Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0B1P3Y5

Protein Details
Accession A0A0B1P3Y5    Localization Confidence High Confidence Score 21.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
76-115RSLKASKRKRTDAIARKPKDARRGRKKRLRRENDDDPDGIBasic
168-190MDAALKQPSKRRRKKDEVDLEEAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
79-106KASKRKRTDAIARKPKDARRGRKKRLRR
159-182KRRRALDKAMDAALKQPSKRRRKK
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035441  TFIIS/LEDGF_dom_sf  
IPR017923  TFIIS_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003746  F:translation elongation factor activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF08711  Med26  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51319  TFIIS_N  
Amino Acid Sequences MSDSEPRVASRNSEERYNDPEKNTSNIEPDKDLETSHSDNESELSEVDEAEFAEFDPTTVALDDRPLVDIDEDVARSLKASKRKRTDAIARKPKDARRGRKKRLRRENDDDPDGIVLNGERIRKSKSGKYNRELQSGDRNKERRPLSPENEENLTPDEKRRRALDKAMDAALKQPSKRRRKKDEVDLEEAFDDEIAALKLRMEQACEADNSARERSQPAIHKLKMLPEVIALLNRNTVQHSIVDPDTNFLQSVKFFLEPLNDGSLPAYNIQRDIFSALTKLPIEKEALLSSGIGKVILYYTKSKKPEIEIKRTAERLLGEWSRPIMKRSDDYRKRQVVTKEFDHHAAQLALRPSGLTGSQVSSSQGIRLAQREIERERILAQPTGGNRARIERSNSSYTVAPKSTFDPSRGLDPSSRPIGAGGIEAFRKMTAKQGRKRN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.48
2 0.47
3 0.54
4 0.57
5 0.54
6 0.48
7 0.53
8 0.48
9 0.49
10 0.5
11 0.45
12 0.45
13 0.45
14 0.45
15 0.4
16 0.39
17 0.38
18 0.33
19 0.31
20 0.26
21 0.27
22 0.27
23 0.27
24 0.27
25 0.23
26 0.23
27 0.24
28 0.22
29 0.16
30 0.14
31 0.13
32 0.11
33 0.11
34 0.11
35 0.1
36 0.09
37 0.08
38 0.08
39 0.07
40 0.08
41 0.08
42 0.07
43 0.08
44 0.07
45 0.08
46 0.08
47 0.08
48 0.07
49 0.09
50 0.1
51 0.1
52 0.11
53 0.11
54 0.11
55 0.11
56 0.1
57 0.11
58 0.12
59 0.11
60 0.11
61 0.11
62 0.1
63 0.1
64 0.16
65 0.19
66 0.26
67 0.36
68 0.46
69 0.54
70 0.62
71 0.67
72 0.71
73 0.77
74 0.78
75 0.79
76 0.8
77 0.74
78 0.74
79 0.77
80 0.74
81 0.73
82 0.73
83 0.73
84 0.73
85 0.81
86 0.85
87 0.88
88 0.93
89 0.93
90 0.94
91 0.93
92 0.92
93 0.9
94 0.89
95 0.87
96 0.8
97 0.7
98 0.59
99 0.49
100 0.39
101 0.3
102 0.19
103 0.11
104 0.09
105 0.12
106 0.13
107 0.13
108 0.15
109 0.2
110 0.25
111 0.3
112 0.36
113 0.44
114 0.54
115 0.62
116 0.64
117 0.7
118 0.69
119 0.71
120 0.63
121 0.56
122 0.56
123 0.54
124 0.54
125 0.52
126 0.51
127 0.46
128 0.53
129 0.52
130 0.48
131 0.49
132 0.54
133 0.51
134 0.58
135 0.6
136 0.55
137 0.55
138 0.48
139 0.41
140 0.34
141 0.3
142 0.22
143 0.24
144 0.29
