Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

Q5KMU2

Protein Details
Accession Q5KMU2    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1019-1054EDGEGEGRKREKKPRKKKTKEGKKGRKVRSKSEVGTBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
1000-1049RAAIVEKRKRRKEGIADSGEDGEGEGRKREKKPRKKKTKEGKKGRKVRSK
1076-1093RKAKSTLAMLKAKRKARR
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 10, mito 6, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR031101  Ctr9  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR019734  TPR_repeat  
Gene Ontology GO:0016593  C:Cdc73/Paf1 complex  
GO:0000993  F:RNA polymerase II complex binding  
GO:0003746  F:translation elongation factor activity  
GO:0016570  P:histone modification  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
GO:0051569  P:regulation of histone H3-K4 methylation  
GO:0006368  P:transcription elongation by RNA polymerase II  
KEGG cne:CNB00490  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF13424  TPR_12  
PF13432  TPR_16  
PF13174  TPR_6  
PF13181  TPR_8  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50005  TPR  
CDD cd22249  UDM1_RNF168_RNF169-like  
Amino Acid Sequences MSNPARVILLVGKGGVQTDVDLDSLAQDEVADIIPVMLADYESECRDWTLIASEHWREGRWNRVMDLLERAVSFFNGERGRRRDSASLINIHSMLAHLHLHLARSAPKVILQNAKYDKLDPSIRTKDYHHREAAASLNAATEALRASGGSQEDEPVSLTMGKVIHYLATGQPGLAHPLVERLLQRQPNNLMALTAQARLQFARRSHLQALQTYQKLLTLAPEMSPDPRIGLGLCFWQLGDRAKARTAWERALEREPGSWVCLLLLGLASLNDARQPSIPRTERLKLETEGVGFVQKAFKLNNKSSASALALASVSGQGGQSQLPLASKLAERAVQYADNKRHAVLANSERGRLGFMAGDLADAGTYIAAVKKEDPNAVNIIAELTLGQMAIKSGNLREALNYIEQTAKRLNGQGPLEYTVLHACLLAYPHPGMSHDEVVRNRTLARNMLTEVHNLVASAETEADWAKLRGVGSDADVFVDLAKLWQGENVEKAIGAYQTALSIITDNDLDSAQEPGLDPPSFTALRLSDNLGALYHLEGNVETAERMYQEALQKIATQEGKEAETLKTVLAYNLGRAYEEGGDHAKAAQWYRDVLRQHPEHVESKVRLALIATSAGRHFDAHTLLKECLQSDENNLILRSVYTNFLITIGSYREAFAFTTQTLKVDKSDAWTFCALGWLHFTLGREAKSPQELAERPKQYLRSAEAYERALIIDPKCAMAAQGLAIALVEDSLALRGTNYGAEEGKVRARLAGQTLGIFGRIKDSLAEGAVNVNLGHCYFIRGEEEKAIESYMTASNAFDEKDVNVLLYLARAWYALANRESNFSAMNKALDYCQKAMHIHPADRAILYNIAMIQQKAAEMLFSLDCSKRTLEELTIALKQAQQAVDTFRSLADDRSGSLPYDAELADQRARYGEGLLRRAAGEMTKQEAYQGEALARVEEARRLRAEEQARIQAAEEARQAELRIKAEEIAEQRRKAREEAQAWQEELAARQAEEEARRAAIVEKRKRRKEGIADSGEDGEGEGRKREKKPRKKKTKEGKKGRKVRSKSEVGTTDEEEEARETGDDEDEETSRARKAKSTLAMLKAKRKARRADPDDDEEEDEDEVNQGQAKRGKQFKSKAYISDSDDENDEAPVSASRPGSEEPLHQKDDEREQSEAHTPAKSQNDEDSGMDVDQNGNDEDEDE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.13
3 0.1
4 0.08
5 0.09
6 0.1
7 0.09
8 0.09
9 0.08
10 0.08
11 0.09
12 0.09
13 0.07
14 0.06
15 0.06
16 0.07
17 0.07
18 0.07
19 0.05
20 0.05
21 0.05
22 0.05
