Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0B1PDG4

Protein Details
Accession A0A0B1PDG4    Localization Confidence High Confidence Score 15
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
11-51PQLSRRTKFIHKLRRIYLGRPLSHISPQKRSNKSNFRQSNFHydrophilic
644-670EENSTRVSGSRHRRRRRAGEARIIHAIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
653-665SRHRRRRRAGEAR
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 12, cyto 3.5, mito 2, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036047  F-box-like_dom_sf  
IPR001810  F-box_dom  
IPR001611  Leu-rich_rpt  
IPR006553  Leu-rich_rpt_Cys-con_subtyp  
IPR032675  LRR_dom_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF12937  F-box-like  
PF13516  LRR_6  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50181  FBOX  
Amino Acid Sequences MPDKATMPDAPQLSRRTKFIHKLRRIYLGRPLSHISPQKRSNKSNFRQSNFSNMTTVSGDASRQHNGQTCSSSSANNCSSKLISPTAIIRKESILLKDGIKICAGNNTIVSDVTQLLTHDSLILKREDSFIQDTIDYLPTETLALEASDQCLITEYMDMVDTKFPNWQTNFDFWAEIPPEIAIGIFMYLTPKELVRVSIVSRRFYNFCYDGQLWTSFDASNFYKDIPAESLAKILVAAGPFVKDLNLRGCIQVEHHQRAEAVVKACNNLVNTTLEGCRNFQRLTLHCLLIGNTKLVNLNLTGLTAVTNGTCKIIAQSCPCLESIDLSGCTRMDARGLRIVVQGCKKLKDIRAREIKGFGCIELAQDIFETNVLERIVFSGCTDFTDHALRTMMHGKDPEIDILTNLPLVPMRKLRYLDISRCYRITNFGIKAMAHLACNLQGLLISGCSRIGNDGLKDVVTSAPQLTLLDLEEVSNLTNDFFKDTLAKASCVLALKHLSISCCDQVDDNGILPIFRACKNLESVELDNTGISDLVLSEAANMLRSRSKVGMAQILSPVIGLRLVVYDCQNVTWAGIREVMSRNSEFHKSTSDEISAQVTELISLKCYYCWQMTVDEHTKRLLRGDIPAAQRLEKLWTDWIIAKEENSTRVSGSRHRRRRRAGEARIIHAIDGRGDRNRSRTRLILNTSSCTIM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.45
2 0.46
3 0.46
4 0.53
5 0.6
6 0.65
7 0.69
8 0.71
9 0.77
10 0.78
11 0.82
12 0.77
13 0.71
14 0.71
15 0.69
16 0.61
17 0.56
18 0.55
19 0.47
20 0.52
21 0.56
22 0.53
23 0.53
24 0.6
25 0.65
26 0.7
27 0.75
28 0.78
29 0.8
30 0.82
31 0.84
32 0.84
33 0.8
34 0.79
35 0.73
36 0.73
37 0.67
38 0.6
39 0.51
40 0.41
41 0.39
42 0.32
43 0.3
44 0.21
45 0.16
46 0.16
47 0.18
48 0.21
49 0.21
50 0.21
51 0.25
52 0.3
53 0.32
54 0.35
55 0.35
56 0.33
57 0.35
58 0.35
59 0.35
60 0.31
61 0.35
62 0.37
63 0.36
64 0.35
65 0.33
66 0.34
67 0.33
68 0.34
69 0.3
70 0.25
71 0.23
72 0.3
73 0.36
74 0.38
75 0.36
76 0.33
77 0.32
78 0.35
79 0.36
80 0.31
81 0.26
82 0.25
83 0.25
84 0.3
85 0.32
86 0.28
87 0.26
88 0.24
89 0.21
90 0.25
91 0.25
92 0.2
93 0.18
94 0.19
95 0.18
96 0.18
97 0.18
98 0.12
99 0.11
100 0.11
101 0.1
102 0.09
103 0.11
104 0.11
105 0.1
106 0.11
107 0.11
108 0.12
109 0.15
110 0.16
111 0.14
112 0.15
113 0.17
114 0.17
115 0.2
116 0.22