145 0.29
146 0.31
147 0.34
148 0.37
149 0.4
150 0.46
151 0.47
152 0.43
153 0.44
154 0.43
155 0.39
156 0.34
157 0.32
158 0.3
159 0.25
160 0.22
161 0.27
162 0.35
163 0.46
164 0.55
165 0.62
166 0.67
167 0.75
168 0.83
169 0.86
170 0.87
171 0.83
172 0.8
173 0.7
174 0.61
175 0.5
176 0.41
177 0.3
178 0.18
179 0.11
180 0.04
181 0.04
182 0.03
183 0.04
184 0.04
185 0.04
186 0.05
187 0.08
188 0.08
189 0.09
190 0.1
191 0.11
192 0.12
193 0.12
194 0.12
195 0.1
196 0.12
197 0.14
198 0.14
199 0.13
200 0.12
201 0.14
202 0.15
203 0.2
204 0.23
205 0.28
206 0.34
207 0.34
208 0.37
209 0.37
210 0.39
211 0.37
212 0.32
213 0.25
214 0.17
215 0.19
216 0.15
217 0.16
218 0.12
219 0.09
220 0.09
221 0.1
222 0.1
223 0.09
224 0.1
225 0.09
226 0.1
227 0.1
228 0.11
229 0.12
230 0.13
231 0.12
232 0.12
233 0.12
234 0.11
235 0.11
236 0.08
237 0.08
238 0.07
239 0.08
240 0.09
241 0.08
242 0.08
243 0.09
244 0.1
245 0.11
246 0.13
247 0.15
248 0.13
249 0.13
250 0.13
251 0.13
252 0.12
253 0.12
254 0.12
255 0.09
256 0.1
257 0.11
258 0.1
259 0.1
260 0.11
261 0.1
262 0.09
263 0.1
264 0.09
265 0.11
266 0.11
267 0.11
268 0.1
269 0.11
270 0.12
271 0.12
272 0.13
273 0.11
274 0.12
275 0.11
276 0.11
277 0.1
278 0.1
279 0.09
280 0.07
281 0.06
282 0.06
283 0.07
284 0.08
285 0.1
286 0.15
287 0.2
288 0.27
289 0.3
290 0.33
291 0.35
292 0.4
293 0.48
294 0.51
295 0.56
296 0.56
297 0.59
298 0.62
299 0.61
300 0.55
301 0.47
302 0.39
303 0.3
304 0.3
305 0.27
306 0.22
307 0.22
308 0.23
309 0.26
310 0.27
311 0.27
312 0.24
313 0.25
314 0.31
315 0.37
316 0.47
317 0.5
318 0.58
319 0.66
320 0.7
321 0.68
322 0.69
323 0.7
324 0.67
325 0.65
326 0.64
327 0.6
328 0.55
329 0.55
330 0.5
331 0.42
332 0.35
333 0.29
334 0.23
335 0.2
336 0.2
337 0.17
338 0.16
339 0.15
340 0.13
341 0.13
342 0.13
343 0.1
344 0.09
345 0.11
346 0.12
347 0.13
348 0.14
349 0.15
350 0.15
351 0.14
352 0.15
353 0.16
354 0.17
355 0.19
356 0.2
357 0.23
358 0.26
359 0.31
360 0.32
361 0.37
362 0.35
363 0.33
364 0.34
365 0.34
366 0.34
367 0.29
368 0.27
369 0.24
370 0.25
371 0.33
372 0.33
373 0.3
374 0.29
375 0.34
376 0.38
377 0.39
378 0.44
379 0.43
380 0.47
381 0.5
382 0.5
383 0.46
384 0.45
385 0.44
386 0.43
387 0.38
388 0.33
389 0.29
390 0.31
391 0.37
392 0.36
393 0.34
394 0.34
395 0.33
396 0.39
397 0.4
398 0.39
399 0.35
400 0.37
401 0.41
402 0.41
403 0.39
404 0.32
405 0.3
406 0.28
407 0.24
408 0.22
409 0.17
410 0.16
411 0.16
412 0.16
413 0.16
414 0.16
415 0.16
416 0.15
417 0.23
418 0.3
419 0.39