23 0.06
24 0.05
25 0.04
26 0.05
27 0.08
28 0.1
29 0.12
30 0.13
31 0.13
32 0.14
33 0.14
34 0.14
35 0.13
36 0.16
37 0.16
38 0.19
39 0.25
40 0.26
41 0.31
42 0.32
43 0.32
44 0.33
45 0.37
46 0.43
47 0.44
48 0.45
49 0.41
50 0.45
51 0.46
52 0.42
53 0.43
54 0.36
55 0.31
56 0.28
57 0.27
58 0.22
59 0.2
60 0.2
61 0.14
62 0.19
63 0.23
64 0.27
65 0.35
66 0.39
67 0.46
68 0.47
69 0.51
70 0.5
71 0.49
72 0.55
73 0.52
74 0.53
75 0.48
76 0.48
77 0.43
78 0.37
79 0.31
80 0.22
81 0.16
82 0.12
83 0.11
84 0.09
85 0.13
86 0.14
87 0.15
88 0.16
89 0.18
90 0.21
91 0.23
92 0.25
93 0.21
94 0.24
95 0.28
96 0.33
97 0.39
98 0.35
99 0.42
100 0.45
101 0.49
102 0.46
103 0.43
104 0.4
105 0.38
106 0.43
107 0.37
108 0.41
109 0.45
110 0.46
111 0.47
112 0.5
113 0.54
114 0.56
115 0.61
116 0.55
117 0.5
118 0.49
119 0.49
120 0.49
121 0.41
122 0.33
123 0.24
124 0.21
125 0.18
126 0.17
127 0.13
128 0.09
129 0.06
130 0.06
131 0.06
132 0.05
133 0.06
134 0.1
135 0.11
136 0.12
137 0.12
138 0.14
139 0.14
140 0.15
141 0.15
142 0.12
143 0.12
144 0.11
145 0.1
146 0.11
147 0.11
148 0.11
149 0.11
150 0.11
151 0.1
152 0.1
153 0.12
154 0.11
155 0.14
156 0.14
157 0.13
158 0.14
159 0.14
160 0.18
161 0.17
162 0.16
163 0.11
164 0.15
165 0.16
166 0.17
167 0.18
168 0.17
169 0.25
170 0.32
171 0.33
172 0.36
173 0.39
174 0.41
175 0.42
176 0.38
177 0.31
178 0.24
179 0.26
180 0.21
181 0.18
182 0.15
183 0.14
184 0.15
185 0.16
186 0.19
187 0.22
188 0.21
189 0.27
190 0.3
191 0.35
192 0.38
193 0.43
194 0.43
195 0.41
196 0.45
197 0.46
198 0.44
199 0.39
200 0.35
201 0.3
202 0.27
203 0.23
204 0.19
205 0.14
206 0.14
207 0.13
208 0.15
209 0.15
210 0.16
211 0.17
212 0.15
213 0.13
214 0.12
215 0.13
216 0.11
217 0.11
218 0.1
219 0.12
220 0.12
221 0.11
222 0.11
223 0.11
224 0.14
225 0.16
226 0.21
227 0.22
228 0.24
229 0.25
230 0.28
231 0.31
232 0.37
233 0.37
234 0.36
235 0.39
236 0.4
237 0.42
238 0.44
239 0.43
240 0.36
241 0.32
242 0.31
243 0.25
244 0.24
245 0.2
246 0.16
247 0.13
248 0.12
249 0.11
250 0.08
251 0.07
252 0.05
253 0.05
254 0.05
255 0.05
256 0.05
257 0.05
258 0.07
259 0.07
260 0.08
261 0.11
262 0.15
263 0.18
264 0.28
265 0.31
266 0.34
267 0.4
268 0.45
269 0.46
270 0.47
271 0.48
272 0.39
273 0.39
274 0.36
275 0.3
276 0.25
277 0.21
278 0.19
279 0.14
280 0.14
281 0.13
282 0.12
283 0.13
284 0.14
285 0.2
286 0.27
287 0.3
288 0.39
289 0.39
290 0.4
291 0.39
292 0.39
293 0.34
294 0.28
295 0.25
296 0.16
297 0.13
298 0.11
299 0.11
300 0.08
301 0.07
302 0.05
303 0.05
304 0.04
305 0.05
306 0.05
307 0.05
308 0.06
309 0.07
310 0.07
311 0.08
312 0.08
313 0.09
314 0.1
315 0.11
316 0.12
317 0.14
318 0.14
319 0.15