117 0.2
118 0.21
119 0.2
120 0.2
121 0.19
122 0.2
123 0.16
124 0.13
125 0.12
126 0.1
127 0.1
128 0.09
129 0.07
130 0.06
131 0.06
132 0.06
133 0.07
134 0.08
135 0.08
136 0.08
137 0.08
138 0.09
139 0.09
140 0.08
141 0.09
142 0.08
143 0.07
144 0.08
145 0.09
146 0.08
147 0.12
148 0.12
149 0.12
150 0.16
151 0.17
152 0.23
153 0.25
154 0.28
155 0.29
156 0.32
157 0.34
158 0.31
159 0.3
160 0.23
161 0.28
162 0.25
163 0.2
164 0.17
165 0.14
166 0.13
167 0.12
168 0.12
169 0.05
170 0.04
171 0.04
172 0.03
173 0.04
174 0.05
175 0.05
176 0.07
177 0.07
178 0.07
179 0.09
180 0.1
181 0.11
182 0.11
183 0.13
184 0.15
185 0.21
186 0.24
187 0.25
188 0.26
189 0.29
190 0.28
191 0.28
192 0.32
193 0.28
194 0.25
195 0.29
196 0.28
197 0.27
198 0.27
199 0.27
200 0.21
201 0.19
202 0.2
203 0.13
204 0.12
205 0.15
206 0.13
207 0.14
208 0.14
209 0.14
210 0.14
211 0.14
212 0.15
213 0.13
214 0.14
215 0.14
216 0.14
217 0.14
218 0.13
219 0.12
220 0.11
221 0.09
222 0.08
223 0.06
224 0.06
225 0.05
226 0.06
227 0.06
228 0.06
229 0.07
230 0.06
231 0.08
232 0.11
233 0.14
234 0.14
235 0.15
236 0.16
237 0.15
238 0.18
239 0.24
240 0.28
241 0.29
242 0.29
243 0.29
244 0.28
245 0.29
246 0.28
247 0.24
248 0.18
249 0.16
250 0.17
251 0.17
252 0.17
253 0.18
254 0.16
255 0.13
256 0.13
257 0.12
258 0.11
259 0.12
260 0.13
261 0.13
262 0.13
263 0.15
264 0.17
265 0.19
266 0.18
267 0.19
268 0.24
269 0.24
270 0.3
271 0.32
272 0.29
273 0.26
274 0.26
275 0.24
276 0.22
277 0.2
278 0.14
279 0.1
280 0.11
281 0.11
282 0.11
283 0.1
284 0.07
285 0.08
286 0.07
287 0.07
288 0.06
289 0.05
290 0.06
291 0.05
292 0.05
293 0.04
294 0.05
295 0.05
296 0.05
297 0.05
298 0.05
299 0.07
300 0.09
301 0.12
302 0.13
303 0.17
304 0.17
305 0.18
306 0.18
307 0.17
308 0.14
309 0.13
310 0.12
311 0.1
312 0.11
313 0.1
314 0.1
315 0.09
316 0.1
317 0.09
318 0.08
319 0.09
320 0.09
321 0.11
322 0.14
323 0.14
324 0.15
325 0.17
326 0.18
327 0.19
328 0.21
329 0.24
330 0.22
331 0.23
332 0.24
333 0.27
334 0.31
335 0.37
336 0.39
337 0.43
338 0.52
339 0.53
340 0.52
341 0.52
342 0.46
343 0.4
344 0.35
345 0.26
346 0.17
347 0.15
348 0.13
349 0.09
350 0.09
351 0.06
352 0.05
353 0.05
354 0.04
355 0.05
356 0.05
357 0.04
358 0.06
359 0.06
360 0.06
361 0.06
362 0.07
363 0.07
364 0.07
365 0.07
366 0.06
367 0.06
368 0.07
369 0.08
370 0.08
371 0.09
372 0.12
373 0.12
374 0.12
375 0.13
376 0.12
377 0.13
378 0.19
379 0.18
380 0.16
381 0.17
382 0.17
383 0.18
384 0.19
385 0.17
386 0.12
387 0.11
388 0.1
389 0.1
390 0.1
391 0.07
392 0.07
393 0.06
394 0.06
