0.1
647 0.1
648 0.11
649 0.12
650 0.12
651 0.12
652 0.12
653 0.13
654 0.14
655 0.19
656 0.19
657 0.2
658 0.2
659 0.19
660 0.17
661 0.21
662 0.17
663 0.12
664 0.13
665 0.11
666 0.11
667 0.12
668 0.13
669 0.12
670 0.14
671 0.14
672 0.14
673 0.15
674 0.16
675 0.17
676 0.16
677 0.14
678 0.19
679 0.21
680 0.25
681 0.32
682 0.32
683 0.32
684 0.35
685 0.36
686 0.31
687 0.33
688 0.31
689 0.27
690 0.28
691 0.28
692 0.28
693 0.27
694 0.25
695 0.21
696 0.18
697 0.14
698 0.14
699 0.12
700 0.12
701 0.11
702 0.11
703 0.11
704 0.11
705 0.1
706 0.08
707 0.08
708 0.05
709 0.06
710 0.05
711 0.05
712 0.05
713 0.05
714 0.04
715 0.03
716 0.03
717 0.02
718 0.02
719 0.03
720 0.03
721 0.03
722 0.03
723 0.04
724 0.04
725 0.05
726 0.05
727 0.06
728 0.07
729 0.07
730 0.09
731 0.1
732 0.12
733 0.13
734 0.12
735 0.12
736 0.12
737 0.14
738 0.15
739 0.16
740 0.14
741 0.13
742 0.13
743 0.13
744 0.13
745 0.12
746 0.09
747 0.09
748 0.09
749 0.09
750 0.08
751 0.09
752 0.09
753 0.09
754 0.09
755 0.06
756 0.07
757 0.07
758 0.07
759 0.06
760 0.05
761 0.05
762 0.05
763 0.06
764 0.05
765 0.07
766 0.07
767 0.09
768 0.12
769 0.14
770 0.15
771 0.16
772 0.17
773 0.16
774 0.16
775 0.15
776 0.11
777 0.09
778 0.11
779 0.09
780 0.09
781 0.09
782 0.08
783 0.09
784 0.1
785 0.1
786 0.08
787 0.08
788 0.07
789 0.09
790 0.09
791 0.08
792 0.07
793 0.07
794 0.06
795 0.06
796 0.06
797 0.04
798 0.04
799 0.04
800 0.04
801 0.06
802 0.08
803 0.12
804 0.15
805 0.17
806 0.18
807 0.2
808 0.21
809 0.19
810 0.19
811 0.15
812 0.16
813 0.14
814 0.14
815 0.12
816 0.12
817 0.14
818 0.17
819 0.2
820 0.18
821 0.18
822 0.2
823 0.21
824 0.22
825 0.29
826 0.29
827 0.27
828 0.29
829 0.3
830 0.29
831 0.27
832 0.27
833 0.18
834 0.16
835 0.14
836 0.12
837 0.1
838 0.11
839 0.12
840 0.11
841 0.1
842 0.09
843 0.09
844 0.09
845 0.08
846 0.06
847 0.05
848 0.07
849 0.07
850 0.07
851 0.1
852 0.11
853 0.12
854 0.14
855 0.14
856 0.13
857 0.15
858 0.17
859 0.15
860 0.17
861 0.17
862 0.18
863 0.19
864 0.18
865 0.17
866 0.16
867 0.16
868 0.16
869 0.15
870 0.13
871 0.13
872 0.17
873 0.18
874 0.17
875 0.17
876 0.13
877 0.16
878 0.16
879 0.16
880 0.14
881 0.13
882 0.14
883 0.16
884 0.17
885 0.15
886 0.15
887 0.13
888 0.11
889 0.12
890 0.1
891 0.09
892 0.1
893 0.13
894 0.15
895 0.15
896 0.15
897 0.14
898 0.15
899 0.14
900 0.15
901 0.16
902 0.18
903 0.21
904 0.22
905 0.22
906 0.21
907 0.21
908 0.2
909 0.17
910 0.15
911 0.14
912 0.18
913 0.18
914 0.18
915 0.19