320 0.17
321 0.19
322 0.22
323 0.29
324 0.33
325 0.35
326 0.35
327 0.33
328 0.35
329 0.32
330 0.3
331 0.3
332 0.3
333 0.34
334 0.35
335 0.35
336 0.31
337 0.3
338 0.29
339 0.22
340 0.17
341 0.08
342 0.07
343 0.08
344 0.08
345 0.08
346 0.06
347 0.06
348 0.05
349 0.04
350 0.04
351 0.02
352 0.03
353 0.03
354 0.05
355 0.05
356 0.06
357 0.09
358 0.12
359 0.15
360 0.19
361 0.19
362 0.2
363 0.22
364 0.21
365 0.19
366 0.15
367 0.14
368 0.1
369 0.09
370 0.06
371 0.04
372 0.04
373 0.04
374 0.04
375 0.03
376 0.04
377 0.04
378 0.05
379 0.05
380 0.06
381 0.09
382 0.11
383 0.11
384 0.11
385 0.12
386 0.13
387 0.14
388 0.14
389 0.11
390 0.15
391 0.15
392 0.17
393 0.18
394 0.17
395 0.17
396 0.2
397 0.21
398 0.22
399 0.23
400 0.23
401 0.22
402 0.24
403 0.23
404 0.2
405 0.18
406 0.13
407 0.12
408 0.1
409 0.08
410 0.06
411 0.06
412 0.07
413 0.07
414 0.08
415 0.08
416 0.08
417 0.09
418 0.1
419 0.12
420 0.14
421 0.17
422 0.17
423 0.22
424 0.22
425 0.25
426 0.24
427 0.22
428 0.2
429 0.19
430 0.2
431 0.18
432 0.19
433 0.18
434 0.19
435 0.22
436 0.22
437 0.2
438 0.18
439 0.15
440 0.13
441 0.11
442 0.1
443 0.07
444 0.07
445 0.06
446 0.05
447 0.05
448 0.05
449 0.06
450 0.06
451 0.06
452 0.06
453 0.06
454 0.08
455 0.08
456 0.08
457 0.09
458 0.09
459 0.1
460 0.11
461 0.1
462 0.09
463 0.09
464 0.08
465 0.07
466 0.07
467 0.05
468 0.04
469 0.04
470 0.04
471 0.04
472 0.06
473 0.07
474 0.08
475 0.09
476 0.1
477 0.09
478 0.09
479 0.09
480 0.08
481 0.07
482 0.06
483 0.06
484 0.05
485 0.05
486 0.05
487 0.05
488 0.04
489 0.05
490 0.04
491 0.05
492 0.05
493 0.05
494 0.05
495 0.05
496 0.05
497 0.05
498 0.06
499 0.05
500 0.05
501 0.06
502 0.06
503 0.09
504 0.09
505 0.08
506 0.08
507 0.12
508 0.12
509 0.11
510 0.13
511 0.1
512 0.12
513 0.13
514 0.14
515 0.12
516 0.12
517 0.12
518 0.1
519 0.1
520 0.08
521 0.08
522 0.06
523 0.05
524 0.05
525 0.04
526 0.05
527 0.05
528 0.05
529 0.04
530 0.04
531 0.04
532 0.04
533 0.05
534 0.05
535 0.08
536 0.1
537 0.11
538 0.11
539 0.12
540 0.12
541 0.12
542 0.16
543 0.14
544 0.12
545 0.12
546 0.13
547 0.13
548 0.13
549 0.14
550 0.11
551 0.11
552 0.11
553 0.09
554 0.09
555 0.09
556 0.08
557 0.09
558 0.09
559 0.09
560 0.1
561 0.1
562 0.09
563 0.09
564 0.1
565 0.08
566 0.08
567 0.08
568 0.08
569 0.08
570 0.08
571 0.08
572 0.08
573 0.08
574 0.09
575 0.09
576 0.08
577 0.1
578 0.11
579 0.16
580 0.16
581 0.17
582 0.23
583 0.23
584 0.25
585 0.26
586 0.27
587 0.25
588 0.26
589 0.28
590 0.21
591 0.22
592 0.21
593 0.18
594 0.15
595 0.13
596 0.12
597 0.08
598 0.09
599 0.08
600 0.07
601 0.07
602 0.08
603 0.08
604 0.08
605 0.08
606 0.07
607 0.1
608 0.11