395 0.07
396 0.09
397 0.13
398 0.16
399 0.2
400 0.21
401 0.22
402 0.3
403 0.35
404 0.38
405 0.4
406 0.43
407 0.41
408 0.41
409 0.41
410 0.32
411 0.31
412 0.3
413 0.3
414 0.25
415 0.25
416 0.26
417 0.24
418 0.24
419 0.23
420 0.2
421 0.13
422 0.12
423 0.11
424 0.1
425 0.1
426 0.09
427 0.06
428 0.06
429 0.06
430 0.06
431 0.06
432 0.06
433 0.06
434 0.06
435 0.06
436 0.06
437 0.06
438 0.08
439 0.1
440 0.1
441 0.11
442 0.11
443 0.11
444 0.11
445 0.11
446 0.09
447 0.07
448 0.08
449 0.07
450 0.07
451 0.07
452 0.07
453 0.07
454 0.07
455 0.07
456 0.07
457 0.06
458 0.06
459 0.06
460 0.06
461 0.06
462 0.06
463 0.06
464 0.05
465 0.06
466 0.07
467 0.08
468 0.08
469 0.09
470 0.1
471 0.11
472 0.17
473 0.18
474 0.18
475 0.17
476 0.18
477 0.2
478 0.19
479 0.19
480 0.16
481 0.16
482 0.16
483 0.18
484 0.18
485 0.17
486 0.17
487 0.2
488 0.19
489 0.18
490 0.17
491 0.15
492 0.15
493 0.18
494 0.17
495 0.14
496 0.13
497 0.12
498 0.11
499 0.11
500 0.12
501 0.11
502 0.11
503 0.14
504 0.14
505 0.17
506 0.2
507 0.21
508 0.22
509 0.24
510 0.24
511 0.24
512 0.24
513 0.21
514 0.18
515 0.17
516 0.14
517 0.09
518 0.07
519 0.05
520 0.04
521 0.04
522 0.05
523 0.04
524 0.04
525 0.06
526 0.06
527 0.08
528 0.08
529 0.1
530 0.13
531 0.14
532 0.17
533 0.17
534 0.19
535 0.2
536 0.24
537 0.29
538 0.26
539 0.27
540 0.25
541 0.24
542 0.22
543 0.18
544 0.15
545 0.09
546 0.08
547 0.05
548 0.04
549 0.06
550 0.07
551 0.08
552 0.1
553 0.12
554 0.12
555 0.12
556 0.13
557 0.12
558 0.12
559 0.15
560 0.15
561 0.14
562 0.18
563 0.18
564 0.21
565 0.25
566 0.27
567 0.26
568 0.26
569 0.27
570 0.28
571 0.32
572 0.3
573 0.28
574 0.3
575 0.29
576 0.31
577 0.32
578 0.3
579 0.26
580 0.26
581 0.27
582 0.21
583 0.19
584 0.17
585 0.13
586 0.11
587 0.13
588 0.12
589 0.11
590 0.12
591 0.12
592 0.12
593 0.15
594 0.18
595 0.17
596 0.19
597 0.19
598 0.24
599 0.26
600 0.34
601 0.4
602 0.4
603 0.39
604 0.41
605 0.42
606 0.37
607 0.38
608 0.34
609 0.28
610 0.29
611 0.34
612 0.37
613 0.38
614 0.43
615 0.42
616 0.38
617 0.37
618 0.32
619 0.32
620 0.26
621 0.24
622 0.23
623 0.23
624 0.25
625 0.29
626 0.3
627 0.29
628 0.28
629 0.27
630 0.29
631 0.3
632 0.31
633 0.28
634 0.27
635 0.24
636 0.27
637 0.31
638 0.33
639 0.42
640 0.49
641 0.58
642 0.68
643 0.77
644 0.83
645 0.9
646 0.92
647 0.91
648 0.91
649 0.91
650 0.86
651 0.81
652 0.77
653 0.67
654 0.56
655 0.48
656 0.39
657 0.32
658 0.3
659 0.29
660 0.29
661 0.33
662 0.37
663 0.44
664 0.52
665 0.53
666 0.55
667 0.57
668 0.59
669 0.63
670 0.66
671 0.66
672 0.61
673 0.6