916 0.19
917 0.2
918 0.18
919 0.16
920 0.12
921 0.13
922 0.13
923 0.12
924 0.12
925 0.1
926 0.1
927 0.14
928 0.16
929 0.18
930 0.19
931 0.23
932 0.24
933 0.31
934 0.35
935 0.36
936 0.39
937 0.42
938 0.41
939 0.37
940 0.37
941 0.33
942 0.29
943 0.26
944 0.23
945 0.18
946 0.18
947 0.18
948 0.18
949 0.18
950 0.22
951 0.2
952 0.2
953 0.19
954 0.2
955 0.2
956 0.24
957 0.24
958 0.31
959 0.35
960 0.37
961 0.41
962 0.46
963 0.48
964 0.47
965 0.48
966 0.48
967 0.47
968 0.51
969 0.54
970 0.52
971 0.5
972 0.47
973 0.41
974 0.32
975 0.28
976 0.23
977 0.16
978 0.12
979 0.12
980 0.13
981 0.16
982 0.17
983 0.19
984 0.16
985 0.16
986 0.16
987 0.17
988 0.2
989 0.23
990 0.31
991 0.39
992 0.48
993 0.59
994 0.67
995 0.74
996 0.75
997 0.79
998 0.79
999 0.79
1000 0.79
1001 0.74
1002 0.68
1003 0.63
1004 0.58
1005 0.48
1006 0.37
1007 0.26
1008 0.18
1009 0.14
1010 0.13
1011 0.15
1012 0.2
1013 0.27
1014 0.35
1015 0.45
1016 0.55
1017 0.64
1018 0.74
1019 0.81
1020 0.87
1021 0.91
1022 0.95
1023 0.96
1024 0.96
1025 0.96
1026 0.96
1027 0.96
1028 0.95
1029 0.95
1030 0.95
1031 0.94
1032 0.89
1033 0.88
1034 0.86
1035 0.84
1036 0.77
1037 0.76
1038 0.7
1039 0.65
1040 0.62
1041 0.54
1042 0.47
1043 0.39
1044 0.35
1045 0.27
1046 0.22
1047 0.18
1048 0.14
1049 0.11
1050 0.1
1051 0.1
1052 0.11
1053 0.11
1054 0.11
1055 0.13
1056 0.13
1057 0.14
1058 0.14
1059 0.14
1060 0.17
1061 0.21
1062 0.21
1063 0.24
1064 0.28
1065 0.36
1066 0.41
1067 0.49
1068 0.53
1069 0.56
1070 0.64
1071 0.64
1072 0.7
1073 0.69
1074 0.7
1075 0.69
1076 0.7
1077 0.71
1078 0.73
1079 0.79
1080 0.77
1081 0.78
1082 0.77
1083 0.76
1084 0.72
1085 0.65
1086 0.57
1087 0.47
1088 0.41
1089 0.31
1090 0.24
1091 0.17
1092 0.14
1093 0.11
1094 0.09
1095 0.12
1096 0.12
1097 0.17
1098 0.23
1099 0.27
1100 0.35
1101 0.43
1102 0.5
1103 0.56
1104 0.64
1105 0.67
1106 0.71
1107 0.71
1108 0.68
1109 0.67
1110 0.66
1111 0.62
1112 0.59
1113 0.52
1114 0.44
1115 0.41
1116 0.36
1117 0.29
1118 0.24
1119 0.19
1120 0.13
1121 0.12
1122 0.11
1123 0.11
1124 0.14
1125 0.14
1126 0.14
1127 0.17
1128 0.18
1129 0.22
1130 0.24
1131 0.3
1132 0.35
1133 0.42
1134 0.44
1135 0.42
1136 0.45
1137 0.46
1138 0.54
1139 0.55
1140 0.49
1141 0.44
1142 0.42
1143 0.45
1144 0.47
1145 0.45
1146 0.37
1147 0.3
1148 0.28
1149 0.34
1150 0.41
1151 0.4
1152 0.36
1153 0.38
1154 0.4
1155 0.4
1156 0.4
1157 0.35
1158 0.29
1159 0.26
1160 0.24
1161 0.18
1162 0.15
1163 0.13
1164 0.15
1165 0.13
1166 0.11