609 0.13
610 0.14
611 0.14
612 0.16
613 0.16
614 0.15
615 0.14
616 0.14
617 0.13
618 0.13
619 0.14
620 0.14
621 0.14
622 0.13
623 0.11
624 0.1
625 0.1
626 0.09
627 0.08
628 0.08
629 0.08
630 0.08
631 0.08
632 0.08
633 0.08
634 0.07
635 0.07
636 0.07
637 0.07
638 0.07
639 0.07
640 0.07
641 0.08
642 0.08
643 0.08
644 0.08
645 0.07
646 0.1
647 0.1
648 0.11
649 0.12
650 0.12
651 0.12
652 0.12
653 0.13
654 0.14
655 0.19
656 0.19
657 0.2
658 0.2
659 0.19
660 0.17
661 0.21
662 0.17
663 0.12
664 0.13
665 0.11
666 0.11
667 0.12
668 0.13
669 0.12
670 0.14
671 0.14
672 0.14
673 0.15
674 0.16
675 0.17
676 0.16
677 0.14
678 0.19
679 0.21
680 0.25
681 0.32
682 0.32
683 0.32
684 0.35
685 0.36
686 0.31
687 0.33
688 0.31
689 0.27
690 0.28
691 0.28
692 0.28
693 0.27
694 0.25
695 0.21
696 0.18
697 0.14
698 0.14
699 0.12
700 0.12
701 0.11
702 0.11
703 0.11
704 0.11
705 0.1
706 0.08
707 0.08
708 0.05
709 0.06
710 0.05
711 0.05
712 0.05
713 0.05
714 0.04
715 0.03
716 0.03
717 0.02
718 0.02
719 0.03
720 0.03
721 0.03
722 0.03
723 0.04
724 0.04
725 0.05
726 0.05
727 0.06
728 0.07
729 0.07
730 0.09
731 0.1
732 0.12
733 0.13
734 0.12
735 0.12
736 0.12
737 0.14
738 0.15
739 0.16
740 0.14
741 0.13
742 0.13
743 0.13
744 0.13
745 0.12
746 0.09
747 0.09
748 0.09
749 0.09
750 0.08
751 0.09
752 0.09
753 0.09
754 0.09
755 0.06
756 0.07
757 0.07
758 0.07
759 0.06
760 0.05
761 0.05
762 0.05
763 0.06
764 0.05
765 0.07
766 0.07
767 0.09
768 0.12
769 0.14
770 0.15
771 0.16
772 0.17
773 0.16
774 0.16
775 0.15
776 0.11
777 0.09
778 0.11
779 0.09
780 0.09
781 0.09
782 0.08
783 0.09
784 0.1
785 0.1
786 0.08
787 0.08
788 0.07
789 0.09
790 0.09
791 0.08
792 0.07
793 0.07
794 0.06
795 0.06
796 0.06
797 0.04
798 0.04
799 0.04
800 0.04
801 0.06
802 0.08
803 0.12
804 0.15
805 0.17
806 0.18
807 0.2
808 0.21
809 0.19
810 0.19
811 0.15
812 0.16
813 0.14
814 0.14
815 0.12
816 0.12
817 0.14
818 0.17
819 0.2
820 0.18
821 0.18
822 0.2
823 0.21
824 0.22
825 0.29
826 0.29
827 0.27
828 0.29
829 0.3
830 0.29
831 0.27
832 0.27
833 0.18
834 0.16
835 0.14
836 0.12
837 0.1
838 0.11
839 0.12
840 0.11
841 0.1
842 0.09
843 0.09
844 0.09
845 0.08
846 0.06
847 0.05
848 0.07
849 0.07
850 0.07
851 0.1
852 0.11
853 0.12
854 0.14
855 0.14
856 0.13
857 0.15
858 0.17
859 0.15
860 0.17
861 0.17
862 0.18
863 0.19
864 0.18
865 0.17
866 0.16
867 0.16
868 0.16
869 0.15
870 0.13
871 0.13
872 0.17
873 0.18
874 0.17
875 0.17
876 0.13
877 0.16
878 0.16
879 0.16
880 0.14
881 0.13
882 0.14
883 0.16
884 0.17
885 0.15
886 0.15
887 0.13
888 0.11
889 0.12
890 0.1
891 0.09
892 0.1
893 0.13
894 0.15
895 0.15
896 0.15
897 0.14
898 0.15
899 0.14
900 0.15
901 0.16
902 0.18
903 0.21
904 0.22
905 0.22
906 0.21
907 0.21
908 0.2
909 0.17
910 0.15
911 0.14
912 0.18
913 0.18
914 0.18
915 0.19
916 0.19
917 0.2
918 0.18
919 0.16
920 0.12
921 0.13
922 0.13
923 0.12
924 0.12
925 0.1
926 0.1
927 0.14
928 0.16
929 0.18
930 0.19
931 0.23
932 0.24
933 0.31
934 0.35
935 0.36
936 0.39
937 0.42
938 0.41
939 0.37
940 0.37
941 0.33
942 0.29
943 0.26
944 0.23
945 0.18
946 0.18
947 0.18
948 0.18
949 0.18
950 0.22
951 0.2
952 0.2
953 0.19
954 0.2
955 0.2
956 0.24
957 0.24
958 0.31
959 0.35
960 0.37
961 0.41
962 0.46
963 0.48
964 0.47
965 0.48
966 0.48
967 0.47
968 0.51
969 0.54
970 0.52
971 0.5
972 0.47
973 0.41
974 0.32
975 0.28
976 0.23
977 0.16
978 0.12
979 0.12
980 0.13
981 0.16
982 0.17
983 0.19
984 0.16
985 0.16
986 0.16
987 0.17
988 0.2
989 0.23
990 0.31
991 0.39
992 0.48
993 0.59
994 0.67
995 0.74
996 0.75
997 0.79
998 0.79
999 0.79
1000 0.79
1001 0.74
1002 0.68
1003 0.63
1004 0.58
1005 0.48
1006 0.37
1007 0.26
1008 0.18
1009 0.14
1010 0.13
1011 0.15
1012 0.2
1013 0.27
1014 0.35
1015 0.45
1016 0.55
1017 0.64
1018 0.74
1019 0.81
1020 0.87
1021 0.91
1022 0.95
1023 0.96
1024 0.96
1025 0.96
1026 0.96
1027 0.96
1028 0.95
1029 0.95
1030 0.95
1031 0.94
1032 0.89
1033 0.88
1034 0.86
1035 0.84
1036 0.77
1037 0.76
1038 0.7
1039 0.65
1040 0.62
1041 0.54
1042 0.47
1043 0.39
1044 0.35
1045 0.27
1046 0.22
1047 0.18
1048 0.14
1049 0.11
1050 0.1
1051 0.1
1052 0.11
1053 0.11
1054 0.11
1055 0.13
1056 0.13
1057 0.14
1058 0.14
1059 0.14
1060 0.17
1061 0.21
1062 0.21
1063 0.24
1064 0.28
1065 0.36
1066 0.41
1067 0.49
1068 0.53
1069 0.56
1070 0.64
1071 0.64
1072 0.7
1073 0.69
1074 0.7
1075 0.69
1076 0.7
1077 0.71
1078 0.73
1079 0.79
1080 0.77
1081 0.78
1082 0.77
1083 0.76
1084 0.72
1085 0.65
1086 0.57
1087 0.47
1088 0.41
1089 0.31
1090 0.24
1091 0.17
1092 0.14
1093 0.11
1094 0.09
1095 0.12
1096 0.12
1097 0.17
1098 0.23
1099 0.27
1100 0.35
1101 0.43
1102 0.5
1103 0.56
1104 0.64
1105 0.67
1106 0.71
1107 0.71
1108 0.68
1109 0.67
1110 0.66
1111 0.62
1112 0.59
1113 0.52
1114 0.44
1115 0.41
1116 0.36
1117 0.29
1118 0.24
1119 0.19
1120 0.13
1121 0.12
1122 0.11
1123 0.11
1124 0.14
1125 0.14
1126 0.14
1127 0.17
1128 0.18
1129 0.22
1130 0.24
1131 0.3
1132 0.35
1133 0.42
1134 0.44
1135 0.42
1136 0.45
1137 0.46
1138 0.54
1139 0.55
1140 0.49
1141 0.44
1142 0.42
1143 0.45
1144 0.47
1145 0.45
1146 0.37
1147 0.3
1148 0.28
1149 0.34
1150 0.41
1151 0.4
1152 0.36
1153 0.38
1154 0.4
1155 0.4
1156 0.4
1157 0.35
1158 0.29
1159 0.26
1160 0.24
1161 0.18
1162 0.15
1163 0.13
1164 0.15
1165 0.13
1166 0.11